SSDB Gene Cluster Search Result

Entry:mmm:W7S_21510 (183 a.a.)
Name:igma-70 family RNA polymerase sigma factor
KO:K03088 RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily
Gap size:
Threshold:
mmmW7S_21485W7S_21490W7S_21495W7S_21500W7S_21505W7S_21510(K03088)W7S_21515W7S_21520(K00140)W7S_21525W7S_21530(K00020)W7S_21535W7S_21540(K00817)W7S_21545(K00648)W7S_21550W7S_21555(K01652)W7S_21560(K02003)
myoOEM_43250 OEM_43260OEM_43270OEM_43280OEM_43290(K03088)OEM_43300OEM_43310(K00140)OEM_43320OEM_43330(K00020)OEM_43340OEM_43350(K00817)OEM_43360(K00648)OEM_43370OEM_43380(K01652)OEM_43390(K02003)
mirOCQ_44130 OCQ_44140OCQ_44150OCQ_44160OCQ_44170(K03088)OCQ_44180OCQ_44190(K00140)OCQ_44200OCQ_44210(K00020)OCQ_44220OCQ_44230(K00817)OCQ_44240(K00648)OCQ_44250OCQ_44260(K01652)OCQ_44270(K02003)
mchiAN480_22475AN480_22480AN480_22485AN480_22490AN480_22495AN480_22500(K03088)AN480_22505AN480_22510(K00140)AN480_22515AN480_22520(K00020)AN480_22525     
mmanMMAN_31140MMAN_31150MMAN_31160MMAN_31170MMAN_31180MMAN_31190(K03088)MMAN_31200MMAN_31210(K00140)MMAN_31220MMAN_31230(K00020)MMAN_31240MMAN_31250(K00817)MMAN_31260(K00648)MMAN_31270MMAN_31280(K01652)MMAN_31290(K02003)
msak MSAS_45720MSAS_45710MSAS_45700MSAS_45690MSAS_45680(K03088)MSAS_45670MSAS_45630(K00140)MSAS_45620MSAS_45610(K00020)MSAS_45580    MSAS_37490(K02003)
mavMAV_4410 MAV_4412MAV_4413MAV_4414(K02636)MAV_4415(K03088)MAV_4416MAV_4417(K00140)MAV_4418MAV_4419(K00020)MAV_4420MAV_4421(K00817)MAV_4422(K00648)MAV_4423MAV_4424(K01652)MAV_4425(K02003)
mpa  MAP_4220MAP_4219MAP_4218(K02636)MAP_4217(K03088)MAP_4216MAP_4215c(K00140)MAP_4214cMAP_4213c(K00020)MAP_4212MAP_4211(K00817)MAP_4210(K00648)MAP_4209MAP_4208(K01652)MAP_4207c(K02003)
maviRC58_21595 RC58_21585RC58_21580RC58_21575(K02636)RC58_21570(K03088)RC58_21565RC58_21560(K00140)RC58_21555RC58_21550(K00020)RC58_21545RC58_21540(K00817)RC58_21535(K00648)RC58_21530RC58_21525(K01652)RC58_21520(K02003)
maoMAP4_4346 MAP4_4345MAP4_4344MAP4_4343(K02636)MAP4_4342(K03088)MAP4_4341MAP4_4340(K00140)MAP4_4339MAP4_4338(K00020)MAP4_4337MAP4_4336(K00817)MAP4_4335(K00648)MAP4_4334MAP4_4333(K01652)MAP4_4332(K02003)
mavuRE97_21645 RE97_21635RE97_21630RE97_21625(K02636)RE97_21620(K03088)RE97_21615RE97_21610(K00140)RE97_21605RE97_21600(K00020)RE97_21595RE97_21590(K00817)RE97_21585(K00648)RE97_21580RE97_21575(K01652)RE97_21570(K02003)
mseoMSEO_49100MSEO_49090MSEO_49080MSEO_49070MSEO_49060MSEO_49050(K03088)MSEO_49040MSEO_49010(K00140)MSEO_49000MSEO_48990(K00020)MSEO_48980MSEO_48970(K00817)MSEO_48960(K00648)MSEO_48950MSEO_48940(K01652)MSEO_48930(K02003)
miaOCU_42780 OCU_42790OCU_42800OCU_42810OCU_42820(K03088)OCU_42830OCU_42840(K00140)OCU_42850OCU_42860(K00020)OCU_42870OCU_42880(K00817)OCU_42890(K00648)OCU_42900OCU_42910(K01652)OCU_42920(K02003)
msimMSIM_15330MSIM_15360MSIM_15370MSIM_15380MSIM_15400MSIM_15410(K03088)MSIM_15420MSIM_15430(K00140)MSIM_15440MSIM_15450(K00020)MSIM_15460MSIM_15470(K00817)MSIM_15480(K00648)MSIM_15490MSIM_15500(K01652)MSIM_52540(K02003)
mitOCO_43010 OCO_43020OCO_43030OCO_43040OCO_43050(K03088)OCO_43060OCO_43070(K00140)OCO_43080OCO_43090(K00020)OCO_43100OCO_43110(K00817)OCO_43120(K00648)OCO_43130OCO_43140(K01652)OCO_43150(K02003)
msto MSTO_28230MSTO_28240MSTO_28250MSTO_28280MSTO_28290(K03088)MSTO_28300MSTO_28310(K00140)MSTO_28320MSTO_28330(K00020)MSTO_28350MSTO_28360(K00817)MSTO_28370(K00648)MSTO_28380MSTO_28390(K01652)MSTO_08550(K02003)
midMIP_06459 MIP_06461MIP_06462MIP_06465MIP_06466(K03088)MIP_06467MIP_06468(K00140)MIP_06469MIP_06472(K00020)MIP_06474MIP_06475(K00817)MIP_06476(K00648)MIP_06478MIP_06481(K01652)MIP_06480(K02003)
mlw MJO58_05115MJO58_05110MJO58_05105MJO58_05100MJO58_05095(K03088)MJO58_05090MJO58_05085(K00140)MJO58_05080MJO58_05075(K00020)MJO58_05065MJO58_05060(K00817)MJO58_05055(K00648)MJO58_05050MJO58_05045(K01652)MJO58_07675(K02003)
mshgMSG_00972MSG_00963MSG_00962 MSG_00970MSG_00969(K03088)MSG_00968MSG_00966(K00140)MSG_00965MSG_00964(K00020)MSG_00960     
mfj MFLOJ_25010MFLOJ_25020MFLOJ_25030MFLOJ_25050MFLOJ_25060(K03088)MFLOJ_25080MFLOJ_25090(K00140)MFLOJ_25100MFLOJ_25110(K00020)MFLOJ_25130MFLOJ_25140(K00817)MFLOJ_25150(K00648)MFLOJ_25160MFLOJ_25170(K01652)MFLOJ_07210(K02003)
mnv MNVI_26080MNVI_26070MNVI_26060MNVI_26040MNVI_26030(K03088) MNVI_26020(K00140)MNVI_26010MNVI_26000(K00020)MNVI_25960MNVI_25940(K00817)MNVI_25930(K00648)MNVI_26120MNVI_25910(K01652)MNVI_26110(K02003)
mbrd MBRA_05730MBRA_05740MBRA_05750MBRA_05760MBRA_05770(K03088) MBRA_05780(K00140)MBRA_05790MBRA_05800(K00020)MBRA_05840MBRA_05850(K00817)MBRA_05860(K00648)MBRA_05870MBRA_05880(K01652) 
mpag C0J29_05985C0J29_05980C0J29_05975C0J29_05970C0J29_05965(K03088)C0J29_17060C0J29_05955(K00140)C0J29_05950C0J29_05945(K00020)C0J29_05940C0J29_05935(K00817)C0J29_05930(K00648)C0J29_05925C0J29_05920(K01652)C0J29_21230(K02003)
mpaa  MKK62_19715MKK62_19720MKK62_19725MKK62_19730(K03088)MKK62_21570MKK62_19770(K00140)MKK62_19775MKK62_19780(K00020)MKK62_19800MKK62_19805(K00817)MKK62_19810(K00648)MKK62_19815MKK62_19820(K01652) 
mcoo MCOO_42580MCOO_42570MCOO_42560MCOO_42540MCOO_42530(K03088)MCOO_38840MCOO_42470(K00140)MCOO_42460MCOO_42450(K00020)MCOO_42410MCOO_42390(K00817)MCOO_42380(K00648)MCOO_26770MCOO_42360(K01652)MCOO_26760(K02003)
mphu MPHO_01020MPHO_01010MPHO_01000MPHO_00990MPHO_00980(K03088)MPHO_40770MPHO_49090(K00140)MPHO_49080MPHO_49070(K00020)MPHO_49010MPHO_49000(K00817)MPHO_48990(K00648)MPHO_48980MPHO_48970(K01652)MPHO_05720(K02003)
mmuc C1S78_017865C1S78_017870C1S78_017875C1S78_017880C1S78_017885(K03088)C1S78_027145C1S78_022665(K00140)C1S78_022670C1S78_022675(K00020)C1S78_022705C1S78_022710(K00817)C1S78_022715(K00648)C1S78_022720C1S78_022725(K01652)C1S78_015460(K02003)
mmatMMAGJ_23420MMAGJ_46530MMAGJ_46540MMAGJ_46550MMAGJ_46570MMAGJ_46560(K03088)MMAGJ_05910MMAGJ_43730(K00140)MMAGJ_43720MMAGJ_43710(K00020)MMAGJ_43650MMAGJ_43640(K00817)MMAGJ_43630(K00648)MMAGJ_69200MMAGJ_43610(K01652)MMAGJ_55260(K02003)
mabb MASS_1p0099MASS_1p0098MASS_1p0097MASS_1p0096MASS_1p0095(K03088) MASS_1187(K00140)MASS_1186MASS_1184(K00020)MASS_1182MASS_2095(K00817)MASS_2094(K00648)MASS_2093MASS_2092(K01652)MASS_4700
mmag MMAD_32160MMAD_32170MMAD_32180MMAD_32220MMAD_32210(K03088)MMAD_45320MMAD_11690(K00140)MMAD_11680MMAD_11670(K00020)MMAD_11600    MMAD_38280(K02003)
msal DSM43276_04479DSM43276_04478DSM43276_04477DSM43276_04476DSM43276_04475(K03088) DSM43276_01057(K00140)DSM43276_01056DSM43276_01054(K00020)DSM43276_01052DSM43276_01883(K00817)DSM43276_01882(K00648)DSM43276_01881DSM43276_01880(K01652)DSM43276_01040(K02003)
maub MAUB_11800MAUB_11810MAUB_11820MAUB_11830MAUB_11840(K03088) MAUB_21520(K00140)MAUB_21530MAUB_21540(K00020)MAUB_21610MAUB_21620(K00817)MAUB_21630(K00648)MAUB_21640MAUB_21650(K01652)MAUB_06930(K02003)
mizBAB75_23565BAB75_26210BAB75_26205BAB75_26200BAB75_26195BAB75_26190(K03088) BAB75_06490(K00140)BAB75_06485BAB75_06475(K00020)BAB75_06465BAB75_11620(K00817)BAB75_11615(K00648)BAB75_11610BAB75_11605(K01652)BAB75_26290(K09810)
mcro MI149_04405MI149_04400MI149_04395MI149_04385MI149_04390(K03088)MI149_28885MI149_06115(K00140)MI149_06110MI149_06105(K00020)MI149_06100MI149_06095(K00817)MI149_06090(K00648)MI149_06085MI149_06080(K01652)MI149_11420(K02003)
mmv MYCMA_03410MYCMA_03415MYCMA_2568MYCMA_03420MYCMA_03425(K03088) MYCMA_0632(K00140)MYCMA_0631MYCMA_0629(K00020)MYCMA_11450MYCMA_1146(K00817)MYCMA_1145(K00648)MYCMA_09595MYCMA_1144(K01652)MYCMA_2575
mablMMASJCM_4196MMASJCM_4712MMASJCM_4711MMASJCM_4710MMASJCM_4708MMASJCM_4707(K03088) MMASJCM_1215(K00140)MMASJCM_1214MMASJCM_1212(K00020)MMASJCM_1210MMASJCM_2119(K00817)MMASJCM_2118(K00648)MMASJCM_2117MMASJCM_2116(K01652)MMASJCM_4727
mhev MHEL_14340MHEL_14350MHEL_14360MHEL_14380MHEL_14370(K03088) MHEL_11320(K00140)MHEL_11330MHEL_11340(K00020)MHEL_11350MHEL_11360(K00817)MHEL_11370(K00648)MHEL_11380MHEL_11390(K01652)MHEL_08490(K02003)
mdx BTO20_26590BTO20_26585BTO20_26580BTO20_26570BTO20_26575(K03088) BTO20_28100(K00140)BTO20_28105BTO20_28110(K00020)BTO20_28130BTO20_28135(K00817)BTO20_28140(K00648)BTO20_28145BTO20_14720(K01652)BTO20_18615(K02003)
mste MSTE_04820MSTE_04819MSTE_04818MSTE_04817MSTE_04816(K03088) MSTE_01157(K00140)MSTE_01156MSTE_01154(K00020)MSTE_01152MSTE_02107(K00817)MSTE_02106(K00648)MSTE_02105MSTE_02104(K01652)MSTE_01134(K02003)
maic MAIC_48510MAIC_48520MAIC_48530MAIC_48550MAIC_48540(K03088) MAIC_45340(K00140)MAIC_45350MAIC_45360(K00020)MAIC_45370 MAIC_14460(K00648)MAIC_14450MAIC_14440(K01652)MAIC_18820(K02003)
mll  B1R94_04120B1R94_04115B1R94_04105B1R94_04110(K03088) B1R94_05625(K00140)B1R94_05620B1R94_05615(K00020)B1R94_05590 B1R94_20705(K00648)B1R94_20710B1R94_20715(K01652) 
mye AB431_03995AB431_03990AB431_03985AB431_03975AB431_03980(K03088)AB431_28940AB431_05855(K00140)AB431_05850AB431_05845(K00020)AB431_05840AB431_05835(K00817)AB431_05830(K00648)AB431_05825AB431_05820(K01652)AB431_10895(K02003)
mpae K0O64_03805K0O64_03800K0O64_03795K0O64_03785K0O64_03790(K03088)K0O64_29105K0O64_05380(K00140)K0O64_05375K0O64_05370(K00020)K0O64_05365K0O64_05360(K00817)K0O64_05355(K00648)K0O64_05350K0O64_05345(K01652)K0O64_10555(K02003)
mcb Mycch_1366Mycch_1365Mycch_1364Mycch_1363Mycch_1362(K03088)Mycch_3876Mycch_0988(K00140)Mycch_0987Mycch_0986(K00020)Mycch_0982Mycch_0981(K00817)Mycch_0980(K00648)Mycch_0979Mycch_0978(K01652)Mycch_0364(K02003)
mab MAB_4656MAB_4655MAB_4654MAB_4653MAB_4652(K03088) MAB_1189c(K00140)MAB_1188cMAB_1186c(K00020)MAB_1184cMAB_2168(K00817)MAB_2167(K00648)MAB_2166MAB_2165(K01652)MAB_4671c(K02003)
msao MYCSP_21680MYCSP_21675MYCSP_21670MYCSP_21665MYCSP_21660(K03088) MYCSP_05240(K00140)MYCSP_05235MYCSP_05225(K00020)MYCSP_05215MYCSP_09290(K00817)MYCSP_09285(K00648)MYCSP_09280MYCSP_09275(K01652)MYCSP_05155(K02003)
many MANY_47460MANY_47450MANY_47440MANY_47420MANY_47430(K03088) MANY_50260(K00140)MANY_50250MANY_50240(K00020)MANY_50190 MANY_54030(K00648)MANY_54020MANY_54010(K01652)MANY_05120(K02003)
nah  F5544_07985F5544_07990F5544_07995F5544_08000(K03088) F5544_07170(K00140)F5544_07175F5544_07185(K00020)F5544_07200F5544_44445(K00817)F5544_44440(K00648)F5544_44435F5544_44430(K01652)F5544_34610(K02003)
mrf   MJO55_07940MJO55_27035MJO55_27030(K03088)MJO55_20125MJO55_05605(K00140)MJO55_05600MJO55_05595(K00020)MJO55_05575MJO55_05570(K00817)MJO55_05565(K00648)MJO55_05560MJO55_05555(K01652)MJO55_10030(K02003)
mrh   MycrhN_4897MycrhN_1985MycrhN_1984(K03088)MycrhN_2672MycrhN_0639(K00140)MycrhN_0640MycrhN_0641(K00020)MycrhN_0647MycrhN_0649(K00817)MycrhN_0650(K00648)MycrhN_0651MycrhN_0652(K01652)MycrhN_5356(K02003)
mpsc   MPSYJ_48740MPSYJ_10140MPSYJ_10150(K03088)MPSYJ_23950MPSYJ_53310(K00140)MPSYJ_53320MPSYJ_53330(K00020)MPSYJ_53370MPSYJ_53380(K00817)MPSYJ_53390(K00648)MPSYJ_53400MPSYJ_53410(K01652)MPSYJ_16860
amm AMES_2702AMES_2129(K03651)AMES_4199AMES_3716AMES_3715(K03088) AMES_6536(K00140) AMES_7156(K00042)AMES_1589    AMES_8335(K02003)
amn RAM_13880RAM_10940(K03651)RAM_21645RAM_19150RAM_19145(K03088) RAM_34045(K00140) RAM_37325(K00042)RAM_08120    RAM_43450(K02003)
amz B737_2703B737_2130(K03651)B737_4199B737_3716B737_3715(K03088) B737_6536(K00140) B737_7156(K00042)B737_1590    B737_8336(K02003)
amd AMED_2730AMED_2147(K03651)AMED_4250AMED_3761AMED_3760(K03088) AMED_6635(K00140) AMED_7266(K00042)AMED_1599    AMED_8464(K02003)
kut JJ691_47100JJ691_47110JJ691_47120JJ691_47130JJ691_47140(K03088)JJ691_35250(K02035)JJ691_80550(K00140) JJ691_27590(K00042)JJ691_90630    JJ691_82740(K02003)
amyc CU254_17220CU254_17215CU254_17210CU254_17205CU254_17200(K03088) CU254_29410(K00140) CU254_19880(K00042)CU254_06455    CU254_38275(K02003)
agra  AGRA3207_004891(K03651) AGRA3207_007835AGRA3207_007836(K03088) AGRA3207_006337(K00140) AGRA3207_005552(K00020)AGRA3207_000545    AGRA3207_007703
nsr  NS506_06046NS506_06044NS506_06043NS506_06042(K03088) NS506_07234(K00140)NS506_07233NS506_07231(K00020)NS506_07228NS506_00996(K00817)NS506_00997(K00648)NS506_00998NS506_00999(K01652)NS506_06610(K02003)
mmor   MMOR_33740MMOR_08170MMOR_08160(K03088)MMOR_14950MMOR_53480(K00140)MMOR_53490MMOR_53500(K00020)MMOR_53570MMOR_53580(K00817)MMOR_53590(K00648)MMOR_53600MMOR_53610(K01652)MMOR_48520(K02003)
pfla    Pflav_031040Pflav_031030(K03088) Pflav_018650(K00140) Pflav_032360(K00042)Pflav_041540    Pflav_065650(K02003)
msa Mycsm_03672Mycsm_03671Mycsm_03670Mycsm_06151Mycsm_06152(K03088)Mycsm_05424Mycsm_01067(K00140)Mycsm_01066Mycsm_01065(K00020)Mycsm_01058Mycsm_01057(K00817)Mycsm_01056(K00648)Mycsm_01055Mycsm_01054(K01652)Mycsm_01153(K02003)
aprt MUY14_22735MUY14_28430 MUY14_29395MUY14_29390(K03088) MUY14_03760(K00140) MUY14_14120(K00042)MUY14_28515    MUY14_41450(K02003)
cai Caci_2523Caci_2524Caci_2525Caci_2527Caci_2526(K03088) Caci_7087(K00140) Caci_4729(K00042)Caci_1273    Caci_0211(K02003)
falFRAAL2030FRAAL4117FRAAL4118 FRAAL4136FRAAL4137(K03088) FRAAL1417(K00140)  FRAAL5864    FRAAL6466(K02003)
fri FraEuI1c_2649FraEuI1c_2648FraEuI1c_2647FraEuI1c_2646FraEuI1c_2645(K03088) FraEuI1c_5929(K00140)  FraEuI1c_0996  FraEuI1c_0585 FraEuI1c_3759
dmat  Dmats_12900(K03651) Dmats_23995Dmats_24000(K03088) Dmats_12605(K00140) Dmats_18860     Dmats_45460(K02003)
dvc  Dvina_13350(K03651) Dvina_28735Dvina_28740(K03088) Dvina_13045(K00140) Dvina_23325Dvina_28260    Dvina_50870(K02003)
kbs   EPA93_41260EPA93_28445EPA93_28450(K03088) EPA93_46870(K00140)  EPA93_07875 EPA93_35235 EPA93_35230(K01652)EPA93_01470(K02003)
kbbccbrp13_17800ccbrp13_29290 ccbrp13_47410ccbrp13_67110ccbrp13_67120(K03088)         ccbrp13_70640(K02003)

[ SSDB | GENES | KEGG2 | KEGG | GenomeNet ]