Aliarcobacter cryaerophilus: ACRYA_0018
Help
Entry
ACRYA_0018 CDS
T06825
Name
(GenBank) putative surface adhesion protein
Organism
acre
Aliarcobacter cryaerophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LapA
Cadherin_C_2
DUF5462
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYJ79195
LinkDB
All DBs
Position
15673..24072
Genome browser
AA seq
2799 aa
AA seq
DB search
MANLAQIQSIAQGQFFVKDSLGNLTELKVGDTVSLNDTIVAANSNTDLSKIEILFDTNEL
ITLSQGEQLLDATLLASTFGNEELAFDKQEVDETLSAWNNTEASDEADMETAAGDVTEQA
TNAGDERAADGGALRSKFNSRTGDSTDVRSDLRDTSFGEGNPENPQEQIPTELLNPVGAT
TPVDTRVPVSVITLSDPTINEGNQITITATVTNAPQTDLIITLNNGQTITIPAGQTTSSV
TFDNPNSEDVYIDKSTETYTITGTTGGNYVSLDTSDSSVVTIEDTEDTTTVKITGTDTTE
GGKATFELELSNKPQTGTTVTGKVEVDGKSYDVTFDADGKATLTVDVKANDVYNGEPTLT
AKVTEISGGNFEKVNPNAQTTITVKDTEDTTTVKITGTDTTEGGKATFELELSNKPQTGT
TVTGKVEVDGKSYDVTFDADGKATLTVDVKANDVYNGEPTLTAKVTEISGGNFEKVNPNA
QTTITVKDTEDTTTVKITGTDTTEGGKATFELELSNKPQTGTTVTGKVEVDGKSYDVTFD
ADGKATLTVDVKANDVYNGEPTLTAKVTEISGGNFEKVNPNAQTTITVKDTEDTTTVKIT
GTDTTEGGKATFELELSNKPQTGTTVTGKVEVDGKSYDVTFDADGKATLTVDVKANDVYN
GEPTLTAKVTEISGGNFEKVNPNAQTTITVKDTEDTTTVKITGTDTTEGGKATFELELSN
KPQTGTTVTGKVEVDGKSYDVTFDADGKATLTVDVKANDVYNGEPTLTAKVTEISGGNFE
KVNPNAQTTITVKDTEDTTTVKITGTDTTEGGKATFELELSNKPQTGTTVTGKVEVDGKS
YDVTFDADGKATLTVDVKANDVYNGEPTLTAKVTEISGGNFEKVNPNAQTTITVKDTEDT
TTVKITGTDTTEGGKATFELELSNKPQTGTTVTGKVEVDGKSYDVTFDADGKATLTVDVK
ANDVYNGEPTLTAKVTEISGGNFEKVNPNAQTTITVKDTEDTTTVKITGTDTTEGGKATF
ELELSNKPQTGTTVTGKVEVDGKSYDVTFDADGKATLTVDVKANDVYNGEPTLTAKVTEI
SGGNFEKVNPNAQTTITVKDTEDTTTVTLTATAEVNEDNNHEVDGVYIGNAITYTAKLPD
GVTANNAITVTLSVGANGEPASDTNPALTITIPKDGNSGTVIADKVNRDNNDGSGEDKYI
ESDSLSAKITGVSEANAGSSGSFENLTFDDTPAVTNILNDEDAVDVTITATVTTPKIIDV
TTVTDGTTGVKVTGYNSDGKETDLSIIKGTNHDGFGVEGTNLSNGDTKELGVEEKIVVEF
TDGKDVNSLDVSFAWRNNHETAKLTFVKDGQVVGYATVDGDGSSTTKAIVKYYDENNNLI
KTQEAEGSSDRVDKAFTFELPDSNGGIVSFDKVEFSAPQNKDDYLINKIVYKEVLNPEVT
DIVTNGGDITFNIQVDENYPPQGTATATVEVNGKEYSVELNSTGRGTLTIDSKELGDLSN
IVAKVVKVEGGNYEKVNPTEASFNFTPTLKSTDDSISTDEDVSYTLKVTDLGEVSSNTKE
FKITELPTNGKLFLNITVGDTIFNPDGTQTVATEDIKVEITKDQIVTLGQVGAGKVEFVP
NKDTDIDSSFNFQVGDGNGKFSTEYTTTIDVKAVADAPIVSIDVTKIGATTIVVDGDTGN
SNNDGNNSIGGIVTENFWEGYNSKEDIMTNSTHNENSIGWQNPFTSNSDNVDIKGNQTQW
IDTQDGNDNVYISENAGGINTGNGDDRVFIKGNVTNNINLGSGNDELHIKGNSSTIDAGD
GDDKVKIEGNANNDIQLGAGNDSLEIKGNASSISTGDGNDKIKIEGNSNGTIELGSGNNY
LEIKGNATSIQVGGDSGNDRVIVNGNATNNISLGKGDDYLELGGKILNYVDGGEGNSDSV
YLKGYTLTEYQALIANGNEWRVKNFENIKLGDGTIVKGDGSVFETSKPENIIKAVAYKVD
ISASLKDIDGSETLSVVIKNVPTGAVLESTKYDVSKNSDGSWSVNFKAGTTGDALLKIED
SLTMKVPQSYKGDINLQIEAKATETNDNTDGNNFATATANDTIKTVTIEPFKAELDMELS
SATTNTITTKDVNKTATEQAGIKLGADGKYYETKVVSKTETVVDTEALKDLTVTINGKTY
TGITVGADGKYYVIDNTIAKEQKTIEVEREVTKTVSLTDKQVESFMIEVTKETKGIVLGK
EVTDLGKNDTITKNNYKTYTLEQPTSNIEIKLSSGSGKIEFVDSNGKVIGSSTTQSGIDS
KGYSVPKDAVGVKITSTSTSLKIEAIKYHVDPHEETVQVGGKILDVEGMQKAGISWSSTV
SEKQVQTQDITKLGSTVGDGNIKGFNPEAKANSQVFDFGKDKAFQKVIIEVDATISGTWN
FNKDSTKDVFVVSANGVPQGAYNFSSNQDYSNQASFDKNIEKDNPNDFDVKYVNGTLSQK
YTYEVYLDENGKAQMNFTVASTNTDEWVTITEVRATYDGLSGFVQTKTEIEKVTETIFVG
VPTKIVYTGEVPTKEITKYETVQVETTPIYTKITQYEYELDLSASITVGSGELSIITLKD
IPSGVTIKGYEANEDGSYTIKIGEDGKSQLTLVSDNLLNDADKESIKANISATSEDGHQN
GDIEVNINGEISNSINIIGTDNDDDISLNIDNATSINIDGGVGYDTIKLEENNDIDFSNL
GNLIKNIEAIDLTDGNHKLTNITLDDVLKMSGDDNKIKITGDEFDSVSFKNTISEDGKEQ
SWSKTAGEGVDKGFDIYVNSGDPTLQVKVEQPISDGITN
NT seq
8400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatttagcacaaatacaatcaattgcacaggggcaatttttcgtaaaagattct
ctaggaaatttaactgagttaaaagtaggtgacactgtatctttaaatgatacgatagtt
gctgcaaactcaaatacagatttatcaaaaatagaaatactttttgatacaaatgaacta
ataacactaagtcaaggtgaacaacttttagatgctactttattagcaagtacttttgga
aatgaagagttagcatttgataaacaagaggtagatgaaactctaagcgcttggaataat
acagaagctagtgatgaagcagatatggagacagcagcaggtgatgtaacagaacaagca
acaaatgctggtgatgaaagagctgctgatggaggagctttaagaagtaaatttaactca
agaactggtgattcaactgatgtcagaagtgacttaagagatacttcttttggtgaagga
aatcctgaaaatcctcaagagcaaattccaactgagcttttaaatccagttggtgcaaca
actccagtggatacaagagttccagtttctgtgattactttatcagacccaactataaat
gaaggtaatcaaataactattacagcaactgttacaaatgcaccacaaacagatttgata
atcacattaaataatggacaaactataactataccagctggacaaacaactagtagtgta
acatttgataatccaaatagtgaagatgtttatattgataaaagtacagaaacttacaca
attacaggtactacaggtggtaactatgttagtttagatacaagcgatagttcggttgtg
actatagaagatacagaagatacaacaacagtaaaaattactgggacagatacaacagag
ggtggaaaagcaacatttgaattagaactttcaaataaaccacaaacaggaacaactgta
acaggaaaagtagaagtagatggaaaatcttatgatgtaacatttgatgcagatggaaaa
gcgacattaactgtagatgtaaaagcaaatgatgtttataatggagaaccaacacttact
gcaaaagtaacagaaataagtggtggaaactttgagaaagtaaatccaaatgcacaaaca
acaataacagtaaaagatacagaagatacaacaacagtaaaaattactgggacagataca
acagagggtggaaaagcaacatttgaattagaactttcaaataaaccacaaacaggaaca
actgtaacaggaaaagtagaagtagatggaaaatcttatgatgtaacatttgatgcagat
ggaaaagcgacattaactgtagatgtaaaagcaaatgatgtttataatggagaaccaaca
cttactgcaaaagtaacagaaataagtggtggaaactttgagaaagtaaatccaaatgca
caaacaacaataacagtaaaagatacagaagatacaacaacagtaaaaattactgggaca
gatacaacagagggtggaaaagcaacatttgaattagaactttcaaataaaccacaaaca
ggaacaactgtaacaggaaaagtagaagtagatggaaaatcttatgatgtaacatttgat
gcagatggaaaagcgacattaactgtagatgtaaaagcaaatgatgtttataatggagaa
ccaacacttactgcaaaagtaacagaaataagtggtggaaactttgagaaagtaaatcca
aatgcacaaacaacaataacagtaaaagatacagaagatacaacaacagtaaaaattact
gggacagatacaacagagggtggaaaagcaacatttgaattagaactttcaaataaacca
caaacaggaacaactgtaacaggaaaagtagaagtagatggaaaatcttatgatgtaaca
tttgatgcagatggaaaagcgacattaactgtagatgtaaaagcaaatgatgtttataat
ggagaaccaacacttactgcaaaagtaacagaaataagtggtggaaactttgagaaagta
aatccaaatgcacaaacaacaataacagtaaaagatacagaagatacaacaacagtaaaa
attactgggacagatacaacagagggtggaaaagcaacatttgaattagaactttcaaat
aaaccacaaacaggaacaactgtaacaggaaaagtagaagtagatggaaaatcttatgat
gtaacatttgatgcagatggaaaagcgacattaactgtagatgtaaaagcaaatgatgtt
tataatggagaaccaacacttactgcaaaagtaacagaaataagtggtggaaactttgag
aaagtaaatccaaatgcacaaacaacaataacagtaaaagatacagaagatacaacaaca
gtaaaaattactgggacagatacaacagagggtggaaaagcaacatttgaattagaactt
tcaaataaaccacaaacaggaacaactgtaacaggaaaagtagaagtagatggaaaatct
tatgatgtaacatttgatgcagatggaaaagcgacattaactgtagatgtaaaagcaaat
gatgtttataatggagaaccaacacttactgcaaaagtaacagaaataagtggtggaaac
tttgagaaagtaaatccaaatgcacaaacaacaataacagtaaaagatacagaagataca
acaacagtaaaaattactgggacagatacaacagagggtggaaaagcaacatttgaatta
gaactttcaaataaaccacaaacaggaacaactgtaacaggaaaagtagaagtagatgga
aaatcttatgatgtaacatttgatgcagatggaaaagcgacattaactgtagatgtaaaa
gcaaatgatgtttataatggagaaccaacacttactgcaaaagtaacagaaataagtggt
ggaaactttgagaaagtaaatccaaatgcacaaacaacaataacagtaaaagatacagaa
gatacaacaacagtaaaaattactgggacagatacaacagagggtggaaaagcaacattt
gaattagaactttcaaataaaccacaaacaggaacaactgtaacaggaaaagtagaagta
gatggaaaatcttatgatgtaacatttgatgcagatggaaaagcgacattaactgtagat
gtaaaagcaaatgatgtttataatggagaaccaacacttactgcaaaagtaacagaaata
agtggtggaaactttgagaaagtaaatccaaatgcacaaacaacaataacagtaaaagat
acagaagatacaacaacagtaactttaacagcaacagcagaagtaaatgaagataataat
catgaagtagatggagtttatataggaaatgcaattacatatacagcaaaacttccagat
ggagtaacagcaaataatgctataacagtaacattaagtgttggagctaatggagaacca
gcaagtgatacaaatcctgcattaacaattacaattccaaaagatggtaattcaggaact
gtaatagcagacaaagtaaatagagataataatgatggaagtggtgaggataaatatatt
gaatctgattcattatctgctaaaattactggtgtaagtgaagcaaatgcaggaagtagt
ggaagctttgagaatttaacattcgatgatacgccagcggttacaaatatactaaatgat
gaagatgctgttgatgtaacaattactgcaacagttacaacaccaaaaattatagatgta
actactgtaactgatggaacaacgggagttaaagttactggatataatagtgatggtaaa
gaaacagatttatcaataattaaaggtacaaaccatgatggatttggagtggaaggtaca
aacctttcaaatggagatacaaaagagttaggagtagaagaaaaaattgttgttgaattt
acagatggtaaggatgtaaactctcttgatgtctcttttgcttggagaaataaccatgaa
acagcaaaacttacatttgtaaaagatggacaagttgttggttatgctacggttgatggt
gatggttctagtactacaaaagctattgttaaatattatgatgaaaataataatttaata
aaaactcaagaagctgaaggaagttcagatagagttgataaagcatttacttttgagtta
ccagattcaaatgggggaatagtatcatttgataaagttgagttttctgcaccacaaaat
aaagatgattatttaatcaacaaaattgtttacaaagaggtattaaatcctgaggtaact
gatattgtaacaaatggaggagatataacatttaatattcaagtagatgaaaattatcct
cctcaaggaacagcaacagctactgttgaagtaaatggaaaagaatactctgttgaatta
aattcaacaggtagaggaactttgactatagattctaaagaattaggagatttatcaaat
attgttgcaaaagtagtaaaagtagaaggtggtaattatgaaaaagttaatcctacagaa
gcgagttttaattttacacctactttaaaatctacagatgatagtatatctacagatgaa
gatgtatcttatactcttaaagtaactgatcttggtgaagtttcctcaaatactaaagag
tttaaaatcactgaattaccaacaaatggaaagttattcttaaatattacagtaggtgat
acaatatttaatccagatggaactcaaacagtagctactgaggatataaaagttgagatt
acaaaagatcaaattgttactttaggtcaagttggagcaggaaaagttgaatttgtacca
aataaagatacagatattgatagtagctttaatttccaagttggtgatgggaatggaaaa
tttagtacagaatacacaacaactattgatgtaaaagcggttgctgatgcaccgattgta
agtattgatgtaacaaaaattggagctactacaatagttgttgatggagatactggaaat
tctaataatgatggaaataatagtataggtggaatagttactgaaaacttctgggaaggt
tataatagtaaagaagatattatgactaattcaactcataatgaaaatagtataggatgg
caaaatccatttactagtaatagtgacaatgttgatataaaggggaatcaaacacaatgg
atagatactcaagatggaaatgacaatgtatatatctctgaaaatgctggtggtattaat
acaggaaatggagatgatagagtatttataaaaggaaatgtaactaataatattaattta
ggttcaggaaatgatgaattacatattaaaggaaattcttcaacaattgatgctggagat
ggtgatgataaagtaaaaattgaaggcaatgcgaataatgatattcaacttggagctgga
aatgatagcttagaaattaaaggtaatgcttcatctataagtactggtgatggaaatgat
aaaataaaaattgaaggtaattcaaatggtactattgaattaggtagtggaaataactat
ttagaaatcaaaggaaatgctacttctattcaagttggtggagattctgggaatgataga
gttatagttaatggaaatgcaacaaacaatatcagtttaggaaaaggagatgactattta
gagttaggtggaaaaattctaaattatgttgatggaggagaaggaaatagtgattcagtt
tatttaaaaggatacactcttactgaatatcaagctttgatagcaaatggtaatgaatgg
agagttaaaaattttgaaaatataaaactgggtgatggaactattgttaagggagatggt
agtgtattcgaaacttcaaaaccagaaaatattataaaagcagttgcttataaagtagat
atttcagcatctctaaaagatatagatggaagtgaaactttaagtgtagttatcaaaaat
gtaccaacaggagctgttttagagagtacaaaatatgatgttagtaaaaattcagacggt
tcttggagtgtaaatttcaaagcaggaactactggagatgctttattaaaaattgaagat
tctcttactatgaaagttccacaaagctataaaggggatattaaccttcaaatagaagca
aaagcaactgaaacaaatgataatacagatgggaataattttgcaactgctacagcaaat
gatactattaaaactgtaacaatagagccatttaaagctgaattagatatggagttaagt
agtgcaacaactaatactataacaactaaagatgttaataaaactgcaacagaacaagct
ggtattaagttaggagcagatggtaaatattatgaaactaaagtagtaagtaaaactgaa
acagtagtagatactgaagctttaaaagacttaacagttacaattaatggtaagacttat
actggtattacggtaggtgcagatggtaaatattatgttatagataatactattgcaaaa
gagcaaaaaactatcgaagttgaaagagaagttactaaaactgtttcattaacagataaa
caagttgaaagctttatgatagaagtaactaaagagacaaaaggtattgttcttggaaaa
gaggttactgatttaggaaaaaatgatactataactaaaaataattataaaacttatact
ttggaacaaccaacttcaaatatagaaataaaactttcgagtggttcaggaaaaatagaa
tttgtagattcaaatggaaaagttattggaagttctacgactcaaagtggaatagattca
aaaggttatagtgtaccaaaagatgctgttggagtaaaaattacaagtacaagtacaagt
ttaaaaatagaggctattaaataccatgtagatccacatgaagagactgtacaagttggt
gggaagatacttgatgttgagggtatgcaaaaagctggaattagctggagtagtactgta
agtgaaaaacaagttcaaactcaggacataactaaattaggttcaacagttggagatggt
aatatcaaaggatttaatccagaagctaaagcaaatagccaagtttttgattttggaaaa
gataaagcattccaaaaagtaattatagaagtagatgcaactatttcaggaacttggaat
tttaataaagattctacaaaagatgtttttgttgttagtgcaaatggagttccacaaggt
gcttataatttttcatcaaatcaagattatagcaatcaggctagttttgataaaaatata
gaaaaagataatccaaatgattttgatgtaaaatatgtaaatggaacattaagtcaaaaa
tatacttatgaagtatatttagatgaaaatggtaaagctcaaatgaacttcacagttgct
tcaacaaatacagatgagtgggtaactattacagaagttagagcaacttatgatggttta
agtggatttgtacaaacaaaaacagagatagaaaaagttactgaaacaatatttgttggt
gtaccaacaaaaatagtgtacacaggtgaagtccctacaaaagagattacaaaatatgaa
actgtacaggtagagactactccaatatatacaaaaattactcaatatgagtatgagtta
gatttaagtgcttcaataactgttggtagtggtgaactatctattattactttaaaagat
attccaagtggagtaactataaaaggatatgaagcaaatgaagatggaagttatactata
aaaattggagaagatggaaaatctcaattaactttagtttctgataatttgctaaatgat
gcagataaagaaagtattaaagcaaatattagtgctactagtgaagatggtcatcaaaat
ggagatatagaagtaaatataaatggagaaatatctaatagtataaatattattggtacg
gataatgatgatgatatttctttaaatattgataatgctacttctataaatatcgatgga
ggagttggttatgatactattaaattggaagaaaataatgatattgatttctctaattta
ggaaatttaatcaaaaatatcgaagctattgatttaacagatggtaatcacaaacttaca
aacattacattagatgatgttttaaaaatgagtggagacgataacaagattaaaattact
ggagatgaatttgatagtgtatcatttaaaaacactatctctgaagatggtaaagaacaa
tcttggtctaaaacagctggagaaggtgtagataaaggatttgatatctatgtaaatagt
ggagatccaacactacaagttaaagttgaacaaccaatttcagacggtattacaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
