Clostridium pasteurianum BC1: Clopa_2897
Help
Entry
Clopa_2897 CDS
T02645
Name
(GenBank) stage V sporulation protein D
KO
K08384
stage V sporulation protein D (sporulation-specific penicillin-binding protein)
Organism
cpas
Clostridium pasteurianum BC1
Pathway
cpas00550
Peptidoglycan biosynthesis
cpas01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpas00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
Clopa_2897
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
cpas01011
]
Clopa_2897
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
cpas01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
DD-Transpeptidase (Class B PBP)
Clopa_2897
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transpeptidase
PASTA
PBP_dimer
Beta-lactamase2
Cortexin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGK97735
UniProt:
R4KDN7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2867979..2870171)
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MGKKMYRDNVIIKNRLFFVLLIFILIFSLLICRLFKVNVILSPKYKKMAIDQWTSEVKIS
AKRGRILDRNGQELAVSGNVYRIDLDLSTIRTDLNSTKKMDMNTLAQKLAEDTGMKPEDV
SKLLNYKLPNGSPAGSATLIRRVEKSVADKVSQLKVNGIIVSPDTKRYYVNNNFLAQVLG
HTNSDGKGLTGVELEYDNYLSGTPGKRIAEIGRNSSNLPYTISDYTKPVNGKDVVLTIDE
NIQEFAEKNAEQALSDNKAKAVSIVVANPKNGEILAMVNKPDYNPNDPWQKGKSFNELQS
EWRNRAVNDAYEPGSIFKVITATAAMEEKVVKATDQFNCTGSITIAKKIIHCWKRTGHGQ
ESFVDIIKNSCNVGFAALGQRLGAANLNKWINDFGFGQKTGIDLPGEAKGIIKPTNKISP
VDVATIAFGQANTVSMVQYLSAFDAVANNGVWVKPHVMKKIVHYDSNNKEIVDKNYDDYG
TKKIMDENVAKELRGYLEQVISDGGGKKAFIDGYHIAGKTGTAQKPNPNGGGYESGKYVA
SFAGMAPANDPQVTVMISIDEPDPSNYYAGQIATPVAKQMFSDIFNYLNIKADAPSGDVE
KSMLNDVVVPNVRGMKLADAQKLLKDNNLAFDADQNGGYVTNITPLPGATVKEGTKVILY
TGGSANYNSNDVEVPDLDGLSKQKASQMLEALGLKANFDGDGMVSDQDIVEGTKVQRGTT
VNLDLENIGD
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgggtaaaaaaatgtacagagataatgtaataataaagaataggttgttttttgtatta
cttatttttattttaatattttctttacttatttgcagattatttaaagttaatgttatt
ttgtcgccaaaatacaagaaaatggctattgatcagtggacaagcgaagtaaaaatatct
gctaaaagaggaagaatacttgatagaaatggacaagaactagcggttagtggaaatgtt
tatagaattgatttggatttaagtactataagaactgatttaaatagcactaagaaaatg
gacatgaataccttagctcaaaaattggcagaggacacagggatgaagccagaagatgta
agcaaattgttgaattataaacttcccaatggaagtccggcaggctctgcaactctaatt
agaagggttgaaaagagtgtggcggataaggtatctcaattaaaggtcaatggtattata
gtttctccagatacaaaaagatattatgtaaataataattttctggctcaggtgctggga
cacactaattctgatggtaaaggattaactggagttgagcttgaatatgacaactattta
tctggaactccaggaaaaagaattgctgaaataggtagaaatagttcaaatttaccctat
accatttcagattatacaaagcctgttaatggtaaagatgtagtacttactattgatgaa
aatattcaagaatttgcagagaagaacgcagaacaggcacttagtgataataaagcaaaa
gcggtttccattgtggttgctaatcccaaaaatggagaaattttagcaatggtaaacaag
ccagactataatccaaacgatccatggcaaaagggtaaaagttttaatgagcttcaaagt
gagtggaggaacagagcagttaatgatgcttatgaaccaggatcaatttttaaagttata
actgcaactgcagctatggaagaaaaggtagtgaaagcaacagatcagtttaattgtact
ggaagtattaccattgcaaaaaaaataatacattgctggaagcgcacaggtcatgggcag
gagagcttcgtggatataataaaaaattcctgcaacgtaggttttgccgcattagggcaa
agacttggtgctgctaaccttaataaatggataaatgactttggatttggacagaagacg
ggtattgatttaccaggagaagcaaagggcataattaagcctacaaataaaataagccct
gtagatgtagctactattgcttttggccaggctaatacagtttccatggttcaatattta
agtgcctttgatgctgtagccaataatggagtatgggtaaaaccacatgtaatgaaaaaa
atagttcattatgattcaaataataaagaaattgtcgataaaaattacgatgattatggt
actaaaaagataatggatgaaaatgtggcaaaagagcttagaggatatcttgaacaagta
atatctgatggtggtggaaaaaaagcttttatagacggatatcatatagcaggaaaaact
ggaacagcacaaaaacctaatccaaatggtggtggctatgagtcagggaaatatgtggcg
tcctttgcgggaatggcaccagcaaatgatccacaggttactgttatgatatctattgat
gagccagatccttcaaattattatgcgggacaaatagctactccagttgcaaaacagatg
tttagtgatatatttaattatctcaatataaaggcagatgcacctagtggcgatgttgaa
aagagtatgttaaatgatgtagtagtaccaaatgtaagaggtatgaaattggcggatgca
cagaaattgttaaaggataataatttggcttttgacgccgatcaaaatggtggctatgta
accaatattacacctctgccaggtgcaacggttaaagagggtacgaaagtaatactttac
actggaggtagtgcaaactataatagtaatgatgtagaagtaccagatttggatggtcta
agcaaacaaaaggcttcacagatgcttgaagctctaggacttaaggcaaattttgatggg
gatggtatggtatctgaccaggatatagtagaaggaactaaggttcaaaggggaactaca
gtaaatttggatttagaaaacataggagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
