Arabidopsis lyrata (lyrate rockcress): 9315499
Help
Entry
9315499 CDS
T01578
Name
(RefSeq) probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g33170
Organism
aly
Arabidopsis lyrata (lyrate rockcress)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
Pkinase_fungal
APH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9315499
NCBI-ProteinID:
XP_020884076
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MKLRGTMVWWISEFKRGSKSMFGGVLFLLTLMVWTSESLNSDGQFLLELKNRGFQDSLNR
LHNWNGTDETPCNWIGVNCSSMGSNNSDNLVVTSLDLSSMNLSGILSPSIGGLVNLVYLN
LAYNGLTGDIPREIGNCSKLEVMFLNNNQFGGSIPVEIRKLSQLRSFNICNNKLSGPLPE
EIGDLYNLEELVAYTNNLTGPLPRSIGNLNKLMTFRAGQNDFSGNIPAEIGKCLNLTLLG
LAQNFISGELPKEIGMLVKLQEVILWQNKFSGSIPKEIGNLARLETLALYDNSLVGPIPS
EIGNMKSLKKLYLYQNQLNGTIPKELGKLSKVMEIDFSENLLSGEIPVELSKISELRLLY
LFQNKLTGIIPNELSRLRNLAKLDLSINSLTGPIPPGFQNLTSMRQLQLFHNSLSGVIPQ
GLGLYSPLWVVDFSENQLSGKIPPFICQQANLILLNLGSNRIFGNIPAGVLRCKSLLQLR
VVGNRLTGQFPTELCKLVNLSAIELDQNRFSGPLPPEIGTCQKLQRLHLAANQFSSNIPE
EIGKLSNLVTFNVSSNSLTGPIPSEIANCKMLQRLDLSRNSFIGSLPCELGSLHQLEILR
LSENRFSGNIPFTIGNLTHLTELQMGGNLFSGSIPPQLGLLSSLQIAMNLSYNNFSGEIP
PELGNLYLLMYLSLNNNHLSGEIPTTFENLSSLLGCNFSYNNLTGRLPHTQLFQNMTLTS
FLGNKGLCGGHLRSCDPNQSSWPNLSSLKAGSARRGRIIIIVSSVIGGISLLLIAIVVHF
LRNPVEPTAPYVHDKEPFFQESDIYFVPKERFTVKDILEATKGFHDSYIVGKGACGTVYK
AVMPSGKTIAVKKLESNREGNNNNTDNSFRAEILTLGKIRHRNIVRLYSFCYHQGSNSNL
LLYEYMSRGSLGELLHGGKSHSMDWPTRFAIALGAAEGLAYLHHDCKPRIIHRDIKSNNI
LLDENFEAHVGDFGLAKVIDMPQSKSVSAVAGSYGYIAPEYAYTMKVTEKCDIYSFGVVL
LELLTGKPPVQPLEQGGDLATWTRNHIRDHSLTSEILDPYLTKVEDDVILNHMITVTKIA
VLCTKSSPSDRPTMREVVLMLIESGERAGKVIVSTTCGDLPPPAPP
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttgagaggaacaatggtttggtggatctctgagtttaagagaggatcaaaatct
atgtttggtggggttttgtttctcttgacacttatggtttggacttcagagtctttaaac
agtgatggtcagtttcttttggagttgaagaacagaggatttcaagattcgttgaaccgt
ttgcataactggaatggtactgacgagacgccgtgtaattggataggtgtgaattgcagt
tcaatgggcagtaataatagtgataatctggtggtgacatctcttgatttgagttctatg
aatctctctgggatattaagcccgagcattggtggtttggttaacttggtctatcttaat
ctcgcgtataacgggttaaccggagatattcctcgggagattggaaactgttcgaagctg
gaggttatgtttttgaacaataaccagtttggtggttcgattccggttgagattaggaag
ttatcgcagttgagaagttttaacatttgtaataacaagctttcgggtcctttgccagaa
gagattggtgatttatacaacttggaagagcttgtggcttatactaacaacttgaccggt
ccattgcctcgttctataggaaatctcaacaagttgatgacatttcgagcagggcagaac
gatttctctgggaatatacctgctgaaattggtaaatgccttaacttgacgttgctcggt
cttgcgcagaatttcatttctggagagcttcctaaggaaattgggatgcttgttaaactt
caggaggtgattctgtggcagaacaagttttccgggtcaattccgaaagagattgggaat
ttagcacgtcttgagactttggctttatacgataactcattggttggaccgataccatca
gagattggtaacatgaagtccttgaagaagctctatctttaccaaaaccagttgaatggg
acaatcccaaaggagcttggaaagctttccaaagtaatggaaatcgatttctcggagaat
ttgttgagtggtgagattccggttgagctaagcaagatcagtgagttgaggctattgtat
ttgtttcagaacaagttaactggaatcataccaaatgagctcagtaggttgaggaatttg
gcgaaactcgatctctccatcaattccttaaccggtcctattccaccgggtttccagaat
cttacgtctatgcgccaacttcagcttttccacaattccctcagcggtgtaatccctcaa
ggtcttggtttgtacagtccactatgggttgttgatttctcagagaaccaactttccggg
aaaataccgccttttatctgtcaacaagctaatctcattctgttgaatctcgggtctaac
cggatatttggaaacattccagcaggtgtattgagatgcaaatcgctgctgcagctgcgt
gttgttggaaaccgactcactggtcagttcccgaccgagttatgcaagcttgtcaacctt
tctgctatagagttggatcaaaaccggtttagcggaccgctacctcctgagataggcact
tgccagaagctgcaaagacttcatcttgcagctaaccaattttcctcaaatatacccgaa
gagatcggtaaactctccaacctggtaacatttaacgtttcctcaaactctctcaccgga
ccaatcccctctgaaatagctaactgtaagatgcttcaacgacttgacttgagccggaac
agtttcattggttctttaccttgcgagcttggaagtcttcatcagctcgagatcctcaga
ctctcagaaaatagattctctggcaacataccgtttaccattggaaaccttacgcatcta
actgagctgcagatgggaggaaacttgttttcaggaagtatcccgcctcaactcggttta
ctctcgagtctgcaaattgcaatgaacctgagctacaataatttcagtggtgaaatacct
cccgagcttgggaatctttacctgctaatgtacctatctctgaacaacaaccatctgagt
ggcgaaatcccaaccacattcgagaacttatccagtttactcggctgcaacttttcatac
aacaacctcactggacgtcttccgcatacgcagctctttcaaaacatgactctaaccagt
tttctcggaaacaaaggactctgtggcggccatttgagaagctgtgaccctaaccagtcc
tcttggcccaacctttcatctctaaaagcgggttctgctcgtcgcgggagaatcatcatc
attgtgtcttcagtcattggcggtatctctcttttactcatagctattgtcgttcatttc
ctaagaaatcctgtggaaccaacggctccttatgtgcacgacaaggagcccttttttcaa
gaatccgacatttactttgtccctaaagaacgattcacagttaaagacattttggaagca
acaaaaggcttccacgatagctacattgtcggtaaaggcgcttgcggaaccgtttacaaa
gcggttatgccttcgggtaaaaccatagcagttaaaaaactcgaatccaacagagaaggc
aacaacaacaacacggataacagtttccgcgccgagattctaacactaggcaaaatccgt
cacaggaacatcgtcaggctctacagtttctgttaccaccaaggatcaaactcaaacctc
ttgctctacgagtacatgtctcggggaagccttggcgagttacttcacggcgggaaatcg
catagcatggattggccaactcggtttgctatcgcactcggtgcagcggaaggtcttgct
tacttacatcatgattgtaaaccaagaatcattcaccgcgacatcaaatctaataacatt
ctccttgatgagaatttcgaagctcatgttggagatttcgggttagctaaagtcatcgac
atgccacaatcaaaatccgtctcagccgtcgctggatcctacggttacatcgctcccgag
tatgcatacacaatgaaagtaacagagaaatgcgatatctacagcttcggagttgtactt
ctcgaattgttaaccggaaaacctccggttcagccgcttgagcaaggcggcgatcttgcc
acatggacaagaaatcatatcagagatcattcgttaacatctgaaatcctcgatccttat
ttaaccaaggtagaggacgatgtgattctaaatcacatgatcacagtgacgaaaattgca
gtgctctgtacgaaatcttcgccgtcggatcgaccgacgatgagagaagtagtgttgatg
cttatagagtccggagaacgtgctgggaaagtaattgtgtccaccacgtgcggtgattta
cctccaccggcgccgccgtga
DBGET
integrated database retrieval system