Cyclobacterium marinum: Cycma_3646
Help
Entry
Cycma_3646 CDS
T01592
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
cmr
Cyclobacterium marinum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cmr02000
]
Cycma_3646
Transporters [BR:
cmr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Cycma_3646
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEL27361
UniProt:
G0J1G6
LinkDB
All DBs
Position
4318727..4321903
Genome browser
AA seq
1058 aa
AA seq
DB search
MNKPIRYLCGKVSKTLCFGSLLQCLLLPTLHAKEGKSIAETSPYKASFSYLNPAIEDFKN
VSGTVTDNEGEPVPGATVVIEGSTTGTVTDIDGQFSLDVPEGAVLLISFIGYETQRINPG
NQTNLSITLVEDATSLDEVVVVGYGVQEKVNLTGAISTVDFDDELTNRPLTNASQALGGT
ASGVWVSQNSGKPGSDGAQIRVRGWGTLNNSNPLIIIDGVEGSFNQLNPNDIENISVLKD
AASAAIYGSKAANGVVLVTTRMGKKNEAMQININSYFGVQSLGRRYDVINNSAEHMELTN
TALMNEGSTPLFSDELIAAFRNGTDPYKYPNTNWFKEIFNSASIQEHNVSIRGGSEQSSS
FLSFNYLNQDGMVPNTNSERYGLRANITSNVKDWLTVSGRFNYIHKDSNEPYADVTYGSL
GRVFEMLGGSAPYIAPYTRDGRFGSVQAISEDGNLLFDNRNALIDAANGLTNTEQNILTL
NLSADVKLTDYLSFKTTVSSNGNWNLVDRYNTSVFGYTDTGIETTTRNYNREGLEINRSQ
VSSLQNNLFSTFNFKKDYNEIHSVSAIGGIQVETFKVKNMFSRRSEPPKEGLTQVDAGTS
GIQGEGNMNGFRIFSYFGRANYTLMSKYLFEANVRADASSRFSKANRWGVFPGFSAGWRL
SEENFIKDVSAISNLKLRASWGQLGNQNISGYWPYLTVIGQNNNLSYSYNGSFSPGAAVT
ALVDENITWETSSSLDIGLEVGVLDDRITLEADYFRKTTKDILVQLPIPSVMGGISSPFE
NVGQMENNGIEFILNYNNLKFDRDQLGFNMGLNLTYIQNEVTKFRGGDSPDQLYLLREGY
SFRTLYGYNAIGIYQSDDEALEHMHANPFTPKAGNLKYEDLNNDGRLNYEDKMALGNTLP
KYTFGISPSFKYKGFDLNLLFQGILGVNMYTQNNFTDLDWENRMISTRWRDAWSPDNPDA
ENPSLKFNNPWDSNQSSYWVNEVNFIKLKNVQLGYSFPTTMAEKLGVQKIYLYVNGQNVF
SIASDGYEGYDPERNTFDAGYQVYPTPRIFSAGINLNF
NT seq
3177 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaacctatacgctacctttgtggtaaggtgtctaaaaccttgtgttttggaagt
ttattgcaatgtttattattaccaacccttcatgctaaagaaggaaaaagcattgcagaa
acaagcccatacaaagcctccttttcctacctgaacccagcaatagaagattttaaaaat
gtttcaggaacagttactgacaatgaaggtgaacctgttcccggagcaacggtggttatt
gaagggtccactaccggtactgttactgatattgatgggcagtttagcctggatgtacct
gaaggtgcagtcctattaatttcttttattggatacgaaacacaaagaatcaatcccggc
aatcaaaccaaccttagtattactttggtagaagatgctacttccttggatgaagtggtt
gtggtgggatatggggttcaagagaaagtaaatcttacaggagccatttccaccgttgat
tttgacgatgaattaaccaatcgcccattgaccaatgcctcccaagccttaggaggaact
gcatcaggtgtctgggtaagccaaaactcaggtaaaccaggaagtgatggggcccaaatt
agggtcagaggatgggggacactcaataattccaaccctctgataataattgatggtgtt
gaagggtctttcaatcaactgaatcccaatgatattgaaaatatttctgtgttaaaagat
gctgcaagtgctgccatttatggttcaaaagctgccaatggagtagttttggttaccacc
cgaatgggtaaaaagaatgaggccatgcagattaatatcaactcttattttggtgtacaa
tccttaggtagaaggtatgatgtgatcaataacagtgcagaacacatggaattaaccaat
acagctttaatgaatgagggatcgactccacttttttcagatgaactgattgctgcattt
agaaatggaaccgacccttacaaatatcccaatacaaattggtttaaggagatatttaat
tcagccagtatccaggagcacaatgtttcgatccgtggaggttcagagcaatcttcctcc
ttcctttctttcaattacctcaatcaggatgggatggtgcccaatacaaattctgagcgc
tatgggctgagggccaatattacttccaatgttaaagattggttgactgtaagtggtcgc
ttcaattatattcacaaagattccaatgaaccctatgctgacgttacctatggttcccta
ggaagggtattcgaaatgcttggtggttctgctccctatattgctccctatacccgagat
ggaagatttggctccgttcaggccattagtgaagatggtaatttgctttttgacaataga
aatgctttgattgatgctgccaatggtttaaccaatacagagcagaacattttgacgcta
aacctaagtgcagatgtcaaattaaccgattatctttcttttaaaaccacagtttcttcc
aatggtaactggaatttggttgatcgatacaataccagcgtttttggttatacggataca
ggaattgaaacaaccacgaggaactataaccgcgaaggtttagaaatcaatcgatcacaa
gtttcaagtcttcaaaataatttattctccacctttaacttcaaaaaagattacaatgaa
atccatagtgtctcggcgatagggggcatacaagtggagactttcaaggtaaagaatatg
ttttctaggcgttcagaaccgccaaaagaaggattaacccaagtggatgcaggtacttcc
gggattcaaggggaagggaatatgaatggcttccgtattttctcgtatttcggaagggcg
aattataccctgatgagcaagtatttatttgaagcgaacgtgagggcggatgcatcctcc
agatttagtaaagccaaccgatggggagtttttcccggcttttctgcaggctggagattg
tctgaggaaaatttcattaaagatgtttctgcaatatctaaccttaaattgagggcttca
tgggggcaattaggaaatcagaatatttcaggatattggccttacctgacagtaattggc
caaaataacaatctaagttatagttacaatgggagtttttctccgggggctgctgtaacg
gcattagtagatgagaacataacttgggaaacctcttcttctttagatattggattagaa
gtaggtgttctggatgataggattactttggaagcggattactttaggaaaacgaccaaa
gacattctagtgcagcttcctatcccgtcggtgatgggagggatttcttcaccttttgag
aatgtaggtcaaatggaaaacaatggcattgagtttatcctcaattacaataacttaaaa
tttgatagggaccaattgggattcaatatggggcttaacttgacttatatccaaaatgaa
gtgaccaaattcaggggaggagactcacctgatcaattgtacctacttagagaaggctat
tcttttagaaccctatatggatacaatgctattggtatttatcagtcagatgatgaagct
ttggaacatatgcatgccaatccatttacccccaaagccgggaatttaaaatatgaggac
ctaaacaacgatgggagattgaattatgaagataagatggcgctgggaaatactttacct
aagtatactttcggcatctctccaagctttaaatacaaaggatttgatttgaacttattg
tttcaagggattttaggagttaacatgtacacccaaaataatttcaccgacctagattgg
gaaaacagaatgatttctactcgttggagagatgcttggtctcctgacaatccggatgct
gaaaatccaagtttaaaatttaataatccttgggatagcaaccaatcatcttattgggtg
aatgaggttaattttatcaaattgaaaaatgttcaattaggctattcatttccaaccact
atggctgaaaaattgggggtacaaaaaatttacctctatgtaaatggacaaaatgttttt
tctatcgccagcgatgggtatgaagggtatgatcccgaaagaaatacttttgatgcggga
tatcaggtgtatccgacccctcgaattttttcagctggtatcaatttaaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
