Candida dubliniensis: CD36_17000
Help
Entry
CD36_17000 CDS
T01140
Name
(RefSeq) syntaxin, putative
KO
K08489
syntaxin 16
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu04130
SNARE interactions in vesicular transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04130 SNARE interactions in vesicular transport
CD36_17000
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cdu04131
]
CD36_17000
Membrane trafficking [BR:
cdu04131
]
SNARE
Syntaxin (Qa)
Stx-TGN / EE
CD36_17000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNARE
DUF2615
DUF2963
MRAP
Secretin_N_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8045742
NCBI-ProteinID:
XP_002418178
UniProt:
B9WAQ8
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(438947..440209)
Genome browser
AA seq
420 aa
AA seq
DB search
MFRDRTNLFLSYRRTIPRDTLPIKRTRFSDLDNEEENEGLILSSTSTTTSTTTATSNRKG
RKNKSNRNSNSNNSGGSDYNDEEDIELRPMIPNIFDIAKELDSYLNIINKNIEELNSMYK
KLIIINKLNKLNLEKKIEELNYQILIKFEKCYILIKKFEYLLNNYQKLKLNYNQQDLEIL
INFKKNYAVKIQDKSLIFRNLQNNYMKFLKNDDDDEEKNKEVENRFDTNNEQITLLNDLE
ESKSINTINSTNNNNNQQQQQQVQIQQQSNIQYLQQREREISKLAHGIIEISTIFKEMES
MVIEQGTILDRIDYNLINTVEELNQANKELIKAHNYQKNSTKCKIIFFLSLCVFALLMIF
MLRPTTSKNSHSNSMSNNNNNNNNNNNDSNISDDQELMRPNIDKPVNEVNPPSNVNKVFI
NT seq
1263 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttagagatagaaccaatttatttttatcatatcgtcgaacaattcctcgtgataca
cttcccatcaaacgaactcgatttagtgatttagataatgaagaagaaaatgaaggatta
atactatcgtcaacttcaacaacaacttcaacaacaacagcaacgtctaataggaaaggg
aggaagaataaatcaaatcgtaatagtaatagtaataatagtggtggtagtgattataat
gatgaagaagatattgaattaagaccaatgattcctaatatatttgatattgctaaagaa
ttagattcatatttgaatataattaataaaaatattgaagaattaaattcaatgtataaa
aaattaataattattaataaattaaataaattaaatttagaaaaaaaaattgaagaatta
aattatcaaattttaattaaatttgaaaaatgttatatattaattaaaaaatttgaatat
ttattaaataattatcaaaaattaaaattaaattataatcaacaagatttagaaatttta
attaattttaaaaaaaattatgcagttaaaattcaagataaatcattaatatttcggaat
ttacaaaataattatatgaaatttttgaaaaatgatgatgatgatgaagaaaaaaataag
gaggtggagaataggtttgatactaataatgaacaaattacattattaaatgatttagaa
gaatccaaatcaataaataccataaattcaaccaataataataataatcagcaacaacaa
cagcaagtacagatacaacaacaatcaaatattcaatatttacaacaacgagaacgagaa
atttctaaattagctcatggtataattgaaattctgacaatttttaaagaaatggaatca
atggtaattgaacaaggaacaattttagatagaattgattataatttaattaatacagta
gaagaattaaatcaagctaataaagaattaattaaagctcataattatcaaaaaaattca
actaaatgtaaaattatattttttttaagtctttgtgtgtttgctttattaatgatattt
atgttacgtccaacaacatcaaagaattcccattccaactccatgtctaataataataat
aataataataataataataatgattctaatattagtgacgatcaagaactaatgagacca
aatattgataaaccagtcaatgaagttaatcctccatctaatgtcaataaagtatttatt
taa
DBGET
integrated database retrieval system