Bisgaardia hudsonensis: A6A11_05640
Help
Entry
A6A11_05640 CDS
T06663
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K01186
sialidase-1 [EC:
3.2.1.18
]
Organism
bhud
Bisgaardia hudsonensis
Pathway
bhud00511
Other glycan degradation
bhud00600
Sphingolipid metabolism
bhud01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bhud00001
]
09100 Metabolism
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
A6A11_05640
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
A6A11_05640
Enzymes [BR:
bhud01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.18 exo-alpha-sialidase
A6A11_05640
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BNR_2
BNR_3
Sialidase
PATR
Kbp-5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLB13130
LinkDB
All DBs
Position
1223195..1227691
Genome browser
AA seq
1498 aa
AA seq
DB search
MKNHKYIRRTVLATIIASTVSSFAISNPIFNFSSTNNQGPVDVTNQFSNNNAFNLESGSL
TFTFKNNSTSGISTLLGVTNPTTTDKYVWFYTKIENGKERFGIEIKNGNALINTNNLITE
PLEKTEDGYRTVTYTFDKDHNEIKIYVDGILNKTINNSKFFKDIDGLSSAYLGKLHRANN
YPTNPLTGLILQSDGTPTVLTQEQILEKYYGVQVKRQEALQKKLEEERQIEAKRKQFSAF
RSEKYEIFKPNQHGSKSYRIPSLFTTKKGTVIATIDKRLQHSADWGNIDTVIRRSLDGGL
TWQDDQVVLDLKSQSYNTGTQSAFLIDAVVTQDKRNGRIFMLLDMFPESQGFFSATTSAA
DGHGYLKVGDKYYRQVTDNQNNKYTVREDGIIYDITGQPTDFRVITEGNPENHFNDLGDL
YQVSSNTRHGNIFLNSQVQGNDSAPFKAYVTSYLWLLHSDDEGVTWSTPKDITPQVKADW
MRFLGTGPGTGIQLKNGNLVLPVYYTNKHNKQSPALIISKDGGETWIRGESPLDAYLDQI
GGSKEAYLTQTEMTESQIIELDSGKIKMFSRNHTGNVLISTSYDGGLSWKKAEAFSDPVL
LDPYSQMSVIKYSKRINGKEYILFSNPHHSNARQNGTIYLGEVQEDDSINWKYSTNITTG
RYSYNSLTELPNGDIGLLYEEQQGENIQYVRLNLQELLWRDNIIYRDTRNNSDNKNIDLT
TPDKDITYYKIGDGEIIQVGTGVNHAKLVIEEGTVTLAQKPDEQGNKQAFSHVTINELGT
LRIPEEGQIDLANVKLNGGSIDLNGRNIDISSESTNGLNLEALLGSITNENARETTLTYS
INGTNNSIKNIGSETSKINLVYQPSESSANLTITGNSFINQIDVKTGSITYDEYTEHKAE
NILLVNQSKLKVLSGVEATIESLSLADNSSLYANITNNKISNIAVNTKGNGNIEKYGAGL
LTLKGNLSHTGKTHVHEGKLELQGNVVSSPLTMESGTILAGNGSISGDTTLKENTIIQPG
FTQPINGISSRSATAFRSADSLDNAFSEQTLTFNKVTNEGTKIVLRVNNTPDNMNTWEHD
QVLIRGDVVSTATSIPVDVQFATNIVGNSDTNNNGKNDPDEGISLIQVLGKSTNETFTLG
KQLDRYNRENSLFQYILVPFNKESSSLAQNKFGDTTKIPFFDYRLQNRLVDQDNHRAVIN
PKIPSYLVANIAMLNQGNSLQQQFMNNLWSRKTAGFYVDQKHSNSNYQSNLGFKQYGYDY
KSSQNSTLFGGYIPLSNNTELHAGIGLSQQDVTPNAADGWSKARYKSTSFLLAARNQWDN
VILNLGLGYHNHKGKLSVADNDDIARINGKQLQLLGEVGYEFQLANFIVTPIYRLTYQHL
TTSTNEHLGNNWDIDFGKNKLISHRLGANFTWKNEAARFGIGAFYEDNSNNIHDILVKAD
QGKTFKSAKQGNAFLMQVNADFAITKQFSIGLSLDHRHAVSNAKLKQTQFGGKLEYKF
NT seq
4497 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatcataaatatattagaagaacagttctagcaacaattatcgcatctacggtt
tcatcattcgcaatttcaaatcctatttttaatttttcatcaacaaataaccaaggacca
gttgatgttactaatcaatttagtaataacaatgcttttaatttagaaagtggttcatta
acatttacatttaaaaataattcaacttctggaatatctacattattaggagttacaaat
ccaacgacaacggataagtatgtttggttttatactaaaatagaaaatggaaaagaaaga
tttggtattgaaataaaaaatggtaatgcattaattaatactaataatttaataacagaa
ccactggaaaaaacagaagatggatacagaactgttacttatacttttgataaagatcat
aatgaaataaaaatctatgttgacggaatactaaataaaacaattaataattctaagttt
tttaaggatattgacggattatcatctgcctatttaggtaaattacatcgcgcaaataac
tacccaacaaatccattaactggattaatattacaatctgacggaactcccactgttctc
acacaggaacaaatacttgaaaagtattatggtgtgcaagtaaagcgtcaagaagctctt
caaaaaaaattagaagaagaaagacaaatagaagctaaaagaaaacaattcagtgccttt
cgtagtgaaaaatatgaaatattcaagccaaatcaacatggttcaaaaagctatcgtatt
ccatctttatttacaacaaaaaaaggaacagtaattgcaacaattgataaaagactccaa
catagcgctgactggggaaatatcgatacggttatccgtagaagtctagatggtggttta
acatggcaagatgatcaggttgtacttgatttaaaatctcaatcttataatactggaact
caatcagcatttcttattgatgctgttgtaacacaagataaacgtaatggccgtatattt
atgttattagacatgttccctgaatctcaaggattttttagtgcaacaacaagtgcagct
gatggacatggctacctaaaagtaggtgataaatactacagacaagtaaccgataatcaa
aataacaaatatactgttagagaagatggtattatatacgatattacaggccaaccaact
gattttagagtaattacagaagggaatcccgaaaatcactttaatgatttaggagatctt
taccaagttagttcaaacactcgtcatggaaatatattcttaaattctcaagttcaggga
aatgatagtgccccatttaaagcttatgtaactagttatttatggttactgcatagtgat
gatgagggagttacgtggtctactccaaaagatatcacacctcaagttaaagctgattgg
atgcgtttcttaggaacaggaccaggaacgggaatccaattaaaaaatggaaatttagta
ttaccggtttattatacaaataaacataataaacagtcaccagctcttatcattagcaaa
gatggcggtgaaacttggattagaggcgaatcaccacttgatgcatatttagatcaaatt
ggtggctcaaaagaagcttatttaactcaaacagaaatgacagaatcacaaataatagag
ctagatagtggaaaaattaaaatgttttcaagaaatcatacaggtaatgtattgatttca
acaagttatgatggaggactttcttggaaaaaagcagaggcatttagtgacccagtatta
ttagatccttattctcaaatgtccgttattaagtattcaaaacgtataaacggtaaagaa
tatatcctattctcaaatcctcatcatagtaatgctagacaaaatggtacaatatatcta
ggagaggttcaagaagatgatagcatcaattggaaatactcaactaacatcactacaggt
aggtactcctacaactctttaactgaattaccaaatggtgatataggtttactttatgaa
gaacaacaaggagaaaatattcaatatgtccgcttaaatctccaagaattattgtggcgt
gataatattatctatcgtgatacaagaaataactcagataataaaaatatagatttaact
acaccagataaggatattacctattataaaattggtgatggggaaataatccaagtcggt
accggtgttaatcatgcaaaactagtgatagaagaaggtacagttacacttgctcaaaaa
ccagatgaacaaggtaataaacaagcatttagccatgtaaccataaatgaattaggtaca
ttgcgtattccagaagaaggtcaaatagatttagctaatgtgaaattaaatgggggttct
attgacttaaatggtagaaatattgatatttcatctgaaagtactaatggattaaatcta
gaagcattacttggtagcattaccaatgaaaatgctagagaaacaactctgacttattct
atcaatggtacaaataattcaattaaaaatattggttcggaaacaagtaaaataaattta
gtctatcaaccatccgaaagtagcgctaatttaaccattactggaaattcttttattaac
caaattgatgtaaaaacaggatcaattacttatgatgaatataccgaacataaagcagaa
aacattcttttggtaaatcaaagtaaacttaaagttttaagtggtgtagaggcaacgatt
gagtcattatccttagctgataacagtagtttatatgctaatatcacaaacaataaaata
tcaaatatagctgttaatactaaagggaatggtaatattgaaaaatatggtgctggatta
ttaaccttgaaaggaaatttatctcatacaggaaaaacacatgttcatgagggtaaatta
gaattacaaggaaacgttgtttctagtccactaacgatggaatcaggtaccattttagcg
ggtaatggtagtatctcaggagatacaacattaaaagaaaataccattattcagccagga
tttactcaacctattaacggtatatcatcaagatcagcaacagcatttagaagtgcagat
agcttagataacgctttttctgagcaaacattaacctttaataaagtaacaaatgaagga
accaaaatagtacttcgtgtgaataatactcctgataatatgaatacctgggaacatgac
caagtattaatcagaggtgacgtggtttcaaccgcaacatcaattcctgttgatgtccaa
tttgcaaccaatattgtcggtaattctgatactaataataatggtaaaaatgaccctgat
gaaggtatatcacttatccaagtattaggtaagtcaacaaatgaaacctttactttaggt
aagcaattagatcgctataatcgtgagaatagtctattccaatatattttagtgccattt
aataaagaatcttcttcattagcacaaaataaatttggcgatacaactaagattcctttc
tttgattatcgcttacaaaaccgtcttgtagatcaagataatcatcgtgcagtaattaat
cctaaaataccatcttatcttgttgccaatatagcaatgctaaatcaaggtaatagctta
cagcaacaatttatgaataatttatggtctcgtaaaactgctggattctatgttgatcaa
aaacatagcaacagtaattaccagtctaacttaggatttaagcaatatggttatgattat
aaatctagccaaaatagtacattatttggaggatatattcctttatcaaataatactgaa
ttacatgctggtattggattaagccaacaagatgtaacaccaaatgcagcggatggttgg
agtaaagcacgctataaatcaacctctttcttattagctgctcgtaaccaatgggataat
gtcatcttaaatttaggattgggatatcataatcacaaaggtaaattaagtgtagctgat
aacgatgacatcgctcgtatcaatggtaaacagttacaactattaggtgaagtaggatat
gagttccaattagctaactttattgttacgccgatatatagactaacatatcaacatcta
actactagtacaaatgagcatttaggtaataattgggatattgattttggtaaaaataaa
ttaataagtcatcgcttaggtgctaacttcacatggaaaaatgaggctgctagatttggt
attggtgctttctatgaagataatagtaacaatatccatgatattttagttaaagcagat
caaggtaaaacatttaaatcagctaaacaaggaaacgcattcttaatgcaagtaaatgct
gactttgctataaccaaacagttctccattggattaagtttagatcatcgtcacgcagta
tcaaacgccaaattaaaacaaactcagtttggcggaaaattagaatacaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
