Chlamydia psittaci NJ1: B712_0673
Help
Entry
B712_0673 CDS
T02252
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter barrel domain protein
Organism
cpsn
Chlamydia psittaci NJ1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
ChlamPMP_M
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS28183
LinkDB
All DBs
Position
702769..705312
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MKHPVYWFLISSSLLASNSLGFAQAQEETLTSANSYNGNTNSKPFEPLSTSNEGGTTYKC
TGNICISYAGLGGEGLTNSCFTDTAGNLAFVGNGYTLCFDNIITTASNPGAINVQGEGKT
LGVSGFSLFSCAYCPPGTTGYGAIKAAGNTTIKDNSSLVFHKNCSQTEGGVIYCKGSSTT
ELKMENNQNLVFSENSSNKKGGAIFTQKLTITSGGPTLFSNNSVSASAPQGGAICLDDTG
SECSLTADLGDITFDGNKIIKTGDNSVTRNSIDLGSSGKFTNLRAKDGFGIFFYDPIANQ
GDTDTEIELNKAEERGSTTYTGKIVFSGERLSDEEKEVPANLQSYFKQPLKIGSGSLVLK
DGVTLEAKSFTQTAGSNVVMDLGTTLQTPSSGGETITLTNLDINIASLGGGGVTPDPAKV
ASQTSNKTVTISAVNLVDSDGNAYEYPILATSKPFTAIVATTNTSTVTAPETNPTNYVPP
THYGYQGNWTVTWDAETATKTATLTWEQTGYSPNPERQGPLVPNTLWGSFSDLRAIQNLM
DISVNGADYHRGFWVSGLANFLHKSGSDTKRKFRHNSAGYALGVYAKTPSDDIFSAAFCQ
LFGKDKDYLVSKNNANIYAGSLYYQHISYWSAWQNLLQNTIGMEAPLVLNAQLTYCHASN
DMKTNMTTTYAPLKTTYSEIKGDWGNDCFGIELGATVPIQTESSLLFDMYSPFLKLQLVH
AHQDDFKENNSDQGRYFESSNLTNLSLPIGIKFERFANNDTASYHVTAAYAPDIIRSNPD
CTASLLVSPDSAVWVTKANNLARNAFILQAGNYLALSHNIELFSQFGFELRGSSRTYNVD
LGSKIQF
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatccagtctactggttcttaatatcttcgagtctacttgcctcgaattccttg
ggctttgctcaagcacaagaagaaaccttaacttctgctaatagctacaatggaaacact
aacagtaagccatttgagcctttatcaacaagtaatgaaggtggtacaacatacaagtgt
acagggaatatatgtatttcctatgcggggttaggcggagaaggcttaaccaatagttgc
tttactgatactgctggtaaccttgccttcgtaggaaatggttacaccttgtgttttgat
aatattattactacagccagtaaccccggagccattaatgttcaaggtgaaggaaaaacc
ttgggcgtctcaggattctcgttattttcatgtgcctattgtcctccaggcacaactggt
tacggagctattaaagctgcagggaatactactatcaaagataactctagtcttgtcttc
cataaaaactgttcgcaaacagaaggtggagtcatttactgtaaaggaagcagtaccact
gagttaaaaatggaaaataatcagaatctggttttctctgagaactcttctaataaaaaa
ggcggtgctatatttactcaaaaactcaccataacttccggtggacctacgttattttct
aacaactccgtatctgcttctgcacctcaaggtggggccatttgtttagatgataccggt
agtgagtgtagcctaaccgctgatctcggggatattacctttgatggaaacaaaataata
aaaactggtgataattcagtaacaagaaattccattgatcttggctctagtggaaaattt
accaatttaagagctaaagatggcttcgggattttcttctatgaccccatcgctaatcaa
ggagatactgacacagaaatcgagctaaataaagctgaggaaaggggatctactacttac
acaggcaagatcgttttctcaggagaaaggctatccgatgaagaaaaagaggttccagcc
aatctacaatcatatttcaaacagcccttaaaaattggttccggttctttagtccttaag
gatggtgtcactttagaagcgaaatccttcacgcaaacagcaggatctaacgttgtcatg
gatctaggaactacgttacagacgccttcctcaggtggagaaaccatcaccctaactaat
ttagatattaacatcgcctcgttggggggggggggggttactccagatcctgctaaagtc
gcatcacaaacctcaaataaaacagttacaatcagtgctgtcaatctagtcgattccgac
ggcaatgcttacgagtatcccattcttgctacgtctaaacctttcacagcaatagtagct
acaactaacactagtacagtcactgcaccagaaaccaatccaacaaactatgtccctcct
actcattacggttatcaaggaaattggacagtaacttgggacgccgaaacagctacaaaa
acagccactctaacttgggaacaaactggctactcccctaacccagaacgtcaaggacct
ttggttcctaacactctttggggctctttctctgacctcagagctatacaaaatttaatg
gatatcagcgtcaatggtgctgattaccatagaggtttttgggtatccggtctagccaac
ttcctacacaaaagtggctctgatactaaacgcaagttccgtcacaatagcgccggatac
gctttaggcgtctacgcaaaaactccttctgatgatattttcagtgcagctttctgccaa
ctcttcggaaaggacaaagactatttagtgtcgaaaaacaacgccaacatttacgcaggt
tctctctattaccaacacatctcttattggagcgcttggcagaatctgctacaaaatact
atcggtatggaagctccgttagtccttaacgcacagttgacttattgtcatgcttcaaat
gatatgaaaacaaacatgacaactacctacgctcctcttaaaacaacgtattcagaaatc
aagggtgattggggtaacgattgtttcggaatcgagcttggggcaactgtgcctatccaa
acagaatcttctcttctattcgatatgtattcacctttcttgaagttacaacttgtgcat
gctcatcaagatgactttaaggaaaacaatagtgatcagggaagatatttcgaaagcagc
aatctcaccaacctttccctacctatcggtataaaatttgagagatttgctaacaacgat
acagcttcttatcacgttactgccgcttatgctcctgacatcataagaagcaaccctgat
tgtactgcttctctgttagtgagccccgactctgccgtttgggtaactaaagctaataac
ctcgcgcgaaatgctttcatactacaagcaggaaattatttggctttaagtcacaacata
gaactcttcagccagtttggtttcgaactcaggggctcttcacgaacttataacgtagat
ctcggatccaagatccagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
