Amphritea japonica: AMJAP_2649
Help
Entry
AMJAP_2649 CDS
T06992
Name
(GenBank) signal transduction protein
Organism
ajp
Amphritea japonica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
HAMP
PAS_4
PAS_3
PAS_8
AI-2E_transport
L1R_F9L
SurA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBB27236
UniProt:
A0A7R6PFC1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2992207..2995734)
Genome browser
AA seq
1175 aa
AA seq
DB search
MKYIESTRGKLISIFVLIKVIPLICLAFFAWNAATELGKKVTDRSAEMTDGMFETIQNVG
NIVIDDSTKALDSRSREAIERLTTDTAQAVAKFLYERDQDIRLVALLEPTEQNFRHFFNN
RTRDLYQHGEWALSPDQSHWLAVEDKRFSESPNVKAELKDNAKQFHQREEEFFGQKQSVR
LYQEITLIGLDGVEILKVSSDDGDKKSLIDTSQRLQTFAKAETYWSELQSLQAGEIYVSE
VIGEYVKSSVIGPYIPESVSKAGLDFKPEESAYAGTENPMGKRFQGIVRWATPLLKDGKI
VGYVTLALNHDHIRQFTDRITPTEQRYTQIADSIEGNYAFMWDHKNRSISHPRDYFIHGY
HHETGLPETPWMDSELYQAWQQSKLPSHEFLAGIPYFDQPSLNKKPAKELIRQGTIALDC
RYLNFSPQCQGWDQLTRDGGSGSFVIYFSGLWKLTTAATIPYYTGRYGQSRKGFGFVTIG
ANVDEFHLAAVESGSRISNIITSKIIDYQKQRDALISSIQHRLSVSTLELAISTVILIII
VIAIAIWMANSLTRRITAINDGIQRFHNGDMNHRLPIHSRDEMGRLTASFNAMADTIESN
IEQMSNEIVIRRQNEDQLRVAGVAFETQEGMCITNADNVILSVNQAFTDITGYNPVDVIG
KTPKILRSGEHPQAFYDQIRQEVRNRGQWQGEICCKRKNGEIFPEWLMITTVTDDHGTIT
HYVRALTDISERKASEKHIRQLAYYDSLTKLPNRRMLTERLEQAVMASQRYGREGALLFI
DLDNFKTLNDTVGHHQGDILLQKVAEQLTCLVRKTDTVARFGGDEFIIMLTDLDVNSEVA
MSQISNLSEKILEAQNQYYTFSGFNHHSTLSIGVTVFSDNNKVGIDQLLQQADLAMYQAK
AAGRNTIRFFNPKMQEAASRRAQLETDLHLAIENKQFQLYYQPQVDSDGAVIGSEALIRW
NHPERGMVSPLDFISVAEETGQILSIGLWVLEEACQQLKRWEDAGFGALTVAVNVSARQY
QHPDFVAAVIEILEKTGVKPGSLNLELTESVLSNNIDDVANKMWQLGAQGIGFALDDFGT
GYSSLSYLKKLPLNYLKIDQTFVRDLLTDPNDTAIAQTIIALAQSMSLKVIAEGVETEAQ
RQRLHEFGCHIYQGYLFGKPVPAEELKLEEFMIQD
NT seq
3528 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatattgaaagcactcgcggaaagctgataagtatttttgtcctcataaaggta
attccattaatctgtctggctttttttgcctggaatgcggcgaccgaactggggaaaaaa
gttactgatcgttctgctgaaatgactgatggaatgttcgaaacaatccagaatgttggc
aatattgtcattgatgacagcacaaaagcgctggatagtcgttcaagagaagcgatcgag
cgactcaccacggatacggcgcaagcggttgccaagttcctctatgaaagggatcaggac
atccgtctggtcgcgttgcttgaacccacagagcaaaacttcagacactttttcaataat
agaacgcgagatttatatcagcatggtgagtgggcattatccccagatcaaagccactgg
cttgcggtcgaagataaacgcttttcagagtcgccaaacgtaaaagcagaacttaaagac
aatgctaagcagtttcatcagcgagaggaagagttttttgggcaaaaacaatcggttcgt
ttgtatcaggaaataacgctgatcggcctggatggcgtggagatactcaaagtttctagt
gatgatggcgataaaaaatccttgattgatacttctcaacgcttgcagactttcgcgaaa
gcagaaacttactggtcagagttgcaatcactgcaagcgggtgaaatctatgtttctgaa
gttattggagaatatgttaaaagctcagtcatagggccctatattcccgaaagcgtatcc
aaagctggtcttgattttaagccggaagaatctgcatatgcaggtacagaaaatccaatg
gggaaacgctttcagggtattgttcgatgggctacaccattgctgaaagatggaaaaata
gttggttatgttactctggctttgaatcacgatcatatacgtcagtttactgaccgaatc
acgcctacagaacaacgttacactcagatagcggactcgatagagggtaattacgctttc
atgtgggatcacaagaatcgttctatttcccaccccagagattattttattcatggttat
catcatgaaacaggattgcctgaaacgccctggatggacagtgaactgtatcaggcgtgg
cagcagtcgaagttgccctctcatgaattcctcgctgggatcccttattttgaccagcct
tctttgaataaaaagccagcgaaagaactgattcgtcagggcactatagccctggattgt
cgttatttgaacttctcccctcaatgtcagggctgggatcaactgactcgagatggtggt
tctgggtcgtttgttatctatttcagtgggctttggaaacttaccactgcagccactatt
ccctattataccggccgttatggtcagagcagaaaaggatttggttttgttactattggt
gccaatgtggatgagtttcatcttgcggcggttgaatcaggtagccgtatttcaaatatt
attacctctaagataattgattatcagaaacagcgtgacgcgctcatctcttcgattcaa
caccggcttagcgtttcaacacttgagctggctatctcaacggtaatactcattattatt
gttatcgctatagcgatctggatggctaactcattgacccgtcggatcaccgctataaat
gacggcatccaaagatttcataatggagatatgaatcatcgattgccaattcatagccgg
gatgagatggggcgccttaccgcttcgtttaatgcaatggcagacaccattgaaagtaac
attgagcagatgagcaatgagatcgttatcagacgtcaaaatgaagatcaactcagggtt
gctggtgtggcttttgaaacccaggaagggatgtgtattactaatgctgataacgtaatt
ctcagcgtaaaccaggcatttacggatattaccggctacaacccggtagacgtaattggt
aaaacacctaagattcttcgttcaggcgagcaccctcaagcgttttatgatcagatcagg
caagaagtacgcaatcggggtcagtggcagggagagatctgttgtaaacgtaaaaacggt
gaaattttccctgagtggttaatgattacaaccgttacagatgatcatgggactatcact
cactatgttagggcgctcaccgatatcagcgaacgtaaagcatcagaaaagcatattcgg
cagctggcttattacgactctttaacgaagctaccaaaccggagaatgctcacagaacgt
cttgaacaggcagtaatggcttcacagcgctatggcagagaaggtgctctgttatttatt
gatctagataattttaagacgctgaacgacaccgtaggccatcatcagggtgatattctg
ttacagaaagttgccgaacagttaacctgccttgttcgaaaaaccgatacagtcgcccgg
ttcggcggcgatgagtttattatcatgctgacagatctggacgttaattcagaggttgcg
atgagccagattagtaatctgagtgaaaaaatacttgaagcgcaaaatcaatattacact
ttttcaggtttcaatcaccacagtactctgagtattggcgttacagtgttttctgataat
aataaggttggcattgatcagcttttacagcaggctgacctggctatgtatcaggcaaag
gccgcaggtagaaatacgattcgtttctttaatccgaaaatgcaggaagcggcgagccgg
cgagctcaacttgagactgatctgcatctggcgattgagaataagcaatttcagctttac
taccaaccgcaggtggattctgatggtgctgtgattggatctgaagcgttgatacgctgg
aatcatccggagcgcggtatggtctcaccactggattttatatctgtggctgaagagacg
gggcagattctatctatcggtctatgggttctggaagaagcttgccaacagctgaaacga
tgggaagatgctggttttggcgctttaaccgttgctgtgaatgtcagtgcccgccaatat
cagcatccagactttgtagcggctgtaatagagatccttgagaaaaccggtgtcaagcct
ggcagtttgaatctagagctgacggagagcgttttatctaacaatattgatgatgttgct
aataagatgtggcagctgggtgcacaaggcataggcttcgcactcgacgactttggtacc
ggatactcctctctgagttatctaaagaaattgccacttaactatctgaaaattgatcag
acctttgtccgtgacctactcactgacccaaacgatacggctatcgcacagacaattatt
gctttggcccaaagcatgagtcttaaggtcatcgcagaaggtgtcgaaactgaagcgcaa
agacaacggcttcatgagtttgggtgtcatatctatcagggttacctgtttggtaagcct
gtacctgctgaagagttaaagttagaagagtttatgattcaggattaa
DBGET
integrated database retrieval system