Alligator mississippiensis (American alligator): 106736726
Help
Entry
106736726 CDS
T03087
Symbol
NOTCH2
Name
(RefSeq) notch 2
KO
K20994
Notch 2
Organism
amj
Alligator mississippiensis (American alligator)
Pathway
amj04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
106736726 (NOTCH2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
Ank
EGF_2
Notch
NOD
NODP
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_3
EGF_MSP1_1
DUF4064
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106736726
NCBI-ProteinID:
XP_006260017
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
2435 aa
AA seq
DB search
MPRGTWGPGPAVGALLVVALALIRGDPAAALQCLDTSKPCVNEGKCFSYPNGTGFCRCPE
GFLGDYCQYRNPCESSTCQNGGTCETTSVIGKATCKCAPGFRGEDCRYPDSHICFVSHPC
LNGGTCQLLSPDAYECVCKPGYTGKNCQWIDACMSQPCANGSTCIASGERFFCTCLSGYT
GQKCEVDVNECTTPGQCQHGGTCLNVPGSYRCQCKPGFTGHRCESTYVPCSPSPCMNGGT
CHQTGDFIYECNCLPGFEGDTCEHNIDDCPNHKCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFC
TEDVDECQLQPNACQNGGTCTNHNGGYACVCVNGWSGDDCSKNIDDCLTASCANGSTCID
RVASFACICPEGKAGLLCHLDDACVSNPCQKEALCDTNPMNGHYICTCPQGYKGADCTED
VDECAMANSNPCEHAGKCVNTEGSFHCECLKGYTGPRCEMDINECHSNPCQNDATCLDKI
GGFTCLCMPGFKGMHCELEINECLSSPCVNNGECLDKVNHFLCKCPPGFTGAVCQIDIDD
CSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGILCEENINNCDPDPCHYGECQDGIDSYTCVC
NPGYMGAICSEQIDECYSNPCLNQGRCIDLVNGYQCNCLPGTSGVNCENNFDDCANKPCV
HGTCIDGINYYSCICNPGVTGPRCNTDIDECISSPCHNGGTCVNEMNGFRCICPEGYHHP
TCHSQTDECLNNPCVHGNCTHDVNGYMCLCDPGWTGMDCEVEENECRSNPCQNGGTCDNL
VNGYRCTCRRGFKGVNCQIVQAPCSPDPCENSGICQESSGSDGYICLCAPGWEGERCTVD
IDECVSKPCRNHAVCHNIQGSYLCECNPGFTGGDCESNIDDCLSNPCQNGASCVDGVNSF
SCICLPGFQGEQCQTDTNECLNEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCPAGFEGTNCENNINECTE
SSCFNGATCVDGINSFTCQCPIGFTGTFCLMEINECDSHPCLNRGTCVDSLGTYHCVCPM
GYTGKNCQILVDLCSKFSCKNKGTCVQQNTHFHCNCPPGWSGAYCDVPNVSCQAAASQRG
VPVDQLCQHSGNCLNVGNSHHCQCRTGYTGSYCEEQVDECISSPCQNGATCRDYLGGYNC
ECAPGYQGVNCEYEVNECQFQPCQNGGTCIDLINHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCMPDS
GGPRCLNGGQCIDQIGGHSCLCPSGFGGKQCEGDINECLSNPCSPRGSRDCVQLVNNYTC
ICRSAFTGRHCETVIDVCPQKPCQNGGTCAVASNMPDGFICQCPPGYSGSKCEFSNTCGQ
MRCKKGELCIQTSSGPRCYCPELLVGEECWATAGCTSAPCQNGGSCHPRPQAPYYYCQCL
SYTEGSQCEHSVHPSREPEGCLGQHCMERAKDGYCDEDCNTHACQWDGGDCSLMIEDPWA
NCSSSLRCWEHFNGLCDEACNTPECLFDNFECQQNPKTCKYGKYCEDHYANGLCDKGCNN
EECGWDGLDCAGDKAEKLAEGTLIIVVLMPPEQLLSDVHSFLWTLGTLLHTNLRIKRDSQ
GKLMVYPYYGEKSALRSRRSVLVIRKARELEQEAIGTKVFLEIDNRQCAEESDQCFKNTE
AAAALLAAQAIKGMVPYPFVSVESERVSRGKTQMLYLLAVVALIGLIILLLGVMMAKRKR
KHGSLWLPEGFILHRDSSNHKRREPVGEDAVGLKNLSVQVSDGNLADCTAGEHWSGDRGP
QPKRAKSEDETLLPEADEQVDQCQWTQQHLRAADIDGTTSLALTPPQADQEVDVLDVNVR
GPDGCTPLMLASLRVGSSDISDEDEDGEDSSANIITDLIYQGANLQAQTDRTGEMALHLA
ARYSRADAAKRLLDAGADANARDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDG
TTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLVLLKNGANRD
MQDNKEETPLFLAAREGSFEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVAQDRMHHDIVQLLNE
YNVAHSPSGHPGTMLNSALSPVICGPNRSFLNLKHASLSKKSRKPNAKSVMAPNLAKEAK
RRRKKSLTESKGQFSESSVTLSPVDSLESPHAFASEQTSSPVMPSPGILHSSPSSLLTAS
VVQAAHPMSFSGLHEMQPLGQGSNTVLPSVSQLLSQHRTTPSSNGLGRLQPGNISTEWMN
HIDVNESQYNEMFGMIPQVVHAHPSGSQQGSLSQTDVKHVGISRETLPPIMTFQLVPKSG
MNQQVLAQQAQSNCPQNVAGPLSSMYQITPDLAQLPSASFPMAVIPQQDGQVAQTILPAY
HQFQSSMGKYPTPPSQHSYTSSSATERTPSHNRHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSA
SDWSDVATSPSHGSTQRGPVARMSEQQRNNMQVYA
NT seq
7308 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgcggggcacatgggggccgggcccggcggtcggggcgctgctggtggtggcgctg
gcgctgatccgcggggacccggctgcggccttacaatgtctggatacttctaagccttgt
gtcaatgagggaaagtgcttctcatatcccaatggcaccggattttgcagatgtccagaa
ggttttcttggagactattgtcagtacagaaacccgtgtgaaagcagtacctgtcagaat
ggaggaacatgtgaaaccacgtctgtgataggaaaggccacttgcaaatgtgctccaggg
ttcagaggcgaggactgcagatatcctgattctcacatctgctttgtgtcacacccctgc
ttaaatggaggaacctgccaactgcttagcccagatgcatatgagtgtgtatgcaagcca
ggttacacaggaaagaactgtcagtggattgatgcttgcatgtctcagccgtgtgccaat
ggaagtacttgcatcgcatctggggagagatttttctgtacatgtctatctggttacact
ggacaaaaatgtgaagttgatgtgaatgagtgtaccacaccaggacaatgccagcatggt
ggaacctgtctcaatgtgcctggctcctatcgatgtcagtgcaagccaggctttaccggc
caccgctgtgaaagcacatatgtgccatgttcaccttcaccatgtatgaatggagggaca
tgtcatcagactggtgatttcatctatgaatgcaactgtctgccaggctttgaaggagat
acctgtgagcacaacattgatgactgcccaaatcacaagtgccagaatggtggtgtgtgc
gtggacggcgtaaacacttacaactgccgctgccctccacagtggacaggtcagttctgt
actgaggatgtggatgaatgtcagctgcagcccaatgcctgtcaaaatggaggtacctgc
accaaccacaatggcggctatgcctgcgtctgtgtcaacggctggagtggggatgattgc
agtaagaatattgatgactgtcttacggcttcctgtgccaatggatctacttgcattgat
cgtgtggcttcatttgcatgcatttgtccagaaggaaaggcaggcctcctgtgtcatctg
gatgatgcatgtgttagcaacccctgccagaaggaagctctatgtgataccaaccctatg
aatggacactatatctgcacttgtccccaaggctacaaaggagcagactgtactgaagat
gtagatgagtgtgctatggcaaacagtaatccgtgtgaacatgctgggaaatgtgtgaat
actgagggctccttccactgtgagtgtctgaagggatacacaggaccacgctgtgaaatg
gacattaatgagtgtcattccaatccatgtcaaaatgatgccacttgcctggataaaatt
ggaggattcacatgtctgtgtatgccagggtttaaaggcatgcactgtgaactagagatc
aatgaatgccttagtagtccctgtgtgaacaatggagagtgtctggataaggtcaatcac
tttctgtgcaaatgcccacctggttttactggagccgtgtgccagattgacatcgatgac
tgctccagcacaccttgcctaaatggagcaaagtgcattgatcatcccaatggctacgag
tgccagtgtgccacaggttttactggcatcttgtgtgaggaaaatataaataattgtgat
cctgacccttgccactatggtgaatgccaagatggtattgattcatacacatgtgtctgc
aatcctggatacatgggtgccatttgtagtgaacagattgatgaatgctacagcaatccc
tgccttaatcaaggacgctgcattgacttggtgaatggttaccaatgcaactgtttacca
ggcacatcaggagtgaactgtgagaataactttgatgattgtgcaaataaaccctgtgtt
catgggacctgtatagatggcattaactactacagttgcatctgcaacccgggagttacc
ggtccaagatgtaatactgatattgatgaatgtatctccagtccctgtcacaatggtgga
acatgtgtcaatgaaatgaatggatttcggtgtatatgtcctgaaggctaccatcacccc
acctgtcactcacagacagatgaatgtcttaataacccttgtgtgcatggcaactgcaca
catgatgtcaacgggtacatgtgtctctgtgacccaggttggactggaatggactgtgaa
gtagaggaaaatgagtgtaggtcaaatccgtgccagaatggaggaacctgtgacaatctg
gtgaatggatatagatgcacctgcaggagaggattcaaaggtgtgaactgccagatagtg
caggctccttgttcccctgatccttgtgagaattctggaatctgccaagaatcatctggc
tctgatggctatatctgtctctgtgctcctggctgggaaggagagagatgtacggtggat
attgatgagtgtgtgtcaaagccctgcaggaatcatgctgtctgccacaacattcaaggc
agctacctgtgtgaatgcaacccaggcttcactgggggagactgtgaaagcaacattgat
gactgcctttcaaatccctgccagaatggagcttcatgtgtggatggggtgaactctttc
tcatgcatctgtctgcctgggttccaaggggagcagtgtcagacagataccaacgagtgt
ctgaatgaaccatgcaagaatggaggcacctgctctgactatgtcaacagctacacgtgc
aagtgcccagcaggatttgaggggaccaattgtgagaacaacatcaatgaatgcactgag
agttcgtgtttcaatggagccacttgtgtggacgggatcaactcctttacatgccagtgc
ccaattgggttcacaggaaccttttgtcttatggaaattaatgaatgtgattcacatcct
tgcttgaacagagggacttgtgtggatagcctggggacctatcattgtgtttgtcccatg
ggttacactggaaagaactgtcagatacttgtggatctgtgtagcaagttttcctgtaag
aacaaaggcacatgtgtccagcagaatactcactttcattgcaactgtccccctggttgg
agtggtgcctactgtgatgtgcccaatgtctcctgccaagcggctgcttcacagaggggg
gtccctgtagaccagttgtgtcaacactctggcaattgccttaacgttggaaacagccac
cattgccagtgccggacaggctacactggtagctattgtgaagagcaggtggatgaatgt
atctccagtccttgtcagaatggcgccacctgcagggactatcttggaggatataactgt
gagtgtgcgccagggtaccagggtgtcaactgcgagtatgaagtgaatgagtgtcagttc
cagccctgccaaaatggaggaacctgcattgatctcatcaatcacttcaaatgctcctgt
ccaccaggaactcggggccttctttgtgaggagaacattgatgactgcatgccagattca
ggagggcctcgctgccttaatggaggacagtgcatagaccaaattgggggccacagctgt
ctttgtccttcaggcttcggaggcaagcagtgtgagggggacattaatgaatgcctctcc
aacccttgtagccctcgtggtagccgagactgtgttcagctggtcaataattatacatgc
atctgccgcagtgcctttactggccgtcactgtgaaactgtaatagatgtgtgtcctcag
aagccttgtcagaatggaggtacttgtgctgttgccagtaatatgcctgatggattcatc
tgccagtgtcctccaggttattctgggtctaaatgtgaattcagcaatacttgtgggcaa
atgaggtgcaagaaaggggaactgtgcatccagacatcctcagggccccgttgttactgt
ccagagctcttggtgggtgaggagtgctgggctactgcaggctgtaccagtgcaccctgc
cagaatgggggaagttgccatcctaggcctcaggctccttattattactgccagtgtctc
agttacactgaaggcagccagtgtgagcattcagtacaccccagccgagaacctgaaggg
tgtctgggtcaacactgcatggaacgagcaaaagatggctactgtgatgaagactgcaac
acacacgcttgccagtgggatggaggggactgttcgctgatgatagaagatccctgggcc
aactgttcttcgtcgctgcgctgctgggagcatttcaatggcttgtgcgatgaggcctgt
aatacgcctgagtgcttgtttgacaactttgagtgtcagcagaaccctaagacatgcaag
tatggtaaatattgcgaggatcactatgcaaatggactctgtgacaaaggatgtaacaat
gaggagtgtggttgggatggtctggactgtgccggtgacaaagctgagaaactggcggaa
ggtacccttataattgtggtgctaatgccccctgaacagctgctttcagatgtccatagc
ttcctatggactctaggaacccttctacacaccaacctgagaataaaacgagattcccag
ggaaagctgatggtatacccatactatggagagaagtcagcactgcggagccggcgatcc
gtgttggtcattcgcaaggccagagagcttgaacaagaggccattggtacaaaggtgttc
ctggaaattgacaatcgacagtgcgctgaagagtcggaccagtgcttcaaaaatacagaa
gctgcagcagctcttttagcagctcaggccattaagggcatggtgccttatccttttgtg
tctgttgaaagtgaacgtgtatcacgagggaagacccagatgctttacctgcttgctgtg
gtagctttgatcggccttataatcctacttttgggtgtgatgatggcaaagcgaaaacgg
aagcatggctccctctggctccctgagggctttattttgcacagagactccagtaaccac
aaacgcagagaaccagttggggaagacgcagttggattgaaaaatctgtcagtacaagtt
tctgacggcaatctggcagactgtactgcaggggaacattggtcaggtgataggggacct
cagccaaagagagctaagtccgaagatgaaacattgctcccagaagcagatgagcaggta
gatcaatgccagtggacacaacaacacctcagggcagctgacatagatgggaccacatcc
cttgctcttacaccacctcaggcagatcaagaagtagatgtcctggacgtcaatgttaga
ggaccagatgggtgcaccccactcatgttggcatctctgcgtgtgggcagctctgacatt
agtgacgaagatgaagatggggaggattcctcagcaaatataataacagacctgatctat
caaggggctaacttgcaagctcaaacagaccgtactggggagatggcactgcacttagca
gcccgctattcaagagcagatgcagcaaaacgcttgttggatgctggtgctgatgctaac
gcccgagacaacatggggaggactcctcttcatgcagctgtggcagctgatgcacagggt
gtcttccagatcttgatccggaacagagtgacagacctggatgctcgcatgaatgatgga
acaactccgttaattctggcagctcgtttggctgtggagggaatggtggctgagctgatc
aactgccaggcagatgtcaatgcagtggatgaccacggtaaatctgctcttcattgggct
gcagctgttaacaatgtggaggcaacgttagtgttgttgaaaaatggagccaaccgcgac
atgcaggacaacaaggaggagacaccactcttcctggcagctcgggaagggagttttgaa
gcagctaaaattctgttggaccattttgccaatcgggacatcacagaccacatggatcgt
ctcccccgtgatgtggcacaggaccgcatgcaccatgacattgtgcagcttctcaatgag
tacaatgtggcccacagcccatctgggcaccctggcaccatgctaaactctgccctctcc
ccagtgatttgtggccccaatagatctttcctcaatttgaaacatgcttctctaagcaag
aagtcgaggaaaccaaatgccaagagtgtgatggccccaaatcttgccaaagaagcgaag
aggagaaggaagaaatctctgactgagagcaagggtcagttttctgagagctcagtgacc
ctctcaccagtcgactctctggaatctccccacgcttttgcatctgaacaaacgtcctct
cctgtgatgccgtccccagggattctgcattcctcgcccagctcactgcttacggcctca
gttgtgcaggccgcgcaccccatgtccttctctggtctccatgagatgcagccgctgggg
cagggatctaacactgtgcttccatctgtcagccagctgctttcacagcaccgaaccaca
ccttccagcaatgggctcggtagactccagccaggtaacatttccaccgaatggatgaac
cacatagatgtgaatgaatcccaatacaatgagatgtttggcatgatcccacaggtagtc
catgctcaccccagtggctctcagcaaggaagtctgagtcaaacagatgtgaagcatgtg
ggaatctccagggagacactgccccctattatgactttccagctggttcccaaaagtggc
atgaaccagcaggtcctggcgcaacaggcccagtccaactgccctcagaatgtagctggt
cctcttagttcaatgtaccagataacgccagatctagctcagctgccaagtgcctccttt
cccatggcagtaatccctcagcaggatgggcaggtcgctcagacaatcctcccagcctat
caccagttccagagctcgatgggaaagtatcccactccgccatcacagcacagctacacc
tcttcctctgccacggagaggactcctagccataacaggcacttgcaaggggagcaccca
tatctgacgccatctcccgaatctcccgatcagtggtcaagctcctccccgcactctgcc
tcagattggtctgatgtggcgaccagccccagccatggtagtacccaacgtggtccggta
gcacgaatgtcagagcagcagcggaacaacatgcaggtttatgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
