Clostridium carboxidivorans: Ccar_19180
Help
Entry
Ccar_19180 CDS
T03979
Name
(GenBank) GntR family transcriptional regulator
Organism
cck
Clostridium carboxidivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
HTH_36
HTH_11
HTH_Crp_2
HTH_CodY
MarR
LexA_DNA_bind
TrmB
MarR_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKN32853
UniProt:
C6PNL8
LinkDB
All DBs
Position
4309942..4311396
Genome browser
AA seq
484 aa
AA seq
DB search
MININWEPKKNNSKPLYKQIVDYIINEISTGNWVVGTKLPSQRQLAQDFKVNRSTIVEAF
DELKSKGFIEGNSGGGTRIVNSTWSLLSSKSKLNWQNYIEGSIHKPNLHTIQMVNKLEYK
KDIIRLGTGEPGPQLFPKNMMDKILNKCSNKIMSLGYLEGKGLLELRTILSEYLKIYGIN
VKPSSILIVSGALQALQLIALSILPLGSKILIEKPSYLKSLHIFQSMGMNMIGTKMDNRG
IIPAEISKEINNKVNTLLYTIPTFHNPTGIVMTKNRRMEILDLCEKHRIPIIEDDVYREL
WLDEIPPLPLKSWDKNGNVLYLGSVSKSLAPGFRIGWLIGPEPVVERLADIKMQTDYGSS
SLSQLILAEWIKSGLYSEHLNNVRSKLKIQRDNALKTLNENFADIATWNIPKGGFYIWLK
LNSPISMNKLFSQAAKENILINPGSIYDSLNNQNLRISYSYASLEEMKIGLEKLSHIVRS
FLKI
NT seq
1455 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgataaacattaactgggaacccaaaaaaaataattctaaacctttatacaaacaaatt
gtagattatataataaacgaaatatctactggcaattgggttgtgggtactaaactccct
tcacaaaggcagttggctcaagactttaaagtaaatagaagcactatagtagaagccttt
gatgaattaaaaagtaaaggtttcattgaaggaaacagcggtggcggtactagaatagta
aatagcacctggtccctgctttcatcaaagtctaagttaaattggcaaaattatattgaa
ggaagtatacacaaacctaatcttcacacaattcaaatggttaataagctggaatataaa
aaagatattatacgattgggcactggtgaacccggacctcaattgtttcctaaaaatatg
atggataaaatattaaataaatgctcaaacaaaattatgtccttaggctatcttgaaggt
aaaggtcttttagaactaagaactattttaagtgaatatcttaaaatttatgggataaac
gttaaaccctcttccatccttattgtttctggagcacttcaagccctacaattaatagct
ttatcaattttgcctttaggttctaaaattttaatagaaaaaccatcttatttaaagtcc
cttcacatattccaatcaatgggtatgaatatgattgggacaaaaatggataacagaggc
attattcctgctgaaatatcaaaagaaattaataataaagtcaatactttattatataca
attcctacttttcacaatcctacaggaattgtaatgactaaaaatagacgtatggaaata
ttagatttatgcgaaaaacatagaattcctattattgaagatgatgtatatagagaatta
tggttagatgaaatacctcccctgccattaaaatcctgggacaaaaacggaaatgtgctt
taccttggaagcgtgtcaaaatcccttgcaccaggttttagaattggatggcttattggt
cctgaaccagtagttgaaagattagctgatataaaaatgcaaacagactatggctctagt
tccttatctcaactaatattagcagaatggataaaaagtggactttatagtgaacatctt
aataatgtaaggtctaaattaaaaattcaaagagataatgccttaaaaactttaaatgaa
aattttgctgatatagctacttggaatattcctaaaggaggtttctatatatggctaaaa
ttaaattcgcctatatcaatgaataagttattctcccaagcagcaaaggaaaatatactt
attaatccaggaagtatatacgattctcttaataatcaaaatttaagaatatcttattct
tatgcttccttagaagaaatgaaaataggtttagaaaaattatcacatatagttagaagt
tttctcaaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
