Paracholeplasma brassicae: BN85316060
Help
Entry
BN85316060 CDS
T03095
Name
(GenBank) ABC transporter related protein
Organism
abra
Paracholeplasma brassicae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
SMC_N
AAA_21
ABC_membrane
AAA_29
AAA_22
RsgA_GTPase
ATP-synt_ab
MMR_HSR1
TsaE
Zeta_toxin
AAA_16
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCV66627
UniProt:
U4KQ27
LinkDB
All DBs
Position
1771256..1773022
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MRTIKNFLFVLKEIYVLQKSYLVVNFFYVVFASMKPISSALVIKIVIDGLIEDVELRENL
NVILLYLLLISSIEILQTILGKYLNEILSTKLKDKLKLKFCDKVKHIDNSAYENPEYYNV
MTRTMANGDSRYIAVSDTFFNFFGSILVITGLTSLIIVLNITLIYSVLIFVVLKIIISSL
IKKLTFDEYISLTRSNRYIDYFTRLFRLPTFINEIKLFPLEDVIRQKHIDESNQRLLMKM
KFKGKQNIYNVLNNVIDVSFMGFVIIFLVIEIGNNRSSVGDFAALMNSTQQLGMSLVSFL
LIIPNLKEHNRYINDMKSFLEYKGEIETNNGENLTTIDKIEFKDVSFCYPNTQSNSLNNI
NITIHKGSKIALVGHNGAGKSTLIKLILRFFDPVTGVILINDKNLKLYNANSYRNHFGVI
FQNYQVYSLSIEENILLRTINSDERIDVLWESLNLVELADKVNSLPLKEKTILSKEFSEQ
GTILSGGEQQKVAIARLYSINKDVVILDEASSALDPYTEHKINNMLLDSFKDKTVIIISH
RLSITKNVDKIFMIENGNIIEQGNHKELIKMSGGKYAEMYNLQANNYK
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagaacaattaaaaatttcttgttcgttttaaaggaaatatatgtattacaaaaatca
tatttggttgttaattttttttacgtggtttttgcttccatgaagcctattagttcagcc
ttagtaataaaaattgtaatagatgggttaattgaagatgttgagttaagggaaaattta
aatgtaattttactttatctcctattgatttcttcaatagagatactacaaacaatacta
ggaaaatacttaaacgagattttatccacaaaattaaaggataagttaaagttaaaattt
tgtgacaaagtcaaacatattgacaactcagcttatgaaaaccccgagtattacaatgta
atgactagaactatggcaaatggggattctagatatatcgctgtatcggatacattcttt
aattttttcggaagtattttggtgattactgggttaacctcactaatcatagtattaaat
ataacgttaatatattctgtactgatttttgtagtccttaaaataataatctcctcatta
ataaagaagttaacatttgatgagtatatcagcttgacaagaagtaatcgatacattgac
tattttactagattatttagattaccgactttcattaatgaaatcaagttatttccttta
gaggacgttattagacaaaaacatatagatgaaagtaaccaacgattattaatgaagatg
aaatttaaaggtaaacaaaatatatataatgtattaaataatgttatagatgtatctttt
atgggattcgttattattttcttagttattgaaatcggtaacaatagaagtagtgtcggt
gattttgcagcattaatgaactcaacgcaacaattagggatgtcattagtgtcttttcta
ttaattataccaaacttaaaggaacacaataggtatattaatgatatgaaaagcttctta
gagtataaaggtgaaatagaaactaataacggcgaaaatttaacgacaattgacaaaatt
gaatttaaagatgtatctttttgctatccaaatactcaatcaaattcactaaataatatc
aatattactatccataagggtagtaaaattgcacttgttggtcataatggggcgggaaaa
tccactttaatcaaattgattttaagattttttgatccagtaactggtgttatactaata
aatgataaaaatttaaaattatataatgcaaatagttaccgtaatcactttggggttatt
ttccaaaactatcaagtttattcattatcaatagaagaaaatatattattaagaactatt
aatagcgacgaaagaatcgacgttttatgggaatcattaaacttagtagagttagcagac
aaagtaaacagtttacctttgaaggaaaaaactattttatcaaaagaatttagtgaacaa
ggcactattttatctggtggggaacaacaaaaagttgcaattgctagactttattcaatc
aataaagatgttgtgatcttagatgaagcatcgagcgctctggatccatatacagaacat
aagattaataatatgcttttagatagttttaaagataaaaccgtaattattatatctcat
agattgtcaatcacaaaaaacgttgacaagatatttatgatagaaaacggtaatattatc
gagcaaggtaatcataaagagttgataaaaatgtcaggaggtaagtatgctgaaatgtat
aacttacaagctaataattataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system