Chenopodium quinoa (quinoa): 110720351
Help
Entry
110720351 CDS
T05764
Name
(RefSeq) DNA ligase 6-like isoform X1
Organism
cqi
Chenopodium quinoa (quinoa)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_ligase_A_M
DNA_ligase_A_N
DRMBL
DNA_ligase_A_C
Lactamase_B_2
UBA_4
RMMBL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110720351
NCBI-ProteinID:
XP_021755062
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1381 aa
AA seq
DB search
MSTSKTLTLNSSELFLQSENPLPSSLPQFPANFPPSKLIPKTRFIVDGFRNSGEFSLSYF
LSHFHSDHYTGLTSTWSRGIVFCSETTARLVVKVLGVSASLVVGLPIDDTVIIDDCEVTL
IDANHCPGAVQFLFKVPVNGGKFERYVHTGDFRFCDDMKLMPKLSEFVGCDAVFLDTTYC
DPKFVFPLQEESIDYVVSVIDRIRSENRDDGKNVLFLVATYVIGKERILLEISRRCGCKI
HVDSRKMGILRALGYEDDGVFTEDELASDVHVVGWNVLGETWPYFRPNFVKVSEIMVEKD
YKKVVGFVPTGWTYEVKRNKFAVRTKDLFEIHLVPYSEHSNYNELREYVRFLKPKRVLPT
VGSDVENVDSKHAIKMQKHFAGLVDEMANKQEFLMGFYQGKAKVKVDDPLTELDKGVEHF
KEEFDVSTLNNEHKTDFGSTCSVVPMDDPGSHIVASLSDKEKEEIMQELRDCLPTWVSVD
QMLELVKTYGRNIVDAVSHFYEHETDFHEQIGKPFPSSLSNLESHSTTFINPCSVDNSLQ
TLVKSPNQKAKFLPLKQSVASSVSPGKRKKNSENKKSKKGKINSNLDSGGIKQSTITKFF
SKNSSVCPGSIAGPLSGTSTEDTNLSSEHSAVCYKEELAQFIQIIDGSESMKNYAAELLQ
KAEGNVGLALDMYYSNSEAHVGGNQKSIDVNSKLLPCEVPDESLSCQGKERSETGNKNFQ
LAQDLLVDNIAVNYVSLPPEKYSPIEHACWKQGQPAPYLHLARTFDIVEGEKGKIKATSM
LSNMFRSLLALSPEDVLPAIYLCTDKIAAEHENMELNIGGSLVASALEEACGTNRAKIRE
RYNNLGDLGDVAQECRQSQSLLLPPSPLLIREVYSILRKISVQTGSGSMGRRKGLIVSMM
RSCREKEMKFLVRTLVKNLRIGAMMRTVLPALAQAVTLNFYDGAGKNQKELLQGLSAAVV
EAYNILPDLNILVPSLMSKGLKFSTTALAMVPGIPIRPMLAKITNGVPQALKLFQNKAFT
CEYKYDGQRAQIHKLDNGSVRIFSRKGDETTSKFPDLVHIIQDLCKPSAKSFIIDAEVVG
IDRTNENKFISFQELSSRKRGSKASSVSLDRIKVDICVYVFDVMFVNGQKLLPCPLRQRR
QCMNDLFRGEKPGYLEYAKELTVEADEARPGCEATVIKINAFLEDAFQSSCEGIIVKSLD
ADAGYFASKRADTWLKVKRDYMDGMGDSLDLVPIGAWHGNGRKAGWYSPFLMACYNPDTE
EFESLCRVMTGFTDAFYKEMKEFLSGDKILIKKPLYYRTDEVPDMWFSAEMVWEIRGADL
TVSPVHKAAVGIVHPSKGISMRFPRFIRTRPDRRPEDCSTSTDTAEMFHSQTRKMDVSGV
H
NT seq
4146 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacctccaaaactctaactctaaattcctccgaactcttccttcaatcggaaaac
cctcttccatcatctcttcctcaatttcccgccaatttcccaccctcaaaactcattccc
aaaacccgcttcatcgtcgatggcttccgaaactccggcgagttttctctctcctacttc
ctctcacacttccactccgatcactacaccggactcacttcaacttggtctcgcggcatc
gtcttttgctcggaaaccaccgctcgtctcgtcgttaaagttctcggtgtttcggcgtcg
cttgttgttggtttaccgattgacgatactgtgatcatcgatgattgtgaggtaacccta
attgatgctaatcattgtcctggtgctgttcaatttttgtttaaggttcctgttaatggt
ggcaaatttgagcgttatgttcatactggtgattttaggttttgtgatgatatgaaactg
atgcctaaattgagtgaatttgttggttgtgatgctgtttttcttgatacgacgtattgt
gacccgaaatttgtgtttcctttgcaagaggaatcgattgattatgtagttagtgtgatt
gataggattaggagtgagaatagggatgatgggaagaatgtattgtttcttgttgcgact
tatgtaattggaaaggagaggattttgttggaaatttcgcgtaggtgtggttgtaagata
catgtagatagtaggaaaatggggattttgcgcgctttaggttatgaggatgatggggtg
tttacggaagatgagttagctagtgatgttcatgttgttgggtggaatgtgttgggtgag
acttggccgtattttcggcctaattttgtgaaggtgagtgaaattatggttgagaaggat
tataagaaggttgtgggatttgttcctactgggtggacttatgaagtgaagagaaataag
tttgcagttaggacgaaagatttgtttgagattcatctggttccttacagtgagcattca
aactacaatgagcttagagaatatgtgaggtttttgaagcctaagcgtgtacttcctacc
gttggttctgatgttgagaatgtggacagtaaacatgctattaaaatgcagaagcatttt
gcaggattggtggatgagatggctaataaacaagagtttttgatgggtttttatcaggga
aaagcaaaggtcaaggtggatgatccgttgaccgagttggacaaaggtgtagaacatttc
aaagaggagtttgatgtgtccacattgaataacgaacataaaactgactttggttccacg
tgttccgtagttcctatggacgatcctggttcacatattgtagcctcattgagtgataag
gaaaaggaggagatcatgcaagagcttagggattgtttgcctacttgggtttctgtagat
cagatgctagaacttgtcaaaacatatggaagaaatatcgttgatgcagtttctcatttt
tatgaacatgaaacagattttcatgagcagatcggaaaacctttcccttcatcattgtca
aacttagaaagtcattccacaacatttattaatccttgttctgttgataacagtttgcag
acactagtgaagtcacctaatcaaaaggccaagtttcttccattgaagcagtcagttgca
agcagtgtttctcctggaaaaagaaagaaaaattctgaaaataagaagagtaagaaaggg
aaaattaactcaaatcttgattctggtggcataaaacaatctacaataaccaagtttttt
agtaaaaatagcagtgtttgtccgggaagcattgctggtcccctgtctgggacaagtacc
gaagacacgaatttatcttctgaacattcagctgtatgttataaggaagagctggcacaa
tttattcagatcattgatggtagcgaatcaatgaaaaactatgctgctgagctgttacaa
aaggctgaaggaaatgttggcttggcactagacatgtattacagtaattctgaagctcac
gttggtggtaatcagaaaagtatagatgttaatagcaaattgctaccctgtgaagttccg
gatgagagcctctcctgccaagggaaagaaaggtctgaaactggcaacaaaaattttcaa
ctggcacaagatttattggttgacaatattgctgttaactatgtatcactgccaccagag
aagtattctccaatagaacatgcttgctggaagcaaggtcagcctgctccatatttacat
ttggcacggacttttgatattgttgaaggtgaaaagggaaaaattaaagctacctctatg
ctttccaatatgtttagaagtttgctggctttgtctccagaggatgtcctacctgctatt
tatctctgcactgataagattgcggctgaacatgagaatatggaattaaacatcggtggg
agtttggtcgcatctgctcttgaagaggcatgtggaaccaatagagctaagattagagaa
aggtacaacaatcttggtgatcttggtgatgttgcacaagagtgtcggcaatcacagtca
ctacttcttcctccttcaccccttttgatacgtgaagtatattccatactacggaaaatt
agcgtacagacaggcagtggaagcatgggtaggagaaaaggcctaattgtaagtatgatg
cgatcttgcagagagaaggaaatgaagtttcttgtcagaaccttggttaagaaccttaga
attggagccatgatgagaacagttcttcctgcattggctcaagcagttactttgaacttt
tatgatggggcaggaaaaaatcaaaaagaactgcttcagggcctttctgctgctgttgtt
gaagcttataatattcttccagacttgaatatattggtgccttctcttatgagcaaaggc
ctaaagttttcgaccactgcgctggctatggtaccaggcattcctatcaggcccatgctt
gctaaaataactaatggggttccgcaagcactgaagcttttccagaataaagctttcacg
tgtgagtacaagtatgatggtcaacgtgctcaaatacacaaacttgataatggttctgtg
cgcatcttttcaagaaagggggatgagacgacctcaaaattcccggatttggtgcacatt
attcaggatttatgtaaaccttctgcaaagtcttttattatagatgcggaggtggttgga
attgatcgcacgaatgaaaacaagtttatatcctttcaagaactatcttccagaaagaga
gggagtaaagcttcctcggtttcattggatagaataaaggttgacatctgtgtctatgtg
ttcgatgtcatgttcgtcaatggacagaagctgttgccttgcccactcaggcaaagacgg
cagtgcatgaacgatctttttagaggggaaaagcctggttatttggaatacgcaaaggaa
ttaactgtggaagcagatgaagctcgtccaggctgtgaagccacagtgataaagattaat
gcttttcttgaagatgcgttccagtcttcttgtgaaggaattattgttaaatcactagat
gctgatgctggctactttgcttcaaagcgtgctgatacatggttgaaggtaaagcgagat
tatatggacggtatgggggactcccttgatttagttcccattggtgcttggcatggcaat
gggagaaaggcaggatggtatagtccatttcttatggcttgttacaatcctgatacagag
gaatttgaaagtttatgccgtgttatgacaggatttactgatgctttttacaaagagatg
aaagagtttctctctggagataagatcttgatcaagaagcccttgtattaccgaacagat
gaagttcccgatatgtggttttcagctgaaatggtgtgggagataagaggtgcagacctc
actgtatcacctgtccacaaggctgcagtaggaatcgttcatccttcaaaaggtatttct
atgaggtttccaagattcatccgtacccgcccagacagacgaccagaagattgtagtacc
tctacagatactgccgaaatgtttcattctcagactcggaaaatggatgtaagcggtgtt
cattag
DBGET
integrated database retrieval system