Brassica napus (rape): 125607145
Help
Entry
125607145 CDS
T04128
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC125607145
Organism
bna
Brassica napus (rape)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RVT_1
RT_RNaseH_2
RT_RNaseH
Integrase_H2C2
RVP_2
Retrotrans_gag
rve
Ty3_capsid
zf-CCHC
zf-H2C2
gag-asp_proteas
Asp_protease
Asp_protease_2
Chromo
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125607145
NCBI-ProteinID:
XP_048632928
LinkDB
All DBs
Position
A3:10820912..10826331
Genome browser
AA seq
1650 aa
AA seq
DB search
MPPKKGTKRTRTVRVRADAREVVDEQGAAGDVQGNGVQAEGVQPVVPPFDQAALMQMVQQ
AATQAAQVAIQQVTQEAARVAAQEAARVAAQEVARQLAAGQQIPAQQIPPQQIPAQQIPP
QQIPPPQIPPQQIPPQQIPPQVPVQGVPEQQLPQGLQQPPLPPPPPLPVYRVYDERFYRL
TTQMRNMDMEHFGGTVDATVAYDWKLGLQRKLEIIECPPEVSLRLAMQYLREDALVWWEG
VRLGHRGPDPLTFTDFIREFDRKYFPKEAMVKKKSDFEHVSQSGMTIREYEVEFNRLRRF
AGGGITEDDLIRKFLSGMQVDIRNRCRVVTYQRLGDLVEKAAEQEAGLAEEQKFLKSSQT
KSGKTDETQKRTRDQSEAPYCARCRRHHDGECLKCFTCGRWGHLSTHCRMKPADATSASQ
IATPTAAIRICYSCYEPGHIARDCPKKGQPTLPPAKRSVSVGGEVAHTLFDTGASHSFVS
SRLVKFWPFQGVFEPKTKQIRTVGTERIGATGVHRDVPILLEGFVFTGDLAEMELDYYDV
ILGMDWLTRHRVVLDCPKARVHIPREEGKITFQCVQAHRGISIVSMMHAEELLEKGVEGF
LASISMVKNDGHHELQDIPVVEEFEDVFEALQGPPPARGDALTIELEPGTAPVSRAPYRL
APAEMAELKKQLEELLGKGFIRPSTSPWGAPVLFVKKKDGSFRLCIDYRGLNKVTIKNKY
PLPRIDELLDQLQGASWFSKIDLASGYHQIAIAGEDVRKTAFRTRYGHYEFVVMPFGLTN
APAAFMKLMNDVFREYLDKCVIVFIDDILIYSRSREEHAEHLRIVLEKLREHQLFAKLRV
AVDPEKIIAITEWPTPKSATEIRIFLGLAGYYRKFVKGFASIAKPMTQLTGKDVKFVWTD
ECSKSLTELKRQLTDTPVLVLPRPGIPYEVYTDASGTGLGCVLMQDGHVIAYASRQLRPH
EVNYPTPDLELAAVVFALKIWRSYLYGEKVQILTDHQSKANHVADALSRRRSDVSGTKEV
QELTGTIASLRLCAITSDGETAGLDVLEQADLLWRIRRVQDDDEALVKQIEIESIGYHTA
LSGMYMYRNRVCVPDDKLLRKEILQQAHNSRFSIHPGNTKMYRDLKRYYHWTGMKKDVAT
FVSQCQTCQMVKAEHQVPSGLLQNLPLPEWKWDMVTMDFVTGLPTTLGGRNAIWVIVDRL
TKSAHFIAIKKTDGADQLAQIYLREIVRLHGVPVSIVSDRDTKFTSAFWRAFQKALGTKV
HMSTAYHPQTDGQSERTIQTLEDMLRACVLDWEGNWGKYLPLAEFAYNNSYHSSIEMAPY
EALYGRPCRTPLCWTEVGERRDLEPAMVQETVEQVEMLKSRLREAHDRQKSYADKRRKDL
EFQVGDLVYLKMRTFQGGSKTRKLKKLKPRFMGPYPILERIGAVAYRLGLSAELSDFHDV
FHVSVLRKVVREPELILQQPPSDLGKNLSALCQPVQILDRQVKAVQGMMTSFVRVRWERD
GIHEETWETETQMRIDYPELFEDGIGQLVQEPNSGSNSLLVGENCNDPIPSPITLARQSP
LVLQETLEIEPSLTSEIVPPPPPRPEPRSTSSPPIPAEDHHRDRDVETSPEQEDQPEIRP
DAPSRASFVPRRSERVSHAPAQPAVVHRRR
NT seq
4953 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgccaaaaaaaggaactaagcgtactcgcacagttagggtcagagctgatgctcgt
gaagttgtggatgagcagggtgctgcaggagatgttcaggggaatggtgttcaggcagag
ggtgtgcagcctgtagtcccaccgtttgatcaggctgcgctcatgcagatggttcagcag
gcagctacccaggctgcccaggttgctattcagcaggttacgcaggaagctgctcgtgta
gctgcacaagaagctgcccgtgtagctgcacaggaggttgcccgtcagttggctgctggt
cagcagattccagctcaacagattccaccgcagcagattccagctcagcagattccaccg
cagcagattccacctccgcagattccaccacagcagattccaccgcagcagattccacct
caggttcctgtgcagggggttccagaacagcagcttcctcagggtttacagcagccacca
ctaccaccacctccacctttaccggtttaccgggtatatgatgagagattttacagactc
acgactcagatgcggaacatggacatggagcattttgggggaacagtggatgctacagtt
gcttatgattggaagcttggtctgcaacgaaaattggagattattgagtgtccaccagag
gtttctcttaggttggctatgcagtacctacgtgaagatgcacttgtgtggtgggaggga
gtacgattgggccatcgtgggcctgatccgcttacctttacagattttatccgggagttc
gataggaagtactttccaaaagaagctatggttaagaagaagagtgacttcgagcatgtg
agccagagtggcatgacaatcagggagtatgaggttgagttcaaccgacttcgcaggttt
gcaggaggtggtattactgaggatgacctgattaggaagtttttgagtgggatgcaagtc
gacattcgcaacagatgtcgtgtcgtcacttaccagagattgggagatttggtggagaaa
gctgctgagcaggaagcaggtttggcagaggagcagaagttcctcaaatcatctcaaact
aagtctggaaagactgatgagactcagaagaggaccagggaccagtcagaagcaccgtat
tgtgctcgatgtcgtcgtcaccacgacggagagtgtctcaagtgttttacttgcggaagg
tggggacatttgtcaacgcattgtcggatgaaaccagcagatgcgacttcggccagtcag
atcgcaacacctacagcggcaatcaggatttgttacagttgttatgagcccggtcatatt
gctagagattgcccaaagaaggggcaaccaacgcttccaccagctaagcgatcggtttct
gttggaggtgaggtagctcacactcttttcgatacgggagcttctcacagcttcgtgagt
tcgcgactagtcaagttttggccttttcagggtgtctttgagcctaagaccaagcagatt
cggacagtcggcacagagagaattggagccactggcgtgcatcgagacgtacctatttta
cttgaagggttcgttttcaccggagacttagcagagatggagctggattactacgatgtt
atacttgggatggattggctgacacggcatcgagtggtgttagattgcccgaaggcaagg
gttcatattcctagagaagaggggaagatcacattccagtgtgttcaagctcaccgggga
atctctattgtctcgatgatgcatgctgaggaattattggagaaaggagttgaggggttt
ctggcgtctatctcgatggttaagaacgacggacatcacgagttgcaggacattccggtg
gttgaggagttcgaggatgtatttgaggccttacaagggccaccaccagcgagaggagat
gctctcactattgagttggagccagggacagcaccggtttcacgggccccataccgacta
gcaccagcagagatggctgaactaaaaaaacaattggaggagctattgggtaagggtttc
atcagacccagtacgtcaccgtggggagcaccagtattgtttgtgaagaagaaagatggg
agttttaggctttgtattgattacagaggtctaaacaaggtgaccataaagaataagtat
ccacttccgcgtattgatgaattgttggatcagctacagggagcttcatggttctctaag
attgacttggcatcaggttatcaccagattgcgatagcaggggaggatgtgcggaagacg
gctttccgtacacgctatggacattacgaatttgtagtgatgccatttgggttgacgaat
gcacctgcagcgttcatgaaacttatgaatgatgtttttcgcgagtacttagataagtgt
gtaatcgtcttcatcgacgatattctgatttattctcggagcagagaagagcatgctgag
catttacggattgtgttggagaagctcagggagcatcagctatttgctaagctgagagtt
gctgtagatccagagaagattatcgcaattacagagtggccgacacctaagagtgctaca
gagatccgcatttttctgggtttagcaggttattacaggaaattcgtcaagggatttgct
agtatcgccaaaccgatgactcagttgacaggcaaagatgttaagtttgtgtggacagac
gagtgctcgaagagtctcacagaattgaagcgacaactcacggacacgccagttttggta
ctaccgaggccagggataccttatgaggtttacacggatgcgtcaggtactggtttgggt
tgtgtactgatgcaggatggtcatgttattgcttatgcatcacgtcagttgaggcctcac
gaggtcaactaccctacccctgatttggagttagcagcagttgtttttgcgctaaaaatc
tggaggtcatatctgtatggagagaaagttcagatcctcacagatcaccaaagtaaggcc
aaccatgtggcagacgccttgagtagacgcaggagtgatgtttcaggaaccaaggaggtt
caggagctgactggcacaattgctagtctcagattgtgtgcaatcacttcggatggggag
acagctggtcttgatgttttggaacaagcagatttactatggaggatacgcagagttcag
gatgatgatgaggctttggttaagcagattgaaatcgagagtattggatatcacacagct
ttgagcgggatgtacatgtaccgaaaccgagtttgtgtgccagatgataaactgctacgg
aaggaaattttacagcaagcacacaactcacgtttttctatccacccagggaataccaag
atgtacagagatttgaagcgttattaccattggactggtatgaagaaagatgttgctacg
tttgtatcgcagtgccagacatgtcagatggttaaggctgaacatcaagtgcctagcgga
ttattgcagaacttgccattgccagaatggaaatgggacatggttactatggattttgtg
actggactcccgacaaccttaggagggaggaatgctatttgggtgattgtggatagactc
accaagtctgctcatttcatagcgattaagaaaacagatggagctgatcagttggcgcag
atttaccttagagagattgtgagattgcacggagttcctgtgagcattgtatcggatcga
gatacaaagtttacatctgctttttggagggcctttcagaaggctcttgggacaaaagtc
catatgagtacagcttatcatccgcagacagatgggcagtcagagaggactattcagact
ttggaagatatgctcagggcttgtgttttggattgggaaggaaattggggaaagtatcta
cctctagcggagtttgcatacaacaacagctatcattcgagtattgaaatggcaccatat
gaggcgctttatggtaggccttgtcgtacaccactttgctggacagaagtgggggagaga
cgagatttagaacctgcaatggttcaggagacagtagaacaggtggagatgctcaagtct
cgacttagggaagctcatgaccgacagaagagttatgcggataagcgccgtaaggattta
gaatttcaggtgggcgacctggtatatctaaaaatgagaacatttcagggaggatctaag
actcgaaagctaaagaagcttaaaccgagattcatgggcccgtaccctattttggagcgg
ataggagcagttgcttacagattgggactatcagcagagttatcagactttcatgatgtg
tttcatgtgtcagttttgagaaaagtcgtgagagagccagagctcattctgcaacagcca
ccaagtgaccttggtaaaaacttgtctgcactttgtcagccagtacagattttggatcgg
caagtgaaagcggttcagggcatgatgactagttttgtcagagttcgttgggagagagat
gggatccatgaggagacatgggagaccgagactcagatgaggattgattacccagaactt
tttgaggatggtattggacagttggttcaggagccgaattcggggtcgaattctttacta
gtgggggagaattgtaacgacccaattcccagcccaatcactttggcccgtcagagcccg
ttagtgttgcaggaaacccttgagattgagccgtcactcacatctgagatcgtaccgccg
ccaccaccacgcccagagccgagatcgaccagttcaccgccgatcccagccgaagaccac
catcgtgatcgtgacgtcgagacgagtccggagcaggaagatcagccggagattcgccca
gacgcgccgtcacgcgcatcttttgtgccgcggcgttccgagcgtgtatcccacgcgcca
gcgcaacccgccgtcgtccatcgccgccgttga
DBGET
integrated database retrieval system