Clostridium isatidis: BEN51_08815
Help
Entry
BEN51_08815 CDS
T05663
Name
(GenBank) alpha-amylase
Organism
cia
Clostridium isatidis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
hDGE_amylase
Bac_A_amyl_C
DUF4015
Glyco_hydro_77
GHL6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASW43580
UniProt:
A0A343JDH2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1872039..1873331)
Genome browser
AA seq
430 aa
AA seq
DB search
MAVDTNKRLKHNVIYSVYVRNYGKMGTFKEVEEDLDRIKKLGVDIIWLMPIHPIGVKNKK
GSLGCPYSIKDYRKVNPEYGTLEDFKSLLNAIHEKEMKCIIDVVYNHTSHDSWLVENHPE
YFYRRKDGSFGNRAGDWSDVIDLNYENKDLWDYQIETLKYWASIGVDGFRCDVASMVPVS
FWGRAREEVAKINKDTIWLAESVHLSFLKALRKEGIEVHSDGELYQAFDILYDYDVNEEF
NNYFNGKGTLKAYIDKLSLQEGIYPNNYIKLRFLENHDQERAAKKIKDFNLLKIWTKFIY
FQKGTVLIYNGQEALEEKTPSLFDLDKINFNNINEELVYLFRSLYNIKKDKVFSEGYYEI
NILSNKEVVAASYEMNNQKLYGIFNFGKRDDVIELEIKDGEYLDLVENKKIVIQDNKLLI
GKEALIFKVK
NT seq
1293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagtagacactaataaaagattaaaacataatgtaatatattcagtttatgttaga
aattatggtaaaatgggaacattcaaagaagtagaagaagacttagatagaattaaaaaa
ttgggagtagatatcatatggctaatgccaatacatccaataggagttaaaaataaaaag
ggaagtcttggctgtccttactcaataaaagattatagaaaagttaatccagagtatggt
actttagaagattttaaaagtttattaaatgcaattcatgaaaaagaaatgaaatgcata
atagatgttgtttataatcatacttctcacgattcctggctggtagaaaatcatccagaa
tatttttatagaaggaaggatggttcttttggaaatagagctggggattggtctgacgtt
attgatttaaattatgaaaataaggacttatgggactaccaaatagaaacattaaagtat
tgggcttcaattggagttgacggctttagatgtgatgttgcttcaatggtgccagtaagt
ttttggggaagggcaagggaagaagttgcaaaaattaataaagatactatatggcttgca
gaatctgttcatttgagctttcttaaagctttgaggaaagaaggaatagaagtgcatagt
gatggtgaattatatcaagccttcgatattctttatgattatgatgtaaatgaggaattt
aataattattttaacggcaaaggaactttaaaggcttatattgataagttaagcttacag
gaaggaatatatcctaataattatataaaattaaggtttttagaaaatcatgatcaagaa
agagcagcaaaaaagataaaagattttaatttattaaaaatctggaccaaatttatttat
tttcaaaagggaacagtattaatttataatggacaagaggctttagaagaaaaaacacca
agtctttttgatttagataaaataaattttaataatattaatgaagagttggtttatttg
tttagaagtttatataatattaagaaggataaagtattttctgaaggatattatgagata
aatatattaagcaataaagaagttgtggcagcttcctatgaaatgaataatcaaaaactc
tatggaatatttaattttggaaaaagggatgatgtaatagaattagaaattaaagatggg
gagtatttagacttagtagaaaataaaaagatagtaattcaagataataagcttttaata
ggtaaagaagccttaatatttaaagtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system