Breviolum minutum: v1.2.016998.t1
Help
Entry
v1.2.016998.t1 CDS
T04349
Symbol
symbB.v1.2.016998.t1
Name
(OIST) -
Organism
smin
Breviolum minutum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
IBN_N
FANCI_HD2
OSCP
Motif
LinkDB
All DBs
AA seq
1731 aa
AA seq
DB search
MAEEVDQLLNLLQSSSNVARQQAEAQLEAWCQNPNFLTVMMSRTLQATSLPSRQLAASIL
SWRLPRAWPTLSETDARRLQAGLLECFLSCNELPVLKALGEACNALCQSIAVSHNTMWQE
LLGAIGQCLSQDALHRRAALEVLASLVRSMGARLHSHYPEIGTTLAACVKDVDLRVRIAA
LGVVGVAASSWCSSPEDVYPLMATFASATPRVSAKPRGDGKDALRIWTASISAAGKAKAW
QKALHLLHDGQSKRLPPNVIANNAAVSACEKATQWPMAVALLESCDIQGWNGAISACSKA
MAWRMALHLFGELDHRGLQRDAVNWGLRIACEAPRRWQDALASLAMMRQAALEANVLNFS
ALLRGCKDSSAWEAAVALLQEMFVKGPAPDVLAANTVIGAKPPWNIALALLEQMESKFLL
PTTSTVNAVIQTLGQAGEWPMMLILMSQLRTRELSLDEVTYVNVLTALGRSKRRDIASQL
MKEVLRSEPAWRHGRSGGNVFSAAVAAVTWEEALEVFNDMARCELRLQSREFNAAMFTAS
EGTWTASFHLYDLMTWHHLQPNVISLTTLLQARQEERAWDMALDLFWRSNIQPNVMSVAE
LSQSFTSSSWMQSVQLLNRAHAQRLADEGVQNLCLRLADSWSRCLAHHGALQTLLRKACN
ANQWAYACSSAFGETFAVQETLRQHLADAGPWEVAIQGVDLSDAKVFFPRSLDSWSQSLA
FFHTFLHRSVRPDASASVSATSAAGRWREALLLREVTDVSDAMKHILQVLAETRHFDQLQ
GILEEEMSGVPMPRAWSAVLYKSYGELCRKQQWNDAVTLLSCLSTVQLEPTLLSQNLLLG
AWQKTGLWSKILDSLDLELPRRGYLPDIFTYGSALAASRMGGWQRSLEQLANLQRQSLKL
SEVALAAMVATQEKAYHWRLALHLSKDFREELSIIACSSAVGACENLGQWRHACDLLDYT
SSLHLRQDVILINSAASAASAAENSAWSRTLAMLGPLEDRAGTSLALNAWGKGNAWPASL
RLMDWAMVNEVQVDVPACSLVVTSCSRALHALGVLKLLQRFSDDLPSWHGAADATLEVAV
SALGSSEREAPEVLVAALRALGRLVVELQSEALRTASLQLVCRVLPGCSSNPNVEACQIQ
ALQLLRALAKSEPMLLSTQQGQGAVATTFAAAKDAAPSVDDLDEVSTTAVAARECLRALA
RANASHVLPVVLEAAQAASASADALDRAAAVHAVAFALCGAREAPGGWAVPLARALNDSA
VWVRQAACEGAMLLAEELKPSTPTTQGLELLLDTLMKLLPHEPNLELLEKAAIAASAILQ
ELSTDEAASFLPAAAPAIFQAMAKVSHALAGAANGDAAQVELREQALIGGAALAALAQAL
TSLASVTTDHFAPWAPEGAKSLTALAGAGPTWPRCDHKDSEAWRAACLSAVDGRAHDGTA
PPAHQRLMPAPGKIKAVLQELLEQVCRTPTCRQARRKMLLDMLRLTPWEHVGSVLKAYVC
LPDVWTGWHERGLAQPLAWASHEERFAGITSTCTKSSNLGAAGAGAVEQEDNFQQELEAY
LDMMEEGAGRGTPQNTAVQGVGFTIDYLTLVVLPGFFRGSDSMGLKLLSTIVVESRGAPM
LAAPVRPAVLAACLDAAGAVIASAWADRSFQSEKEELAAAAQSVLLDSHAPSEARASSHN
FYARVALAQFEDFAPSLDTVMPPALEALAAPETGEVVKHGRSRAVRTGAHE
NT seq
5251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttttgatgtcctttcaaacaagggaaacaaaaaccatggcgtgacaccccattttgcaat
ggcagaggaggttgatcaattgctgaatttgctgcagtcttccagcaatgtggcccgtca
acaagcagaagcacaactggaggcctggtgtcagaatcccaacttcctcacggtaatgat
gagtcgtactttgcaagcaacaagtttgccttcacgacaattagctgccagcattctctc
atggaggttaccccgcgcctggccaaccttgtccgagaccgacgcccgacggctgcaggc
agggctcctggagtgttttttatcctgcaatgagttgccggtgctcaaagcccttggcga
ggcttgcaatgcgctatgtcaatccattgcggtgagtcacaataccatgtggcaggagtt
gttgggagctattggtcaatgccttagtcaagatgctttgcatcgtcgagctgcgttaga
ggtgttagcctctttggtgcgttccatgggagcccggctgcatagccattacccggagat
tggaaccaccctggctgcttgtgtgaaggatgttgatctccgggttcgcattgcggctct
gggtgtggtaggtgtggctgcatcctcatggtgttcttcgccagaggacgtgtaccccct
gatggccacattcgcgtcagcaacgccgcgtgtgtcagccaagccgcgtggtgatgggaa
agatgctttgaggatttggacggcttccatctctgctgctggaaaagccaaagcttggca
gaaggccctacacttactgcacgatggccaaagtaaacgactgccaccaaacgtcatcgc
caacaatgctgcagtgagtgcttgtgaaaaggcgacacaatggcctatggctgtggcctt
gctagaatcttgcgatatccaaggttggaatggtgccatctcagcttgctccaaggccat
ggcttggcgtatggcattgcatcttttcggcgaattagatcatcgtggtctgcaacgtga
cgccgtgaattggggcttgcgtattgcatgtgaggctccccgtcgctggcaagatgcatt
ggcatccctagcgatgatgcgccaggcagctttggaagccaatgtgctcaacttctcggc
tttgctgaggggatgtaaggactcgagtgcttgggaagcagctgtggcattgctccaaga
aatgtttgtgaaaggtcctgcgccggacgtcttggcagccaatacagtcattggtgctaa
gccgccgtggaacattgctctagccctcttggaacagatggaatcgaagttcttgctgcc
gaccacctcgacggtcaatgcggtgattcaaactttaggtcaggctggtgaatggcccat
gatgttaattttgatgtcccagctgcgcactcgcgagttgagtttggatgaggtcaccta
tgtcaatgtgctcacagctcttggccgtagcaaaaggcgtgacatcgcctcacaactcat
gaaagaggtccttcggtcagaaccagcttggaggcatggtcgtagtggaggcaatgtctt
cagtgctgccgttgcagcagtcacatgggaggaagcattggaggttttcaacgacatggc
aagatgtgagttgcgcttgcaaagtcgagaattcaatgcagccatgttcaccgcctccga
aggtacgtggacggcatctttccatctctatgacttgatgacatggcatcatttacagcc
caacgtgattagcttgaccaccttattgcaagcacgacaggaagaacgagcttgggacat
ggcgttggatcttttttggcgttccaacattcagcccaacgtgatgagtgtagcagagct
gtctcaaagtttcaccagcagcagttggatgcaaagtgtgcaacttctgaatcgtgctca
tgcacaacgtttggcagatgagggcgtccaaaatttgtgccttcgtttagctgattcctg
gtcgcgttgcttagcacaccatggagctttgcagacattgcttcgcaaggcctgcaatgc
caaccagtgggcttatgcttgcagcagtgcttttggggagacgtttgcagttcaagaaac
tcttcggcaacacctggctgatgcaggcccttgggaggtggcaatacaaggcgttgacct
ttccgatgccaaggtgttctttccacgttcgttggacagttggtcgcagtcactcgcgtt
tttccacaccttcctccaccgctcggtacgtcctgatgcttccgcttccgtttcggccac
ttcagcggcgggacgctggcgagaggcattgctgctgcgggaggtgacagatgtttcgga
tgccatgaaacatatcttgcaggtgctggccgaaacgcgacactttgaccagcttcaggg
catcttggaagaggagatgtcgggtgtgccaatgccacgtgcttggtcggcggtgctgta
caagagctatggcgagctttgtcgtaagcagcaatggaacgacgccgtgactctcctcag
ttgtttgtcaaccgtgcagctcgaaccgacccttctgtcgcagaatctgcttttgggtgc
ttggcaaaagactggactttggtccaaaatcttagattccttggatctagagttgccgag
gcgtggttatctcccagacatcttcacctacggttcagcattggctgcatcacggatggg
tggatggcaacgcagccttgaacagttggcaaatctgcaacgtcaatcgttgaaattgag
cgaagttgccttagcagcaatggtggccacacaagagaaagcctatcactggagattagc
attgcatttgtcgaaggattttcgtgaagaattaagtatcatcgcctgtagcagtgctgt
gggagcttgtgaaaatttgggacaatggcgtcacgcatgtgatctattggactatacatc
cagtctccaccttcgtcaagatgtgattttgatcaactcggctgccagcgctgccagtgc
agcggaaaactcagcttggagtagaacccttgcaatgctgggtcctttggaagaccgtgc
tggaaccagtttagcattgaatgcatggggaaagggaaatgcatggcctgcctcgttgcg
attaatggattgggccatggtcaatgaggtgcaagtagatgtacccgcctgcagtttggt
ggtcacttcttgcagccgtgcgttgcatgctttgggtgtcttgaagttgctccaacgatt
ctccgatgacttgcccagttggcacggagcagcagatgcaaccttggaggtggccgtgtc
agcattaggcagctccgaacgtgaagctccagaggtcttagtggctgctcttcgcgcctt
agggcgtttggtagttgagttgcagtcggaggcgttaagaaccgcttccttgcaactagt
gtgccgtgtgttgcctggatgttccagtaatcccaatgtggaagcatgtcaaatccaggc
tctacagctcttgcgagcgttggccaaaagtgaacccatgttgttatccactcaacaggg
tcaaggtgccgttgccaccacctttgctgcggccaaagatgctgcgccctcggtggatga
tctcgacgaggtgagcactactgctgtggccgcgcgggaatgtctaagggccttggctcg
ggccaatgcgtcccatgtgttgccggtggttttggaggcagcccaagccgcatcggcaag
tgcagatgcattggaccgtgcagctgcagtacatgcggtggcttttgctttgtgtggtgc
acgcgaggctcctggaggttgggcagttccattggcacgcgccttgaacgactccgccgt
ctgggtgcgtcaggcagcttgtgagggtgctatgctcctggcagaggagttaaaaccatc
cacaccgacaacccaaggtttagaactcttgctcgacaccttgatgaaactcttgccaca
tgaacccaacttggaactcttggagaaggctgccattgctgccagtgccattctgcaaga
gttgtccaccgatgaggctgcttcattcttgccagcagcagcaccagccatttttcaggc
gatggccaaagtgtcacacgcactggctggagctgcaaatggtgatgctgctcaagtgga
gttgagggaacaagctctcataggtggtgcagccttagctgctttggcacaggctttgac
cagcttagccagtgtaaccacagatcactttgcaccgtgggctcctgaaggggcaaaaag
tttaaccgctttggcaggggccggtcctacgtggccacgttgtgatcataaggatagtga
ggcctggagagcagcttgcctctccgcagttgatggcagagctcatgacgggaccgctcc
gccagctcatcagcgcctgatgccagcgcctggcaagatcaaggcggtcttgcaggaatt
gcttgagcaggtttgccgcacaccaacttgccgccaggctaggcgaaagatgctcctcga
catgctccgcttgacgccgtgggagcatgtcggctctgtgctgaaggcctatgtttgttt
acctgatgtgtggactggatggcacgaacgtgggctggcccagcccttggcctgggccag
ccacgaagaaaggtttgctggtattaccagcacctgcaccaaaagcagcaacctgggcgc
tgctggcgctggcgctgtcgagcaggaggacaacttccagcaagagctcgaagcctacct
cgacatgatggaagagggtgcaggccggggcacgcctcagaacactgcagtacaaggtgt
tggtttcaccatagactacctcacattggtcgtgctgccaggtttttttcgtggctcaga
tagcatgggactcaagttgctatcaactatagtggttgagtccagaggtgctccaatgct
ggctgcacctgtgagacctgcagtcttggcagcctgcctcgatgctgcaggtgcagtgat
cgcctcggcctgggcagatcgatcctttcaaagtgaaaaggaggaattggctgctgcagc
ccaaagtgtgctgctagatagccatgcacctagcgaggcaagagcgagttctcacaactt
ctatgctcgagtggcgttagcccagttcgaagactttgcgccctcgttggacacggtgat
gcctccagcgctggaggctcttgctgcccctgaaacgggtgaagtggtgaagcatggccg
atctcgggccgtgcgaaccggtgctcatgag
DBGET
integrated database retrieval system
