Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0652
Help
Entry
RATSFB_0652 CDS
T01624
Name
(GenBank) F5/8 type C domain protein
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_85
F5_F8_type_C
PKD
PKD_4
DUF6385
InlK_D3
DUF4830
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81214
UniProt:
G2IHD6
LinkDB
All DBs
Position
complement(750851..753679)
Genome browser
AA seq
942 aa
AA seq
DB search
MIRGKLKKIIAISMFLAIAFIACSNKNANISTNNISKANYRVTGEAEEAEKLKMSNMPIA
PFWFPEELLNWDSTTDKNINFNKSTIPLATRVAKENLQTVNNNQNKDFKIVALSIMNEST
SGNSPQGLNKFASNTFSYWQYIDKLVYWGGSSGEGIIVPPSADVINSAHKNGVPVLGTVF
FPTTEHGGKAEWVDQFLTKDENGNFPMIDKLIEVCEVLGFDGWFINQETGLTIKQNDFID
QTETAKEGAKITKAHAELMQEFIREFNKKSDYEIMWYDSLTKDGEMDWQNALTEKNDYFL
IDSNKEKVADSMFLNFWWTTNRLAEQELLKASNLRATSLGLNPYDLYAGIDIQANGTNTQ
IRWDLLTDDKNSPYTSLGIYCPSWTFFSSNNLDEFMVKENRLWVNDVGDPRTTTENTGFV
GMSNYAVEKTVVNSLPFTTNFNIGNGYNYFINGEKVSSMDWNNRSLADIMPTYRWIINNG
EGNTFKASIDYSKAYYGGNSIKLSGNIKANTPTEIKLFSSDLKIENDTQFTTTLSSTSDV
SVSLVLDFDDGSSEEIKGNKNVSSEWVKVGFDVSKFSGKTIRSISYKILSDKDSNNININ
FGNISITDSKKVNVLDITSVNVDDVVFEEEDLYAGVRLSFNASNKKDVKQYEIYKVNEDE
SLTFLGASINENYFINALPRDNNSNTTTLEVVAVNNDLSRGKGIRTKIEWPNNSIPKADF
TASKTLVSPGEEITFTSLSSKVTENLEWIFEGANIQTSTDLSPKVKYENEGTYKVSLKAK
NSSGENVKVLEEYITVTKDADNFKNLSNSKNAEASSFVNANEAPNFAFDGKLDTKWCATG
TPPHSITVDLGNVALVSEVKMAHAEAGGESDSMNTSDYTIEVSEDGTNFTEVVNVKKNSN
SNTVDTFKAIFARYVRVTATKPTQGSDSAVRIYEIEVGGIEK
NT seq
2829 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattagaggaaaattaaaaaagattattgctatatcaatgtttttggctattgctttt
atagcttgcagtaataaaaatgcaaacataagtacaaataatatttcaaaggcaaattat
agagtaactggagaggcggaagaagcagaaaaattaaaaatgtctaatatgccaatagct
cctttttggtttcctgaagaactactaaattgggattcaacaacagataaaaatattaat
tttaataaatctactatccctttagctacacgagttgctaaagaaaatcttcagacagta
aacaataatcaaaataaagattttaaaattgttgccttatctataatgaatgaaagcaca
agtggaaattccccacaaggattaaacaaatttgcctccaatacgttttcttattggcaa
tatatagataagttagtttattgggggggatcttcaggtgaaggaataatagttccccca
agtgcagacgttattaactcagctcataaaaatggagttcctgttttaggaactgtattc
tttccaacaacagaacatggtggaaaagctgagtgggttgatcaatttttgacaaaggac
gaaaatggaaatttcccaatgattgataaactaattgaagtttgcgaagttttaggattt
gatggatggtttataaatcaagaaacaggtcttactattaaacaaaatgatttcatagat
caaactgaaacagcaaaagaaggtgcaaaaatcacaaaagctcacgctgaacttatgcag
gaatttatacgagagtttaataaaaaatctgactatgaaattatgtggtatgattctcta
acaaaagatggagagatggactggcaaaacgcattaactgagaaaaatgattatttcctt
atcgattcaaacaaggaaaaagttgctgatagtatgtttttaaacttttggtggacaaca
aatcgtttggctgaacaagaacttttaaaagcatctaatctaagagcaacctctcttgga
cttaatccatacgatttatacgctggtatagacatacaagcaaatggtacaaacactcaa
atacgctgggatcttttaactgatgataaaaattcaccttatacttcattaggtatatat
tgtccaagctggaccttcttttcttctaataacttagatgaatttatggttaaagaaaat
cgtttatgggttaatgatgtcggagatccaagaacaactaccgaaaatactggatttgta
ggaatgtctaattatgctgttgaaaaaacagtagttaattcattaccattcacaacaaac
tttaatataggtaatggatataactattttataaatggtgaaaaagtttcatcaatggat
tggaacaatcgaagtcttgctgatattatgccaacttatagatggattataaataatgga
gaaggaaatacttttaaagcttcaatagattattctaaagcctattatggaggaaattca
ataaaattatcaggtaatataaaagcaaatactcctactgaaataaaattatttagctca
gatttaaagatagaaaatgatactcaatttacaactactctttcttctacttctgatgtt
tcagtaagtttagttcttgattttgatgatggaagttctgaagaaattaaaggaaataaa
aatgtttccagtgagtgggtaaaagttggtttcgatgtatcaaaattttctggaaaaact
atacgttcgatatcttataaaattttaagcgataaagatagtaataatataaacattaat
tttggaaatataagcataacagattctaaaaaagtaaacgttttagatattacatcagta
aatgttgatgatgttgtatttgaagaagaagatctatatgcaggagttagactttcattt
aatgcatcaaataaaaaagatgttaagcagtatgaaatttataaagtaaatgaggatgag
tctttaacatttttaggtgcctcaattaatgaaaattactttataaatgcattaccaaga
gataataattcaaacaccacaactttagaagttgtagctgtaaacaatgatttgtctaga
ggaaaaggtattagaactaaaatagagtggccaaataatagtatacctaaggcagatttt
acagcttcaaaaacactcgtttcaccaggtgaagaaataacatttacaagtttaagttca
aaagttactgaaaatttagaatggatatttgaaggagcaaatatccaaactagcactgat
ctttcaccaaaagtaaaatatgaaaatgagggaacgtacaaagtttcattaaaagctaaa
aattcttctggagaaaatgtaaaagtactagaagagtatataactgtaacaaaagatgca
gataacttcaaaaatttatctaattcaaagaatgcagaagcatcaagctttgttaatgca
aatgaagctccaaactttgcttttgatggaaagctagatacaaaatggtgtgctactgga
acacctcctcacagtataacagttgatcttggcaatgtagctcttgttagtgaagttaaa
atggctcatgctgaggctggtggagaaagtgattccatgaatacatcagattacactata
gaagttagtgaagatggaactaattttactgaagttgttaatgttaagaaaaattctaat
tctaatacagtagatacatttaaagcaatttttgcaagatatgtaagagtaacagctaca
aaaccaacgcaaggttcagactctgctgttagaatttatgaaatcgaagtaggtggaatt
gaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
