Chrysoperla carnea: 123299935
Help
Entry
123299935 CDS
T09255
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase SlrP-like
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NEL
LRR_4
LRR_8
FNIP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123299935
NCBI-ProteinID:
XP_044738293
LinkDB
All DBs
Position
5:50237135..50241260
Genome browser
AA seq
754 aa
AA seq
DB search
MIPDYLEEFKVWELWELPDDEEFYTYELQSWEEEEKIIELNDDKSFLKAWELWKTAEDQT
ENESRMKAFERLENCGEQLFLEFLYLTTIPNVYPYGLKELHLADNHLKQIPDNLPETLEI
LNMDSNQVYRIPEKLPSNLRELLLLKNYIRSIPETLPDSITLLNLCNNKIDILPNKLPKS
LKTLSVCENRLTSLPENLPETLEELEVRSNKLTCLPNNLPKSLRSIFADFNAIQFLPKKL
PEMLKTITIKSNNLTCLPEQLPKSLEKLHISCNKITEPKLDFESLIELYIENNGIETIPE
DNFNLPKLKTFFVSDNKLKMLPKNLPETLEWLYACNNEFTEIDLPKSLKNLDLDDNNITT
LSAELPPNLERMSLNYNKLTEIPTELPESLESLSLYDNLITEVSPNIENFPNTTFYLGEN
PLSETSLEYLRWLILTTGRQNICFNGSHEYYLNFVEAGALIEEIPNWLDTELIHPYWNTI
SEEITARPFSRLLYRIRQTPNFEVAQFKEDMSKWLCLLGEDNNSKQKLREKIFLVAAEAN
ESCDHRVVWSLNQMKILSIAQEVELGKYDNKMEELIRLARGMYRLNVLDQISRQTVRNLE
NACDETEIYLEYQIRLREVFDLPIGTSKMNEHYSFVLPDEDIEHAVKEIVNKERIEFIDY
LLLDWQPWKEVLKRWNDDQFVKCENDIRNEEFFKQTLDKRKMEYLLETNMSDELPLDVEI
QLGSQVQRQIEKDTWLKLTNEFLESKNLGNIERL
NT seq
2265 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcccgattatctagaagaatttaaagtatgggagctttgggagttaccagatgat
gaagaattttatacttatgaattacaatcttgggaagaagaagaaaagataatagaatta
aatgatgacaaatcttttttaaaggcgtgggaactttggaaaacagccgaagatcaaact
gaaaatgaatcacgtatgaaagcttttgaacgactggaaaattgtggagaacagttattt
ctagaatttttatacttaacaactattcccaatgtttatccatatggattaaaggaatta
catcttgcagataatcatttaaaacaaattccagataatttacctgaaacacttgaaatt
ctaaatatggatagtaatcaagtgtacagaattccagaaaaattaccatccaatttacgg
gaattactattgcttaagaattacataagaagtattccagaaacattacctgattcaata
acacttttaaatttatgcaataacaagattgacatattacccaataaattacccaaaagt
ttaaaaacattaagtgtgtgtgagaatcgattaacaagtcttccagaaaatttacctgaa
accttagaagaattagaagtaagatcaaataaacttacgtgcttgccaaataatttacca
aaatcattacgttcgattttcgcagattttaatgcaatacaatttttacccaaaaaatta
cctgaaatgttaaaaacaattactattaaatctaataacttaacttgcttaccagaacaa
ttacccaaatcgttagaaaaactacacatttcgtgtaataaaataaccgaaccaaaatta
gattttgaatccttaattgaattgtacattgaaaataatggcattgaaacaatacctgaa
gataattttaatttacctaaattaaaaacgtttttcgtttcggataataaattaaaaatg
ttaccgaaaaatttacccgaaacattagaatggttatacgcatgtaataatgagtttaca
gaaattgatttaccaaaatccttaaaaaatttggatttggatgataataatataactact
ttatcagcagaattacctccaaatttggaacgaatgagtttaaactataataaacttacg
gaaattcctacagaattgcccgaatcattagaatcattatctttatacgataatctgatc
actgaggtatcaccaaacattgaaaatttccccaatactacattttatctgggagaaaat
ccactatctgagaccagtttggagtatttacggtggttaattcttactacaggtcgtcaa
aatatttgttttaatggtagtcatgagtattatttaaactttgttgaagcaggagcatta
attgaagaaattccaaattggttggatacggaattaattcatccatattggaacaccatt
tctgaggaaataaccgctagaccgttttctcgtttattgtatcgaatacgacaaacacca
aattttgaagttgcacaatttaaagaagatatgtcaaaatggttatgtttattaggagaa
gataataattccaagcaaaagttgcgtgaaaaaatatttttagtggcggcagaggcgaat
gagtcatgcgatcatcgtgttgtttggtccttaaatcaaatgaaaatactaagcatcgct
caagaggtggaattgggtaaatatgacaataaaatggaagaattgataagattagctcgt
ggaatgtatcgattaaatgttttggatcaaatttcaagacaaacagtacgaaacttagaa
aatgcttgtgatgaaaccgaaatatatttagaatatcaaattcgtttacgtgaggtattc
gatttaccaattggcacatcgaaaatgaatgaacattattcatttgttttacccgatgaa
gatattgaacatgctgtgaaagaaatagttaataaagaacgaattgaatttattgattat
ttattacttgattggcaaccttggaaagaggtccttaaacgatggaatgatgatcaattc
gtaaaatgtgaaaatgatattagaaatgaagaattttttaaacaaacattggacaaacga
aaaatggaatatttattagaaacaaatatgtcagatgaacttccgttggacgttgaaatt
caacttggctctcaagttcaacgtcaaattgaaaaagatacttggttgaaactaacgaat
gaattcttggaaagtaaaaacttaggaaatatagaaagactgtga
DBGET
integrated database retrieval system