Phocaeicola vulgatus: BVU_0841
Help
Entry
BVU_0841 CDS
T00546
Name
(GenBank) putative outer membrane protein, probably involved in nutrient binding
Organism
bvu
Phocaeicola vulgatus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR38538
UniProt:
A6KYM4
LinkDB
All DBs
Position
1139855..1142893
Genome browser
AA seq
1012 aa
AA seq
DB search
MKKQILLLCLALTSLCSYAQTITVKGVVTSASDKEPMIGATVQVKGTGTGTITSIDGDYS
LNDVAKDAVLVFSSIGYETQEIKVNGQTVINVVLKDASELLDEVVVIGYGAVKKSDLTSS
ISTVKGKEITETVTGNAMDALQGKINGVQVTSGGGPGAQPKVLIRGVTTVNGTDPLYVVD
GMPVGTNINFLNSNDIESMEVLKDASAAAIYGTRASNGVILITTKKGMAGKTNISFNASA
GFQTLSKPKMANAAEYKEVFNTRYTNDGGTSIWNDTGATTNPGGTDWWDEVINKTALVQN
YSLNISGGSDKLVYNLSMGYYRNNSQYDYGYWDKINARLNTEYTFNKYVKMGFDIAPRVE
SWDDTPDLFSAAMSMDPTTPIFKPEDQWVDNEFNNYQRSYNNQEWNPAGSLARQNSHSRE
MGTIVNTYLQINPIQKLTLRTQFGANAHFRRTDKFTPEFYIDALEQSTLSNVSREMQEWL
DWNWTNTATYITTFAEKHNINVMGGFTAERFAEFQSKASRDDVPNNMDQMQEVNAGTQNQ
KSEGKTAYSTLVSYLGRVMYNYDNRYYLTASIRADGSSRFPKGNKYAIFPSVSASWRIIS
ESFMQDQKIFSNLKLRGGWGRVGNQNIDNDATLTLLGQSDYVFGTAPGRVSGTMVSGVGN
NLLKWETVEDWNVGVDMSFLDSRLDMTFEYFQKKSSDMLYQKQNIFAIGYPDWNSTVWMN
IGSMKASGWELSLNWHDKVADFRYNVGLNLSAVKNKAVKFSGDGPIQTGGFNSDQIIRNE
DGGLISRFYGYVADGIFQNWDEVYAHTNENGKLVQSNAQPGDIRFKDLNHDGVLDENDKT
WIGNPYPDLMVGLNLGFSYKNIDFTANFYGTFGNDIFNKTKGLYSGVSGQNVWTGTLQKA
WHGEGTSNDIPRLSYNDLNQNYTRVSSFFVEDGSYMRCKLLQVGYTLPKKWLNGTELRLS
LSAQNPFTITSYSGMDPERPQIGKDGSVIETGIDGIAYPNPRTFLFGIDLKF
NT seq
3039 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagcaaatattattattgtgtcttgcgctgacaagtctatgtagctatgcgcag
accatcactgtaaaaggtgtagtaacctcggcttcagataaagaaccgatgattggtgca
acagtgcaagtaaaaggtacaggtacaggtactattacaagtattgatggtgattattca
ctaaacgatgttgccaaggatgccgtacttgtgttctccagcataggatatgagactcaa
gaaataaaggtaaacggacaaaccgttatcaatgtagtgctgaaagatgccagtgaatta
ctggacgaagtagtggttattggttatggagccgtgaaaaaaagtgacctgaccagttct
atatctaccgtaaaaggaaaagaaattaccgaaactgtaaccggtaatgcaatggacgcc
ttgcaaggtaaaatcaacggtgttcaagtaaccagtggtggtggtccgggcgcacaacca
aaagttctaatccgtggtgtaacaacagtaaacggaaccgatcctttgtatgtagtagat
ggcatgccggtaggtacaaacatcaacttcctaaacagtaatgacattgaatctatggaa
gttttaaaagacgcttcggctgctgccatttacggaacacgtgcttctaacggtgtcatt
ctaatcacaaccaaaaaaggaatggcaggaaaaacaaatatcagttttaatgcatctgca
ggtttccaaacattgtcaaaacccaaaatggctaatgccgccgaatataaagaagtattc
aatacccgatacacaaatgacggaggaacttctatttggaatgatacaggcgctactacc
aatcccggaggaacagactggtgggacgaagtaatcaacaaaactgctttagtgcaaaat
tactcactcaatatctccggtggttcagacaaactggtttataacctgagtatgggttac
taccgtaacaattcacaatatgactatggttattgggacaaaatcaacgcacgccttaat
acagaatatacatttaataaatatgtaaaaatgggtttcgacattgccccacgtgtagaa
tcatgggatgatacccccgatcttttttcagctgccatgtctatggaccccacaactcct
atattcaagccggaagatcaatgggtggataacgaattcaataactatcagcgttcttac
aacaaccaggagtggaaccctgccggttcattggctcgccaaaattcccactcccgtgaa
atgggtacaattgtaaatacttatttacagataaaccctattcaaaaactgaccctgcgc
acgcagttcggcgctaatgcacacttccgccgtacagacaaattcactcctgaattctat
attgatgctttggaacaatctacattaagtaatgtttcccgtgaaatgcaggaatggctt
gattggaactggactaatactgctacttacatcacgacttttgcagaaaagcataatatt
aatgtaatgggtggctttacagctgaacgctttgctgaattccaatcaaaagcctcacgt
gacgatgttcctaataatatggatcaaatgcaggaagtaaatgccggtacacaaaaccaa
aagtcagaaggtaaaactgcttacagcacattagtatcttatttaggacgcgtgatgtat
aactatgacaatcgttactatctaacagcttctattcgtgcagacggttcttctcgtttc
cccaaaggaaacaaatatgccatcttcccttctgtttctgcttcatggcgtatcatcagt
gaaagtttcatgcaagaccagaagattttcagtaacttgaaattacgcggaggttgggga
cgtgtaggtaatcaaaacatagataatgatgctacgctgactttgttaggacaatctgat
tatgtattcggtacagctccaggacgtgtttcaggtactatggtatcaggcgttggcaat
aatttgctaaaatgggaaacagtagaagactggaacgtaggtgtggatatgtccttcctt
gactcccgtctagacatgacctttgagtatttccaaaagaaatcttctgatatgctctat
cagaaacaaaatatcttcgccatcggataccccgactggaacagtacagtatggatgaat
ataggtagtatgaaagctagcggttgggaattaagtctgaactggcacgacaaagtagca
gacttccgatataatgtgggattgaacctttccgcagtgaaaaataaagctgttaaattc
tccggtgacggtcctatccaaactggaggtttcaacagcgaccaaattatccgtaatgaa
gacggtggcttgatttcacgcttctacggctacgtagccgatggtattttccaaaattgg
gatgaagtttatgctcacaccaacgaaaatggcaagctggtacaatccaatgcccaaccc
ggtgacattcgctttaaggatttgaatcatgacggagtgctagatgaaaatgataaaaca
tggatcggtaacccatatcccgatttgatggtaggtttgaacttgggtttcagctataaa
aacatcgatttcacagccaacttctatggtacattcggtaatgatattttcaataagacc
aaaggtttatactccggcgtaagtgggcaaaacgtttggacaggtacattgcagaaagca
tggcatggcgaaggaaccagcaacgatattcctcgtctgtcctacaatgatttgaatcag
aattacacacgcgtttcaagtttctttgtagaagacggctcttatatgcgttgcaaacta
ttacaagtgggttacacactccccaagaagtggttgaacggaaccgaattgcgtctctca
ttgtcggctcaaaatcctttcactatcaccagctactcaggtatggatcctgaacgtcca
cagattggtaaagatggcagtgtaattgaaaccggtattgacggcatcgcttatcctaac
ccacgtactttcttatttggaattgatttaaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
