Bacillus pumilus SH-B9: UP12_09245
Help
Entry
UP12_09245 CDS
T04776
Name
(GenBank) BclA
Organism
bpus
Bacillus pumilus SH-B9
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bpus00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
UP12_09245
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMM97518
LinkDB
All DBs
Position
1875154..1879071
Genome browser
AA seq
1305 aa
AA seq
DB search
MGNLYNQYDNKCPFCGKKHDWQPHYRKSRHDRPLFDDCPLLKRECKKKKVVKHHSTCAKA
KGRKKTNNKIVKRGPTGATGTTGVTGDTGPTGVTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGV
TGDTGPTGATGATGDTGPTGPTGDTGSTGATGNTGPTGVTGATGDTGATGVTGVTGVTGD
TGPTGVTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGATGATGD
TGPTGATGVTGDTGPTGATGDTGATGVTGVTGVTGDTGPTGATGATGDTGSTGATGDTGS
TGATGDTGSTGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGVTGDTGPTGV
TGATGDTGPTGVTGVTGDTGPTGVTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGA
TGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGVTGDTGPTGA
TGATGATGDTGPTGTTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGTTGPTGATGDTGPTGD
TGATGVTGVTGPTGTTGATGDTGPTGATGATGDIGPTGATGVTGDTGPTGTTGATGVTGP
TGATGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGDTGATGDTGPTGPTGVTGD
TGPTGATGVTGVTGPTGVTGTTGPTGATGATGVTGPTGATGDTGPTGTTGVTGDTGPTGA
TGATGDTGPTGATGATGDTGPTGTTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGATGATGDTGPTGT
TGVTGATGDTGPTGPTGAAGDTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGTTGVTGATGDTGPTGP
TGAAGDTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGATGATGVTGDTGPTGVTGATGVTGDTGPTGV
TGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGATGATGDTGPTGPTGATGATGDTGPTGPTGVTGD
TGPTGATGATGVTGDTGPTGVTGVTGVTGPTGVTGTTGPTGATGATGVTGPTGATGDTGP
TGDTGATGVTGVTGPTGTTGATGDTGPTGATGDIGPTGATGVTGDTGPTGTTGATGVTGP
TGATGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGTTGVTGDTGPTGATGVTGDTGP
TGATGVTGDTGPTGPTGDTGATGDTGPTGATGPTSQIFFDQTATQQQIFPPLNSEITVLT
FTVPVTSGQRVKIDLSANITANTTANYSINGNTRLRRNGTLLTEVPFFRSGSGAGAQSFV
VSTTFVDTVTSTGNNVYTVNIIITAQSSITTVNTDTRAANAVRYV
NT seq
3918 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaatttgtataatcagtacgataacaaatgtcccttttgcggaaaaaagcatgat
tggcaacctcactacagaaaatctcgtcacgatagacctctatttgatgattgccctctt
cttaaacgagaatgtaaaaagaaaaaagttgttaaacatcacagcacttgtgctaaagca
aaaggacggaaaaaaacaaataataagattgtaaaaagaggtcctaccggagctactgga
accactggtgtaactggagatactggtcctactggagttactggtgtaaccggagatact
ggtcctactggagttactggggcaactggtgataccggtcctactggagccactggtgta
accggagataccggtcctactggtgctactggcgcaactggtgataccggtccaacggga
cctactggagatacaggttctactggggcaactggaaatacaggtcctactggtgtaact
ggcgcaactggagatacaggtgctactggtgtaactggtgtaactggtgtaaccggagat
actggtcctactggagttactggtgtaaccggagatactggtcctactggagttactggg
gcaactggtgataccggtcctactggagccactggtgtaaccggagataccggtcctact
ggtgctactggcgcaactggtgataccggtcctactggtgctactggcgcaactggtgat
accggtcctactggtgccactggtgtaactggtgatacaggtcctactggcgcaactgga
gatacaggtgctactggtgtaactggtgtaactggtgtaaccggagatactggtcctact
ggtgccactggtgcaactggagatacaggttctactggtgcaactggagatacaggttct
actggtgcaactggagatacaggttctactggggcaactggagatacaggtcctactggt
gtaactggcgcaactggagatactggtccaacgggacctactggtgtaactggtgataca
ggtcctactggtgctactggtgctactggtgtaaccggagataccggtcctactggagtt
actggtgcaactggtgataccggtcctactggagttactggtgtaactggagataccggt
cctactggagttactggtgtaactggagataccggacctactggtgctactggcgcaact
ggtgataccggtccaacgggacctactggtgtaactggtgatacaggtcctactggtgcc
actggtgtaactggtgatacaggtccaacgggacctactggtgtaactggagataccggt
cctactggtgctactggtgctactggcgcaactggagatactggtcctactggtgccact
ggtgtaactggtgatacaggtcctactggtgtaactggtgatacaggtcctactggtgct
actggtgctactggagccactggagataccggtcctactggaaccactggtgtaaccgga
gatactggtcctactggtgctactggtgtaaccggagataccggtcctactggaccaact
ggtgtaaccggaactaccggtccaacgggagcaacaggagatactggtcctactggagat
acgggagcaacaggtgtgaccggagttaccggtcctactgggacaactggggcaaccgga
gataccggtcctactggtgctactggtgccactggagatatcggacctactggtgccact
ggtgtaactggagataccggtcctactgggacaactggtgcaaccggagttaccggacct
actggagccactggtgtaaccggagatactggtcctactggtgccactggggcaactgga
gataccggtcctactggagccactggtgtaactggtgatacaggtccaacgggacctact
ggtgatactggcgcaactggagatacaggtccaacgggacctactggtgtaactggtgat
acaggtcctactggtgctactggtgtaaccggagttactggaccaactggtgtaaccgga
actaccggtccaacgggagcaacaggtgcaaccggagttaccggacctactggagccact
ggagataccggtcctactggaaccactggtgtaaccggagatactggtcctactggtgcc
actggggcaactggagatactggtcctactggagccactggtgcaactggagataccggt
cctactggaaccactggtgtaaccggagatactggtcctactggtgccactggggcaact
ggagatactggtcctactggagccactggtgcaactggagatactggtcctactggaacc
actggtgtaactggcgcaactggagatacaggtccaacgggacctactggtgccgctggt
gatactggtgtaaccggagatactggtcctactggagccactggtgcaactggagatact
ggtcctactggaaccactggtgtaactggcgcaactggagatacaggtccaacgggacct
actggtgccgctggtgatactggtgtaaccggagatactggtcctactggagccactggt
gcaactggagatactggtcctactggagccactggtgctactggtgtaaccggagatact
ggtcctactggagttactggtgctactggtgtaaccggagatactggtcctactggagtt
actggggcaactggagataccggtcctactggagccactggtgtaactggtgataccggt
ccaacgggacctactggtgctactggggcaactggagataccggtccaacgggacctact
ggtgctactggggcaactggagataccggtccaacgggacctactggtgtaactggtgat
acaggtcctactggtgctactggtgctactggtgtaaccggagataccggtcctactgga
gttactggtgtaaccggagttactggaccaactggtgtaaccggaactaccggtccaacg
ggagcaacaggtgcaaccggagttaccggtcctactggagcaaccggagatactggtcct
actggagatacgggagcaacaggtgtgaccggagttaccggtcctactgggacaactggg
gcaaccggagataccggtcctactggtgccactggagatatcggacctactggtgccact
ggtgtaactggagataccggtcctactgggacaactggtgcaaccggagttaccggacct
actggagccactggtgtaaccggagatactggtcctactggagccactggggcaactgga
gatactggtcctactggagccactggtgtaaccggagataccggtcctactggaaccact
ggtgtaactggagatactggtcctactggagccactggtgtaaccggagatactggtcct
actggagccactggtgtaactggagataccggtccaacgggacctactggtgatactggg
gcaactggagataccggtccaacgggagctactggaccaacctcacaaattttctttgac
caaacagcaacacagcagcaaatatttcctccgttaaattcagaaataacagtactcact
tttacagttcctgtaacaagtggtcaaagagtaaagattgacctgtcagcaaatattaca
gctaacactacagcgaattatagtataaatggaaatactcgattaaggagaaacggaaca
ttgttaacagaagttcctttctttagatcaggatcaggcgcaggggcacaaagctttgta
gtttccaccactttcgttgatactgtaactagtacgggtaataatgtatatactgttaat
atcattattacagcacagtcaagtataacaacagttaacacagatactcgagctgcaaat
gctgtaagatatgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
