Campylobacter concisus 13826: CCC13826_0009
Help
Entry
CCC13826_0009 CDS
T00593
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cco
Campylobacter concisus 13826
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
FlgD_ig
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW74837
UniProt:
A8Z6I4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1981960..1986096)
Genome browser
AA seq
1378 aa
AA seq
DB search
MATRIGVIKSISQGSSVIATAKDGTQRVLKVGDEIFLGETIQTTDFDSKVVITANDGKDI
AIIGKDTLNLDKSVAHNESFGDDSVADVSAIQKALLDGANITDLEETAAGGNAAAGAGGD
GVSLGAASFEEGGHYSNITDDYRNLPDSSRAFQTPENSIGGYNDGNDAGNATPVAPVIPP
ISVDIKTLNDNFGTIQGDYSLDAPSVPRTNDATPTISGTVEPTAVRAVVSVLDKNGHEVF
TKTLNPNDYADGKFKFTTNELSVDGNHDGNYEVKIVATGRDGNIATDTGNFVLDTVAKIT
INVETEMSLVKESEMSEGLKGNFWFNHIYEPGVSGTELRPYAFNNTEYAHNGKKQNDFVE
YYMNNTKPWASFKAKELNFQQGKGGDRDNTDNDAGTVSGLDGAHNMVGKIDLDGNVVTPN
SEWVAPNFKALEYFIDNAKGSDIHILRDAPNGKNTTAGAMVNLKGTMYLEPGDYKFDAKN
TDDSVRFKVDGKTMVDYDTIHSENRATTTTLHVDKAGYYDFDMSYANYIFWGKLKLTVSK
DGGPESILGSEASGIKLNSTDFDSYVDTVTRNVYKVTQKITGTVDNVEDGQIVTVTSSTG
ESHTAKVVDGKYEVEFKTSDPKATYTAKVSDLVGNEAQATSAKLNVATDLIDAIDNDASV
VSANTSTGINDATKYYKYTTDDIAQTDKFSSNAPLPVLSDKTPTFTGSIDSSATKAIITV
LDKNGHEVFTKELSQSEFSNGKFEVTSDNLEDGNYNIKATAIFANGDKSTIVSEFVVDKT
PVTIENIKIIENDGEGLHHTLKFNLKNYEDGDKIESIKIVTADGTTNVISVGTTKPTNGV
LSFEYDHKIKLGDKIEVEMTDKAGTKYTHVNEILVPTMTQFENGNDTTTNANNRSAEKLW
GTMEMSESGTRADGSRIVSNDAIPYLRAVIPEDTTAGATSDNKTVSEFLNSGRGIRWSTG
DVKFVSTNVDTGVTKVLLSEAIEKPIGNVTPDHYNRLTGFNNRLDGYGKMADGVYKISID
GKYQGGDELLYNSIQFTIDATAATIDNSNFNYDAATNKTTWSGNLSENGVGASYTLKQHF
EEAVKGIALKDSITLRDANGHIIPANSVTLDDNGNFEAVFNGDVKANDVYLQISDIAKNT
RVDAENNNNNNVITTSEGNDIITVGDGNNTINAGRGENEIRTGNGNNVIITGDNNDVITT
GSGNDYIDAGRSGYTGINKGDLVNAGAGNDKVVFTFDDPRAALSQSLDGGAGTDTLIMRP
MAKDGTIDFDKIDNKSLTNAIKNFEEIQLGMDEHGNDNQAVKLLNLKADNVFGITDDVNT
ILKISGDNKDSVSLKGFTEATSQNGVEAGYTRYEGQTSADTPKTIYIDVDNDINKQLV
NT seq
4137 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacaaggataggcgttataaaaagcatctcacaaggatcaagtgtaatcgcaact
gcaaaggacggcactcaaagagtattaaaagtaggcgatgaaatttttcttggtgagact
atacagacaactgattttgactcaaaagtagtcataactgcaaacgatggcaaagacatt
gcgatcatcggaaaagataccctaaatttagacaagagtgtagctcacaatgagagcttt
ggtgacgatagcgtagctgatgtaagcgctatccaaaaagcacttcttgatggcgcaaac
atcacagatcttgaagagacagcagccggtggtaacgcagcagctggagctggtggagat
ggcgtaagcttaggtgctgcaagctttgaagagggtggtcactactcaaacattactgat
gattatagaaatttacctgattcaagcagggcttttcaaactccagagaactcaatcggc
ggctacaatgacggcaatgacgcaggcaacgcaactcctgttgcaccagtcatacctcca
attagcgttgatatcaaaacactaaatgataactttggaactatacaaggcgattacagc
ctagacgcgccaagcgtacctcgcacaaatgatgctactccaaccataagtggcacagtt
gagcctactgctgtaagagctgttgttagcgtacttgataagaacggacacgaagtcttt
acaaaaactctaaatccaaacgactatgctgatggtaaatttaaatttacaactaacgag
ttaagcgtagatggcaatcatgatggcaattatgaagtaaaaatagtagcaactggaaga
gacggcaatattgcaaccgatactggtaatttcgtgcttgatacagttgcaaaaataact
ataaacgttgaaactgagatgagccttgttaaagagtctgagatgagcgagggactaaaa
ggaaatttctggtttaaccacatctacgagccaggcgtaagcggtactgagctaagacct
tatgcttttaataatacagaatacgctcataacggtaagaagcaaaatgattttgtagaa
tactatatgaataataccaaaccttgggcaagctttaaagcaaaagagctaaatttccaa
caaggcaaaggtggcgatagagataacactgataatgatgctggaacagtctcaggacta
gacggtgctcataatatggtcggcaagatcgatcttgatggtaatgtagtaactccaaat
agtgagtgggtagctccaaatttcaaagcacttgagtacttcatcgacaatgcaaaaggt
agcgatatccatatcctaagagatgctcctaatggcaaaaacacgacagctggtgcgatg
gtaaatttaaaaggcactatgtatcttgagccaggggactataaatttgacgcaaaaaat
actgatgatagcgtgagatttaaggttgatggtaagactatggttgattatgacactatt
cattctgaaaatagagctacaaccacgactttacacgttgataaagcagggtactatgac
tttgatatgagctatgcaaactacatcttttggggcaagctaaaactaacagtttcaaaa
gatggcggacctgagagcatacttggctcagaggcaagtggcataaaactaaattcaacc
gactttgacagctatgtagatacagtaacaagaaatgtctataaagtcactcaaaagatc
acaggaactgtggataatgtagaagacggacagatcgtaactgtgacatcaagcaccggc
gagagccatacagctaaagtggtagatggcaaatatgaagttgagtttaaaacaagcgat
ccaaaagctacatacacagctaaggttagcgaccttgtaggcaacgaggcgcaggcaaca
tcagctaagctaaatgtcgcgacagacctaatagacgctatagataatgacgcaagcgtt
gtaagtgcaaatacaagcacaggcataaacgatgcaactaaatattataaatatacaact
gatgacatcgctcaaactgataaattttcatctaatgcgccactaccagtactaagcgac
aagactccgacatttacaggtagcatagatagcagcgcaactaaagcgatcatcactgta
cttgataaaaatggacatgaagtctttacaaaagagcttagccaaagtgaattttcaaat
ggtaaatttgaagtcacatctgataacttagaggatggtaactataacatcaaagcaact
gcaatattcgcaaatggcgacaagagcacgatagttagtgaatttgtagttgataagacg
ccagttactatagaaaacatcaagatcatcgaaaatgatggcgagggactacaccatacg
cttaaatttaacctcaaaaactatgaggatggcgataagatcgagagtataaaaatcgta
acagctgacggaactactaacgtaatctctgttggcactactaagccaactaatggtgtg
ctaagctttgagtacgatcataagataaaactaggcgataaaatagaagttgagatgact
gataaggctggcacaaaatatactcacgtaaatgaaattttagttccaactatgacgcag
tttgaaaacggcaacgacacaactacaaatgcaaataaccgctcagctgagaagttgtgg
ggcactatggagatgagtgagagcggcactagagctgatggctcaaggatcgtttcaaac
gacgctatcccatacctaagagctgtgatcccagaagatacaacagctggtgctactagc
gataataaaactgtaagtgagtttttaaatagcggcagaggcataagatggagtactgga
gatgttaaatttgtatctacaaatgttgatacaggtgttacgaaagttttactatctgaa
gcgatagaaaaaccaataggcaatgtaacgcctgatcactacaatagacttacaggcttt
aacaacagacttgacggctatggcaagatggctgatggtgtttataaaatttctatcgat
ggtaaatatcaaggtggagatgagctactttacaactctattcaatttactatcgatgca
acagctgcaacgatagacaactcaaattttaactacgatgcagctacaaataaaaccaca
tggagtggaaatttaagtgaaaatggagttggtgcaagctatacgctaaaacaacacttt
gaagaggcggtaaaaggcatagctctaaaagatagcatcactttaagagatgcaaatgga
cacatcatacctgcaaattctgtaacgcttgatgataatggaaatttcgaagcagtattt
aatggcgatgtaaaagcaaacgatgtctatctacaaatttctgatatcgctaaaaacaca
agggtggatgcagaaaataacaacaataacaatgtcatcacaacaagtgaaggcaacgat
atcataaccgttggagatggaaacaacacgatcaacgcaggacgcggcgaaaatgaaatt
cgcacaggcaatggcaacaatgtaatcatcactggcgataacaacgacgtcataaccaca
ggaagtggtaacgactacatagacgctggcagaagtggctatactggcataaacaaaggc
gatctagtaaatgctggcgctggcaatgataaagttgtatttacctttgatgatccaaga
gcagctctatctcaaagcttggatggtggcgctggtacggatacgcttattatgcgtcca
atggcaaaggatggcactatcgactttgataagatagacaataaatctttaactaatgcg
atcaagaattttgaagagatccagcttggcatggatgagcatggcaatgacaaccaagct
gttaagctactaaatttaaaagcagataatgtatttggtatcactgatgatgtaaatact
atcttaaaaataagtggcgacaacaaagatagcgtttcattaaaaggatttactgaggct
acaagtcaaaatggtgtcgaagctggatatacaagatatgagggtcaaacaagcgcagat
actccaaaaactatctatatagatgtcgataatgatataaacaaacaacttgtataa
DBGET
integrated database retrieval system