Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013: CLPA_c19870
Help
Entry
CLPA_c19870 CDS
T03753
Symbol
spaT
Name
(GenBank) subtilin transport ATP-binding protein SpaT
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
cpat
Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpat00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cpat02000
]
CLPA_c19870 (spaT)
Transporters [BR:
cpat02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
CLPA_c19870 (spaT)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
AAA_21
AAA_22
ABC_membrane
AAA_18
SMC_N
AAA_23
AAA_29
SRP54
AAA_14
Rad17
AAA
nSTAND3
AAA_28
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA52045
UniProt:
A0A0H3J4V7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2127521..2129365)
Genome browser
AA seq
614 aa
AA seq
DB search
MVKIKTSINETKKITIFILKTIKLLWDSSKTSFIITLIVTIINGVISPLNLVISKYLIDS
VVAALAHSNNHKYYNLVFLWLGIELTVAVFSQLIQRVNAYYSTIQVKILNNYISKLIVKK
SNELDLSFFENNDFYNKIEKANNQSAYSAMAISNALMEVIKSFTTLVGSIAIVIQLSSVM
LILCVLTSIPMFVLNIKISEFQYNIYSKRIEKTRFAQNLQKLMFHYNSVKEIKLSRLGKY
FENLILLVYKNNLDKDKSVEKKRFGRLSIADCLSLVIAYCYKIYIIFTTITNGLTIGSMN
MYMTAVTNVDNSVKITLNNMAQLYSYNLYIENLFYVLDLKPIIVDKEEVKMLKNVIMDCI
EFRNVSFKYSGANKYTLKNVSFKIKANENCAIVGLNGCGKTTVIKLLARLYEPTEGEIFI
DGININEFRLESLYKCISVVFQDFMKYPFTVKENIGFGDIENLDDMDRIELSAKKANAYE
FIQSLENKFDTRLEKLWSNGVELSLGQWQKLAISRAFMSDSSILILDEPTASVDAETEYE
LFKNFKELVGNRTSILISHRFSTVRMADLIIVLNEGTVVEKGTHKSLLLKEGLYSKLYNM
QAEGYLDNSVDVAN
NT seq
1845 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaagattaaaacctccattaatgaaacaaaaaagataactatttttatattaaaa
acaataaaattattatgggatagttcaaaaacaagtttcataattacactgatagttaca
attattaatggtgtaattagtcccttaaacttagtaatttctaagtatttgattgacagt
gttgtagctgccttggctcattcaaataatcataaatattataatttggtatttttgtgg
ttaggtatagaattgacagttgctgttttttcccaattaattcagcgagtaaatgcatat
tattccacaattcaagtgaagattttaaataattatatatctaagcttatagtgaaaaaa
tcaaatgaattagatctttcattttttgaaaataacgatttttacaataaaattgaaaaa
gcaaacaatcaatcagcttattctgcaatggcaattagcaatgcattaatggaagtaata
aaaagctttactacattggtggggtctatagcaatcgtaattcagctaagttcagttatg
cttattttatgcgtgctgacatctattcctatgtttgttttaaatataaaaatatcagaa
tttcaatataatatttatagtaagagaatagaaaaaactagatttgcacagaatcttcag
aagctaatgtttcattataatagtgttaaggaaattaaactaagtagattaggcaagtat
tttgaaaacttaatattattagtatataagaataatcttgataaagataaatccgtggaa
aagaagaggtttggacgtttgagtattgccgattgtttaagtttggttattgcatattgc
tataaaatttatataatttttactactattactaatgggttaactataggatcgatgaat
atgtatatgacagcagtaaccaatgtagataactccgttaaaatcactttgaataacatg
gcacaattatattcgtacaatctttatatagaaaatttattttatgtattagatttgaaa
ccaataattgtagataaagaagaagtaaaaatgcttaagaatgtcataatggattgtatt
gaatttagaaatgtatcctttaagtattcaggagcaaataaatatacattaaaaaatgtt
agttttaaaataaaagcaaatgaaaattgtgccattgttggactaaatggatgcggaaaa
acaacagttattaaacttttggcaaggttatatgaaccaacagaaggtgaaatttttatt
gatggaataaatattaatgaatttagattagagtcgctatataaatgtataagcgtggta
tttcaagattttatgaagtacccatttacagtgaaggaaaatataggctttggtgatata
gaaaaccttgatgatatggataggatagagctttcagctaaaaaggcaaatgcctacgag
ttcattcaatcattagaaaataaatttgatacaagattagaaaaattatggtcaaatgga
gttgaattatccttaggacagtggcaaaagctggctattagcagagcatttatgagtgat
tcatcaatcttaattttagatgaaccaacagcttctgttgatgctgaaacagaatatgaa
ttgtttaaaaatttcaaagaattagtaggtaatcgaactagtatattaatatctcataga
ttttctacagtgaggatggctgatttaataatagtattgaatgaaggtacagttgttgaa
aaagggacacataaaagtttattgctaaaagaaggtctctactcaaagttatacaatatg
caagcagaaggatatttagataattctgtagatgtggctaattga
DBGET
integrated database retrieval system
