Alteromonas mediterranea MED64: I533_03930
Help
Entry
I533_03930 CDS
T02958
Name
(GenBank) hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family transporter
Organism
amag
Alteromonas mediterranea MED64
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF
HEF_HK
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGP80777
LinkDB
All DBs
Position
869604..872786
Genome browser
AA seq
1060 aa
AA seq
DB search
MFGVFIKRPVMAIMLSLMIIFLGALSVFTLPTSQFPDIAPPRVLISLAYPGSSADVLVKS
SLVTIERSINGVPGMKYIVSDATSAGEATIQVIFDLDVDPNQALINVKTRLDQIMNRLPQ
LVQLEGVVLQRVQPSMLMYINVYSTDEDADEKFLYNYSNINVIPEIQRVNGIASAKILGS
RQYAMRIWLKPDRMRAYNISVDEVMESIDEQSLIGRPGRLGRSSGISAQSKEYVLVYEGR
YDEPDEYKNIIIRADSDGKLLKLSDIADVELSSEFFDIYSNKDGYPSAAIVLKQNYGSSA
NEVISQVKAKMAELEETFPEGMKYEINYDVSKFLDASIEQVLHTLFEAFILVSLVVFIFL
GDWRSTLIPLLAVPVSLIGTFFCMQATGVNINLITLFALVLAIGIVVDNAIVIVEAVHAK
MEESASLTPYMATQQVLGEMGGAIIAITLVMTAVFVPLVFMTGPVGVFYRQFSITMASSI
IISCIVALSLTPVLCAMLLKNPHTHTKKATPISKLIDVFNRWFDKLTGGYTNIIKALVTR
RVVTILSLFAFVAGTIGFNHILPTGFIPGEDQGQIYAIIQTPPGSTLEVTNEVARELQTL
ALDVEGVSSVSSLAGYEILTEGRGSNAGTCLINLKDWANRDQTVQEIIEELEAKTHHLGA
VVEYFEPPVVPGYGASSGLSFRLLDKTNTTDYQEFDEINQSFMDELSKRKELKGLFTFYA
ANYPQYKIEIDNQAAMQKGVSIGKAMENLNILIGSTYEQGFTRFNNFYKVYTQSAPEYRR
YPSDLMDYYVKNEEGEMVPYSAFMKLIKTQGPNEITRYNLYTSAAIRAEPAKGYTSAEAI
KAVEEVAAATLPKGYDIGWEGLSFDEAKRGSEAIVIFGVVLLFVYIVLASQYESLLLPLA
VILSLPSGLIGSFILLDLMGLANDVYAQLGLVMLVGLLGKNAVLIVEYAVQKNQQGLSIA
EAAVDAAKQRFRPILMTSFSFVAGLIPLVIATGAGAVGNRTIGASALGGTLCGSVFGIIV
IPGLYYLFAKLEEGKSLIKNEDHVPLTETYHYNDEVLSDE
NT seq
3183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttggtgtatttattaaacgtccggtgatggcgatcatgctatcccttatgattatc
tttttaggcgcgctttcagtttttaccttgcctacttctcaatttccagatatcgctcct
cccagggttctaatttctttggcataccctggttcaagtgctgatgtacttgtaaagtca
tccttggtaaccattgagcgttcaataaatggtgtgccgggcatgaagtacattgtgtct
gatgccacaagtgccggtgaagctactatccaagttatttttgacttggatgtagaccct
aaccaagcgttaataaacgtgaaaacgcggcttgaccagataatgaaccggctcccgcag
ttggtacaactagagggggtggtacttcaaagggtgcagccaagtatgttgatgtacatc
aacgtgtacagcacagacgaagacgccgatgagaagttcctttataactactcgaacatc
aacgttataccagaaatacagcgtgttaacggtattgccagcgctaaaatattgggtagt
cgtcagtatgctatgcgcatatggttaaagccagatcgcatgcgagcgtataacatttca
gtcgatgaagtgatggagtcgattgatgagcaaagccttattggtcgtccaggccgactc
ggacgaagctcgggaataagtgcgcagtctaaagaatatgtgcttgtttacgaaggtcgg
tatgacgagcctgatgaatataaaaatatcattatcagagcggatagtgacggcaaactg
cttaaattaagtgatatagcagacgtagagcttagcagtgagtttttcgatatctattca
aataaagatggatatccttctgcggcaatcgtgttaaagcaaaactacggcagtagcgct
aatgaagtgatatctcaagtaaaagctaaaatggcagagcttgaagaaaccttccctgaa
ggcatgaaatacgaaattaactatgacgtgtctaagtttctcgatgcatcaatagaacag
gtactgcataccttatttgaagcgtttatcttagtctcgctggtggttttcatctttttg
ggagactggcgttccaccttaattcccttattggccgtcccggtatccttaattggtacc
tttttttgtatgcaagcaacgggtgtaaacattaacttgatcacccttttcgcgttggta
ttggctatcgggatagtggtagataacgccattgttatcgtcgaagctgtgcatgcaaaa
atggaagagagcgctagcttgacgccttatatggcgacgcagcaggtattaggtgaaatg
ggcggcgctattattgctatcacgcttgtgatgacagcagtatttgtgcctttagtgttt
atgactgggccggtgggcgtcttttatcgtcaattctctatcaccatggcatcgtctatt
atcatttcttgtattgtagcgctttcattaacgccagtgttgtgcgcgatgctgcttaaa
aatccgcatacacataccaaaaaagccacgccaatcagtaagcttattgatgtatttaat
cgttggtttgacaagctcaccggtggttacactaacattattaaagcgttagtaacccgt
cgcgtggtgactattctgtcgctctttgcgtttgtcgcaggcacgattggttttaaccac
attcttcctacaggttttattcctggagaagatcaggggcaaatttacgccattattcaa
actcctccaggaagtacccttgaagtaacaaatgaggtggcgcgagaactccaaaccctt
gctcttgatgtagaaggggtgtcatcggtttcttcacttgcaggttatgaaatcttaacg
gaagggcgaggttctaatgcgggtacttgtctaattaaccttaaagactgggcaaataga
gaccagacggtacaggaaatcattgaagaacttgaggctaagacccatcaccttggcgct
gtggttgaatacttcgagccccctgtagtgcctggctatggcgcctcatcagggctttca
ttccgtttgctcgataaaacgaacacgacagactaccaagagtttgatgaaataaaccaa
tcctttatggatgaactgtcaaaacgtaaagagctcaaagggctatttactttctacgcg
gctaattatccgcaatataaaattgaaatagataatcaagcagcgatgcaaaagggtgta
tcaattggtaaggcaatggaaaaccttaacattttgattggtagtacctacgagcaaggc
tttacccgtttcaataacttctacaaggtgtatacccaaagtgccccagagtatcgtcgt
taccctagcgatttaatggactactacgttaagaacgaggaaggtgaaatggtgccttac
tctgcgtttatgaagctaattaaaacgcaagggccaaatgaaatcactcgatacaacctg
tacacctctgcagccattcgagcggaacccgcaaaaggctacacctctgccgaagccatt
aaagcggtagaagaagtcgccgcagcaacgttacccaaaggctatgacataggttgggaa
gggctatcttttgatgaggcgaaacgcggtagtgaagccatcgttatattcggtgtagtt
ctgctatttgtgtatatcgtattggcgtcgcaatatgaaagcttattgcttcccctagcg
gttatattgtctttgccaagcggcctgattggttcatttattctgcttgacctaatgggc
ctagcgaacgatgtatacgcgcaattaggacttgtaatgttggttggattactgggcaaa
aacgcagtgctaattgttgaatacgcggtacagaaaaatcagcagggtttatctatcgca
gaagccgccgtcgacgcagcaaaacagcgattccgccctatattaatgacctcattttcg
ttcgtggcggggcttatccctctggtcatcgccacaggcgcaggcgcggtaggaaaccgt
acaattggtgcttcagcactgggaggtacactttgcggaagtgtcttcggcatcatagtt
attccaggcttgtactatcttttcgctaagctagaagagggtaagtcgctaattaaaaac
gaagatcacgtcccacttacagaaacctaccactacaacgatgaggtgctaagcgatgag
taa
DBGET
integrated database retrieval system