Salinivirga cyanobacteriivorans: L21SP5_03025 Help Entry L21SP5_03025      CDS       T04172                                  Name (GenBank) Microbial collagenase precursor Organism blq  Salinivirga cyanobacteriivorans SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  PKD_4 PKD CHU_C PKD_3 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ALO16645 UniProt:  A0A0S2I373 LinkDB All DBs Position complement(3656162..3663097) Genome browser AA seq 2311 aa AA seqDB search MKNRVSRILALAINLLLFLFINSTIYAQTDQEFWFIAPEVNDAHGGGGQPTYLRIATYDL PSEVTISQPANPAFTPIVINIPANDTRSIEFRPGGGGAGVYDLNLIENEIQSPTPTRVGN INNVGLKISSTSNITAYYEISSNLNREIVALKGRNAVGRNFYVPFQTNFNNYLTGSYPLV YSAIDILATQATTVNIRPTNDMLIVDAGGDVVIPAFTTYSVNLNTGETFTAVPYGTGDNA TYNISRRDRLAGTRVWSNDSALVVQTKDDLVHDLSGVYCNGCGGDVDYVADQLVPVSLLG QTYVVMQGQITTVPEYVYVLATENATTVSLNGTPQAPVLNAGEQMAIRIDNLGSNFNLIE ADHPVSVYHVSGFAGQMGGSILPQIDVCTGSQEVVFTRPQNFDFYMNILVRKGAENNFEL NGVGGLINPIGGWTEIVPNEWMAGTIDATGIVATQTPQVLSNDDVFHLGIINGDGSTDCF YGYFSDFNKLDVSATIVGTIDGSKVLCYGKSTQLIASTGNSYLWTADATPYYIDDPTSQN PIVSPLTNRKYKVVVEGGCNLRDSAYVDIIVSDPIEASFALSDVLGCAPMDVAIVNHSED NYPVSDYEWDMDGDNIPEYTTGPDTIYHTFNNTTNAPITYEIKLRTENILRCKDSLYADV TVHPAIYADFEPDTAGCNPLTVPFRNLSSGDTATFEWSFGDGATSIESEPVHQYQNLTNN IQTYTAQLVTKSPTYFCKDTMTRTVSVEPALYAQFHVDKNMGCAPLEVTPSNLSSPSASI DSYKWIWGDGDTTYTDNPGSHTYTNNTGIEQIYTLKLVAIKNSCTDTTELDIRVYPGVEA GFDQDLLSGCHPLPVTFQDTSTGAIAEQKWFMGDGTVINNQLNPVHQFENYSGADTTFNV QLIIASANGCQDTAQNNITVHPYIKAGFTPNKIKGCANLEISVINKSAGAINSYEWTWGD GSPVTNAINPAPHTYTNPTDNIIQDTIQLVVDNTAGCTDTAFQPIEIYPVADATFTAAPL SGCNPLDVDFAHTPTNNVDVQLSWNFGDASSGSDSAITHTYQHFNTTTTTFDVELAVQTA RGCKDTATTTVDVGPYYDIAFTLDTAQGCSPFTIRPTNTSSGGIDTWTWKKEDVVFSSAQ SPAAITLYNTTNNPIDTVITLIGSNTGGACEDSMQRTVTIYPSVDATYIQDVDEGCNPLT VNFTHTPANNPAMSFNWDFDDNNSSALQNPSHTFVNNTAASKIYNVQLNVTSPYNCKDSA NSVVTVGSYVEARMSVSAVSGCAPFQVEFEDISNGDVATRTWLRNGTSFSNLANPQIIIN NNSGVARQDTIMLIVENGSGFGCTDTAQKIITIYPEVDATFNHPVTQGCNPLTVDFTHNP AFPIPVDYTWDFGDESSSNLANPTHTFNNQTESPRTYNIKLLVESQHGCKDSTYSSVEVA SRLDAKFVMPAAAGCSPFSASFQDASVGDINSWQWYIDGNPVSSTSTASTTLNNTTNFNI TQDVKLVVSNSGPGNCVDSVTKQITAYPEVTANFSQDTDRGCNPLPVNFTYEPGGNTVNV NHDWDFGDGTSSDEQDPPHNFEHFNYNGTTTFEVWHTTTSEYGCTDQQSSTVVVEKALKA EFAIDPSAGCNPFDATFVNTTQGADTYQWTFGDGDTYDVNVLQDVSHQYTNSSYTNTATF DAQLLVTNTAGNCRDSMTKTVSVYPNVRATYDLSSTEGCHPLTVDFTNTSLGSNNFYWDF DDQTSATVTNPTHTFTNFSSTNDVFYDVYLLATNDFECQDDTTATIRVNHLPKSQFTIDN TESCSPLEILAQNTSIGYDDFQWRLGNGETSSSATLNYTYNNTGNSTASYQLELFTQTNR GCTDSSSLLLNVYPNVSADFNIETDRGCNPLTTAFDNLSVNADNFYWDFGDGTTSNQQNP TNRFEIQGYTNQTIPVKLVAASDYECTDSTTKNVTVYVQPAAEFEADPATQQYPQSTVTI TDLTNGGPFSYQWSFGDGNTSTQMFPGAHTYDTWGTYTIDLSVVNNDFNCADNASESITI DPPVVTAEFNIDDTAGCVPHTVTFTAEASQYPDDNYDYLWDFGDGTSSTEQQPTHTFDSA ATYPITLTVVGDNGAVNAAGSVKVYPLPEVSFTMEPRLLMIPGDQTQCYNLTQYASDYLW DFGDGSTSTDKNPTHYYSTEGQYTVSLTATSAFGCQASATRENYIEVIGKGQVVFPNAFT PSLAGPSDGAYSDSDVSNNIFHPMAEGVVEYNLYIYNRWGELMFESKDVDVGWDGYYNGK LCPQDVYIWKVEGKFINGKTFEKTGDVTLLR NT seq 6936 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaaatcgcgtatcccgtatactcgctttagcaattaacctcttgctctttctgttt ataaacagcaccatttatgcgcaaacagaccaggagttttggttcatagcccctgaagta aacgatgctcacggtggtggcggtcagcctacttatttacgcattgctacctacgacctg ccctcagaagttacaataagccaacccgcaaacccggctttcacgccaatagtaattaat attcctgccaatgatacacgctcaattgaatttagacccggaggtgggggtgccggagtt tacgacctcaacctaattgagaatgaaattcagtcgcctacacccaccagagtaggaaac ataaataatgtaggacttaaaatttccagcacatcaaatattacagcctattatgaaata agctctaatttaaaccgcgaaattgtggcgctgaaaggccgcaatgctgtaggcagaaat ttttatgtgccttttcaaaccaactttaataattatcttacgggctcctaccccctggtt tacagtgcaattgacatacttgcaacgcaagccacaacagtcaatatcagacccacaaat gatatgctgatagttgatgcaggtggggatgttgtaattcctgcttttacaacctacagc gttaacctgaatactggcgaaacatttacagctgttccttatggaactggtgacaatgcc acctataacatcagtcgtagagatcgacttgccggtacacgggtgtggtcaaatgactcg gcacttgtggtacagaccaaagacgatctggtacacgatttaagtggcgtttattgcaac ggctgcggaggagatgtcgactatgtggctgatcaattagttcctgtaagcttgctcggg caaacttatgtagtcatgcagggacaaatcacaacagtcccggaatatgtttatgtactt gccaccgaaaatgcaactacagttagcttaaacggaactccgcaagcaccggttctcaat gccggtgagcaaatggcaataagaattgataatttaggatcaaattttaatttaatagaa gccgaccatccggtatcagtatatcatgtttctggttttgcaggacaaatgggtggcagt attttgccacaaattgatgtttgtacaggttcacaagaagttgtatttacaagaccccag aactttgacttttacatgaatatactggtgcgaaaaggagctgaaaataattttgagctc aatggtgtaggcggacttatcaatcccataggaggatggactgaaattgtgccaaacgag tggatggccggaacaatagatgcaacaggaattgtcgcaacacaaacgccccaggtttta tcaaacgatgatgtttttcacctgggcataattaatggtgatggatcaacggactgtttc tatggctatttcagcgattttaataagctcgacgtttcagctacaattgttggtacaatt gatggctcaaaagtactgtgctacggtaaaagtacccagttaattgcaagtaccggcaac tcctacctttggacggcagatgccacaccctattatattgacgacccaacaagccaaaac cctattgtatcccctttaaccaacagaaaatacaaagttgtggtagaaggaggatgtaac ttgcgggactctgcttatgttgacattattgtttccgaccccattgaagcatcttttgct ttaagcgatgtactcggttgtgctcccatggatgttgccattgtcaatcattctgaagat aattatcccgtatctgactacgaatgggatatggatggagacaatatacccgaatacacc acaggaccagatacaatttatcatacatttaacaatactaccaacgcacctataacctac gaaataaaacttcgcacagaaaacattctccgctgcaaagactctttatatgctgatgtt accgtacatccggcaatttatgctgatttcgaacccgatacagcaggttgtaatccattg acagtgcctttcaggaacctatcaagtggcgacaccgctacatttgaatggagttttggc gacggagccacatcaattgagtcagaacccgtacatcaataccaaaacctcactaataat attcaaacctatacagctcaattggtaaccaagtcacccacctatttttgtaaagataca atgaccagaacggtatcagttgagccagcactttatgcacaatttcatgtggataaaaat atgggctgtgcaccactggaagttacaccttccaacctatcatcaccatcggcctcaata gactcctataaatggatatggggagatggagacacaacttataccgacaatcccggctca catacatacaccaataacaccggaattgaacaaatttacacattaaaactcgttgccatt aaaaacagttgtacagacacaacagaattagacataagggtttaccccggagtagaggct ggtttcgatcaggatttattaagcggatgccatccattaccagtaacttttcaggatact tctactggtgcaattgccgaacaaaaatggtttatgggcgatggtacggtaattaacaat cagctcaatccggttcatcagtttgaaaactacagcggagccgatacaacattcaacgta caattaatcattgcatcagcaaatggttgtcaggatactgcacagaacaacattaccgtg catccttatataaaagccggctttacacccaataaaattaaaggctgtgcaaatcttgaa atatctgttataaataaatcagcaggtgccatcaatagttatgaatggacctggggtgat ggatcacctgtaaccaatgcgatcaatccggcacctcatacgtacacaaacccaacagac aatatcatacaggacactattcaattggtagtagacaataccgcaggatgtactgataca gcattccaacctatagaaatttatcccgtagccgacgccaccttcaccgcagcaccactt agtggttgcaacccactggatgtggattttgcacacacacccaccaataatgtggatgtg caactcagctggaattttggcgatgcttcttcgggcagcgacagtgccattacccacacc tatcagcactttaatacaaccacaaccactttcgacgtggagctggcagtgcaaacggcc cgcggttgtaaagatacggctaccactaccgtggatgtgggtccatattacgatattgct ttcaccctcgatactgcccagggttgttcgccttttacaatcaggcctaccaacacttca tcgggtggtattgatacatggacatggaaaaaagaagatgtggttttctcttctgctcag tcgcctgcagccattacgctgtacaacaccaccaacaaccccattgatacggtcattaca ctcattggctcaaacaccggtggggcctgcgaagacagcatgcaacgtaccgtgaccatt tacccatctgttgatgctacctatattcaggatgtagacgaaggttgtaatcctttaact gtgaattttactcataccccggccaacaacccggccatgagtttcaactgggattttgac gacaacaactcctcggcactgcaaaatccttcccacacctttgtaaacaacactgctgca tctaaaatttataatgtgcaactcaatgtcacctcaccatacaactgtaaagattctgcc aactccgtggttacagtaggttcgtatgtggaagcacgcatgtcggttagcgcagtcagc ggttgcgcccctttccaggtcgagtttgaggatatttccaatggtgatgtggccacacga acatggctgcgtaacgggacttcattctctaacctggccaacccgcaaattattatcaat aacaacagcggggttgcaaggcaggataccattatgctcattgtagaaaatggcagtggg tttggctgtaccgatacggctcaaaaaatcattaccatttatcccgaagtggatgccact ttcaatcatcccgttacccaggggtgtaatccgcttacggttgattttacacacaacccg gcattccccataccggttgactacacatgggattttggcgatgagtcgagcagcaacctg gccaacccaacacacacttttaataaccagaccgaatcgccgcgcacttacaatattaag ctgctggtagagtcgcaacatggttgtaaagactctacttacagctcggtggaggtggct tcaaggctcgatgccaaatttgtaatgccggctgctgctggctgctcacctttcagtgct tctttccaggatgcttctgtaggtgatattaattcatggcagtggtacatcgatggtaac ccggtaagcagcacaagcacggcatcgactacgctgaacaacaccactaatttcaatatt acacaggatgtgaagctcgtggtatctaattcagggcccggaaattgtgtcgactcggtg acaaagcaaattacggcctatccggaagtgacggccaatttcagccaggataccgatcgc ggttgtaacccgctgccggtgaacttcacttatgagcccggtggcaatacggtcaacgtg aaccacgactgggactttggtgatggtacatcttctgacgagcaggacccacctcacaat ttcgagcatttcaactacaatggtaccacaacttttgaggtttggcacaccacaacctct gaatacgggtgtaccgatcagcaatcttcgaccgtggtggttgaaaaagcactgaaagca gaatttgccattgacccaagtgcagggtgtaatcctttcgatgctacatttgtaaatacc acacagggggccgatacctaccagtggacctttggcgatggcgatacctatgatgtaaat gtactgcaggatgtaagccatcagtacaccaacagctcatacaccaacaccgcaaccttt gatgcccagctactggtgaccaacactgccggtaactgccgcgactctatgaccaaaacc gtttcggtttatcctaatgtcagggccacctacgacctctcttctacagaagggtgtcat cctcttaccgtcgactttacaaacacttcgctgggtagcaacaatttttattgggatttt gacgaccagacaagtgccacggtaaccaacccgacgcacacatttaccaatttcagctct accaacgatgtgttttacgatgtttatttactggccaccaatgattttgagtgccaggat gataccactgcaaccatcagggttaatcacctgcccaaaagccagtttacaattgacaat accgaaagttgcagtccgctcgaaattctggctcaaaatacctccatcgggtatgacgat ttccagtggcgcctcggaaacggggagacctcatccagtgccacactcaattatacgtac aacaacacaggaaacagcacggccagttatcagctggagctctttacccagaccaacagg ggctgtaccgacagcagttcgctattgctcaatgtataccccaacgtatcggctgatttc aatattgaaaccgaccgcgggtgtaaccctctcactacggcctttgacaatttatcggtc aatgccgacaatttctactgggactttggcgatggcaccacatctaatcagcagaaccca accaaccgattcgaaattcagggatacaccaaccaaactattcccgtgaagctcgtggca gcttctgattatgagtgtacagactccaccacgaaaaatgtaaccgtgtatgtgcagcct gcggccgagtttgaggccgatccggctacgcagcaatacccgcaaagtacagttaccatt actgatttaaccaatggcgggcctttcagctaccaatggagctttggcgatggtaatact tcgacacaaatgttcccgggtgcgcacacttacgatacatggggtacttacaccattgat ctgagtgtggtgaacaatgattttaattgtgcagacaatgccagcgaaagcatcaccatt gatccgcccgtggttactgctgaattcaatattgacgataccgcaggttgtgtgccacat accgtcacttttacggctgaagcttcgcagtaccccgacgacaattacgattacctgtgg gactttggcgatggtacatcatctacagagcagcagcccacacacacatttgattcggct gccacttatcccattacactgaccgtagtgggtgataatggtgctgtaaatgcagctggt tctgtcaaggtatatccactgcctgaggtatcattcaccatggagccccgcctgcttatg attcccggcgatcagacccagtgctacaacctcacccagtatgcttctgattatttatgg gactttggcgatggatcgaccagcactgacaaaaacccgacgcattactacagcacggaa ggacaatatactgtttcactcactgccaccagtgcttttggctgccaggcctcagccaca cgagaaaactacattgaggttattggcaaagggcaggttgtttttcctaatgcctttacc ccttcgctggcagggccttcggatggtgcctacagcgattctgatgtaagtaacaacatt ttccacccaatggccgaaggggttgtggaatacaatctgtatatttacaaccgctggggc gaactcatgttcgaaagtaaagatgtagatgtgggatgggacggttattacaacggaaag ttatgcccccaggatgtatatatctggaaggtagaaggaaaatttatcaatggtaaaacc tttgaaaaaactggagatgttacactactgcgataa

DBGET integrated database retrieval system