Brassica oleracea (wild cabbage): 106296772
Help
Entry
106296772 CDS
T04124
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02750
Organism
boe
Brassica oleracea (wild cabbage)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106296772
NCBI-ProteinID:
XP_013588457
UniProt:
A0A0D3CP92
LinkDB
All DBs
Position
C6:complement(3002899..3005401)
Genome browser
AA seq
776 aa
AA seq
DB search
MRCAGTKRLEELCAQNQHSSFSGLKPRFNAKKEATFHSSAKRTQTQVQKPQSKSGDEDIK
QWNVAISSYMRNGRCNEALRVFERMPRWSSVSYNAMISGYLRNGEFETARKMFDEMPERD
LVSWNVMIKGYVRNRSLGKARELFERMSERDVCSWNTMLSGYAQNGCVDEARRVFDRMPE
RNEVSWNALLSAYVQNGRLEEACVLFDSRENWALVSWNCLLGGFVKKKKIVEARKFFDGM
SVRDVVSWNTIITGYAQNGKIGEARKLFDESPVKDVFTWTAIVSGYVQNRMVEEARELFD
KMPERNEVSWNAMLAGYVQGERMDMAKELFDVMPFRNVSTWNTMITGYAQCGDLSEAKSL
FDKMPKRDPVSWAAMIAGYSQSGHGHEALRLFVQMEREGGRLNRSSFSSALSTCADVVAL
ELGKQLHGRLVKGGYESGCFVGNALLLMYCKCGSIEDANDLFEEMTGRDIVSWNTMISGY
SRHGFGEEALRFFESMKREGLKPDDATMVAVLSACSHTGLVDKGREHFYTMNQDYGVRPN
SQHYACMVDLLGRAGLLEEAHSLMKAMPFEPDGAIWGTLLGASRVHGNTELAEIAADKIF
AMEPDNAGMYVLLSNLYASLGRWGDVSKLRVRMRDKGVKKVTGYSWIEIHNETHTFSVGD
EFHAERDEIYAFMEDLDLRMKRAGYVSKTNVVLHDVEEEEKERMVRYHSERLAVAYGIMR
VPQGKPIRVIKNLRVCEDCHSAIKCMAKITGRVIILRDNNRFHHFKDGSCSCGDYW
NT seq
2331 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgatgcgcgggaacaaaacgattagaagagctttgtgctcagaatcaacattcatcc
ttcagtggactcaaacccagattcaacgccaaaaaggaagcaacttttcactcttcagcg
aagagaactcaaacccaagtccagaaaccgcagagcaaatccggagacgaggatataaaa
caatggaacgtagctataagcagctacatgcgcaacggacgctgcaacgaagcgctccgc
gtgttcgagcgcatgcccaggtggagctccgtttcatacaacgcaatgatctcaggttac
ttacgaaacggcgagttcgaaaccgcccggaagatgttcgacgaaatgcctgagagagat
ttagtttcgtggaatgttatgatcaaagggtatgtgaggaacaggagcctcgggaaagcg
agggagctgttcgagaggatgtcggagagagatgtctgctcgtggaacacgatgttgtct
gggtacgctcaaaacgggtgtgttgatgaggcgaggagggtctttgatcggatgcctgag
aggaacgaagtgtcttggaacgcgttgctctctgcttatgttcagaacgggaggctggag
gaagcttgtgttttgtttgattcgagggagaattgggctttggtttcttggaactgtttg
cttggtgggtttgttaagaagaagaagattgttgaggcaaggaagttttttgatgggatg
agtgtgagagatgtggtttcatggaatacgatcattactggttatgcacagaacgggaag
attggtgaggcgaggaagctctttgacgagtctcctgttaaagatgtttttacatggaca
gcaatagtttcaggttatgtacaaaaccgtatggtggaagaagcgagagagttgtttgac
aagatgccagagaggaacgaagtttcatggaacgctatgcttgcaggttatgtgcaggga
gagaggatggatatggcaaaggaactgtttgatgttatgccttttcgaaatgttagcaca
tggaacacgatgataactggatatgctcagtgcggggatctttctgaagctaagagcctt
ttcgacaaaatgcctaagagagatcctgtctcttgggctgctatgattgcagggtactcg
caaagcggacatggacatgaagctttgcggttgtttgtacaaatggagagggaaggcggg
aggttgaaccggtcttcgttctcatctgctctaagcacgtgtgcagacgttgttgctctt
gagctcgggaagcagttgcacggaagattggttaaaggtgggtatgagagtgggtgcttt
gttgggaacgcacttttgttgatgtattgcaagtgtggaagcatagaagacgccaatgac
ttgtttgaggagatgactgggagggacattgtctcttggaacacgatgatttcaggttat
tcaagacatgggttcggagaagaggctttaaggttctttgagtcgatgaagagagaaggg
ctgaagccagatgatgctaccatggttgcggtactatctgcgtgcagtcacacaggactt
gtagacaaaggcagggaacatttctacacgatgaatcaagactacggtgtaagacctaac
tcacagcactacgcttgtatggtggatcttcttggtcgagctgggcttttagaagaagct
cacagtttaatgaaagcaatgccctttgagccagacggtgcaatatggggaactttactt
ggtgcaagcagagtccacggaaacacagagctagctgagatagctgcagacaagattttt
gcaatggagcctgacaacgccggaatgtatgttcttctctccaatctatacgcttcttta
ggtcgatggggagatgtaagtaagctgcgagtgagaatgcgtgacaaaggagtcaagaaa
gttacagggtacagctggattgagattcataacgagacgcatactttctcggttggggac
gagttccacgccgagagagacgagatctacgcgtttatggaggatcttgatttgaggatg
aagagagcagggtacgtttcgaagacgaatgtggttcttcacgatgtggaagaagaagag
aaggagcgtatggttaggtaccatagcgagagactggctgtagcgtatgggataatgcgt
gtgccgcaagggaaaccgatacgtgtgataaagaacctgcgtgtgtgtgaggattgccat
agtgccatcaagtgtatggcgaaaatcacagggagagtgattatactgagggataataac
aggtttcaccattttaaggatggttcatgctcttgtggagactactggtga
DBGET
integrated database retrieval system
