Clostridium gelidum: psyc5s11_16940
Help
Entry
psyc5s11_16940 CDS
T08447
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cgel
Clostridium gelidum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAMP_2
MCPsignal
HAMP
4HB_MCP_1
TarH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCZ45627
LinkDB
All DBs
Position
1961990..1965316
Genome browser
AA seq
1108 aa
AA seq
DB search
MGWFNNLGISKKLLSSFILIALIAGAMGAYGILNLKSIKNSDTELYENMTVPVSQMGEIS
SEFQRLRVNLRDMIIAQSPEDIQANMDKIEERRANIDKVSNSFEKTIISVEMKKEFEAFK
VARVDFKSKLDKAILLAKENKDQEAVAMISENGEAGKSSRVEQDSIAKIISMKIDDAQAK
SDLNTKNANITITIMLGIIIFVVVMSILIGLYISNLITKPLKRAVYIIQEMSKGHLGERL
KINTKDEIGQMSVAMDIFADDLQTSIIGNMKKISNGDVSMNIQLKDEKDEISPALNKMVE
NIRELVKDTNMLSKAAVEGKLDTRADATKHSGDFRNIVEGVNNTLDSVIGPLNIAAEYVE
RISKGDIPEKITDTYYGDFNEIKNNLNNCIDVMRGLLTETNNLIKATQEGKLDTRGNSAA
FVGDWGTLIDGVNKLIDAFVAPINITAEYVERISKGDIPEKITDTYYGDFNEIKNNLNNC
IDVMRGLLTETNNLIKATQEGKLDTRGNSAAFAGDWGTLVGGVNKLIDAFVAPINITAEY
IDRISKGDIPEKITDTYNGDFNEIKNNLNNCIDVMRGLLTETNNLIKATQEGKLDTRGNS
AAFVGDWGTLIDGVNKLIDAFVAPINITAEYIDRISKGDIPEKITDTYHGDFNEIKNNLN
NCIDNIRELVTESIMLSKAAIEGKLDTRADESKHNGDFRKIVEGVNELIEAMVKPIQEVN
SVMNEMSKGNLGVSVKGDYKGEFGVLANTINNFRERLKNIIGEISEVIGKISEGNLVIED
VREFGGDFKSISVSLNTIIESLNSVLSEINTASDQVFTGSSQVSDGSQALSQGATEQASA
IEELTSSITEVAAQTKENAINANQAKDLSLNVKEKAEEGNRHMSEMLKSMGEINESSANI
SKIIKVIDEIAFQTNILALNAAVEAARAGQHGKGFAVVAEEVRNLAARSANAAKETTALI
EGSIKKSEKGTEIANNTAKALYEIVDGVSKAATLVAEIAASSNEQATGISQINLGIEQVS
QVVQTNSATAEESAAASEELSSQSQMLKEMVSSFKLKNDNGNSSLNNGAKNYKNKQSYIK
ENKVAFKEVAATSSKPKIALSDNEFGKY
NT seq
3327 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttggtttaataatttaggtattagtaaaaaattattgtcgagttttatcttaata
gcattaatagctggagcaatgggtgcttatggaattttaaatttaaaatccattaaaaac
tcagatactgaattgtatgagaatatgactgttccggtttctcaaatgggtgaaatatca
tctgaatttcaaaggcttagagtaaacttaagggatatgataattgctcaatcaccagaa
gatattcaagctaatatggataaaatagaagaaagaagagctaacatagataaagtgtct
aattcttttgaaaaaactattatttctgtagaaatgaaaaaagagtttgaagcttttaaa
gtagctagagttgacttcaaatcaaaacttgataaagcaatattgcttgcaaaagaaaat
aaagatcaagaagcagttgctatgattagtgaaaatggtgaagctggaaaatcctcaaga
gtagagcaggattcaatagcaaaaataatttctatgaagattgatgatgcacaagcaaaa
tcagatttaaatacaaaaaatgctaacataacaataacaattatgcttggaataattatt
tttgttgtggttatgtcaatattaattggattatatatttcaaacttaattactaagccg
ttaaaacgggcagtatatattattcaagaaatgagcaaaggtcatcttggagagaggtta
aagattaatactaaagatgaaattggacaaatgtctgtggctatggatatatttgcagat
gatttacaaacttctataattgggaatatgaagaaaatctccaatggcgatgtgagtatg
aacatacagttaaaagatgaaaaagatgaaatatcacctgctttgaataaaatggtagaa
aatataagagaattagtaaaagatacaaatatgttatcaaaagcagcagtagaaggaaaa
cttgatacaagagcagatgcgacaaaacatagtggggatttcagaaatattgttgaaggt
gtaaataatactcttgattcagtaataggaccattaaatattgcagcagagtatgtagag
agaataagtaaaggtgatataccagagaagataacagacacatattatggagactttaat
gaaataaagaacaatttaaataactgtatagatgtaatgagagggttattaactgaaact
aataatctaataaaggcaacacaagagggcaaacttgatacacgaggaaattcagcagca
tttgttggggattggggtacgttaattgatggtgtaaataaattaatagatgcttttgta
gcaccaataaatataacagcagaatatgtagagagaataagtaagggagatataccagaa
aaaataacagacacatactacggagacttcaatgaaataaagaacaatttaaataattgt
atagatgtaatgagagggttattaactgaaactaataatctaataaaggcaacacaagaa
ggaaaacttgatacacgaggaaattcagcagcatttgctggagattggggtacattagtt
ggtggagtaaataaattaatagatgcttttgtagcaccaataaatataacagcagagtat
atagacagaataagtaaaggagatataccagagaagataacagacacatataatggagac
tttaatgaaataaagaacaatttaaataactgtatagatgtaatgagagggttattaact
gaaactaataatctaataaaggcaacacaagaaggcaaacttgatacacgaggaaattca
gcagcatttgttggagattggggcacgttaattgatggtgtaaataaattaatagatgct
tttgtagcaccaataaatataacagcagagtatatagacagaataagtaaaggagatata
ccagagaaaataacagacacatatcatggagactttaatgaaataaagaataatttaaat
aactgtatagataatattagagaattggtaacagagtcaattatgctatcaaaggctgct
atagaaggaaagttagatacgagagcagatgaatcaaagcacaacggggattttagaaag
atagtagaaggtgtaaatgagttaatcgaagctatggtaaaaccaatacaagaagtaaat
agtgttatgaacgaaatgtctaaaggaaatttaggagtttctgtaaagggagattacaaa
ggagaatttggagtattagcaaatactattaataatttcagagaacgtttgaaaaatatt
attggagaaatttctgaagttatagggaaaatttctgaaggcaatcttgtgattgaagat
gttagagaatttggaggagacttcaaaagtatttctgtttcattaaatacaataatagag
tctttaaattcggtgcttagtgaaataaatactgcatcagatcaagtgtttacaggatca
agtcaagtttcagatggtagtcaagcactatctcaaggagccacagagcaagcaagtgct
atagaagaattaacatcttctataacagaagtagcagcacaaactaaggaaaatgctatt
aatgcaaaccaagctaaggatctttcgcttaatgtaaaggaaaaggctgaagaaggtaat
agacatatgagtgaaatgctcaaatctatgggtgaaataaatgagtcttctgcaaatatt
tcaaaaataataaaagtaatagatgaaatagctttccaaactaatatacttgcacttaac
gcagcagtggaagcagcaagagcaggtcaacatggtaaaggatttgcagtagttgctgaa
gaagtaagaaacttagcagcaagaagtgcaaatgcagctaaagaaactacagctcttatt
gaaggttctataaagaaatctgaaaaaggtactgagattgcaaataatacagcaaaagct
ttatatgaaatagtagatggagtatcaaaagcagctacccttgtagcagaaatagcagca
tcttcgaatgaacaagctactggtatttcgcaaataaacctgggaattgagcaagtatca
caagttgttcaaacaaattcagcaactgcagaggaaagcgcagcggcgagtgaggaactt
tcaagccaatcacaaatgcttaaagagatggtttctagttttaaacttaaaaatgataat
ggtaatagttcattaaataatggcgctaaaaactataaaaacaaacaatcttatattaaa
gaaaataaagttgcttttaaagaagtagcagccacatcaagtaaacctaaaatagcatta
agtgataatgaattcggtaaatactaa
DBGET
integrated database retrieval system
