Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow): 111806871
Help
Entry
111806871 CDS
T05351
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cpep
Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow)
Pathway
cpep03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpep00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111806871
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cpep03019
]
111806871
Messenger RNA biogenesis [BR:
cpep03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
111806871
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111806871
NCBI-ProteinID:
XP_023548146
LinkDB
All DBs
Position
LG12:781016..784478
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKDYFSNYGEVMHTVVMRDKITSRPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLQDKHTIDGKTVEAKRALSREEQQTPARASNSNATRNSGGGGGGGGGGGGGNMRTKK
IFVGGLPPTLTEEGFKEYFEAYGHVTDVVVMYDQNTRRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKT
FHDLNGKQVEVKRALPKDANPGAGGRSMGGGGYQGYGSSGGVNSNSYDSRMDSSRYMQSQ
GSGGGFPPYGSSGYSNPGYGYGSSNNGMGYGGYGNYSGSNTGYGAPAAVAYGNPNAANAG
YGSGPQGGPRSSWSTQAPSGYGAMGYGNAAPWGGAPGGNAGAGSGGPGSAPTGHSPGGAA
GYGNQGYGYGGLGNQGYGYGGGDGSYGSQSGYGTGGGRSGSASNSNVGGGPSGGEIQGNS
GGYMGNGYGDANGNNSGYGNAAWRSDGGQVGYTGGYAGGQARQAQQQ
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagcttttcattggtggaatttcatgggaaacctccgaggat
aagcttaaggactacttcagcaactatggtgaagtgatgcatacggtggtgatgagggat
aagatcactagcagacctagagggtttgggttcgtcgttttctcagatccctctgttctc
gatcgagttcttcaggataagcacaccatcgatggtaaaacggttgaggccaagagggcc
ttatcacgggaagaacagcagacccctgctagagcaagcaattctaatgctactaggaat
tctggtggtggtggtggtggtggtggtggtggtggtggaggaaacatgagaactaaaaag
atttttgttgggggattgcctccaacattaactgaagaaggatttaaggagtactttgag
gcgtatggccatgtaaccgatgttgtagtcatgtatgatcaaaatactaggcgtccacgg
ggatttggatttatatcgtttgatactgaagaagctgttgacagggttttgcataagaca
tttcatgatttgaatggtaaacaagtagaagttaagcgtgcccttcctaaagatgctaat
ccaggtgcgggtggtcgttcgatgggtggcggtggttatcaaggttatgggtcttctggt
ggtgttaattcgaattcttatgatagtcgtatggattcgagtaggtatatgcaatctcag
ggctctggtggagggttcccaccttatggttcctctggatatagtaatcctgggtatggg
tatggttcatcgaacaatggcatgggatatggtggttatggaaattacagcggttcgaat
actgggtatggcgcccctgcagctgtagcctacggtaacccgaatgctgctaatgctggt
tatgggagtggtcctcaaggtggacctagaagttcatggtccactcaagctccctctggg
tatggagccatgggatatggtaatgctgctccttggggtggtgctcctggaggcaatgct
ggagctggcagtggaggacctggatctgcacccactggtcattctcctggtggagctgct
gggtatggaaaccagggttatggatatggtgggcttgggaatcaaggttatggttacggt
ggaggcgatggctcgtatgggagtcaatctggttatggtacaggcggaggacggtctggt
agtgcctcaaatagcaacgtcgggggtggtccaagtgggggagagatacaagggaacagt
ggtggttacatgggaaatggctatggggatgctaatggaaacaactctggttatggaaac
gctgcatggagatctgatggaggacaagtaggttatacgggtggttatgctggtggacaa
gctcggcaagcccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
