Alteromonas mediterranea U4: I607_14075
Help
Entry
I607_14075 CDS
T02720
Name
(GenBank) two-component hybrid sensor and regulator
Organism
amal
Alteromonas mediterranea U4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
HATPase_c_3
FleQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGP86600
LinkDB
All DBs
Position
3155859..3159224
Genome browser
AA seq
1121 aa
AA seq
DB search
MQSNQKIIPTRRSYNKLVANEMMEDFALRFTAKKARKWSLNKVAGTALGIVSFLVLEAIG
GAATINFGFINVAWAILSVVLVVFLTGTPISYYAAKYGVDIDLLTRGAGFGYIGSTITSL
IYASFTFIFFALEAAIMAMALHILFGISLAIGYVISALLVLPLVTHGISYISRFQVWSQP
IWVILQLVPLLFVFQHPDSNFKDWIAFTGIGENETEARNFNLLLFGSASAILLSLVAQIG
EQVDFLRFLPERPKAGRFKWWLALIAAGPGWIFFGALKLFLGSFLAYFALTQGVDIDLAD
DPAHMYNLAFSLVFDNPTISLIVACSFVVISQLKINVANAYAGSLAWSNFFSRVTRTHPG
RVIWTVFNVVIALLLMELGIYQTIETMLSVYSVLVLSWLSSVVADLIINKPLGISPKHIE
FKRSHLYDINPVGIGAMFISSFIGITGHYGWYGETIQALASYLAFFLPFILVPVIGKLTG
GKYYLVDNKVAITQTSCVCCICENEFEQEDITFCPAYSGVICSLCCSLDVKCGDICRPEA
TLFAQSQIFFHRFLSIDLLKALTTPMSQFIALTFALSCVSASILYLVYLQVPSTSGANVL
FADMLIKIFFLLSIIVGILSWLFVLARNANKIALKELRSQASALADEIGAHEVTSIALEK
AKNAAEAANEAKSRYLAGLSHELRTPLNVMLGYSQLLGKDVSLSEKQRDTMGIMRRNGEH
LANLIEGLLEISKIEAGRLTLHRDEFNIRAILKQLIDMFELQASNKGLNFHTNISTKLPD
VVVGDKQRLRQILINLISNAIKYTEAGHVKFDVQYRNEVAIFVVVDTGSGISEAHKETIF
QPFEQIRNTHTQAIGGTGLGLTISRSLTELMGGELSFKSLLGKGSTFTLRLMLPRITQNQ
TTPENHSQHVCAYSGTRKTILVIDNEPHQQQLLKDVLTPLGFIVLLAENEKKVFSQLESH
HIDLITLDVKLSNASGWDLLSTLRMDNWLMPVLMVSANARELEQYTAHTKLHNGYISKPF
NLDNLFNQIGQLLALNWEYSPDKTESITQIEKQQRTPVTSDHYRELITLAEIGYLSGFNS
KLTEIETHHYFSPDVESNIKQHISQCNFPEIIRYLGECIHE
NT seq
3366 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatctaatcaaaaaataattccgacccgacgcagttacaataaacttgttgcgaat
gaaatgatggaagatttcgctttgcgttttaccgcgaagaaagctcgaaagtggtctttg
aataaggttgcaggaactgccctcgggattgtttcttttctcgtactagaagctattggt
ggtgccgccacaattaattttgggttcattaacgtggcatgggcgatattgtctgtggtg
cttgttgtatttttgaccggcacgcctatcagttactacgcggcaaaatacggcgttgat
atcgacctattaaccagaggggccggatttggttacataggctcaactataacctcactg
atttacgcctcttttacgttcatttttttcgcacttgaagccgctatcatggcgatggcc
ttgcacatcctatttggcatatctttagcaatcgggtatgtgattagtgcattgctagta
cttccattagttacgcatgggattagttatataagccgattccaggtttggtctcagcct
atttgggtaatacttcaattagtgcctctccttttcgtgtttcaacaccctgacagcaac
ttcaaagactggattgcttttactggaattggcgaaaatgaaaccgaggcacgcaatttc
aacttacttttattcggaagtgcatccgctatattgctttccctagttgcgcaaattggt
gagcaggtagactttctgagatttttaccggaaagacccaaagctggcaggtttaaatgg
tggttagctttgatagctgctggccctggatggattttttttggcgcattaaaattattt
ttagggtcttttctagcgtactttgcacttactcaaggtgtggatattgacttggcagat
gacccggcacacatgtataacctagcttttagcttagtttttgataacccaactataagc
cttatcgttgcctgtagctttgtggttatttctcagttaaaaattaacgtcgccaatgcg
tatgcaggctcgttagcatggtctaactttttctctcgtgtaactcgcactcatcccggt
cgagtgatatggaccgtgttcaatgtagtcatcgcactattgctaatggagttaggtata
taccaaacgatagagaccatgttatccgtttattctgtattggtattgtcatggctaagt
tctgttgtagctgacttaataataaataagccgctaggcattagccccaagcacattgaa
tttaaacgttctcacttatacgacattaatcctgtgggaattggcgcaatgttcatatct
tctttcatcggtataacgggccattacggctggtatggtgaaacaattcaagctcttgcc
tcttaccttgcctttttcttaccttttatcttagttcctgtcattggaaaactcaccggt
ggtaaatactatttggttgataataaagtagctattacacaaaccagctgtgtatgttgc
atttgtgaaaatgaatttgagcaagaggatattactttttgtccagcatatagtggggtc
atctgctcgctgtgctgttcattagatgtgaagtgtggagatatctgtaggccagaagct
acgctctttgcacaatcacagatattttttcatcgttttttaagtatcgaccttcttaaa
gccttaacgacccctatgtcacagtttatagcgctaacatttgcgctaagttgtgttagc
gccagtattctatatttagtttaccttcaagtaccttctacctcaggtgcaaatgtcctt
tttgcagatatgctaattaagatatttttcttgctctctatcattgttggcatactaagt
tggctatttgttttagcaagaaacgctaacaaaatagcccttaaagaacttcgttcccaa
gcgtcagctttggccgatgaaataggagcccacgaagtaacgtccattgcgcttgaaaaa
gcaaagaatgctgctgaggctgcaaatgaagccaagagccgatatttagcgggactaagc
catgagctgcgaacgccattaaatgtgatgctaggttattcacagctattaggtaaagat
gttagtttaagtgaaaaacaacgagacactatgggcatcatgcgaagaaatggggagcat
cttgccaatttgattgaaggactgttggaaatatcaaaaatagaagctggccgcctaaca
cttcaccgagatgaatttaatattagagctatattgaaacaactcatcgatatgtttgaa
ttgcaggcaagtaacaaaggtctcaattttcacactaacatcagtacaaagcttcccgat
gtagtggttggtgataagcaaagacttaggcaaatattgattaatttgatctctaacgcc
atcaaatatacagaggccggtcatgttaaattcgatgttcagtatagaaatgaagtcgcg
atttttgtcgttgtagatacaggctcaggtataagcgaagcgcataaagaaactattttt
cagccctttgagcaaattagaaacacccatacacaggcgattggtggcactgggttagga
ttaacgatatctcgctctttaaccgaattaatgggcggtgaacttagcttcaaaagttta
ctagggaaaggttcaacctttactttgcgcttaatgcttccacgcattactcaaaatcaa
accacgccggaaaatcatagccaacatgtttgcgcatactcaggcacgcgtaaaactata
ctggtgatagacaatgagcctcatcaacagcagttgcttaaagatgtattaactccactt
ggttttattgtgttgctagcggaaaatgagaaaaaagtgttttctcaattagaaagtcac
cacatcgacttaattacactagatgtaaaactgtctaacgcaagtggatgggatctgctg
tccacactacggatggataattggttaatgcccgtactcatggtatcggcaaacgctcgt
gagttagagcaatatacggctcacacaaaattgcataacgggtatatttcaaagccgttc
aatttggacaatttattcaatcagattgggcagttgttagcacttaattgggaatattct
cccgataaaaccgaaagcataacgcagatagaaaagcagcaacgaacgcccgttacatct
gaccactacagggaattgatcacactagctgaaattgggtatttatctgggtttaatagc
aaactaacggaaatagaaacccatcattatttttcccctgatgtagaatcaaatataaag
caacatatttcccaatgtaactttccagaaataatcagatatttaggtgagtgtattcat
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system
