Chenopodium quinoa (quinoa): 110733220
Help
Entry
110733220 CDS
T05764
Name
(RefSeq) 187-kDa microtubule-associated protein AIR9-like isoform X1
Organism
cqi
Chenopodium quinoa (quinoa)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110733220
NCBI-ProteinID:
XP_021768926
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1745 aa
AA seq
DB search
MEDPIVQFQPLMSEGIEELCNGSADGGEKVVEVMKAAVGSSNRRAEARSSLGLKTGVAKS
CVSGSPHNPNVVTVRARRSSTGGSGEKQSIPAKKQQSGSGLAGRKTAGPSVSEPVRRSLP
ETRTSKVSDVGKSVSKMGIRDTKSGPISPGTRTSKMSTSSSLSKNDSDNKKSFTPAIGSS
TSKFHSSPSVDSTVSSTTKKLLSKNSTQSAQSPSVSSGLKKSTKLSSPLTRSPSVSSGFR
KGTVSASRDQSSSSSGRKKAATSDCQDSHFIVLPQVETKAGDDVRLDLRGLRIRSLSASG
VNLSQNLEFVYLRDNLLSSLEGIEILKRVKVLDLSFNEFKWLGFEPLGNCQVLQQLYLAG
NQITSLSSLPELPNLEFLSVAQNKLKSLSMASQPRLQVLAASKNKISSLKGFPHLPSLEH
LRVEENPILRMPHIEAASILLVGPTLKKFNDRGQCLPLYKKSITIVIESLISFLRFVSDL
SKEEITIAKHYPTCTALCIRDGWEFCSPDRVADSTFDFLVEQWRDQLPPGFLLKEASIDL
PFEEDACRCHFIFLQDHGNDSNLVLKYQWYVGEGVLSNFKAIPDAISEVYCPKHDEVDKY
LKVECIPVFGETEYPPIFAISSQVSPGTGCPKVLNLDVRGDLVEGNIIKGCAEVAWCGGT
PGKSVYSWLRRKWNSSPAVIHGAEEAKYQLTIDDVDSSLVFMYTPVTAEGTKGEPQYAIT
DYVKSAPPSVSNLRIIGDYVEGNTIKGVGDYFGGREGPSKYEWLRANKETRVSELILSGA
PEYTLTRDDVGCRVVFTYIPVNFEGKEGESASAFSDIVKQAPPKVTNTRIVGELREGSKI
TVSGAVTGGTEGASRVQWFKTSSFTLSGEDGLEALSMSKIAKAFRIPLGAVGYYIVAKFT
PMTPDDEAGEPAYVISEMTVETLPPSLNFLSVTGDYAEGEMLTASYGYIGGHEGRSIYNW
YLHEDETETGTLINEILGHLQFRIPKEAIGKFIAFKCIPVRDDGMIGKETICMGHERVRA
GSPRLISLQIAGKSIEGSTLVAERLYWGGEEGESVFRWFRTDSSGQQIEINDAMTASYTL
SVEDVGCLISVSCEPVRSDWARGPEVISEQFGPIVPGLPSCEELKFSGSMMEGERLAFIA
SYHGGVKGNCCTEWFRIQNNGHKEKLCANDYLDLTLDDVGSCIEIIFTPVRGDGIRGISQ
SIISDVIIPADPVGLELTIPGCCEAEVVLPHTIYFGGHEGLGEYIWYRTKNKLHGSDLSS
ISDTYDDIVICGRDLTYTPFLDDVGTYLVLYWVPIRDDGKPGKPLVSICDDPVAPAHPIV
RNICVKSLNLSTYSGEGEYFGGHEGSSLFSWYRETAEGLITLINGADSLTYEVTESDYNC
RLLFGYTPVRLDSVVGELRLSDPTDLLFPELLKIEMVALTGKAMEGELLTSVEVIPNSES
QQIVWSKYKKDVKYQWYYSSDSEDVRSWELLSSESSCSYRLRYEDIDRCLRSECIVTDVF
GRSSEPVYTESTPIMPGTPRINKLEIEGRGFHTNLYAVRGVYSGGKEGKSRIQWLRSMVG
SPDLISIPGETGRMYEANVDDVGYRLVAVYTPVRDDGVEGHPVSASTEPIAVEPDVLEEV
KKKLDFGSVKFEVICNKAPSSKKILDTGGLERRMLEINRKRAKVVKPGSKTSFPTTEMRG
SYAPPFHVEVFRNDQHRLRVVVDSNNEADIIVHTRYLRDVIVLVLRGLAQKFNSTSLNSL
LKIET
NT seq
5238 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggatcctattgtgcaatttcaaccattgatgtctgaagggattgaggaactatgc
aatggttctgctgatggtggtgaaaaagttgtggaagtgatgaaagcagctgttgggtcg
agtaataggagagcagaagcaaggagtagtttaggtttgaaaacaggtgtggctaaatca
tgtgtaagtgggagtccacataatcccaatgtggtaactgtaagggcaagaagaagtagc
actggtgggtcgggtgaaaagcagtctattcctgcaaaaaagcagcaatctggttctggt
ttggcgggaagaaaaactgccggtccttctgtttcagagccagtacggcgatcattgcca
gaaacaaggacgtccaaggtttctgatgttggtaagagtgttagcaaaatgggtatcaga
gatacaaaatcagggccaatttcacctgggactagaacttcgaagatgtctacaagctct
agtttaagtaagaatgattctgataacaagaagtcatttacacctgctataggttcctca
acaagtaagtttcattcttctccttcagttgatagtacagtaagcagcactaccaaaaag
ttattgtcaaagaactctacacagtcagctcaatccccatcagtatcaagtggattgaag
aaaagtaccaagctttcttcacctttgactcggtctccatctgtaagtagtggattcaga
aaaggtaccgtgtcagcttcacgggaccagagttcaagctcatctggtcgaaagaaggca
gcaacctctgattgccaggattctcatttcatagttctgccacaggtagagaccaaagcc
ggggatgatgtgaggctagatctgagaggtttgaggatccgtagcctgagcgcaagtggt
gtgaatttgtctcaaaatttagagttcgtttatctcagggacaatttattatcttcgtta
gaaggcattgaaatacttaaaagagttaaggttcttgatttgagtttcaacgaatttaaa
tggctcggattcgaaccacttgggaactgccaagtcctacagcaactttatcttgctggg
aatcaaataacatcactttcaagcctcccagagcttcctaatttggagtttctctccgtc
gctcaaaataaattgaagtctctctctatggcgagtcaacctcggctacaggtgttagct
gcaagcaaaaacaaaatatcatctctcaagggtttcccacatttaccatctcttgagcac
ttaagagtcgaggagaacccgatcctccggatgcctcatatagaagcagcatccattttg
cttgttggtcccacattaaagaagtttaatgacagaggtcagtgtttacccttatacaag
aaatcgatcactattgtgatagaatctctcatttcatttttacggtttgtttcagacctt
tccaaggaagaaatcacaattgctaagcactaccctacgtgtactgccctctgcataagg
gatggttgggaattttgctctccagaccgtgttgcagactcaacttttgacttcctcgtt
gaacaatggagggatcaactgcccccaggatttctcctcaaggaagcatcaattgatctg
ccttttgaggaagatgcttgccgctgccactttattttccttcaagaccatggtaatgac
tcaaacttggttttaaaatatcaatggtatgtcggagaaggggttctttcaaatttcaag
gcaattcctgatgccatttctgaggtctactgtccaaagcatgatgaagttgataagtac
ttgaaggttgaatgcattcctgtatttggggagacagaataccctccaatttttgcaatt
tcttcacaagtctctcctggaactggatgtccaaaggtcttgaatcttgatgtgcgtggt
gaccttgttgagggaaacatcattaagggctgtgctgaggttgcttggtgtggtgggact
cctggaaaaagtgtctacagctggttaaggagaaaatggaacagcagccctgcagtaatt
catggagctgaagaagctaaatatcaattgactatagatgatgttgattcaagtttagtt
tttatgtacactccggtaacagctgaaggtaccaaaggagaacctcagtatgccatcact
gattatgtaaaatcagctcctccatcagtctctaatttacggataattggagattatgtt
gaaggcaacactatcaagggtgttggagattactttggaggaagagaaggtcctagcaag
tatgagtggctgcgtgccaataaagaaacaagggtatctgaattaatattaagtggggct
ccagaatataccttgacacgggacgatgttggctgccgtgtggttttcacatatatacct
gtgaattttgagggtaaagaaggtgaatctgcttctgcattttctgatatagttaagcaa
gcacctccaaaggtaacgaatacaagaattgttggtgaacttagagagggaagtaagatt
accgtaagtggtgcagttactggaggaacagaaggggccagcagagtacagtggtttaaa
acaagctcttttactttatctggggaggatggcctagaagctttaagcatgtccaagatt
gcaaaggcctttcgcataccattaggagctgttggctactatattgttgcaaaatttact
ccaatgacccctgatgatgaagctggtgaaccagcttatgttatatctgagatgactgtt
gagactcttcctccaagtttgaatttcttgtcagtcactggtgattatgcagaaggtgaa
atgttgacagcctcctatggttatataggtggtcacgaaggcagaagtatatacaactgg
tatcttcatgaggatgaaactgaaacaggcactttaatcaatgaaattttggggcatctt
cagtttcgaatacccaaggaagcgattggtaaatttatagccttcaaatgcatacctgtt
cgagatgatggtatgattggcaaagaaaccatttgcatgggacatgagcgtgttcgtgct
ggaagtccaaggttgatatctttgcaaatagctggaaaatctattgaaggatcaacattg
gttgctgagagattatattggggaggtgaagagggagaatcagtttttcgctggtttcgg
actgattcaagtgggcaacaaattgaaatcaatgatgctatgacagcatcatacacactt
tcggttgaagatgttggatgtttaatatcagtatcctgtgaacctgttagaagtgactgg
gcacgtggtccagaagtaatctctgagcaatttggtcccatagtacctggtcttccatcc
tgtgaggaactaaagttctcaggttctatgatggaaggggaacgattggcattcattgct
tcatatcatggaggggtaaaaggcaactgttgtactgaatggtttagaattcaaaacaat
ggtcacaaggagaaactatgtgctaatgattatctggatctaacccttgatgatgttggg
agctgcattgaaattatatttacgcctgttcggggtgatggaataagaggaatttcccag
agtattatatctgatgttatcattcctgctgatcctgtgggtttggagcttactattcct
ggttgctgtgaggctgaggtggtgcttccacatacgatatactttggcggacatgaaggt
cttggggaatatatttggtacagaacaaagaataagcttcatggatctgatttgagtagc
atatctgatacatatgatgatattgttatttgtggtagagacttaacatacacaccattt
cttgatgatgtggggacatatttggtgctatattgggttccaattcgtgatgacgggaaa
ccgggcaagccattggtttcaatttgtgatgatccagttgccccagctcatcccattgtc
agaaatatttgtgtgaaatctttaaatttaagcacttattctggcgaaggtgaatatttt
gggggacatgaaggatcaagcttgttcagttggtacagagaaacagctgaaggcttaatt
actttaattaatggggctgattctctgacatatgaagtcactgaatcggattacaattgt
cgtttgttgtttggatatacaccagttcgtttggattcagtcgttggggaactcaggctt
tcagatccgacagaccttttatttcctgaactgttgaaaattgagatggttgctctcact
ggaaaagcaatggaaggagaattgctcacttccgttgaagttattccaaatagcgagagc
caacaaattgtttggagcaagtataagaaagatgtcaaatatcagtggtattattcttca
gattctgaggatgtcagatcctgggagttactttcttcagaaagttcctgctcttacaga
ttgcgttatgaagacattgatcgctgcttgagatctgagtgtattgttactgatgtcttt
ggaaggtcaagtgagcccgtatatactgaaagtactcctataatgccaggaacacctaga
attaataaactggagattgagggaagaggatttcacactaatttgtatgctgttcgagga
gtttatagtggaggaaaagagggaaaaagcagaatacagtggcttagatccatggttggc
agtcctgatctcatctctattccaggagaaacgggaaggatgtatgaagctaatgttgat
gatgtggggtaccgacttgtagcagtatacacccctgtgagagatgatggagttgaggga
cacccggtctcggcttcaacagagccaatagcagttgagcctgatgttcttgaagaagtg
aagaaaaagcttgattttggttctgtgaagtttgaggtaatatgcaacaaggctccatca
tccaagaagattttggatactgggggacttgagaggagaatgcttgaaatcaacagaaag
agagccaaagtggtgaagcctggttctaaaacctctttcccaactactgaaatgcgtggc
agttatgctcctccattccatgtggaggtttttcgcaatgatcaacaccggttgagggtt
gtggttgacagcaataatgaagcagatattatagtgcatacacgctacttgagggatgta
attgtgcttgttctcagaggtttagctcaaaaattcaacagcacatccctaaattctttg
ttgaaaatagaaacatag
DBGET
integrated database retrieval system
