Astyanax mexicanus (Mexican tetra): 111196798
Help
Entry
111196798 CDS
T05042
Name
(RefSeq) uncharacterized threonine-rich GPI-anchored glycoprotein PJ4664.02-like
Organism
amex
Astyanax mexicanus (Mexican tetra)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
111196798
NCBI-ProteinID:
XP_022541888
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1929 aa
AA seq
DB search
MPESADLRNSTYTQVQNSINTALNTLLNQPDADLFESQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDG
DTKVPISFFNELKTQIASTTTVSPTTTTSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVP
SESSVLNATTTLLNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPESADLRN
STYTQVQNSINTALNTLLNQPGADLFEPQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFF
NELKTQIASTTTVSPLTTNSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSESSVLNAT
TTLLNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPESADLRNSTYTQVQNS
INTALNTLLNQPGADLFEPQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFFNELKTQIAS
TTTVSPTTTNSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSESSVLNATTTLLNSRLS
NLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPESADLRNSTYTQVQNSINTALNTLL
NQPGADLFEPQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFFNELKTQIASTTTVSPTTT
NSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSESSVLNATTTLLNSRLSNLNHSTNVL
NISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPESADLRNSTYTQVQNSINTALNTLLNQPGEDLFE
PQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFFNELKTQIASTTTVSPTTTNSLMVTSTA
TPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSESSVLNATTTLLNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISD
SSYAVIFTFSLSNISMPESADLRNSTYTQVQNSINTALNTLLNQPGADLFEPQSSVFTSS
ANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFFNELKTQIASTTTVSPTTTTSLMVTSTATPSTISGAA
VVSARLVFNSSSTVPSESSVLNATTTLLNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTF
SLSNISMPESADLRNSTYTQVQNSINTALNTLLNQPGADLFEPQSSVFTSSANQIEGNME
YLFQDGDTKVPISFFNELKTQIASTTTVSPTTTNSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFN
SSSTVPSESSVLNATTTLLNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPE
SADLRNSTYTQVQNSINTALNTLLNQPDADLFESQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTK
VPISFFNELKTQIASTTTVSPLTTNSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSES
SVLNATTTLLNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPESADLRNSTY
TQVQNSINTALNTLLNQPGADLFEPQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFFNEL
KTQIASTTTVSPTTTTSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSESSVLNATTTL
LNSRLSNLNHSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLSNISMPESADLRNSTYTQVQNSINT
ALNTLLNQPGADLFEPQSSVFTSSANQIEGNMEYLFQDGDTKVPISFFNELKTQIASTTT
VSPLTTNSLMVTSTATPSTISGAAVVSARLVFNSSSTVPSESSVLNATTTLLNSRLSNLN
HSTNVLNISYQKISDSSYAVIFTFSLILININNYNYHSNHHSAPPTATTTGPPQPPHATT
TGPPQQQPPQRPHRNTTAPLTQPHGHHSNHHSAPHRQNHHSAPTATTTGGHHRPSQQPPT
GHHSNHHRPLQQPPRAPPQQPPQGRTTAPLTATTTGATTTNHHKRPPTETTTAPPQQPAT
GATTATTTAAAPQQHHSAPHSNHHSGPPQATTTSTLHSGHHSAPTAPPLGNPHSGHHRQP
PLYRKHYYS
NT seq
5790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagagagcgctgacctcaggaacagcacctacacccaagtgcagaactccatcaac
acagcgctgaacactctgctaaatcaacctgatgcagatctttttgaatcccagagctca
gtcttcacaagctcagccaatcagattgaaggcaacatggagtacctcttccaagatgga
gacaccaaagtacccatcagcttcttcaatgagctcaagacacagattgcttcaacaaca
acggtttctccaacgactacaaccagtctgatggtgacttccacagcgacgccttccaca
atatctggtgctgcagtggtttctgccaggctggtgttcaattcctcctctaccgtcccc
agtgagagttcggtcctcaatgctaccacaactctgctcaactctcgactctcaaacctc
aaccattctactaacgtgctgaacatcagctatcagaaaatttcagactcctcctatgca
gtcatcttcacattcagcctcagtaatatcagcatgccagagagcgctgacctcaggaac
agcacctacacccaagtgcagaactccatcaacacagcgctgaacacactgctaaatcaa
cctggtgcagatctttttgaaccccagagctcagtcttcacaagctcagccaatcagatt
gaaggcaacatggagtacctcttccaagatggagacaccaaagtacccatcagcttcttc
aatgagctcaagacacagattgcttcaacaacaacggtttctccactgactacaaacagt
ctgatggtgacttccacagcgacgccttccacaatatctggtgctgcagtggtttctgcc
aggctggtgttcaattcctcctctaccgtccccagtgagagttcggtcctcaatgctacc
acaactctgctcaactctcgactctcaaacctcaaccattctactaacgtgctgaacatc
agctatcagaaaatttcagactcctcctatgcagtcatcttcacattcagcctcagtaat
atcagcatgccagagagcgctgacctcaggaacagcacctacacccaagtgcagaactcc
atcaacacagcgctgaacacactgctaaatcaacctggtgcagatctttttgaaccccag
agctcagtcttcacaagctcagccaatcagattgaaggcaacatggagtacctcttccaa
gatggagacaccaaagtacccatcagcttcttcaatgagctcaagacacagattgcttca
acaacaacggtttctccaacgactacaaacagtctgatggtgacttccacagcgacgcct
tccacaatatctggtgctgcagtggtttctgccaggctggtgttcaattcctcctctacc
gtccccagtgagagttcggtcctcaatgctaccacaactctgctcaactctcgactctca
aacctcaaccattctactaacgtgctgaacatcagctatcagaaaatttcagactcctcc
tatgcagtcatcttcacattcagcctcagtaatatcagcatgccagagagcgctgacctc
aggaacagcacctacacccaagtgcagaactccatcaacacagcgctgaacacactgcta
aatcaacctggtgcagatctttttgaaccccagagctcagtcttcacaagctcagccaat
cagattgaaggcaacatggagtacctcttccaagatggagacaccaaagtacccatcagc
ttcttcaatgagctcaagacacagattgcttcaacaacaacggtttctccaacgactaca
aacagtctgatggtgacttccacagcgacgccttccacaatatctggtgctgcagtggtt
tctgccaggctggtgttcaattcctcctctaccgtccccagtgagagttcggtcctcaat
gctaccacaactctgctcaactctcgactctcaaacctcaaccattctactaacgtgctg
aacatcagctatcagaaaatttcagactcctcctatgcagtcatcttcacattcagcctc
agtaatatcagcatgccagagagcgctgacctcaggaacagcacctacacccaagtgcag
aactccatcaacacagcgctgaacacactgctaaatcaacctggtgaagatctttttgaa
ccccagagctcagtcttcacaagctcagccaatcagattgaaggcaacatggagtacctc
ttccaagatggagacaccaaagtacccatcagcttcttcaatgagctcaagacacagatt
gcttcaacaacaacggtttctccaacgactacaaacagtctgatggtgacttccacagcg
acgccttccacaatatctggtgctgcagtggtttctgccaggctggtgttcaattcctcc
tctaccgtccccagtgagagttcggtcctcaatgctaccacaactctgctcaactctcga
ctctcaaacctcaaccattctactaacgtgctgaacatcagctatcagaaaatttcagac
tcctcctatgcagtcatcttcacattcagcctcagtaatatcagcatgccagagagtgct
gacctcaggaacagcacctacacccaagtgcagaactccatcaacacagcgctgaacaca
ctgctaaatcaacctggtgcagatctttttgaaccccagagctcagtcttcacaagctca
gccaatcagattgaaggcaacatggagtacctcttccaagatggagacaccaaagtaccc
atcagcttcttcaatgagctcaagacacagattgcttcaacaacaacggtttctccaacg
actacaaccagtctgatggtgacttccacagcgacgccttccacaatatctggtgctgca
gtggtttctgccaggctggtgttcaattcctcctctaccgtccccagtgagagttcggtc
ctcaatgctaccacaactctgctcaactctcgactctcaaacctcaaccattctactaac
gtgctgaacatcagctatcagaaaatttcagactcctcctatgcagtcatcttcacattc
agcctcagtaatatcagcatgccagagagcgctgacctcaggaacagcacctacacccaa
gtgcagaactccatcaacacagcgctgaacacactgctaaatcaacctggtgcagatctt
tttgaaccccagagctcagtcttcacaagctcagccaatcagattgaaggcaacatggag
tacctcttccaagatggagacaccaaagtacccatcagcttcttcaatgagctcaagaca
cagattgcttcaacaacaacggtttctccaacgactacaaacagtctgatggtgacttcc
acagcgacgccttccacaatatctggtgctgcagtggtttctgccaggctggtgttcaat
tcctcctctaccgtccccagtgagagttcggtcctcaatgctaccacaactctgctcaac
tctcgactctcaaacctcaaccattctactaacgtgctgaacatcagctatcagaaaatt
tcagactcctcctatgcagtcatcttcacattcagcctcagtaatatcagcatgccagag
agtgctgacctcaggaacagcacctacacccaagtgcagaactccatcaacacagcgctg
aacactctgctaaatcaacctgatgcagatctttttgaatcccagagctcagtcttcaca
agctcagccaatcagattgaaggcaacatggagtacctcttccaagatggagacaccaaa
gtacccatcagcttcttcaatgagctcaagacacagattgcttcaacaacaacggtttct
ccactgactacaaacagtctgatggtgacttccacagcgacgccttccacaatatctggt
gctgcagtggtttctgccaggctggtgttcaattcctcctctaccgtccccagtgagagt
tcggtcctcaatgctaccacaactctgctcaactctcgactctcaaacctcaaccattct
actaacgtgctgaacatcagctatcagaaaatttcagactcctcctatgcagtcatcttc
acattcagcctcagtaatatcagcatgccagagagcgctgacctcaggaacagcacctac
acccaagtgcagaactccatcaacacagcgctgaacacactgctaaatcaacctggtgca
gatctttttgaaccccagagctcagtcttcacaagctcagccaatcagattgaaggcaac
atggagtacctcttccaagatggagacaccaaagtacccatcagcttcttcaatgagctc
aagacacagattgcttcaacaacaacggtttctccaacgactacaaccagtctgatggtg
acttccacagcgacgccttccacaatatctggtgctgcagtggtttctgccaggctggtg
ttcaattcctcctctaccgtccccagtgagagttcggtcctcaatgctaccacaactctg
ctcaactctcgactctcaaacctcaaccattctactaacgtgctgaacatcagctatcag
aaaatttcagactcctcctatgcagtcatcttcacattcagcctcagtaatatcagcatg
ccagagagcgctgacctcaggaacagcacctacacccaagtgcagaactccatcaacaca
gcgctgaacacactgctaaatcaacctggtgcagatctttttgaaccccagagctcagtc
ttcacaagctcagccaatcagattgaaggcaacatggagtacctcttccaagatggagac
accaaagtacccatcagcttcttcaatgagctcaagacacagattgcttcaacaacaacg
gtttctccactgactacaaacagtctgatggtgacttccacagcgacgccttccacaata
tctggtgctgcagtggtttctgccaggctggtgttcaattcctcctctaccgtccccagt
gagagttcggtcctcaatgctaccacaactctgctcaactctcgactctcaaacctcaac
cattctactaacgtgctgaacatcagctatcagaaaatttcagactcctcctatgcagtc
atcttcacattcagcctcattttgatcaacattaacaactacaattaccacagcaaccac
cacagcgcgccccccacagcaaccaccacagggccaccacagccccctcacgcaaccacc
acagggccaccacagcaacaaccaccacagcgcccccacagaaacaccacagcgcccctc
acacaaccccacggccaccacagcaaccaccacagcgcccctcacaggcaaaaccaccac
agcgcccccacagcaaccaccacagggggtcaccacaggccctcacagcaaccaccaaca
gggcaccacagcaaccaccacagacccctccagcaaccaccacgcgcccccccacagcaa
ccaccacaggggcgcaccacagcgcccctcacagcaaccaccacaggggccaccacaaca
aaccaccacaagcgccccccaacagaaaccaccacagcgcccccacagcaaccagccaca
ggggccaccacagcaaccaccacagccgccgccccacagcaacaccacagcgccccccac
agcaaccaccacagcggccccccacaggcaaccaccacaagcacccttcacagtggccac
cacagcgcccccacagcaccaccactaggcaaccctcacagtggccaccacaggcaacca
ccactctacaggaaacactactacagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
