Cellulosilyticum lentocellum: Clole_1150
Help
Entry
Clole_1150 CDS
T01448
Name
(GenBank) alpha amylase catalytic region
KO
K01176
alpha-amylase [EC:
3.2.1.1
]
Organism
cle
Cellulosilyticum lentocellum
Pathway
cle00500
Starch and sucrose metabolism
cle01100
Metabolic pathways
cle01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cle00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
Clole_1150
Enzymes [BR:
cle01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.1 alpha-amylase
Clole_1150
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM26
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ82879
UniProt:
F2JSP5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1322470..1325679)
Genome browser
AA seq
1069 aa
AA seq
DB search
MIHSKKAVLKFLLSILISLTMIFPNLFAASLSTSLIGNVPITSTDDDPYFTWDNATVYFT
MTDRFYNGNTSNDTSYGRAKVDATGKNIGTFHGGDVAGLTKKLKEGYFKNLGVNAIWMTA
PYEQMHGYVGGGNSGDFAHYAYHGYYALDYTMMDKNMGTVAEMREFVDEAHSQGIRVILD
IVMNHPGYLSMKDMTEYDIMPTNHSKSELLNWSPSNGQTWHSYHDLFLDYTGHNDAWAKW
WSSGWIRAGVAGYTAGDNSELRMNLAGLPDFKTEVTSNQGLAPLLKTKWSQETSGYDNWI
VPAAKSLRTDLGVAPTEYNIKWLAAWVREFGIDGFRVDTAKHVEPFRWGQLKDACNTALK
EWRVANPTKAGANWDDDFWMTGEVYNTGVEYKAEYFETGKFDSLINFFFPKDGNLNTINN
TYQDIASKVNTKDNWNVLSYISSHDEGLTRANMTNLGTALLLSPGGVQIFYGDETNRPGS
ETCSDKDQPSRSDMNWSSVNQSTLNHWQIIGTFRKNHPSIGAGTHTVISSSPYVFSRTYN
KEGISDKVVVALNATGSTTINVSSIFKDGTPVKDAYTGAKATVANGSVTFTAGSAGVILI
EQNGEEPLTPVVTLTPGNVADTTKYYTDTLDVKVALQNVTEATCMINGNEAYTVKNGDII
TIGKGEALETTTKITVSAINTLGTYSQTYSYLKTERKPVTVHFYKPADWSTPSLYYYNDV
LSLTGPKWPGVTMNSEGDNWYSYTLPAEYETAQVIFNTNNGTTQIPDKEKPGFVVEGEMW
YKEGVWTSTNPDGKPSVTLTPGNSSTTTTYTSSTLSIKVILKNVISATCQIDNGEAFSVA
SGESFEIGKDVATGTITSIKVKAENEQGLFNGTFTYKKETVLPPTDITVHFYKPSSWGIP
NLYYYETESKTGPKWPGEAMINEGDGWYSYTIKDWTTAYVLFNSNGQQIPDANEPGIEVS
KEIWYKDGMLYTSKPEEKVITVHFYNPSGWGIPNLYYYETESKTGPKWPGEAMTAEGNNW
YTYTIPSEIAVKVLFNSNNQQIPTANQPGFEANGEMWYKDGTWTSSKPN
NT seq
3210 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcattccaaaaaagcagttcttaagtttttactttctattcttatctcacttact
atgatttttcctaacttatttgcagccagcttatctacttcattgattggtaacgttccc
attacttctactgatgatgatccctattttacttgggataatgctactgtttattttacc
atgacagaccgtttctataatggtaatacctctaatgatactagctatgggcgtgccaaa
gtagatgctactggtaaaaatatcggtacttttcatggtggagatgttgcaggacttact
aagaaactaaaagaaggctacttcaaaaatctaggtgttaatgctatttggatgactgca
ccttatgagcaaatgcatggctacgtcggtggtggtaacagtggtgactttgcacactat
gcttatcatgggtactatgcacttgactataccatgatggataaaaatatgggaacagtt
gctgaaatgagagaattcgttgatgaagcgcactcacaaggtattcgtgttatcttagac
attgttatgaatcaccctggttatctaagcatgaaagatatgacagagtatgatattatg
ccaaccaatcatagtaaatctgagctacttaattggtcacctagtaatgggcaaacttgg
catagctatcatgacctattccttgattacactggacacaatgacgcctgggcaaaatgg
tggagttctggttggattcgtgctggtgtagctggctatactgctggagataattcagag
cttcgtatgaacctggcaggtttaccagactttaaaacagaagtaactagcaatcaaggt
ttagcacctcttttaaaaacaaaatggtcacaagaaacttctggttatgataactggatt
gttcctgctgctaaaagcttaagaactgatttaggcgttgctcctactgagtataatatt
aaatggttagctgcttgggtgcgtgaatttggtattgatggattcagagttgatacagca
aaacacgtagaaccattccgctggggacaattaaaggatgcttgtaatacagcacttaaa
gagtggcgtgttgctaatccaactaaagctggtgctaattgggatgatgatttctggatg
actggtgaagtatataatactggtgtagaatataaagctgaatacttcgaaaccggtaaa
tttgattcacttattaacttcttcttccctaaagatggcaatctaaatactattaataat
acttatcaagatattgcaagtaaagttaatacaaaggataattggaatgtccttagttat
atttcatctcatgacgaaggcttaactagggctaatatgactaatttaggtacagcttta
cttttatctcctggaggtgttcaaatcttttatggtgatgaaaccaatagacctggcagc
gaaacgtgctctgataaggatcaaccaagtcgttctgacatgaactggtcaagtgtgaat
caatcaacacttaatcactggcaaatcattggtacctttagaaagaaccacccttctata
ggcgctggtactcatactgttattagttcttctccttatgtatttagtcgcacctataat
aaagaaggtatctctgataaagtcgttgtagcattaaatgcaacaggtagtacaacaatt
aatgtatcttctatctttaaagatggtacaccagtaaaagatgcttataccggcgcaaaa
gcaactgtagctaatggctctgttacctttactgctggctcagcaggtgttatcttgatt
gaacaaaatggtgaagaaccacttacaccagttgttacattaactcctggaaacgttgcc
gatacaactaaatattatacggatactttagatgtaaaggtagctttacaaaatgtcact
gaagctacttgcatgattaatggtaatgaagcttatactgttaagaatggggatatcatt
actattggtaagggggaagccctagagacaacaactaaaattactgtttcagctattaat
acactaggtacttactcacaaacttattcttatttaaaaactgaacgtaaaccagtcacg
gttcatttttataagcctgctgattggtctaccccatccctctactattataatgatgta
ctttcattaactggacctaaatggcctggtgttactatgaatagcgaaggagataactgg
tatagttatacacttccagccgaatacgaaacagctcaggttatatttaatacgaataat
ggtactacacaaattccagataaagaaaaacctggttttgtcgtagaaggcgaaatgtgg
tataaagagggtgtctggacctcaactaatccggatggcaagccttctgttacgttaacg
cctggaaacagtagtacaactacaacttatacaagtagtacactttccattaaagtaata
cttaaaaatgtaataagtgctacctgccaaatcgataatggtgaagctttttcagtagct
tctggtgaaagcttcgaaataggtaaagatgtagctactggtacaataacttctattaaa
gtaaaagcagaaaatgagcaaggtttatttaatggaacatttacgtataaaaaagaaacg
gtgctcccaccaacagacattactgttcatttctataaaccttctagctggggtatacca
aatctttactattatgaaacagaaagcaaaactggacctaaatggcctggtgaagctatg
atcaatgaaggagatggttggtacagctatacaatcaaagactggacgactgcttacgtt
ttatttaatagcaacggtcaacaaatccccgatgctaatgagcctggtatagaagtttca
aaagaaatttggtacaaagatggtatgctttatacttcaaaacctgaagaaaaggttata
actgttcatttctataatccttctggttggggcataccaaacctttattactatgaaaca
gaaagcaaaactggtcctaaatggcctggtgaggctatgactgctgaagggaataattgg
tacacctatactataccaagtgaaattgccgtgaaagtactgtttaacagtaataatcaa
caaattcctactgctaatcaacctggtttcgaggcaaatggtgaaatgtggtataaagac
ggcacttggacttctagtaagcctaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
