Cajanus cajan (pigeon pea): 109806646
Help
Entry
109806646 CDS
T04868
Name
(RefSeq) putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g17630
Organism
ccaj
Cajanus cajan (pigeon pea)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109806646
NCBI-ProteinID:
XP_020224706
LinkDB
All DBs
Position
10:526086..528528
Genome browser
AA seq
727 aa
AA seq
DB search
MLNAASERFRFLSSRFQPFFLISRSICRVHNDDFLDSFDAFFQRCFTLQQARQLHSQLVL
TAAHRLPFLAARLIAVYARFGFLSDARKVFDAIPIEGLHHLLLWNSIIRANVSHAYHEHA
LQLYVEMRKLGFLPDGFTLPLIIRACSNLGGADLCRVVHCHALQMGFRNHLHIVNELVGM
YGKLGRMEDARQLFDGMFVRSVVSWNTMVSGYAFNCDSLGASGVFKRMELEGLQPNSVTW
TSLLSSHARCGLYDETLEMFKRMRKRRVEISAEAVAVVLSVCADMAEVDWGKEIHGFVVK
GGYEDYLFVKNALIGTYGKHRHLGDAHKVFLEIKNKNMVSWNALISSYAESGLCEEAYAA
FLQMEKSGSDGQSPVRPNVISWSAVIGGFACKGHGEKSLELFRQMQLAKVMANCVTISSV
LSVCAELAALNLGRELHGFAVRNLMVDNILVGNGLINMYMKCGDFREGHLVFDNIKGRDL
ISWNSLIGGYGMHGLGENALRTFDEMIRAGMKPDNITFVAILSACSHAGLVAAGRNLFDK
MVREFRIESNVEHYACMVDLLGRAGLLKEATDIVRNMPIEPNEYVWGALLNSCRMYRHTD
NVEETASQILSLKSKITGSFMLLSNIYAANGRWDDSARVRVSARTKGLKKIPGQSWIEVR
KKVYTFSAGNLVHLGLEEVYTILEELALHMGSENYKLNSCFSQEFVYDQSKHLLQTETRE
ARYYVMP
NT seq
2184 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcaatgcagcctctgagcgcttccgctttctctcttcacgattccaaccctttttt
ctcatctctcgttcaatctgccgcgtccacaatgacgactttcttgattccttcgacgcc
ttttttcaacgttgcttcactctccaacaagctcgccaacttcactcccaattggttctc
accgccgcgcaccgtttacccttcttggccgccaggctcatagcggtttacgctcgattt
ggctttctctccgacgctcggaaagtgtttgatgcaataccaattgaggggctccaccat
cttcttttgtggaattcaattatcagagccaatgtctctcacgcttaccacgaacacgcg
cttcaactttatgttgaaatgcgaaagcttggatttttgcccgatgggttcactcttccg
ttgataattcgcgcttgctcgaatctgggtggcgctgacctctgcagggttgtccattgt
catgctctgcaaatggggtttcggaatcatcttcatattgtgaacgagctcgtggggatg
tatgggaagcttgggcgaatggaggatgcgcgccaactgtttgatggaatgtttgtgaga
agtgtcgtgtcgtggaatactatggtttcgggttatgccttcaactgtgattctcttggt
gcttctggggtttttaagcggatggagttggaaggtttgcagccgaactctgtgacgtgg
acctcgctcttgtcgagccatgctagatgtgggctttatgatgagactcttgagatgttt
aagaggatgaggaaaaggagagttgaaatcagtgctgaagcagtggctgtggtgttatcg
gtttgtgctgatatggctgaagtcgactggggtaaagaaatccatggttttgttgttaaa
ggtggatatgaagattatttgtttgtgaaaaatgcactgataggtacttatgggaagcac
cggcatctgggggatgctcataaagtgtttttggaaataaagaacaagaatatggtaagt
tggaatgctttgatatcgtcatatgctgaatctgggttatgtgaggaggcctatgcagca
tttttacagatggagaaatcaggttcagatggtcagtcccctgtgaggcccaatgtcata
agttggagtgcagtgatcggtggttttgcttgtaaggggcatggtgagaagtcactggaa
ctttttaggcaaatgcagcttgcaaaagtaatggccaattgtgtgacaatttccagcgtt
ttatcagtttgtgcagagttagcagcattgaaccttggcagggagctccatggttttgcc
gttaggaatttgatggttgacaatattttggtgggcaatggtctgataaacatgtatatg
aagtgtggggatttcagggaaggacacttggtgtttgataacataaagggtagagattta
atctcatggaactcattaattgggggttatggaatgcatgggcttggtgagaacgcttta
agaacttttgatgagatgattagagccggaatgaagccagacaacatcactttcgttgct
attctatctgcttgcagtcatgctggacttgttgccgctggtcgaaacctttttgacaag
atggtcagagagtttaggattgaatctaatgtagagcactacgcgtgcatggttgatctc
cttggtcgtgcgggacttttgaaagaagcaactgatatcgtgcgaaacatgccaattgaa
cctaatgaatatgtttggggggctcttctaaactcatgtagaatgtacagacacacagac
aatgtagaagaaacagcatcacaaattctaagcctgaagtcaaaaataactgggagcttc
atgctgctgtccaatatttatgctgctaatggaagatgggatgattctgcaagagtgaga
gtgtcggcaaggacaaaaggtctgaaaaaaatacctggtcaaagttggattgaggtgaga
aagaaagtttacacattctcggcagggaatctagtccatttgggtctggaagaagtttat
acgatccttgaagaattggcacttcacatggggagtgaaaattataaactcaatagttgc
tttagtcaagaatttgtttacgaccaatcaaagcacttgttgcaaactgagacccgagag
gctagatattatgtcatgccatga
DBGET
integrated database retrieval system
