Nostoc sp. PCC 7120: alr4880
Help
Entry
alr4880 CDS
T00069
Name
(GenBank) two-component hybrid sensor and regulator
Organism
ana
Nostoc sp. PCC 7120
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
HATPase_c
HATPase_c_5
HisKA
Gp58
DUF6085
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAB76579
CyanoBase:
alr4880
UniProt:
Q8YMQ3
LinkDB
All DBs
Position
5814307..5815638
Genome browser
AA seq
443 aa
AA seq
DB search
MLDTSTETSFILIVDDTLTNLEIISEALIGAGFEVATAVDGKKALEQIQIRVPDLILLDV
MMPIMDGFETCKNLKIQPETHDIPVIFMTAITDTNSKVEALSLGAVDYITKPFHKAEVLA
RISSHLQLRSLNKNLEKRVTERTAELNQALKDLQDYQLQLVQQEKMSVLGQLVTGLAHEI
NNPVSCIYGNLGHALTYFENMNKLINLYQSYYPHPVQEIQDEISEMDLAYVRSDLPNLIF
SMKEGIQRIRDISRSLRIFSRSDTEKKIQFDIHEGIDSTILILKHRLKGSENHPDIEIKR
DYGVIPQVNCFPGQLNQVFMNILANAIDALEESFSHKYSSIIDSAVTDNQKLMAETPKII
IQTMLSEDQSHALIKIQDNGIGMPHQIKERIFDNLFTTKPVGKGTGLGLSISRQIIIQKH
GGKLEVNSEPGRGSEFIINIPIE
NT seq
1332 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttgatacatcaaccgaaactagctttattttaatcgtagatgataccctaaccaat
ctcgaaattatctctgaagcattgattggcgcaggttttgaagtagccaccgcagttgat
ggaaaaaaagcactcgaacagatacaaattagagtgccagatttaattctgctggatgtc
atgatgccaataatggatggatttgaaacctgtaaaaacttgaaaattcagccagaaact
cacgacattcccgtgattttcatgacagcaattaccgatacaaatagtaaagtagaagcc
ttaagtttaggtgcagttgattacattactaagccattccataaagcggaagtattagct
cgtatctcttcccatttgcaactaagaagcctgaataaaaatttagaaaaacgagttact
gaacgtacggcggaattaaatcaagcattaaaagacctacaagattatcaactccaactt
gtacaacaagaaaaaatgtctgttcttggacaattagtaacaggattagctcatgaaatt
aataacccagtcagttgtatttatggcaatttaggtcacgctttaacatattttgaaaat
atgaataagctgattaatttatatcaaagttactatccccatcctgtacaagaaattcaa
gacgaaatcagtgagatggatttagcttatgtgcgctctgacttacccaatttaattttt
tctatgaaagaagggattcagcgcatccgagatattagcaggagtctacgtattttttcc
agatcagacacagagaaaaaaattcagtttgatattcatgaaggaattgatagcactatt
ttaatactcaaacatcgattgaaagggtctgaaaatcatcctgatattgaaattaaacga
gattatggtgttatacctcaagttaactgctttcctgggcaattaaatcaggtgttcatg
aatattttagctaatgccattgatgccttggaggaatcatttagtcataaatattcttca
ataatagatagtgcagtaactgataatcaaaaactaatggctgagactccaaaaatcatc
attcagacaatgctgagtgaagatcaaagtcatgctttaattaaaattcaagataatggc
ataggaatgccacatcaaattaaagaaagaatatttgataatttgtttactactaaaccc
gtgggtaaaggtacaggtttaggattatcaatttctcggcaaattatcattcaaaaacat
ggcgggaaacttgaggtaaattcagaaccaggaagaggctcagaatttattattaacatc
cctattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
