Clostridium perfringens SM101: CPR_1716
Help
Entry
CPR_1716 CDS
T00379
Symbol
priA
Name
(GenBank) primosomal protein N'
KO
K04066
primosomal protein N' (replication factor Y) (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
cpr
Clostridium perfringens SM101
Pathway
cpr03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
CPR_1716 (priA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cpr03400
]
CPR_1716 (priA)
Enzymes [BR:
cpr01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CPR_1716 (priA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cpr03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
CPR_1716 (priA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PriA_3primeBD
DEAD
ResIII
PriA_C
Helicase_C
PriA_CRR
AAA_30
zinc-ribbons_6
AAA_11
AAA_19
YjdM_Zn_Ribbon
T2SSE
PIF1
FkbH_N
zf-CHY
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG87853
UniProt:
Q0SS76
LinkDB
All DBs
Position
complement(1910977..1913172)
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MEKFAEVIVNSEAVTIDKPFTYKIKEDLVHNIKVGHRVLIPFGNGNKKIEGFVLKILDNV
ENKSIRYKSIYNVCDNEPLLSEDSLKLVKFLREKYLCKYIDAIRVMIPPKIMSGNKEKTK
QVIVFKKYIEELSEPQKRALELIEEKSGGFTKAEWNKIFNISTYMINKLIELGCVSSKEV
RVGRENLREFKPYPPKSLNEEQIRAYDTILESDKNIFLLKGVTGSGKTEVYMNLVSYMLL
VEKSSLILVPEIALTPQMIERFKGRFGKDVAVFHSRLSDGERYDEWYRVKNDQVKVVIGA
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FYKALKGNYELIELKKRVNNLELPNVSIVDMREELKSNNKTMFSRDLYLKIKDRLEKKEQ
IILFLNRRGFSSFVSCRSCGFVFKCNNCDISMTYHNNGYLVCHYCGNTEKMPKLCPKCGS
NYVKHFGVGTEKLEEAVHHHFKEAKVLRMDVDTTRKKNSHEEIYNSFKSKEADILIGTQM
IAKGLDFPDVTLVGVMAADMSLNLPDYKSSEKTFQLITQVSGRAGRGDKKGDVIIQSYSP
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NILKEYDNIFIYEACPCSISKIKNVYRWQILIKGKLDLEVCSKIKKGVYELSKDVYNEIK
IGLDINPNSLM
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
