Buchnera aphidicola Ua (Uroleucon ambrosiae): BUAMB_429
Help
Entry
BUAMB_429 CDS
T01830
Symbol
recB
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V 135 kDa polypeptide
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
buh
Buchnera aphidicola Ua (Uroleucon ambrosiae)
Pathway
buh03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
buh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BUAMB_429 (recB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
buh03400
]
BUAMB_429 (recB)
Enzymes [BR:
buh01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BUAMB_429 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
buh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BUAMB_429 (recB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
AAA_11
DUF3642
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEO08232
UniProt:
G2LPU5
LinkDB
All DBs
Position
477155..480652
Genome browser
AA seq
1165 aa
AA seq
DB search
MTVLIKKKLNVFKIILSGINLIEASAGTGKTFTIVLLYLRCLLGIGKKTYQKKLLIHEIL
VLTFTNAAKEELYIRLQEGINNLYLSCINKRNEDPICQLFLNEIQDTNAAIKILKIAKNN
IHDASIYTIDSFCQNILQSNTFDIYYTFHDKIIENEDHLYLKTTEDFWRLYVYTLPENII
KIILQYSKSPKDLLKIIKPFIDLDSVNFNKKIFNNESLILLHEKNIKQINYFKKKWLTHS
YKILKIINHVNINKKIYHDVNISRWINYIDKWSKSQTQDYNIPIILKYFTQNYIKKNTID
YIDSKCIIFNEIEKILKYNFSLKHIFILHAIQKIKKLLIKEKKKQSLFGFNDILNLFLKI
LKKEKNLRKLIRKKYPIAFIDEFQDTNIKQYKIFNILYKNSKKLALFLIGDPKQAIYSFR
GADIFSYLHITSKIKKHYYLDTNWRSSVNMCNSINFLFSQNSNPFIFKDISYIPIIASQK
NSKMQFIVNGISQVPIRFFLYEKTETSLDEYQIWIAKQCAQKISYWLTCAQNGKAKIITQ
KTEKILSSNDIAILVKNKKEADIIKKELHQLNISSIYFSERNSVFKIFDAQELLWILECV
LEPDNIKLLQQAMSTHIFQVIASTIQKKNKTQSYLMIEKLYAYYAIWNDISIFHLIQNMI
LEYQKHATLTELNTNYIKNLNFLHIAEILQEQYQYFNKKISLIRWFQKKISEIKEPVQNE
YIRNYQECQLVKIITIHKSKGLEYPIIWIPFMVNFNQSSSYIHHNNNEVIINIQSNKKYF
KIADKERLAEDMRLLYVAITRSMLHCCIGLSCLIKQRKKNRIHSDIHISSIGYLIQNGKS
MNYEDLLKKINQLSINNLLEVKNNTKKFVLSNTKNIYLINQPIYFNQKHQYIWNITSFTK
LKKENNFFENKKSTILYNQYNTEIFIKKNKKLTVNNFPKGKKTGLMMHFILKNLYILNYK
DNNFFSNILEKYNISLKWTKTLISWIKNILHISLDNQNMRLSTILKQSCIKELEFFLPIK
QILYNAELNKIMQCFNPISFSTPKLLFNPTKGILNGCIDLFFIWDKKYYILDYKSNWLGD
NNSFYAPQNIRTEMIKNRYDFQYQIYTIAVHKYLKQKLKNYHYENDFGGVFYVFLRAIED
QKKHHGIFYIKPDYLLIKKIIDLIS
NT seq
3498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagtacttataaaaaaaaaacttaatgtatttaaaattattttatctggaattaat
ttaatagaagcttctgcaggtacaggaaaaacttttacaatcgtcttattatatttacgt
tgtttattaggaataggcaaaaaaacatatcaaaaaaaacttcttatacatgaaatatta
gtattaacttttacaaatgcagcaaaagaagaattatatatacgtctccaagaaggaatt
aataatttatatttatcttgtattaataaaagaaatgaagatcctatatgtcaattattt
ttaaatgaaatacaagatacgaatgcagctattaaaattttaaaaatagctaaaaataat
atacatgatgcttctatttatacaatagatagtttttgccaaaatatattacaatcaaat
acttttgatatatattatacttttcacgataaaattattgaaaatgaagatcatttgtat
cttaaaacaacagaagatttttggagactatatgtatatactttaccagagaatattatt
aaaattattttacaatattctaaaagcccaaaagatctcttaaaaattattaaacctttt
atagatcttgattcagtaaattttaataaaaaaatatttaataatgaatctttaatttta
ttacatgaaaaaaatataaaacaaataaactattttaaaaaaaaatggttaacacattct
tataaaatattaaaaataattaatcatgtcaatattaacaaaaaaatatatcatgatgtt
aatatatctagatggataaattatattgacaaatggtcaaaatctcaaacacaagattat
aatattcctattatattaaaatattttactcaaaactacataaaaaaaaatacaatagat
tacattgactcaaaatgtattatttttaatgaaatagagaaaatattaaaatataatttt
tcattaaaacatatatttatattacatgctatacaaaaaattaaaaaattattaataaaa
gaaaaaaaaaagcaatcattatttggttttaatgatatattaaatctttttttaaaaata
ttaaaaaaagaaaaaaatttacgaaagttaataagaaaaaaatatcctatagcatttatt
gatgaatttcaagatactaatattaaacaatataaaatatttaatatattatataaaaat
agtaaaaaattagcattattcttaattggagatccaaaacaagcaatatatagttttaga
ggagcagatattttttcttatttacatataacatctaagataaaaaaacactattatctt
gatactaattggcgttcttcagtaaatatgtgtaatagtattaattttttattttcacaa
aacagcaatccatttatatttaaagacatttcatatatacccattatagcttctcaaaaa
aattctaaaatgcaatttatagttaatggcatatctcaagtgcccattagatttttttta
tatgaaaaaacagaaacatctttagatgaatatcaaatatggattgctaagcaatgtgct
caaaaaattagttattggttaacttgcgctcaaaatggaaaagcaaaaattataactcaa
aaaacagaaaaaatattatcatctaatgatattgcgatattagttaaaaataaaaaagaa
gctgatattattaaaaaagaattgcatcaacttaatatatcttcaatatatttttctgaa
agaaacagtgtattcaaaatttttgatgctcaagaattattgtggatattagaatgtgtt
ttagaaccagataacataaaattattacaacaagctatgtctacacacatttttcaagtc
atcgcttctacaatacaaaaaaaaaataaaacacaatcatatttgatgattgaaaaatta
tatgcatattatgcaatatggaacgatattagtatcttccatttgattcaaaatatgata
ttagaatatcaaaaacatgctactttaactgaacttaatacaaactatataaaaaattta
aattttttacatattgcagaaatcttgcaagaacaatatcaatattttaataaaaaaata
tctttaattcgctggtttcaaaaaaaaatatcagaaataaaagaacctgtacaaaatgaa
tatattagaaattatcaagaatgtcaattagttaaaattattactatacataaatcaaaa
ggattagaatacccaattatttggataccttttatggtgaattttaatcaatcttcatca
tatattcatcataataataatgaagttattattaatattcagtctaataaaaaatatttt
aaaattgctgataaagaacgattagcagaagatatgagattattatatgttgcaattaca
agatctatgttgcactgttgtattggattatcttgtttaataaaacaaagaaaaaaaaac
agaatacacagtgatatacatataagtagtataggatatcttatacaaaatggaaaatct
atgaattatgaagatttattaaaaaaaataaatcaattaagtataaataatttattagaa
gtgaaaaataacacaaaaaaatttgtattatctaatacaaaaaatatttatttaatcaat
caacctatttattttaatcaaaaacatcagtatatttggaatataactagttttacaaaa
ttaaaaaaagaaaataatttttttgaaaataaaaaatcaactatactatataatcaatat
aatactgaaatatttatcaaaaaaaataaaaaattaacagttaataattttccaaaaggt
aaaaaaactggattaatgatgcattttatattaaaaaatttgtatatattaaattataaa
gacaataatttcttttctaatattttagaaaaatataatatttctttaaaatggacgaaa
acattaatttcgtggataaaaaatattcttcacatttcgcttgataatcaaaatatgcgt
ttatcaacaatactaaaacaatcatgtataaaagaattagaattttttttacctattaaa
caaattttatataatgcagaattaaataaaattatgcaatgttttaatccaatttctttt
tccactccaaaattattatttaatccaacaaaagggatattaaatggatgtattgattta
ttttttatatgggataaaaaatattatattttagattataaatctaattggttaggagac
aataattctttttatgctccacaaaatattagaacagaaatgataaaaaatagatatgat
tttcaatatcaaatatatacaatagcagtacataaatatttaaaacaaaaacttaaaaat
tatcattatgaaaatgactttggtggagtgttttatgtttttttaagagcaatagaagat
caaaaaaaacatcatggaattttttatataaaaccagattatttacttattaaaaaaata
attgatttaatttcataa
DBGET
integrated database retrieval system
