Capsicum annuum (peppers): 107841059
Help
Entry
107841059 CDS
T04646
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: TMV resistance protein N
Organism
cann
Capsicum annuum (peppers)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TIR
NB-ARC
C-JID
TIR_2
LRR_4
LRR_8
AAA_16
zf-RVT
nSTAND3
ATPase_2
NACHT
DUF87
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107841059
NCBI-ProteinID:
XP_047252639
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(218873687..218880108)
Genome browser
AA seq
1345 aa
AA seq
DB search
MSSTSYSPLSPSEQWDYDVFLSFRGEDTRKTFVGHLYSKLTGSGINTFKDDETLERGESI
SPQLVRAIKRSRFSIIIFSKNYASSKWCLDELVTIMEHRNKLEPAVLPIFYDISPSDVRS
QRSSFAEAFSRYEEDLNIDAKKVHNWRKALNEAANLVGHDMHGTTYNGDESQCVEHIVKE
IGNKLCQKSTISDTLIGAESQIQAVSSLLMMGSENVRFVGILGMGGIGKTTIARAILHRF
SRQFEGACFVEDIKENQAKQGLLSLQKTMLTKVLTIESVNLADEYSGIDMIRERLHFRKV
LVVLDDVDHQDQLDGLAGDHDWFGKGSRIIITARDKHLLLDCDDTYKVRLLATAEATRLF
CWHAFRKTYPINGFKYFSDQVVQYAGGLPLALKVLGSFLRGRNMKQWWSALEALADIPSE
EIISKLKISYDGLGNSVKQVFLDLACSFITSDARLLKKLFTXIMIDVLVEKSLLFFSSSG
KIVMHDLIREMGRRIAVEEYPRRRIWLHEDVADILTENKGGEAIEGIVIPLKSNSEEDTI
HLSSEVFKHMKRLRIFLSLSHNSVRLCSHDPINFLPNSLCWLCWPDYPSPSLPENFAPPK
LVWLFMYSSYVVNLWEGSKCLNRLTILDLRDSRELIRISDLSGSPNLEQLIIRHCNKLEE
FHPSVGTLKRLTILDVEGCAKLERLPSEFQSGSLEILNFPGCPSLRKFPEIQQNVNRLTR
FKQPYFEGLELTSSFEHGIDPSFLDLSGCSNIEALPNSICRLKNLKFLYLNRCTKLKNLP
EDICDLVNLEGLDASETSIWCIPNSITRLEKLMFLSIRKVPKLFHVCDLCSWGCFVQLEL
NFHLPNVISAFCPLQILDLSACNLIDGSVPEDLGCLASLLELNLSRNSFTYLPKSIALLY
HLRHLDITYCEKLKELPELPPRIMKLFADDRFALQSITTLSTMYKELYLVSFANQKLQEM
WCNSHRESSGVQMRNCPRVKMTDMLEGIHLPFLSMVQQKLIFDDPRRGGKFGIVFHRNNP
SDKVPLWFKYRETCTNRIFFNLNKHWYNDKFLGFAIYCQLPFLKDGLPKQHYRQFAFSLF
WGLTVTTKLVSEHAAMNHPTLENIFHLQVSNVVACDSHDCFIFLQFDLTKVRFKGKGKDT
MVNDPNYYCRFEASIDCHISSNWGVRLVYADDIEVMRSERAQQIDRFDHMREEETKLCFS
RLERVLVPGEICYFYSTLFYFRLPVLSTCPRCLSFAEDLAHLFLNCKYSKLVWEGSRLGL
NFDVGTPVEFREWLQSWTLSAPENEDLSFSFAILWAIWKHRNKVVHERVDFVPSEVVSTA
IKEHSRFPYSEGRAIRAIYKERSLG
NT seq
4038 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatcgacctcttatagtccgttatcaccttctgaacagtgggattatgatgtgttt
ttgagttttagaggtgaagacacgcgtaagacttttgtgggccacctttacagtaaatta
actgggtctggaatcaataccttcaaggatgatgaaacactagaacgaggtgaatcaatt
tcacctcaacttgtccgtgccattaaacggtcaaggttttccattattatcttctcaaag
aactatgcttcatccaagtggtgcttggatgagctagtgacgatcatggaacatagaaat
aaacttgagccggctgttttaccaatcttctatgacataagtccatcggatgtacgctcc
cagagaagtagttttgctgaagccttctccagatatgaggaagatctcaacattgatgcc
aagaaggtgcataattggaggaaagccttaaatgaagcagcgaatttggtaggccatgat
atgcatggtactacttacaacggagatgagtctcagtgcgttgaacatattgtgaaagag
attgggaataagttgtgccaaaagtcaacaatcagtgacactttaatcggagcagaatca
caaattcaggctgtaagctcactgttgatgatgggatctgaaaatgttcgatttgttggg
attttggggatgggtggtattggaaagaccaccattgcaagagccattcttcacaggttt
tctcgtcaattcgaaggtgcttgctttgttgaagacattaaagaaaatcaagctaaacag
ggattattgtctctgcaaaaaacaatgcttacgaaggtattgacaattgaatctgtgaat
cttgctgacgaatatagtggaattgatatgataagggaaaggcttcactttaggaaggtt
ctggtagttcttgatgacgtggatcaccaagaccaattggatgggctagctggcgaccat
gattggtttggtaaaggtagtaggattatcattacagcaagggacaagcacttgcttttg
gactgtgatgacacttataaagttcgtttacttgctacagctgaagcaactcgactgttt
tgttggcatgcttttagaaagacatatccaatcaatggttttaagtatttctccgaccaa
gttgtacagtatgccggaggccttcccctggcgcttaaagtcttgggttccttccttcgt
ggacggaacatgaagcagtggtggagtgcactagaagcactggcagatattcctagtgaa
gaaattatttcaaagcttaagataagttatgatggactagggaattcagtgaagcaagtt
tttctagacttagcatgttcattcataacatcagatgcgcgtcttctgaaaaaactgttc
acctaaataatgattgatgttctggttgagaagtccctcctttttttttcatcatctggt
aagattgtgatgcatgatttgattcgagaaatgggccgacgtattgcagtggaagaatac
cctaggcgccgaatatggcttcatgaagatgttgctgatattttaactgaaaataaggga
ggagaagcaatagaaggcatagtaatcccattgaaatccaactcagaggaagatactata
cacctgagcagtgaagtcttcaaacatatgaagcgactaagaatatttttgtcattgtct
cacaacagcgtgcgtttatgctctcatgacccgattaattttcttcccaacagcttatgc
tggttatgttggccagattatccttcaccgtcattgccagaaaattttgcaccaccaaag
cttgtgtggctttttatgtattccagttatgtggttaacctctgggaggggtcaaagtgt
ttaaacaggctgaccattcttgatttgagggactcccgggaattaattcgaatttcagac
ctttcggggtctccaaatttggagcagctaatcatacgtcactgtaataagctggaagag
ttccacccatccgttggaaccctcaaaaggcttactattttagatgtggaaggttgtgca
aaacttgaaaggcttcccagtgagtttcagtcaggctctcttgaaattctaaattttcct
ggttgtccgagtttgagaaaatttccagaaattcagcagaatgtgaatcgcttaaccaga
ttcaagcagccatactttgagggacttgaactaacatcgtcatttgaacatggcattgac
ccgagctttctagatttgagcggctgcagtaacattgaagcactacctaatagcatttgc
aggttgaaaaatttgaagtttctttacctcaatcgctgtaccaaactaaagaacttgcca
gaagacatttgtgatcttgtaaacttggaggggcttgatgcaagtgaaacttcgatctgg
tgcatcccaaattccatcacgcgcttggagaaactaatgttcttatctattcgaaaagta
cctaagttgtttcatgtgtgcgatttatgcagttggggatgttttgttcaacttgagttg
aactttcatctgcccaatgttatatcagccttttgcccacttcaaattctggatcttagt
gcttgcaatttaattgatggcagtgttcctgaagatctcggatgtttggcctcactatta
gagttaaatctgagcagaaatagcttcacctatttacccaaaagcattgctctactttac
caccttcggcaccttgacataacttattgtgaaaagcttaaagagttgccagagcttcct
ccacgtataatgaaactgtttgcagatgaccgatttgctttgcaaagtataacaacacta
tcaacgatgtacaaagagttgtacttggtctcctttgctaaccagaagttgcaagaaatg
tggtgtaattcacacagggaaagttctggtgtgcagatgagaaactgtccaagggtaaag
atgaccgacatgctagaaggcattcaccttccatttttgtcaatggtgcagcaaaagttg
attttcgatgacccacgtagaggagggaaatttggtattgttttccatagaaataatcca
agtgataaggttcctttgtggttcaagtatcgtgagacatgtacaaataggattttcttc
aatctaaacaaacactggtacaacgataagttcctgggatttgctatctattgtcagctt
ccattcttaaaagatggattgccaaaacagcattataggcagttcgcattcagcttgttc
tggggcttaacagttacaacaaaattggtgtcggaacatgctgcgatgaatcatccaacg
cttgaaaatatatttcatttgcaagtgtcaaacgtagttgcatgtgacagtcatgactgc
tttatttttctacaatttgatctgacaaaggtgcgtttcaaagggaaaggtaaagacact
atggtaaatgatcctaattactactgtagatttgaggcctctatagattgccatatttca
tcaaattggggcgttcgtctggtatatgctgatgatattgaggtgatgaggtcggaacgg
gctcagcagattgacagatttgatcatatgcgtgaagaggaaacaaaattgtgtttttcg
aggttggagagagtgttagtccccggggaaatttgttatttttattcgacacttttttac
tttagattgccagtcctatcaacttgtcctagatgcttatcctttgctgaagacttggct
cacttatttttgaattgtaaatactctaagctagtctgggaaggatcgagattgggccta
aactttgatgttgggaccccagttgaatttcgagagtggttacagtcctggactttgtca
gctcccgaaaatgaagatttgagtttttcgtttgctatcctatgggcgatctggaagcac
aggaacaaggtagtgcacgaaagagttgattttgttccctcagaagtcgtttccactgcc
attaaagagcactcaaggtttccgtattctgaaggcagagcaataagagcgatctataag
gagcgcagcctaggctaa
DBGET
integrated database retrieval system