Alligator mississippiensis (American alligator): 106736734
Help
Entry
106736734 CDS
T03087
Symbol
FBN3
Name
(RefSeq) fibrillin 3
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
amj
Alligator mississippiensis (American alligator)
Pathway
amj04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amj00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
106736734 (FBN3)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
amj00536
]
106736734 (FBN3)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
amj00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
106736734 (FBN3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
FBN_EGF_st1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106736734
NCBI-ProteinID:
XP_014455336
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
2873 aa
AA seq
DB search
MGVLWLAKFMLGCTALLYVEQAQCQYDGDLQTDRFSGYEERQPANRVRRRGQDTLRGPNV
CGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSTNCGSSGVQT
CSVRCMNGGSCNEESCLCQKGYTGTYCGQPICENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCE
RDYRTGPCFSQVNNQMCQGQLSGIVCTKTMCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPN
IRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSETSHKCEDVDECSTISSV
CDGGECTNTAGSYVCTCPRGFMTSPDGSRCIDQRIGTCFSALIGGRCAGELPGQYTKMQC
CCDSGRCWAIGQTPEMCPVRGSDEYRRLCIEGLPVVPGFPGSFPGIPGFGPNGVGPGISG
PGGIGPNGANGQGGIPGLPGMGPGSSSIGTATLNQTIDICKHFTNLCLNGRCIPTPSSYR
CECNMGYKQDVRGECIDVDECSSSPCVHGDCVNTPGSYHCKCHEGFQSTPTKQACIDIDE
CIMNGVMCRNGRCVNTDGSFQCICNAGFEITPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGS
FKCICKPGFVLAPNGRYCVDIDECETPGICMNGWCINTEGSFRCECLGGLAIGVDGRVCV
DTHMRSTCYGGIKKGTCARPFPGAVTKSECCCANPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQALCSS
GIGITADGRDINECALNPDICPNGMCENLRGSYRCICNLGYESDPTGKNCVDVDECTVNR
LLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGFVFRTETDTCEDINECTSNPCVNGVCRNNAGSFACECS
PGSKLDPSGTICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCEID
PACPRGFARMKGVTCEDVNECDVFPSVCPNGRCVNTGGSFRCECPEGLTLDGTGRTCVDV
RVEQCYMKWDEDECNEPLPGKYRMDVCCCSVGSAWGIDCEECPRVGTSEYKAICPRGPGF
ANRGDVLSGRPFYKDVNECKVFSGLCTHGTCRNTIGSFRCICGNGFALDAEERNCTDIDE
CRISPDLCGHGTCINTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGICVNNE
GSFECICPPGHELTSEGHACVDINECSLSDNLCRNGRCVNVIGTYQCTCDSGFQATPDRQ
GCVDIDECTIMNGGCDTHCANSEGSYQCSCSEGYALMPDKRSCTDIDECEDNPDICDGGQ
CTNIPGEYRCLCFDGFMASLDMKTCIDVNECDLNPNICLHGECENTKGSFICHCQLGYFV
KKGTTGCTDIDECEIGAHNCDMHASCINVPGSFKCKCRTGWLGDGLKCNDLDECATEEHK
CNLNANCVNTPGSYRCACREGFNGDGFSCSDVDECADNVNLCENGQCLNAPGGYRCECEM
GFNPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCACDDGYELDRSGGNCTDINECAD
PVNCINGLCVNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLDTQDRGDGGISCSAEIG
VGVTRASCCCSLGRAWGNPCELCPPANTTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELP
GLCQGGNCVNTFGSFQCECPLGYYLNEDTRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLGNYTCV
CPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSFNMTKKMCCCSYNIGKAWNKPCEPC
PTPASPEYQILCGNQAPGFIIDIHTGKPIDIDECSEIPAICTNGVCINQIGSFRCECPIG
FSYNNILLICEDIDECSSGENLCQRNADCINIPGSYRCECSTGYKLSPSGACVGRNECQE
IPNVCSHGDCVDTEGSYICVCHNGFKATGEQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCL
CFPGFELTHNNDCMDIDECSSLVGQVCRNGQCINSIGSFQCLCQEGYDRTPDGKNCVDIN
ECVSLPGTCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVQNDNCIDINECEEEPNICLFGTCTNTPGS
FQCICPPGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGD
PCELCPQEGNVAFQELCPYGHGAIPGPGDTREDVNECSENLGICINGACINTDGSFRCEC
PFGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECV
LNPLLCAFRCINTFGSYECTCPSGYALREDRRMCKDLDECAEGLHDCESRGMVCKNLIGT
FMCICPPGMQRRPDGESCTDENECRTKPGICPNGRCVNTVGSYRCDCNEGFQVSPSGTEC
IDTRQGFCFTEVLQTMCQMSSTNRNLATKSECCCNGGRGWGTQCELCPLPGTTQYKKMCP
HGPGYSTDGQDIDECKVLPNLCKNGQCINSIGSFRCHCKLGYTTDITGTACTDLDECNQS
PKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILHEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGGFNCKC
PPGFTQHHSSCIDNNECTSQPSLCGAKGQCLNTPGSYNCECQKGFSLDSSGVNCEDVDEC
DGNHRCQHGCQNVLGGYRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECSSPTVCGSASCYNTLGSFKC
ICPSGFDFDQAFGGCQDVDECSAGSSPCSYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRAGQGHCISGLG
FGKGPYLPAPQEEDEDNLLSPETCYECKINGYPKRGRQRRSVNGTERHQDHRVNLASVDT
DAPLPMFLNLSDLAHKEHILELLPAVEPLENRVRYMISHGNEDGYFRIHQKEGLSYLHLG
RKKIVPGTYMLEIMSVPLYRKKELQKLEAKNDLNYLAGELGQALRMRLQLQLY
NT seq
8622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtattatggctggccaaattcatgctgggatgtacagcacttttgtatgtggaa
caagcccagtgtcaatatgacggggacttgcagacagacagattttcaggctatgaggaa
agacagccagcaaacagagtgagaagaagaggccaagacactttacgaggaccaaatgtt
tgtggctcaaggttccactcttactgctgccctggatggaaaacactgcctggaggaaat
cagtgtattgttccaatttgcaggcactcctgtggtgatggattttgctcacggccaaat
atgtgcacgtgctccaacgggcagctttccaccaattgtggttcttctggagtccaaacc
tgcagtgtaagatgcatgaatggtggaagctgcaatgaggagtcctgcctctgtcagaaa
ggatacactggaacttattgcgggcaacctatctgtgaaaatggctgccagaatggaggt
cggtgcattggaccaaaccgctgtgcttgtgtgtatggattcactggccctcaatgtgaa
agagactatcgcactggtccctgcttcagccaagtgaataaccagatgtgccagggccag
ctcagtggcattgtctgcaccaaaactatgtgctgcgccaccatcggaagggcctggggt
catccatgtgaaatgtgccctgcccagcctcacccctgccggcggggcttcatccccaac
atacgcactggggcttgccaagatgtggatgaatgtcaggctatccccggcctgtgtcaa
ggtggtaactgcatcaacactgtgggttcatatgagtgcaaatgtcctgcaggacacaag
caaagtgagaccagtcacaagtgtgaagatgtggatgagtgtagcactatctccagcgtt
tgtgatggcggtgagtgcaccaacacagcaggcagctatgtgtgcacgtgtccacggggc
ttcatgaccagcccagatggatcgcgctgtattgaccagcggattggcacatgtttctca
gctctgatcggtggacgctgcgctggggagctcccgggccaatacaccaagatgcaatgc
tgctgtgactctggacgctgctgggcaattgggcagactcctgaaatgtgcccagtcagg
ggatctgatgaataccgcagactctgcattgaaggactcccagtagtgccagggttccct
gggagcttcccaggaattcctggatttgggccaaatggtgtcgggcctggaatcagtgga
cctggaggcattggaccaaatggggctaatggacaaggcgggatcccaggcctgcctgga
atgggcccaggaagttcaagtattggaactgccaccttaaatcagaccattgacatctgc
aagcatttcaccaacctgtgtctgaatgggcgctgcatccccaccccctccagctaccga
tgcgagtgcaacatgggatacaagcaggacgtgcgtggcgagtgcattgatgtggatgaa
tgctccagcagcccctgtgtgcatggagactgtgtaaatacacctgggtcctaccactgc
aagtgccatgagggcttccagagcacccccactaagcaggcctgtatcgatatcgatgag
tgcatcatgaatggagtgatgtgtaggaatggccgctgcgtaaacactgatggcagcttc
cagtgcatctgtaatgctggctttgaaattacccctgatggcaagaactgcgttgatcac
gatgagtgtgctacaaccaatatgtgtctcaatgggatgtgtatcaatgaagatggcagt
ttcaaatgtatttgtaaaccaggctttgtactggctcccaatgggcgctactgtgttgat
atcgatgagtgcgagacccctggcatctgcatgaatggctggtgcatcaacacagagggc
tcctttcggtgtgagtgcctgggtggcctggccattggcgtggatggacgagtctgtgtg
gacacccatatgcgcagcacgtgttatggaggcattaaaaagggcacctgtgcccgtccc
tttccaggagccgttaccaaatctgaatgttgctgtgctaacccagaccatggttttggg
gagccttgtcaaccgtgtccagccaaaaactctgctgaattccaggcactctgcagcagt
ggcattggaataacagctgatggcagagatatcaatgaatgtgccctcaacccagacatc
tgccccaatggcatgtgcgagaacctgcgtgggagctaccgctgcatctgcaatttgggc
tacgaatcagatcccactggcaagaactgtgtggatgttgatgagtgcactgttaatcgt
ttgctctgtgacaatggcctgtgccgtaacacacctggaagctacacctgcacctgtccc
aaaggctttgtcttcaggactgagacagatacctgtgaagatatcaatgaatgtacctca
aacccatgtgtgaatggtgtatgcaggaacaatgctggctcttttgcctgtgagtgctcc
ccaggcagcaaactggacccaagtggcaccatctgtgtggacagcatgaaggggacatgc
tggttgaacatccaggatggccgctgtgaggtgaacatcaatggagcaacactgaaatct
gagtgctgtgccacactgggagcagcctggggcagtccttgtgagcgctgtgagatcgat
cctgcctgtcccagagggtttgccaggatgaagggggtcacatgtgaagatgtgaatgaa
tgcgatgtcttccccagcgtctgtcccaatggtcgctgtgtgaacacaggcggctccttc
cgatgcgagtgtccagaagggctgactctcgatggaactggcaggacatgtgtggatgtg
cgtgtagagcagtgctacatgaagtgggatgaggatgagtgcaatgagcccctgcctggg
aagtaccggatggacgtatgctgctgttctgtgggctcagcctggggcattgactgtgaa
gaatgtcccagagttggcaccagtgagtacaaggccatctgcccaagggggccaggcttt
gccaacagaggagatgtgctctcaggcagacccttctacaaagatgtgaatgagtgcaag
gtcttctctggtctctgcactcatgggacttgtcgaaacacaattggcagcttcagatgc
atctgtggcaatggctttgctttggatgctgaggagagaaactgcacagatatcgatgag
tgtcgcatctcaccagacctgtgtggccatggcacctgcatcaacactccaggcagcttt
gaatgcgagtgcttcgagggctatgagagtgggttcatgatgatgaagaactgcatggat
attgatgagtgtgagcgggaccccctgctctgccgtggcgggatctgcgtcaacaatgag
ggcagctttgaatgcatctgccccccaggccatgagctaaccagtgaaggccatgcctgc
gtagatatcaacgaatgctctctcagtgataacctgtgccgcaacgggcgctgtgtcaat
gtcatcggcacataccagtgcacgtgtgactcaggctttcaggccactccagacagacag
ggctgtgttgatattgatgagtgcaccatcatgaatggcggctgtgatacacactgtgcc
aattcagagggtagctaccagtgcagctgcagtgagggctacgcactgatgccagataag
aggtcgtgtacagatatcgatgaatgtgaggataacccagacatctgtgatgggggccag
tgcaccaacatccctggggaataccgctgtctctgcttcgatggcttcatggcttcatta
gacatgaaaacatgtattgatgtgaatgagtgcgacctcaatcccaacatctgccttcac
ggggaatgtgaaaacaccaagggctccttcatctgccactgccagcttggctactttgtc
aagaagggaaccactggttgcacagatatcgatgagtgtgaaattggagctcacaactgt
gacatgcatgcctcatgcatcaatgtacctgggagcttcaagtgcaagtgccgcacaggc
tggcttggagatggtctgaaatgcaatgatttggatgaatgtgccactgaagaacacaag
tgcaacctgaatgccaactgtgtgaacacaccaggctcctaccgctgtgcatgccgagag
ggcttcaatggggatggcttttcctgctcagatgtggatgaatgtgcagacaatgtgaac
ctgtgtgagaatgggcaatgcctgaatgcgccaggaggctaccgctgtgaatgtgagatg
ggcttcaaccccacagaggacagcaaggcttgccaagacattgatgaatgcaccttccag
aacatttgtgtctttgggacctgccaaaaccttccagggatgttccgctgtgcctgcgac
gatggctacgagctagataggagtggaggcaactgcacagatatcaatgagtgtgcagac
cctgtgaactgcatcaatggtctgtgtgtcaacaccccaggcagctacttgtgcaactgc
ccccaggactttgagctgaaccctactggtgtaggatgcgtggacacccgtgttggtaac
tgcttcctggacactcaggaccgaggggatggtgggatctcctgcagtgctgaaatcgga
gttggagtcactcgagcctcctgctgctgctcactgggccgtgcctggggcaatccctgt
gagctctgccctcctgcaaatacaacggagtacaaaaccctgtgtcctggaggagaaggc
ttcaggcccaaccccatcactgtcatcctggaggatatcgatgagtgccaggaactgcca
ggtctgtgccaggggggcaactgtgtgaacacatttggcagcttccagtgtgagtgtccc
cttggctactacctaaatgaggatacacgcatctgcgaagatattgatgagtgttcagcc
cacattgggatttgtggccctggaacctgctacaacacccttggcaactacacctgcgtc
tgcccccctgagtacatgcaggtcaacggaggaaacaattgcatggacatgaggaagagt
gtgtgctaccgcaactacaatgacacctgtgagaatgagctctccttcaacatgaccaag
aagatgtgctgctgctcctacaacattggcaaggcttggaacaagccctgcgagccctgt
cccacccctgccagccctgagtaccagatcctttgtggaaaccaggcccctggatttatc
attgacattcacactgggaagccaattgatattgatgagtgcagtgagatccctgctatc
tgcaccaatggcgtttgcattaaccagatcggcagcttccgatgcgagtgcccaattgga
ttcagctacaacaatattctgctcatctgtgaagacatcgatgaatgcagcagtggtgag
aatctttgccagcgcaatgctgattgcatcaacatcccgggcagttacaggtgcgagtgc
tcaactggatacaagctgtcgcctagtggagcctgtgtgggtcgtaatgaatgccaggaa
attcccaacgtctgcagccacggtgactgcgttgacactgagggcagctatatctgtgtc
tgtcacaacgggttcaaagccacaggagagcagaccatgtgcatggatattgatgaatgt
gaccggcagccttgtggaaatggcacctgcaagaacacagtgggttcctacaactgcctg
tgcttccctggctttgagctaacacacaacaatgattgcatggatatcgatgagtgctcg
tccctggtggggcaggtgtgtcggaatggccagtgtataaacagcattgggtccttccag
tgtctgtgccaggaaggctacgaccggaccccagatgggaagaactgtgttgacattaat
gagtgtgtgagcctgcctgggacctgttctcctggaacatgtcaaaacctggaaggctct
ttccgttgtatctgtcccccggggtacgaggtgcagaatgacaactgcatcgatatcaat
gagtgcgaagaggagcccaacatctgcctgtttggaacctgcaccaacacccctggcagc
ttccaatgcatttgtccccctggctttgtcctgtctgacaatggccgcaggtgctttgat
actcgccagagcttctgcttcacccgctttgataatgggaaatgctccgtccccaaggcc
ttcaataccaccaaagcccggtgctgctgcagcaagatgcctggagagggctggggtgac
ccatgtgagctgtgccctcaagaagggaatgttgcctttcaggagctgtgtccatatggc
catggggccatccctggcccaggcgatacccgagaagatgtaaatgaatgctctgagaac
ctgggcatctgcataaatggggcatgtattaacactgatggctccttccgctgtgagtgc
ccctttgggtataacttggactacactggagtcaactgtgttgacacagatgagtgctcc
attggtaacccctgtgggaacgggacctgcagcaacgtggtaggaggctttgaatgcacc
tgtgaggagggatttgagccaggccccatgatgacatgtgaagacatcaatgaatgtgtg
ctgaaccccctgctctgtgccttccgctgtatcaacacctttggctcctatgagtgcacc
tgcccctctggatatgccctccgggaagacagaagaatgtgcaaagatctggacgagtgc
gctgagggcctccatgactgtgagtctcgaggaatggtgtgcaagaaccttattggtacc
ttcatgtgcatctgtccaccagggatgcagcgcaggcctgacggagaaagctgcacagat
gagaacgaatgtcggaccaagccaggaatctgtcccaatggccgctgtgttaacaccgtg
ggcagctatcggtgtgactgcaacgaaggcttccaagtcagcccctctggcactgagtgc
attgatacccgccaaggtttctgcttcactgaagtgctgcagactatgtgccagatgtcc
tccaccaaccgcaacctggctaccaagtccgagtgctgctgcaatggtggacgtggctgg
ggaactcagtgtgaactctgcccactccctggaactacccaatacaagaagatgtgtcct
catggacctgggtactccactgatgggcaagacattgatgagtgcaaggtgctgcctaat
ctctgcaaaaatggacagtgcatcaacagcatcggctccttccgctgccattgcaagctg
ggctacaccacagacatcacaggcacagcctgcacagatctggatgagtgtaaccagtct
cctaaaccatgtaacttcatctgcaagaataccgagggaagctatcagtgctcctgcccc
agagggtacatcctacatgaagatgggaagacgtgcaaagacttggatgaatgttccacc
aagcagcacaactgtcagttcctgtgtgtgaacaccattggtggattcaactgcaaatgc
cctcctggattcacccagcaccattcatcctgcattgacaataatgaatgcacttcccag
ccttccctgtgtggagctaaaggacagtgtctgaacacaccaggaagctacaactgcgag
tgtcagaaaggattttccctggacagttctggtgtcaactgtgaagatgtggatgagtgt
gatgggaaccatcgctgccagcatggctgccagaatgtactgggaggctatcgctgtggc
tgtccccagggttacgtgcaacattaccagtggaaccagtgtgtagatgaaaacgagtgc
tccagccccacagtctgtggctctgcctcttgctacaacaccctgggcagcttcaagtgc
atctgtccttctgggtttgactttgaccaggcctttggtgggtgccaggatgtggatgag
tgctcagctgggagcagtccctgcagctatgggtgctcaaacactgatgggggctactta
tgtggctgccctggaggatacttccgagctggacaagggcactgtatttctggacttggc
tttggcaaaggcccctacctgcctgccccacaggaggaagatgaggacaacttgctctct
cctgagacttgctatgagtgtaagataaatggctaccccaagaggggccgacaacggcgc
agtgtcaatgggactgagaggcaccaggaccacagagtgaatctggccagtgtggacact
gatgctcccttgcccatgttcctgaacctctcggacctggcccacaaggagcatatcctg
gagctgctgccagctgtggagcccctggagaaccgtgtgcgctatatgatctctcatggg
aatgaggatggctacttccgcattcaccaaaaagaaggactcagctacttgcatctcggc
cgcaagaagatagtccctggcacctacatgctggagattatgagcgtccccctgtaccgc
aaaaaggaactgcagaaactggaggccaagaatgacctcaactacctagcaggggagctt
ggccaagcactcaggatgaggctgcagctccagctttactag
DBGET
integrated database retrieval system
