Caldivirga maquilingensis: Cmaq_0080
Help
Entry
Cmaq_0080 CDS
T00611
Name
(GenBank) Glycoside hydrolase family 42 domain protein
KO
K12308
beta-galactosidase [EC:
3.2.1.23
]
Organism
cma
Caldivirga maquilingensis
Pathway
cma00052
Galactose metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cma00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
Cmaq_0080
Enzymes [BR:
cma01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.23 beta-galactosidase
Cmaq_0080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_42
Glyco_hydro_42M
Glyco_hydro_14
Glyco_hydro_35
Cellulase
LBP_M
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW00934
UniProt:
A8M9Q3
LinkDB
All DBs
Position
93529..95676
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MSFPVSVWYGVGSVTPLFDEETIKRDLKNIKEAGFKYVRGWVNWRDSEPRPGEYDFSGVE
NLLKTANDIGLRVILQVYLEFAPDWLPKLHPDSLYVSESGSVIMPQGSPGVCLDHPGVRA
RAEEFMRKLAQVVIKYPNFYVWDLWSEPNVIQWIYQPTGWRGLFCYCNYSKGRFRDWLKT
IYGNVNTLNKAWHRSYLEFNDVEPPRFVSLHFARDNIDWLTFNIVKLKEDLEWRVKVIRS
IDNNHPVVSHSHGGTSVFSNPLFGEPDDWEMASVVDAWGTSFYPKHAGRVKVDHVLDSLV
LDAARSAALASGKPYWIGELQAGQGVGGLKAVEPVTPDDVALWMWQAIAHEAKAINIYHW
YPMMLGFESGGYGLINPDGSLTDRARKAGETARVIYENSDLFLKAKLIDSSVAILYNIES
YKWLWIAQRHSSDVLSRSILGVYRVLFNSNYNVDLVSIRQVEGNLISKYKVLIAPLSLVM
TLKAALGLRNFVSNGGLLLVDSRFAAIRSDGYIDSGTPAYGLSEVIGGYEDGYMSVDKVN
LRITSNLIPGLKTGDLIIGSNYVSWLNSKANEVGVSEFNLSKPSITINDYGKGKAIYVGT
SIGLSYEANGPGSGVGKLIEGIMNIAMVQPPVEVKSTREGYIEVRIMRSGADYLLFIINH
SYGDQLVNVRINENVINVGNASIKDLVTGASISITNNELQLTLRGRQVVVGLVSI
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgtttccggtttccgtatggtatggtgtaggtagcgttaccccactgtttgatgag
gaaaccattaagagggatttaaagaacattaaggaggctgggtttaagtatgttaggggt
tgggttaactggagggattctgaaccaagacccggggagtatgatttcagtggagtcgag
aatctgcttaagaccgctaacgacattggcttaagggttattcttcaggtttaccttgaa
ttcgcccccgattggttacctaagcttcacccagactcactatacgtctctgagtcaggc
agcgttatcatgcctcaaggtagccctggggtttgccttgaccaccctggtgttagggct
agggctgaggaattcatgaggaagctggctcaagtagtgattaagtaccctaacttctat
gtctgggacttatggagtgaacccaatgttattcagtggatttaccaacccactggttgg
cgtggattattctgctactgcaattactctaagggtaggttcagggattggttaaagact
atatacggcaacgttaacacgttgaataaggcctggcataggagttacctggagtttaat
gatgttgaaccaccgcgtttcgtctcccttcacttcgctagggataacattgattggtta
acattcaatatagttaagcttaaggaggaccttgaatggagggttaaggtaattaggagt
attgataataatcacccagtggttagtcatagtcatggcggtacctcagtgttcagtaat
ccactcttcggtgaacctgatgattgggaaatggccagtgtggttgatgcatggggtaca
tcattttaccccaagcacgcaggtagggttaaggttgaccatgttcttgactcactagta
cttgatgcagctaggtcagcggcattagccagtggtaaaccatactggataggggagctt
caagctggtcaaggtgttggtgggcttaaggcggttgaaccagtgacacctgatgatgtg
gctctttggatgtggcaggcgattgcacatgaggctaaggcaattaacatatatcactgg
taccctatgatgcttggttttgagtcaggtgggtatgggttaattaaccctgatggttca
ttaaccgatagggctaggaaggctggggaaacagccagggtgatttacgagaatagtgac
ctattcctaaaggctaagttaattgactcaagtgtggctatactttataatattgagtcg
tataagtggctttggattgctcaaaggcatagtagtgatgtattatcaaggtcaatactg
ggtgtttatagggttctcttcaatagtaattataatgtggatttagtatccattagacag
gttgaaggaaacttaattagtaagtacaaggtgcttatagccccattatcactggtaatg
acccttaaggctgccctaggtttaaggaactttgtaagtaatggtggattactactggtt
gattcaaggttcgcagcgattaggagtgacggttacattgactcaggtacaccggcgtat
gggttaagtgaggttattgggggttatgaggacggctacatgagtgtggataaggtgaac
ttaagaatcactagtaatctaatacctggtttaaagaccggtgacttaataattggttct
aattacgttagctggcttaattcaaaggctaatgaagtaggggttagtgaatttaactta
agtaaaccttcaataaccattaatgattatggtaaagggaaggcaatctacgtgggtaca
agcattggtttatcctatgaggctaatggaccagggagtggtgttggaaaattaatagaa
ggcatcatgaatattgccatggttcaaccacctgttgaagttaagtcaaccagggagggt
tacattgaggtaagaataatgaggagtggtgctgattatttactcttcataataaatcac
tcctacggtgatcaactagttaatgtgagaattaatgagaatgtaattaatgtgggcaat
gcatcaattaaggaccttgtaactggtgcatcaataagtattactaataatgagcttcag
ttaaccctaaggggtaggcaagttgtagtagggcttgtgtctatttaa
DBGET
integrated database retrieval system