Bacillus carboniphilus: LC087_11750
Help
Entry
LC087_11750 CDS
T09277
Name
(GenBank) T7SS effector LXG polymorphic toxin
Organism
bcao
Bacillus carboniphilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LXG
Endonuclea_NS_2
PT-TG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WLR41559
LinkDB
All DBs
Position
complement(2283893..2285872)
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MENLIYERDSLVSASQSRMHEYENLKEQFEEVKKAMLSLVEMDEFQGKGASAIKGFYQAQ
SEVINAWLGLIDRQIAFLKGIDGDTEEAGLGGETTVYVPFLEDELSKSIKQSKEMVHQQQ
DDISTILSSVSDLVDIDVYSTDRFEEAMENADKERKETIEAVEQLNQNLLNEYQQSEINQ
GFVVQLYSALIDATTKGGNVSPIHFNLKAFKESDVYQLRDDVQKATDEYVTLKDQQAEYR
QLQAAVEAEKNKPLYLKMVDGFKNFTGELTGYYDYKRATEGVDPITGRELSTAERVKAGG
MALAGFIPIAGWGGRLGKGGLGALKTFKGVSAATHALDAYKGAKSFDVLYKTEMGIYGLV
TANGFGEYLTGQDMFGNPLTDAQRQDSLHGALLGLTIGTAAHSLNRQASGQTLFPYSKAY
VGQKVTQSQQALSKLRSNIGQLRVPVGVEAQQLATSAGKVTNFKLNTKTLSDVKQQVMMK
AEGVGAKGNKIKELNEVSYGDHFTKGKRGRKELAPNVRYVTQDGYKYTTDELGRIIDVEA
DNLILQEADRNLGMQRAAGRENRLPDDDGGHLIGSQFHGSGDIDNLVAQNSQINRSGGQW
YKMESEWADALKEIPPRKVSVKIEPIYIENSLRPDSFEIVYKIEGKGIFEKIIKNKSGG
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaacctaatctatgaacgagattctcttgtttctgcttcacagtcaaggatgcat
gaatatgaaaatttaaaagaacagtttgaagaagtaaaaaaggccatgttaagtctagta
gaaatggatgagtttcaaggaaaaggagccagcgccattaaaggattttaccaagcgcaa
agcgaagtgattaatgcttggctcggtttaattgataggcaaatcgcctttttaaaggga
attgatggcgatacagaagaggcaggtttaggcggtgaaacgactgtctacgttcctttt
cttgaagatgaattatccaaatcaattaaacaatcaaaagagatggttcaccagcaacaa
gatgatatcagcaccatcctatcaagtgtttccgatttggtggacattgatgtgtattca
actgaccgatttgaagaagccatggaaaacgccgacaaagagcgaaaagagaccattgaa
gccgttgaacaactcaatcaaaacttgttgaatgaatatcaacaatcagaaataaaccaa
ggcttcgtcgtccagctctatagcgcactcattgatgctacgacaaaagggggcaacgtc
tcccccatccactttaacctaaaggcatttaaggaaagcgatgtatatcaattaagagac
gacgtacaaaaagcgacagacgaatacgtaacgttaaaagatcaacaagcggaatacaga
caactacaagcagcggtcgaagcagagaaaaataaacctttgtatttaaaaatggtagat
ggatttaagaactttacaggggaactgacgggctattatgattataagagagcaacagaa
ggcgtcgatcccatcacagggcgagagttatcaacggcagaacgagtaaaggcaggcgga
atggctctagctggttttataccgatcgcaggttggggaggtcgtctcggtaaaggtgga
ttaggtgctttaaaaacgtttaaaggcgtcagtgccgccacacatgccttagatgcgtat
aaaggagccaaatcatttgatgtcctttataaaaccgaaatgggcatttacgggttagtg
accgccaatggcttcggtgaatacttaacgggtcaagatatgtttggcaatcctttaaca
gatgcccaaagacaagatagtttacatggtgccttactaggcttaaccattggtacagcc
gctcattcattgaataggcaggcttcaggtcagacattattcccatacagcaaggcttat
gtaggacaaaaagtcacccaatcccaacaagcgttatcgaaattaaggtcaaatattggt
cagttgagagttccggttggcgttgaagcccagcaactcgccacaagtgcagggaaagtc
acgaactttaaacttaatacgaagacgttgagtgacgtgaagcagcaggttatgatgaag
gctgagggagttggggctaagggtaataaaattaaagaattaaatgaagtatcctatgga
gaccattttactaaaggcaaaagaggaagaaaagaacttgcaccaaatgttcgctatgtt
actcaagatggatataaatatacaacggatgaattaggacggattattgatgtagaagca
gataatttaatattacaggaagcggatagaaatttaggaatgcaaagagcggctggtaga
gaaaacagattacctgatgatgacggtggacatttgattgggagtcagtttcatggttca
ggcgacattgataatcttgttgctcagaatagccaaattaatcgttctggaggtcagtgg
tataaaatggaatcagaatgggctgatgcattgaaagaaataccacccaggaaagtatct
gtaaaaatagaacctatatatatagaaaattcattaaggccagattcatttgaaatagta
tataaaattgaagggaaaggaatttttgagaaaattattaaaaataaatcaggaggttga
DBGET
integrated database retrieval system