KEGG   Bombilactobacillus thymidiniphilus: MOO47_06900
Entry
MOO47_06900       CDS       T08331                                 
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
bog  Bombilactobacillus thymidiniphilus
Pathway
bog03030  DNA replication
bog03430  Mismatch repair
bog03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bog00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MOO47_06900
   03430 Mismatch repair
    MOO47_06900
   03440 Homologous recombination
    MOO47_06900
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:bog03032]
    MOO47_06900
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bog03400]
    MOO47_06900
Enzymes [BR:bog01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MOO47_06900
DNA replication proteins [BR:bog03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MOO47_06900
DNA repair and recombination proteins [BR:bog03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MOO47_06900
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T PHP DNA_pol3_finger DNA_pol3_a_NII DNA_pol3_a_NI HHH_6 DEDDh_C tRNA_anti-codon HHH_3 Zn-ribbon_8 YhfH T2SSK DUF6282 ZNRF_3_ecto
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQS84379
LinkDB
Position
1353913..1358154
AA seq 1413 aa
MDLRQQVLFQTARIRKVEVHTESQRWTFIFEFAQILPLTTFKLFKKYLEAGFQGVKKIDL
LIKTSDQQFDQQLLTSYWEYVVQQISPNSSIMKELALQKGPVLQNGRVLLAVDNDVLKQY
LSQQYLALIEQVYADVGFPKFKIKLLIDNSQTQAQIEDLRKQQVKQQQAISVAASSKKAK
QNTFNEIAHHVLGKKIANDAPLVSMAEISEEQQSVVVEGYIFSSEVRNLRSGRQLLILEM
TDYTSSFVVKKFSKNGESDDVFAAFTRGHWAKVRGSVQEDNYSRELTINAYDIMLIQKLG
RQDQATDKRIELHVHTNMSQMDAVSSTTDLVKRAADWGHEAIAITDHSTAQSFPDAYSAG
QKYGVKIIYGIEANLVDEGESIAYNLRDEVLETAEYVIFDVETTGLSAVYDSIIELAAVK
MCNGKVLAEFDEFIDPGKPLSATTINLTSITDEMVHNSNTEQEAMDKFAQFMGDAILVGH
NVTFDIGFLNAARRRSGYDPVAVPVIDTLEMSRTLHSEYRNHKLDSLAKRYNIKLEHHHR
ANSDALTTGCLMYTLLKEMQDQFQTLNVLQLNDHLGGKEAYKQARPYHAILLAQTQDGLK
NLFKIISSSMTEYYFRTPRVPRRLLNEYRTGILVGSACSSGEVFTTMMQKGYDDAYQKAQ
FYDYLEVMPHAIYQPLLDSGLINDQKALEDILANIVKLGGELDKPVVASGDVHYLDPKDA
IYREIIVKAVKSNPLARQQLPLADFKTTDEMLQDFAWLGAEKAHEVVVDNPRKVAEMIDE
IVPVKDKLYTPKMPGAEQEIQDLTYTQAKTLYGDPLPEIVAQRLDKELKSIIGNGFSVIY
LISQRLVHKSNKDGYLVGSRGSVGSSLVATMTGITEVNPLPPHYRCSKCHYSQFFTNGEV
GSGFDLPDKQCPQCGSDLSKDGHDIPFETFLGFKGDKVPDIDLNFSGDYQPIAHNYTKVL
FGEDHVFRAGTIGTVADRTAYGYVSNFEELTDQKFRGAEKDRLASGATGVKRTTGQHPAG
IIVVPDYMDIYDFTPIQYPADDQSAAWKTTHFDFHSIHDNILKLDILGHDDPTMIRMLQD
LSGIDPQTIPTDDPGVMALFSGTESLGVTPEQIDSKMGTLGVPEFGTRFVRGMLEETHPT
TFSELLQISGLSHGTDVWLGNAEEYIQQGIVTLKDVIGCRDNIMMDLIHWGMEPQLAFQI
MEHVRKGKGIPDDWQEQMRAHKDIPDWYIESCLKIKYMFPKAHATAYIMMALRIAYFKVH
FPIIYYCAYLSVRADTYDLKAMASGKTAVKEAMKAINSQGNDASQKDKSTLTVLEIANEC
LERGIAIQMVDIEKSDSLNFKIIDEHTLLAPFVAVPSLGTNVAKQIVAAREEQPFLSKED
LSKRGKVSQSIIEYLTTNHVLDDLPDENQLSLF
NT seq 4242 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatttgcgtcagcaagtgttgtttcaaacagcacgtatacgaaaagtagaagtccat
actgaatctcagcgatggacttttattttcgaatttgcacaaattctcccattgacaact
tttaaattgtttaaaaaatatcttgaggctggttttcagggcgttaagaaaattgattta
ttgatcaagacttctgaccaacaatttgaccaacaattattaacttcttattgggaatac
gtggtccaacaaatttcacccaattcttctattatgaaagaactagctttacaaaaaggt
ccagtattacaaaacgggcgtgttttattagccgtagataatgatgttttaaaacaatat
ttgtcacaacaatatttagcgttaattgagcaagtttatgctgatgtgggttttcccaaa
ttcaaaatcaagttattaattgataattcacaaacgcaagctcagattgaagatttacgt
aagcaacaagtcaaacaacaacaagccattagtgtagctgcttccagtaaaaaagctaag
caaaatacttttaatgaaatagcgcaccacgttttaggtaagaaaatagctaatgatgcg
ccgctggtctccatggcggaaatttcagaagagcaacaatctgtagttgtagagggttat
atttttagtagtgaagtgcgtaatttacgttcagggcggcaattactaattttggagatg
acagattatacttcatcttttgttgtaaagaaattttctaaaaatggtgaatcagatgat
gtttttgcagcttttacccgaggtcattgggcaaaagtgcgtggttctgtacaagaggat
aactattcgcgtgaattgacgattaatgcttacgacattatgttgattcagaaattaggt
cgccaggatcaagcaacagataaaagaattgagctacatgttcatactaatatgagtcaa
atggatgcagttagttcaacgactgatctggtcaaacgagctgctgattggggacacgaa
gctattgcgattactgatcattcgaccgcacaatcttttcctgatgcttatagcgctggg
caaaaatatggcgtgaaaataatttacgggattgaagctaatttggttgatgaaggtgaa
tcgattgcctataacttgcgcgatgaagttttagaaactgcagaatatgttatttttgat
gtagaaacaacaggtttatcggcggtttatgattcgattattgaattagcagcggttaag
atgtgtaacggtaaagtgctggcagaatttgatgaatttattgatcctggcaaaccactg
tctgcgacaacgattaatttaacttctattaccgatgaaatggtgcataacagtaacaca
gaacaagaagccatggataaatttgctcaatttatgggcgacgcaattctagtcggacat
aatgtaacttttgatattggttttttgaatgctgcgcgacgacgaagtggttatgatcct
gtcgcagttcctgtaatcgatacgttagaaatgtctcgtacgttgcattctgaatatcgt
aatcataaattagatagtttagctaagcgttacaatatcaaattggaacatcaccatcga
gctaattcggatgcgctgacgacaggctgtttgatgtatactctgttgaaagaaatgcaa
gatcaatttcaaactttgaatgttttacagctaaatgatcatttgggtggcaaggaagct
tataagcaggctcgtccgtatcatgctattttgttagcacaaacccaggatggcttaaaa
aatttgttcaagataatttctagttctatgacagaatattattttcgaactccaagagtg
ccccgccgactattgaatgaatatcgtacgggtattttagtaggttcagcttgtagttca
ggtgaagtatttacgacgatgatgcaaaaaggttatgatgatgcctaccagaaagctcaa
ttttatgattatttagaagttatgccacatgctatttatcaaccattgttagattctggc
ttaatcaatgatcaaaaagcactagaagatattttggctaatattgttaaactagggggg
gaattagataagccagtggtggctagtggtgatgtacattacttggatcctaaagatgct
atttatcgcgagattattgtgaaagctgttaaaagtaatcctttggcacgtcagcaatta
cctttggctgattttaagactaccgatgagatgctacaagattttgcatggctaggtgct
gaaaaagcgcatgaagtggtggtcgataatccccgtaaagtggcagagatgattgatgag
attgtaccggttaaggataaattgtatacacccaaaatgccgggagcagaacaagaaatt
caagatttaacttatactcaagcgaaaactttatatggcgatccgttaccggagattgtg
gcacaacgtttagacaaagaattgaaaagtattattggtaatggattttcagtgatttat
ttaatttcacaacgtttggtgcataaaagtaacaaagatggttatttagttggctcgcgg
ggatcagttggttcaagtctggtggcgacaatgactgggattactgaggttaacccgttg
ccaccacattatcgttgttcaaaatgtcattattcccagttttttactaatggtgaagtg
ggttctggttttgatttgccagataagcaatgcccgcaatgtggcagtgatttaagcaaa
gatggtcatgatattccttttgaaacttttttaggctttaaaggagataaggtgccagat
attgatttaaacttttctggcgattatcaaccaattgcgcacaattatacaaaagtattg
tttggggaagatcatgtatttcgtgcaggtacgattggtacagtggctgatcgtaccgca
tatggttacgtaagtaactttgaagaactaacagatcaaaaatttcgtggtgcagaaaaa
gatcgcttagcaagtggtgcaactggtgttaagcgcactactggacagcatccggcgggt
attattgtagtgcctgattatatggatatttatgattttacaccgatccaatatccggct
gatgatcaaagtgcagcttggaaaacgactcattttgattttcattctatccatgataat
attttaaaacttgatattttaggacatgatgatccgactatgattcggatgttgcaagat
ttatctggcattgatccacaaactattccaactgatgatccaggagttatggcactattt
tcgggcacagaatctttaggtgttacacctgagcaaattgactctaaaatgggtacttta
ggtgtaccagaatttgggacgcgttttgtacgaggaatgttggaagaaacccacccaaca
actttttcagaattattgcaaatttctggcctttctcatggtactgatgtttggttaggt
aatgcggaagaatatattcagcaaggtattgtaactttaaaagatgtgattgggtgtcgg
gataatattatgatggacttaattcattgggggatggagccgcaattagcgtttcagatt
atggaacatgtccgtaaggggaaaggaattcctgatgattggcaagagcaaatgcgggcg
cataaagatattcctgattggtatattgaatcatgtttaaaaattaagtatatgttccct
aaagctcatgcaacagcttacatcatgatggctttgcgaattgcctattttaaagttcat
tttccaattatttattattgtgcttatttatccgtgcgtgctgacacttatgatctaaaa
gcgatggctagtggtaaaacggcggttaaagaggcaatgaaagcaattaatagtcaaggc
aatgatgctagtcaaaaagataaaagtactctgactgttttagaaattgctaatgaatgt
ttagagcggggaatagcaattcaaatggtggatattgaaaaatcagactcgttgaatttt
aaaattattgatgaacatactttgttagcgccatttgttgcggtgccaagtttaggtact
aatgtggctaaacaaattgtagctgctcgcgaagaacaaccttttttatcaaaggaggat
ctttccaagcgtggaaaagtgtcgcagtcaattattgaatatttaacgactaaccatgtt
ttagatgatttacctgacgaaaaccagttatccttattttaa

DBGET integrated database retrieval system