Clostridium botulinum A Hall: CLC_0705
Help
Entry
CLC_0705 CDS
T00575
Name
(RefSeq) restriction/helicase domain-containing protein
Organism
cbh
Clostridium botulinum A Hall
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3427
ResIII
Helicase_C
PLDc_2
SWI2_SNF2
DEAD
AAA_22
AAA_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5399085
NCBI-ProteinID:
YP_001386584
UniProt:
A5HZJ5
LinkDB
All DBs
Position
722101..725067
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MDIMTRNKMVTITDNIEFKSIENGNDNLIKNEILKASEAGLVNKLIDSNLALTPKLVVND
YSKGSKVLSEIISELNKCEEFFISIAFITNSGILPLLETLKVLNKKGIKGKILTTDYLNF
SEPKALKKLLEFPNIEIKLYSKENFHTKGYIFRYRDHYKLIVGSSNLTQTALTKNKEWNL
KVSSLEEGSLTEGVISEFNQLWNEADKLTLEWIQTYEDIYRKQVEFTRKSKVPRLAQYKL
KPNKMQVEAIQGLERLKENGQDRGLLISATGTGKTYLSAFELRNYNPKRALFIVHREQIG
KQALNSFRKVFGDTRSMGILSGTSKDVDKDFIFSTIQTLSKDEILQSFDKNEFDYIIIDE
VHKAGANSYQKIVNYFNPKFLLGMTATPERSDDFDIFKMFNYNIAYEIRLQQALEEDLLC
PFHYFGVSDVTIDGIELDDKIEFKYLVAEERVKHIIDKINFYGYCGERVKGLIFCSDKKE
AKELSDIFNTKGYKTVALTGESLQEEREKAIERLEQDETLNSLDYIFTVDIFNEGVDIPS
VNQVVMLRPTKSSIIFVQQLGRGLRKNKFKEYVVIIDFVGNYNSNFLIPIALSGDRTFNK
DTIRKYVMEGTRVIPGCSTINFDEVSKKKIFESIDLANFNNIKLIKESYFNLKQKIGRIP
SLSDFDKFDSIDPLRIFGTKLGSYYNFLKKYDKEYTVELNDLEALFIEFISKKLASGKRP
HELIIIKNIIHNKVDLIGELKHELKEMHNIDFKEITETNVINVSTNEFPTGSAKKTYSKC
IFLERKYNYYIISSEFKKCIENIYFKEMVMELIDFGLSRYNKNYSNRYMNTNFQLYQKYT
YEDVCRLLEWEQGEVALNIGGYKYDKITKTYPVFINYDKSDDIEKTINYEDRFESESQLI
AISKSGRTIESQDIVQAYNAEKDGVEMTLFVRKNKDDKISKEFYFLGKIKTVGKPHQFTM
KNTTKTAVEIRYKLITKAREDIYDYIIS
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatataatgactagaaataaaatggttacaattacagataatattgaatttaaatct
atagaaaatggtaatgacaatttaataaaaaatgagatattaaaagctagcgaagcagga
ttagttaataaattaatagattcaaatttagctttaactccaaagttagttgttaatgat
tattctaaagggagtaaagtgttaagtgaaataatatctgagcttaataaatgtgaggaa
ttttttatatctattgcttttatcaccaatagtggaatacttcctttattagaaaccttg
aaagtcttaaataaaaagggaattaaaggtaaaattttaactactgattatttgaatttt
agtgaaccaaaggcattaaaaaagcttttagaatttcctaatatagaaattaagttatac
agcaaagagaattttcatacaaaaggatatatttttagatatagagatcattataaatta
atagtaggtagctcgaatttaacacaaacagccttaactaaaaataaggagtggaattta
aaggtttcatctttagaagaaggctcattaacagaaggagttatttcagagtttaatcaa
ctttggaatgaggctgataagctaactcttgaatggattcaaacttatgaggatatatat
agaaagcaagttgagtttactagaaaaagtaaggttcctagacttgctcaatataagcta
aagcctaacaagatgcaagtagaagcaatacaaggattagaaagacttaaagaaaatgga
caagatagaggtcttttaatttctgcaactggaacaggtaagacctatttatctgccttt
gaacttagaaattataatcctaaaagagcattatttattgtacacagagagcaaatagga
aaacaggccttaaatagttttagaaaagtatttggtgatacaagaagtatgggaatatta
tcaggtactagcaaggatgtggacaaggattttattttttctacaattcaaacattgtca
aaggatgaaatattacaatcctttgataaaaatgaatttgattacattataatagatgaa
gttcataaagcaggtgcaaatagctatcaaaagatagttaactattttaatcctaaattt
cttttaggtatgacagcaacacccgaaagaagtgatgattttgatatattcaaaatgttt
aattataatattgcatatgaaatacgattgcagcaagccttagaagaggatttactttgt
ccattccattactttggagtttctgatgttacaattgacggaattgagttagatgataag
attgaatttaaatatttggtagcagaggaaagggtaaagcatattatcgataaaataaat
ttttatggatattgtggtgaaagagtaaagggattaatattctgcagtgataaaaaggaa
gctaaagagctttcagatatatttaatacaaagggatataaaactgttgccttaacagga
gaaagcttacaagaggaaagagaaaaagctattgaaagattagagcaggatgaaacttta
aattcattagattatatttttacagtagatatatttaatgagggagtagatattccttct
gtaaaccaagttgtaatgttaagaccaactaaatcctcaataatatttgtacaacaatta
ggtagagggcttagaaaaaataaatttaaagagtatgttgtaataatagattttgtaggt
aattataacagtaactttttaattccaatagctttatcaggggatagaacttttaataaa
gatactattagaaagtatgttatggaaggtacaagggttataccaggttgttctactatt
aatttcgatgaagtatcgaaaaagaaaatatttgaatcaatagatttagccaattttaat
aatataaagttaattaaagaaagttattttaatcttaaacaaaaaattggcagaatacct
agtttaagtgattttgataaatttgattctatagatccattaagaatttttgggactaag
ttagggtcctattataatttcttaaaaaagtatgacaaagaatatactgtagagcttaat
gatctagaggctttatttattgagtttatttctaaaaagttagcttcaggtaaaagacca
cacgaacttataataattaaaaatataatacataacaaagtagatttaataggtgagtta
aaacatgagcttaaagaaatgcataatatagattttaaagaaattactgaaacaaatgta
attaatgtatcaacaaatgaattcccaacgggatcggctaaaaagacttattcaaaatgt
atctttttagaaagaaaatataactattatataatttcatctgagtttaaaaaatgtatt
gaaaatatttattttaaagaaatggttatggaattaatagattttggattaagtagatat
aataaaaattatagtaataggtatatgaatactaactttcaattatatcaaaaatataca
tatgaagatgtgtgcaggctgttagaatgggagcagggggaagtagctttaaatattggt
ggctataaatatgataaaattactaaaacttatcctgtatttattaactatgataagtca
gatgatatagaaaagactataaattatgaggatagatttgaatcagaatcacagttaata
gcaatttcaaagtcaggtagaactatagaatctcaagatattgttcaagcatataatgca
gaaaaagatggagtagaaatgactttgtttgtaagaaaaaataaagatgataaaatttca
aaagaattctactttctaggaaaaataaaaacagtagggaagccacatcaatttacaatg
aaaaatactacaaaaacagctgtagaaataagatataaattgattacgaaagcaagagaa
gatatttatgattacataatatcatag
DBGET
integrated database retrieval system
