| Entry | SW_score | bits | identity | overlap |
| paa:Paes_1265 | 623 | 147.8 | 0.391 | 253 |
| paa:Paes_1297 | 535 | 127.7 | 0.389 | 234 |
| paa:Paes_1284 | 419 | 101.3 | 0.292 | 257 |
| paa:Paes_0186 | 340 | 83.3 | 0.301 | 246 |
| paa:Paes_0946 | 322 | 79.2 | 0.304 | 257 |
| paa:Paes_1143 | 321 | 79.0 | 0.332 | 223 |
| paa:Paes_1695 | 319 | 78.5 | 0.313 | 198 |
| paa:Paes_0417 | 292 | 72.4 | 0.276 | 250 |
| paa:Paes_0425 | 279 | 69.4 | 0.337 | 208 |
| paa:Paes_0767 | 279 | 69.4 | 0.275 | 244 |
| paa:Paes_1086 | 275 | 68.5 | 0.304 | 194 |
| paa:Paes_1182 | 273 | 68.0 | 0.232 | 271 |
| paa:Paes_1937 | 270 | 67.3 | 0.269 | 227 |
| paa:Paes_0717 | 269 | 67.1 | 0.270 | 259 |
| paa:Paes_0347 | 263 | 65.7 | 0.253 | 229 |
| paa:Paes_1108 | 260 | 65.1 | 0.257 | 226 |
| paa:Paes_0509 | 257 | 64.4 | 0.271 | 218 |
| paa:Paes_1597 | 256 | 64.1 | 0.243 | 251 |
| paa:Paes_1109 | 253 | 63.5 | 0.240 | 229 |
| paa:Paes_1484 | 252 | 63.2 | 0.282 | 234 |
| paa:Paes_1200 | 244 | 61.4 | 0.282 | 188 |
| paa:Paes_1666 | 236 | 59.6 | 0.259 | 228 |
| paa:Paes_0785 | 234 | 59.1 | 0.270 | 215 |
| paa:Paes_2206 | 226 | 57.3 | 0.260 | 219 |
| paa:Paes_1447 | 225 | 57.1 | 0.258 | 244 |
| paa:Paes_0270 | 219 | 55.7 | 0.261 | 211 |
| paa:Paes_2205 | 218 | 55.5 | 0.260 | 231 |
| paa:Paes_1212 | 216 | 55.0 | 0.256 | 199 |
| paa:Paes_1577 | 214 | 54.6 | 0.245 | 229 |
| paa:Paes_1665 | 213 | 54.3 | 0.264 | 208 |
| paa:Paes_0621 | 204 | 52.3 | 0.251 | 235 |
| paa:Paes_0474 | 126 | 34.5 | 0.320 | 97 |