Beggiatoa leptomitoformis: AL038_18430
Help
Entry
AL038_18430 CDS
T04090
Name
(GenBank) HAMP domain-containing protein
Organism
blep
Beggiatoa leptomitoformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Guanylate_cyc
HAMP
GAF
PAS_9
GAF_2
PAS_8
GAF_3
PAS_4
PAS
PAS_7
PAS_10
CTD11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGX03518
LinkDB
All DBs
Position
766025..769060
Genome browser
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MVFNMVAVGEPFVFKNLKLKSKLLLSFFIVTCISTISTTIFSIYYFSDKIEVEAVENMKK
NMRVAQLIYQNKVKEIESTTHTLATDRSLQVLVNFLIKNKINQYLTDALDSKKLSQLIIV
DPQKNLLAQTIRKDYARLEKETALHNNILIKKALEQRETITATELIEIDNLQKLLAISVA
SPIFKSEAVRSANNNSPIATQPEVIGVLLARYVLNQDRILVADIENLLEVTAAIYADAES
ISFTTEHLENKPQIRAENYLRTIRAQQEIHDIDIRYGGQLAEYATINDINKMPIAVLGVS
IPADRYVETTKQAVINLLGLMLLCIVVASIFGYLLARSILIPIYKLLNGVRRVTSGDLSY
EIIMDLKDEFGTLASSFNSMSRQLQELFNTLEQRVQDATRKLQNTLAHMTAIIDNMADGL
LVTDKQGKIIRYNPALLAMFPKRRDMLGKDCQDIFNDAEAAELARKVMNSIGEVYGAEIS
LVDNRVGQAVATAIIQKDTLSETSEYVGSKYIGSVILVRDITKEKEADRILKNTVETLTR
VGTALSAENSLLKLLELFVSEARNVTNADGGTLYILEDEQLGFEIIQNKSLNLFLGGAYT
QSIDLPAINIHEQKYVAYSARTKQILTSKADFKEVFDPERDKAIYTLFKGYRIQEILVVP
LLDRTQNAVGVLQLINPLDPKTGDCVPFANNHIEIVFSLASQAAVAIENVRNYEKIERKN
IAFKRFVPTEFLLRLGREEIEDVVLGDASQETMSVLFSDIRSFTTLSETMTPEDNFHFLN
DYLDFIGPNITENGGFIDKYIGDAIMALFPGTHVGVADDAVLAAVGMLMRLHEYNAYRQN
NGEKPLSIGVGIHTGALILGTIGFESRMESTVIGDTVNLASRMEGLTKQYGIIIGITSST
YQQLQHPERFLIREIDTVQVKGKEEAITVYEVFDVDPLALREVKLAHLTRYEIAMQLYKS
RQWEEALEHFLALKVFLQDDKVINIYIQRCQYFITNPPNELWRGVTRLDEK
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtattcaatatggtggcggtgggagaaccttttgtgtttaaaaatctcaaattaaaa
agtaagttactactttctttttttattgtgacgtgtatttccactatctctacaactatt
ttttcaatttattacttctccgacaaaattgaggtagaagccgttgaaaatatgaaaaaa
aatatgcgggttgcacagttaatttatcagaataaggttaaagaaattgaaagtacaacg
catacattggcaaccgatagaagtttacaagtgttagttaattttttgattaaaaataag
attaatcaatatttaactgatgcattagacagtaaaaaattatcgcagcttattattgtt
gacccgcaaaaaaacctattagcgcaaacaatacggaaagattatgcccgtttggaaaaa
gaaacggctttacacaataatattttaataaaaaaagccttagaacaacgggaaaccatt
actgcaacggaattaattgaaattgataatttacaaaaattattagcgatttcagtagca
agccctatttttaaaagtgaggcggttcgcagtgcaaataataactcgccaatagcaaca
caacccgaagtgataggcgtacttttagcccgttatgtgttaaatcaagatcgtatttta
gtcgctgatattgaaaatctgttagaggtaacagcggcaatttatgctgatgcagaatct
atcagttttacaacagaacatttagaaaataagccacaaatcagggcagaaaattatctt
agaactattcgtgcgcagcaagaaatacatgacattgatattcgctatggtggacaatta
gctgaatatgcaacgattaatgatattaataaaatgccaattgctgttttaggcgttagt
attcctgctgataggtatgtagaaaccacaaagcaagcggtgattaatctacttggatta
atgttgttgtgtattgttgtcgcttctatttttggttatttgctggcgcgtagtatattg
attcctatttataaattacttaatggggttcgacgggttacttctggcgatttgtcgtat
gaaattattatggatttaaaagatgaatttgggacattagccagttcatttaatagtatg
tcacgacaattacaggagttgtttaatacactagagcaacgggtacaagatgctacacgt
aaattacaaaataccctcgcgcacatgacagccattattgataatatggcggatggttta
ttagtaactgataaacaaggtaaaattattcgttataatcctgcattattggcgatgttt
cctaagcggcgcgatatgttggggaaagattgccaagatatttttaatgatgcggaagcc
gccgaattagcccgcaaagtcatgaatagtattggtgaggtttatggcgcggaaattagc
cttgtagataatcgagtgggacaagccgttgcaaccgcgattattcaaaaagacaccctt
tcagaaaccagtgaatatgttggttctaaatatatcggttcggtcattttagttcgggat
attacgaaagaaaaagaggctgaccgcattcttaagaatacagttgaaacgctaacacgt
gttggaaccgccttatctgctgaaaatagtctgctgaaattattagagttatttgtgtct
gaggcgcgtaatgtaacaaatgcggatgggggaacattgtatattttggaggatgagcaa
ttgggctttgaaattatccaaaataaatcccttaatttgtttttaggcggtgcttatacg
cagtcaattgatttacccgctattaatattcatgagcagaaatatgttgcttatagtgcg
cggactaaacaaattttaaccagtaaagccgattttaaagaagtatttgaccccgagagg
gataaggctatttatacgctgtttaaaggctatcgtattcaagaaattttagttgtacca
ctcttagaccgtacacaaaatgcagttggggtattgcaactgattaatccgctagacccg
aaaacgggtgattgtgtgccatttgcgaataaccatattgaaatcgtgttttccttagcc
tcacaagcagccgtcgctattgaaaatgtgcgtaattatgaaaaaattgaacgcaaaaat
attgcctttaaacgttttgttccaaccgagtttttattacgtttgggaagggaggaaatc
gaagatgttgttttaggggatgcgtctcaggaaacaatgtcggttttgttttcggatatt
cgttcatttacgactttatcggaaaccatgactcccgaagataactttcactttttaaat
gattatttggattttattggtcctaatatcacagaaaatggtggttttatcgataaatat
attggcgatgccatcatggcgttatttcccggtacgcatgttggggttgcggatgatgcc
gtattggcggctgttgggatgttaatgcgtttacatgagtacaatgcttatcgacaaaat
aatggggaaaaaccattgtcaattggagtgggtattcacacgggcgcattgattttaggc
acaattggttttgaaagtcggatggaaagtaccgttattggtgatacggttaatttagca
tcacgtatggaaggcttgactaaacagtatgggattataatcggcattacttcttctact
tatcagcaattgcaacatcctgaacgctttttaatccgtgagatagacaccgtacaagtt
aagggaaaagaagaagctattacggtttatgaagtgtttgacgttgacccgctggcgttg
cgcgaggtgaaattagcccatttaacccgttatgaaatcgcaatgcagttgtataaatct
cgtcaatgggaagaggcattagaacactttttagcattgaaagtttttttacaagacgat
aaggtcattaatatttatattcagcgttgccaatactttattactaatccacccaatgag
ttatggcgaggcgtaacacggttggatgaaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
