Beta vulgaris (sugar beet): 104906227
Help
Entry
104906227 CDS
T03548
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280
Organism
bvg
Beta vulgaris (sugar beet)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
PPR_long
AEP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104906227
NCBI-ProteinID:
XP_010693262
LinkDB
All DBs
Position
2
Genome browser
AA seq
1252 aa
AA seq
DB search
MLHRISSTHLSTSIINQVYFSSLSLFHLKFHQFILSAFFTSSSSSSNSSDKLSNTQLKSP
RVLVPLVGKLVLSKYTHLLNSQSDNFNIANLSLNQLLLNISYVSPGICRKFFRVSCWKPE
YMLEILLSFQLSRENLGSNVEVVKSLWEIFRRVDGGNVGFKHLPRSCEVMASMLINVRMF
REVEYLLSSVKNQGIFVGNDEIFSGLIEGYVNLGLSERALLMYDTMKGLCLAPSLFCYRS
LLGILIEEGKVDQAIRIYEDGVEVGFEEVKNLESLIGFLCRDGKIREARKLLKKIVASGW
KPSLVILSEVADVYYEKKDFEDLLSFFIEMKCAPDTLVGNKIIYSLCSNFNIRRANSFMW
ELENLGFIPNEITFGIFISWSCLDGKIKDAFAYLSEILFRGLKPDRHSYNALISGLLKAG
MHELAREILNEMIDNGIKPNLATYRAFLAGYSKARQFDEVKLMMSEMANYGLILLSPSEN
PISKAFSVLGLNPLTVKVKRDNDIKNFRTEYVDTLGNGLYLDTDVDEFEKNVMGVLEESL
IPDFNLLVIRQCNLKNGQEALLMVDEMLQWGQDLSLPVLSALVRLLCESKCHIKEIPALL
DKVFQLFVKLDHKTLNFTAEVLSKNGFVDQSRSLLHEMHKRHLPIFHATYTSTLVAVCKL
GSTSDILYCWGLARKDHWSPEWGDFIIVLDSLCQRKMLEELLELFDVMLASNPYLGIQIC
DVFLEKISSAGFTDMGDILVTTLKQKNIDLHHSVYSHIIKGYCQEKRFSEALRTFDKIRA
QTLSLSQDALLLLIPKLCKVNRLKEAVALKDAVLKNHPSAFFSLHNALIIGCCRANIVVE
AEGLFLEILLKNIHPDDEVINALLQAHCQSSDLKTANELLCFMVKRKMGLSLSSYRDFLY
LLCKKGMFHSAWSLKSLMLVENKSPYSIIHNIYIFQLFKTGKCLLVDAFLGELEESGLQL
DEVGYNFLVHGFSVCKDMTKSIKFFNEMILKGLKPSNRSLRAAIGYLCRNGKVQDALQLS
NQIESRGWNVCPTVHYAILEGLFFDGRIHFAERYLARIMKKVLTPETIYYNNLIRNFCRY
GRVETAVSLLEQMLKKKSIPDRSSYDCIVQSFCGYNHLECAMDFFNEMLHRDLKPNIRTW
DMIIQKLSKTGQTKEAESILILMIEVGENPTKGMYTSVIDRYRMENNLFKASELMDRMQQ
QGYEPDFSTQWSLISSLSNFTDQKSNIGTEGFLSKLLGESGFPSGSTKSKLK
NT seq
3759 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttcaccgcatctcgtcgactcatcttagcacttccattattaaccaggtctatttc
tcctcactctctctttttcacctgaaatttcatcaatttatactatctgcttttttcact
agttcttcatcatcttcaaattcatctgacaaattaagcaacacccagttgaaatctcct
cgtgttcttgtccctcttgtgggaaaattggttctttccaaatatacccatctgttgaat
agtcaatctgataactttaatattgctaatttgtctcttaatcaattgcttttgaacatt
tcttatgtttctcctggaatttgccgcaaattttttcgggtttcttgttggaaacctgag
tatatgcttgaaattttactgagttttcagttgagtagggaaaatttggggagtaatgtt
gaagttgttaaatctttgtgggaaatttttaggagggttgatggtggaaatgtgggattt
aagcatttgcctcgttcttgtgaggttatggcatccatgcttattaatgttaggatgttc
agggaggttgaatatttgttatcctccgttaagaatcaaggaatttttgtgggtaatgat
gaaattttcagtggactaattgagggttatgttaatcttgggttgtctgaaagggcactt
ttgatgtatgacacaatgaagggcctatgtttagctccatctttattctgttatcgatct
ctacttgggattttgattgaggaaggtaaagttgatcaagcgattcgtatttatgaggat
ggggttgaggtgggttttgaagaggtgaagaatttggagagtctaataggttttttgtgt
cgtgacggaaagattagggaagcaaggaagctcctgaagaaaattgtggcttctggatgg
aagccaagtctagtgattttgagtgaggttgcggatgtgtattacgagaagaaggatttc
gaagatcttctgagttttttcattgagatgaaatgtgcaccagataccttggttggtaat
aagataatttattctttgtgctctaatttcaatatacgcagagcaaattcattcatgtgg
gagttggagaatttaggttttatccccaatgagataaccttcggaatctttataagttgg
agctgccttgatggaaaaataaaagatgcctttgcttatctatcagagattttgtttaga
ggcctgaaacctgataggcactcctataatgcattgataagtggtttgttgaaggcaggt
atgcacgagcttgcacgagaaattctcaatgaaatgattgataatgggataaaacccaat
ctggcaacctatagagcttttttagctgggtattctaaagccaggcagtttgatgaggtt
aaacttatgatgagtgagatggccaattatggtttgatacttctttctccttcagagaat
ccaatatccaaagcattctctgttttggggctcaacccgttaactgtaaaggtcaagagg
gataatgatataaaaaatttcaggacagaatatgttgatactttgggaaatggtctttat
ctagacactgatgtggatgagtttgagaagaatgtaatgggtgttcttgaagaatccttg
attccagactttaatttgctggtgattaggcaatgcaatcttaaaaatggtcaagaggcg
ttgttgatggtggatgagatgcttcaatggggacaagatttatcacttcctgttctttct
gcattggtaagattgttatgtgaatcaaaatgccatatcaaagagatcccagctctccta
gataaagtatttcaacttttcgtcaagctagatcataaaacactcaatttcactgctgag
gttttaagtaaaaatgggtttgtggatcagagcaggtcactccttcatgaaatgcacaaa
agacatctaccaattttccatgcaacatatacttccacccttgtggcagtatgcaagctt
ggtagcacgagtgacattctttattgttggggtcttgcacggaaagatcactggtcacct
gaatggggtgattttattattgtgttggatagtttatgtcagagaaaaatgcttgaagaa
ctacttgaattgtttgacgtcatgctggcatcaaacccttacttaggcatccaaatttgt
gatgtgtttcttgaaaaaatttcttctgctggtttcaccgacatgggggatatcttggtc
actacactaaaacagaagaacattgatttgcatcactctgtctatagccatattatcaaa
ggctactgtcaagagaaaagattttcagaagccttaaggacatttgacaaaattcgagct
caaaccttgtccttgtcgcaggatgctcttttactgttaatacctaagctttgcaaggtt
aacagactcaaagaagcagttgctttaaaagatgcagttttaaaaaaccatccttccgcc
ttcttttctcttcacaatgcccttattattggttgctgcagggctaatattgttgtagag
gcagaaggtttatttctagaaatcttattgaaaaacattcatccggatgatgaagttatc
aatgctctgcttcaggctcactgccaaagtagtgatttgaagacagctaatgagctactt
tgtttcatggtgaagaggaaaatgggtctctcactgtccagctatcgtgatttcttatac
ctattatgcaaaaagggaatgtttcattctgcctggagtttaaagagtctcatgcttgtc
gaaaataagtctccatattccatcatccataatatatatattttccaactcttcaaaaca
gggaagtgtctccttgttgacgcttttttgggtgaacttgaagaaagtgggttgcaactt
gatgaagttggttacaattttctggtccatgggttttcagtttgcaaagacatgacaaag
tcgataaaatttttcaatgagatgattttgaagggccttaaaccgagcaatcgcagcctc
agagcagcaataggctacttatgtagaaatgggaaggttcaggatgccttacaattaagt
aatcagatagagtcaagaggctggaatgtttgtcctactgtacattatgcaatcctggag
gggcttttctttgatggtagaatacattttgcagaaaggtatcttgctcgaatcatgaag
aaagttttaacacccgaaaccatctactacaacaatttaatacgcaacttctgcagatat
ggaagagtggaaacagcagtaagtctcctggaacaaatgttgaagaagaaaagcatacct
gacagatcctcctatgattgtattgtccaaagtttttgtgggtacaatcacttggaatgt
gctatggattttttcaatgagatgctacatagggatcttaaaccaaacataagaacatgg
gacatgatcattcagaagttaagcaaaactgggcaaactaaggaagcagaaagtattcta
attttgatgatcgaagttggtgaaaatcctactaaggggatgtacacctcagtgattgat
agatatcggatggagaacaacttgtttaaggcatcagaattaatggacagaatgcaacaa
caaggttatgaacctgatttctcgactcagtggtcccttattagcagcttgagcaacttc
actgatcagaaaagtaatattggcactgaaggctttctatcaaaacttcttggggagagt
ggattcccttcagggagtaccaagtccaaactgaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
