Cyclobacterium amurskyense: CA2015_3806
Help
Entry
CA2015_3806 CDS
T03993
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
camu
Cyclobacterium amurskyense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
DUF1565
PDZ_2
Pectate_lyase_3
Pectinesterase
XylC_M
DUF5123
PDZ
PDZ_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP53177
UniProt:
A0A0H4PXP7
LinkDB
All DBs
Position
4684439..4686802
Genome browser
AA seq
787 aa
AA seq
DB search
MGNLKAKIIVVLTTFVLISCGSKELTIYVSANGNNENDGTSEMPFHTIEKALEEAIKIRK
NTNETITIHLKEGEYHLTAPLVISSELSNIALIGEGTDKVSVKGSTVLETNWKAFDKNIW
ITELKENLVFNQLFINGEKQILARYPNFDENGGAWQGHAEDAIAKERVASWKEPKGGFVH
AMHRGRWGGFHYQITGVDSTGELSLIGGHQNNRPSAMHPELKMVENIFEELDSEGEWYFD
KQENKLYLWAKDGTDLVNSTTEVSTLKHLIEVIGNSENPVKNVNIEGIRFEHAMRTFMED
YSKLLRSDWTIYRGGSILLSGTESITIKDCEFINLGGNVIFVNGYNRNTEIIGNHIHDCG
ATAISFVGDFTAVRSASYQYNEFVPIAEIDSIQGPANDLYPADCKVENNLIYKIGRIEKQ
VAGVQISMAMNIHVKNNSIYEVPRAGINVSEGTWGGHLIENNDVFNTVMETGDHGAFNSW
GRDRFWHPNRKIIDSLVQANPQMPYWDAIHTTIIRNNRFRCDHGWDIDLDDGSSNYHIYN
NLCLNGGLKLREGFDRVVENNIMVNNGFHPHVWFANSKDVFRNNITMTKHFPIRLTGWGK
EVDYNLFPDAESLVLAQENNTDANSLYGNPMFVSPETGDFTVAENSPALQLGFKNFPMDN
FGVQKAELKAIAKQPSIPELNAPYFQNDTKSTKDWLGATLKNVETLAEQSASGLHNMDGV
IVLSVKNESKLAISGIMDGDVIVGVEGEKIKNISELLIKYQENLWHGYLKLSIVRNQKVN
EIKVNLQ
NT seq
2364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggtaatttaaaagcaaaaattattgtagtactaacaacatttgttctcataagttgt
ggcagtaaggagctaaccatttatgttagtgccaatggtaataatgagaatgatggaaca
agtgaaatgcctttccacaccattgaaaaagccttggaagaagcaattaaaatcaggaaa
aataccaatgaaacgataaccatccatttgaaagaaggggaatatcatttaacagctcct
ttggtaatctcttccgaactaagcaatatcgctcttatcggggaaggaacagacaaagta
agtgttaaaggttcaacggttctggagacaaactggaaagcattcgataaaaatatttgg
attaccgagcttaaagaaaacctggtttttaatcagctatttatcaatggagaaaagcag
attctggctaggtatcctaatttcgatgaaaatggaggggcttggcaaggccatgctgag
gatgccatagcaaaagaacgtgtagcgtcatggaaggaacctaagggaggttttgtacac
gccatgcatcgtggccgatggggtggttttcattaccagataactggggtagattcaact
ggagaactaagtctaattggtggacatcaaaataatagaccttcagccatgcaccctgaa
cttaaaatggtagaaaatatttttgaagagttggacagtgaaggagaatggtattttgat
aaacaggaaaacaaactttatctgtgggctaaggacggtactgatttagtcaattcaacc
actgaagtatccactttaaagcaccttattgaggtaattgggaactccgaaaatcctgtt
aaaaatgtcaatattgaagggatacgttttgaacatgccatgcgaacttttatggaggat
tatagtaagttgcttcgtagcgattggacaatctacagaggagggtcaattttattaagc
ggaaccgagtccatcactattaaggattgcgaatttatcaatttaggagggaacgtgatt
ttcgtcaatgggtacaatagaaatactgaaataattggtaatcacattcatgattgtggg
gcaacagccatcagttttgtgggagattttactgctgttcgttcagcatcttatcaatac
aacgagtttgtccctattgcagagatcgatagtattcaaggcccagccaatgatttgtat
cccgcagactgtaaagttgagaacaacctgatttataaaattggacgcatagaaaagcaa
gtggcaggagttcagatctctatggccatgaatattcatgtgaaaaacaatagtatttat
gaggtcccgcgggcaggaatcaatgtaagtgaaggtacttggggaggacatcttattgaa
aataatgatgtgtttaatactgttatggaaactggggatcatggagcattcaactcttgg
ggtagagaccgtttctggcatccaaacagaaaaattattgacagtttagtacaagcgaat
cctcaaatgccctattgggacgccattcacacaaccattatccgaaacaatcgttttcgt
tgtgaccatggttgggatattgatttagatgatggctcatccaattaccatatttataat
aatttatgcttgaacggaggtctcaaacttcgtgaaggttttgatagggtagttgaaaat
aatataatggtaaacaacggttttcatccacatgtttggtttgccaatagtaaagatgtt
tttagaaataacattacaatgaccaaacatttcccaattcggcttacgggttggggtaag
gaagtggattataacttatttcctgatgccgagtctttggtcttagctcaggaaaacaat
actgatgccaatagtctttacggaaatccaatgtttgtttctcctgaaacgggggacttt
acggttgcagagaattctcctgcacttcaattgggattcaaaaatttccctatggacaat
tttggcgttcaaaaagcggaattaaaagccattgccaaacaaccgagcattccagaatta
aatgcgccttattttcaaaatgacaccaaaagcacaaaagattggcttggtgctacactt
aaaaatgtggaaaccctagcagaacaatctgcatcaggtttacataatatggatggggta
attgtgttaagcgtaaaaaatgaaagtaaattagcaatttcaggaataatggatggcgat
gttattgttggggttgaaggggaaaaaataaaaaacatttcagaactgcttataaaatat
caggaaaatttatggcatggatatttaaagttaagcatagtccgtaatcagaaggtgaac
gaaataaaggttaatttgcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
