Chlamydomonas reinhardtii: CHLRE_11g480400v5
Help
Entry
CHLRE_11g480400v5 CDS
T01039
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
Organism
cre
Chlamydomonas reinhardtii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3707
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5722927
NCBI-ProteinID:
XP_042919725
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(3348540..3360615)
Genome browser
AA seq
2100 aa
AA seq
DB search
MAWRWRAWTFTLLVLFATWPTARGQGASTPSDEYDAALPARSTSSFPWCQCVAYDCGCSP
YQLQVLPPTRDGINVRSCFRVTYVGCDTTRKCCRGMLAAVDKLALETSAACSERGRVLGV
TLNGRVHESWNPYVHGTGAELKIYNLQRSNATFAGVLVCVTTAPPCGWLNDLCVHGSGGP
GGAGADGTSGGGGGMQNSCRYSLSDTPEATYCPVCAVRLPPAPPPPSPPGPNAPGRRRAR
PPPPEPTPPPSPTPSPAPTPCEVCLTLTLLPPPGAAAATQGGGLPFALTDPLCTDLESPM
LSGLADAARAAGATISIPFARTACSTSYVPTATPMVLPYLRLCGAFRTASDGLRLQSWLA
GPTTGLSAWLLQLTGGEACPASPGLSGYVITSLASSPAGGDTCLSAAAVQTCVAAQAPPP
PPPPKARMPPPRASAAARAPPLPPLPDVPQVGGPQCELYLHIQVLPAAASAASASSSLAA
GAFGRRRMQQAWGPGVEGEEVVGKGGSAAAGEAAAMAVTPQAVALRLPGGSGSLSGSGSG
SRAASNGWRRQQKDITTGEQAFSFDVASCAELADRIISGFAVQAPLVGSEITVPFTQFAC
APQQLTLYGAFATAYDGHLLYDWLNGPDGMQAWVHAVTGGDACSQRLSGYTIRSLVTGPG
GELAASCMSGFAQQQCPSTPPPFLPPLPPESPSSPSPPLPPPDSPPPPSPWPPPDTPPPS
PPPPPPPDAPPPPPPNSPPQSTPPPPPDSPPPSPPPPPPTPPVAPEPPSPQPPGLPSPSP
PQIPGPQVPSPPLPSPLPPSPPPSPAPPSPQPPLPPPSPSPPPCVVCITTTIQPPVSASA
STVYNLTDAQCLDLSSTIIDNMQMLAFDTGAVIVTPFTQDACSPSYNATSVPAKYPFARV
CGAFLSAEDGALVADPLKELMKEWVESLTGGAACSSASLSGHLISSKATDPSGAASCLDA
SFRQACSIRRPPSPRPPQPRPPSPAPPSPAPPSPGPPSPQPPSPEPPSPEPPSPEPPTPV
PPSPAPPSPAPPSPAPPSPAPPLPPPPSPVPPSPAPPSPVPPSPMPPSPAPPSPTPPSPT
PPSPVPPSPQPPSPAPPSPAPPSPTPPSPAPPTPAPPSPIPPSPPPPAPPPPCITCVSVF
VLPDSLISGVPFRPNASLCSSMAAMVSAGFTAAAADAGAVVVQPFAVTSCVRGGGPLAGV
LTPLMKICGGLLSADDGAKLQLRIPAATAQPSPPVSATTFATAAFATAAFPTAAASATTQ
PATTEPATPEPVATVSTATQPSTALAVAALAAAAGPSASFTAATLAAAAPSPAAPTAATV
AAATGSASTKPFAFDDSECGKLAKRIDDGFKQQAALLGANIQVPFRLDHCTPTYLKLMGT
FGSARDGEMLQEWLNGPLGMLDWVKSVTGECPDRLSGYAVRSAVQPPNNDTNSCLVGDFK
LECFYQPPPPQPPLPPPSPPPPCVVCITTTIQPPVSASASTVYSLTDAQCLDLSSTIIDN
MQMLAFDTGAVIVTPFAQDACSLSYNATSVPAKYPFARVCGAFLSADDGALVADPLKELM
KEWVESLTGGAACSSASLSGHLISSKTPLSPAPFAFTPASCADLAAVITDDVSQQAADMG
SVMLAPFALTECSDNSLRLCGTFQSAADGAALGPWLEDQSQFWLEALGGGDCSAELAGYS
MVFEAVAGPGGGGVCLQVNAPPLPRIPCEVLVHILLQPPDGLPAVAEAITDGVGSATSTS
RHRERLLLQQLTVTATAADASGSAAFSFDAASCAALSTRIATGFAVQAPLVGSDITVPFT
QFACAPQQLVLYGSFATAYDGFLLYDWLNGPDGMQAWVHSVTGGDACSPELQGYLIRSVV
TGPSGELAPSCMAGGFKQQCEGGPALPPPPPPPPSPPPPLLPPSPSPPSPGPPPRQATPG
LRQPSMPPPPPPSPSPPPPPPSRPDLVQTHECVASTNDVPYSVGPLYVRQSLDQFGAPAV
AMCTRVSGRQACRQAAFCCDMDFAKIEVPINPACRNELRRIAVNRRLKDWSWGSYPSGLL
TVKFESLITDLPDGPDGAELCWLVRPGGVCADPSVFCLQRSCQVNIFSTNNKCCPSAFIS
NT seq
6303 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtggcgctggagagcctggaccttcacgctgctcgttcttttcgcgacatggccc
actgcacgtggtcaaggtgcatcaaccccgagtgacgagtacgatgccgccctcccggcg
cgttccacctcaagtttcccctggtgccagtgcgtggcctacgactgcggctgctcgccc
taccagctgcaggtcctcccgcccacccgggatggtatcaacgtgcgcagttgcttccgt
gtgacctacgtgggctgtgacacgacacgcaaatgctgcaggggcatgttggcggcggtg
gacaagctggcgctggagacgtcggcggcctgttccgagcggggccgggtgctcggcgtg
accctcaacggccgcgtgcacgagtcgtggaacccctacgtgcacggcacaggcgctgag
ctgaagatctacaacctgcagcggagcaacgccacctttgcgggcgtgctggtgtgcgtc
accaccgccccgccctgcggctggctgaacgacctgtgtgtgcatgggtccggggggccc
ggcggcgccggggccgacggtaccagtggcggtggtggcggcatgcaaaacagctgccgc
tactctttgtcagacacgcccgaagcgacgtactgccctgtatgcgccgtacggctgccg
cccgcgccgccaccgccctcaccacccgggcccaacgcgccgggccgccgccgcgcgcgg
cccccgccgcccgagccgacgccgccgccttcgccgacgccgtcacccgcaccaacgcca
tgcgaggtctgccttacgctcacgctcttgccgccacccggcgccgccgccgccacgcaa
ggcggcggcctgcccttcgccctcaccgacccgctctgcaccgacctcgagtcccccatg
ctctcgggcctcgccgacgcggcgcgcgccgccggcgccaccatctccatccccttcgct
cgtaccgcttgctcgacgtcgtacgtgccaaccgccacgcccatggtcctgccgtacctg
cggctctgcggcgcgttccgtacggcgtccgacggactgcggctgcagtcctggctggct
ggccccaccacgggcctcagcgcgtggctgctacagctcacgggtggcgaggcctgcccc
gccagccctggcctctcgggatacgtcatcacctccctcgccagctcgcccgcaggtgga
gacacctgcctgtcggcggcggcggtgcagacgtgcgtggcggcgcaggcaccgccgccg
ccgccgccacccaaagcacggatgccgccgccccgagcgtcggcggcggcacgggcgccg
ccacttccaccgctgccggacgtgccgcaggttggcgggccgcagtgtgagctgtaccta
cacatccaggtgctgccggcggcggcctcagccgcctcagcttcctcgtcactagcggcg
ggggcgttcggccggcggcggatgcagcaggcgtgggggccaggcgtggagggggaagag
gtcgtgggaaagggtggcagcgcggccgcaggcgaggcggcagcgatggcagtgacacca
caagcggttgcgttgcgtctgccaggcggcagtggcagcctcagcggtagcggcagcggt
agccgcgctgccagcaatggctggcggcggcagcagaaggacattacaacgggggagcag
gccttctccttcgacgtcgcctcctgcgccgagctcgcggaccgcatcatttccggcttc
gcggtccaggcgccgctggttggctccgaaatcaccgtgcccttcacccagttcgcctgc
gcaccacagcaactgacgttgtacggcgcttttgcaaccgcctacgacggtcatctattg
tacgactggcttaacggcccagatggcatgcaggcgtgggtgcatgcggtcacaggcggc
gacgcctgctctcagcgcctgtcaggatacaccatccgcagcctcgtgacagggccgggt
ggcgagctggcggcgtcctgcatgtcgggatttgcgcagcagcagtgcccttccacgccg
cctccgtttcttccaccgttgcctcctgaatccccgtcgtcgccctcacctcctctgcct
ccacctgactcgccgccgccgccgtcgccgtggccgccacctgacacgccgcctccgtcc
ccgccaccgccaccgccacctgacgctcctcctccgccgccacctaactcgccgccgcag
tcgacgcctccgccgcctcctgactcaccaccgccatcaccaccgccgcctccgccaacg
ccgccggtggctccagagccgcccagccctcagccaccagggctgccgtcaccctcgccg
ccgcagataccggggcctcaggtgccctccccgccgcttccgtcacctctcccgcccagc
ccgccacccagcccagcaccgcccagcccccagccaccgctgccgccaccctcgccgtcg
ccgccgccctgtgtggtctgcatcacaaccaccatccagccgccagtgtcggcgtcggcg
tcaactgtgtacaacctcacagatgcccagtgcttggacctgtcatccacgatcattgac
aacatgcaaatgctggccttcgacaccggagcagtcatcgtgacgccgtttacccaggac
gcctgctcaccctcctacaatgcgacgtctgtgccagccaagtatccgtttgcgcgcgta
tgcggggctttcctttccgcagaggacggtgcattggtagcagaccccctaaaggagctg
atgaaggagtgggtggagtcactcacgggtggcgctgcctgctcttctgcgtctctgagt
ggccacctgattagcagtaaggcgactgaccccagcggtgccgccagctgcctagacgcg
tcctttcgtcaggcctgcagcatccgccgccctccttcgcctcggccgccgcagccccgt
ccccccagccctgctccccccagccctgctcctcccagcccggggcctccgagcccgcag
ccgcctagcccagagccaccgtcgccggagccgccatctcccgaaccacccactccagtg
ccgcccagtcccgcaccgcctagtccagcgcctcccagccccgcgccacccagccctgcg
ccccccttgcctcccccgcccagccctgtgccaccgagcccggcgcctccctctcccgtt
ccacccagcccaatgccacctagccccgcgcctcccagccccacaccgcctagcccaacg
ccccccagtcctgtgccgcccagcccgcagccacccagccccgcaccgcccagcccggca
ccccccagccctaccccgcccagcccggcgcctcccacgcctgcaccgccctcccccatc
cctccctcgccgcctccgcccgccccgccgcccccctgcatcacgtgcgtcagcgtgttt
gtcctgcccgactccctcatctccggcgtgccgttccggcccaacgcatccctctgcagc
agcatggctgccatggtgtctgccggcttcacagccgccgccgccgacgccggggccgtg
gtcgtgcagcccttcgcggtgacgtcgtgcgtgcgcggcggcggtccgctggcgggcgtg
ctgaccccgctgatgaagatctgtggcgggctgctgtcagcagatgatggcgcaaagctg
cagctgcgcattccagccgccaccgcccagcccagcccccccgtctccgccaccaccttc
gccaccgccgcctttgccaccgccgccttccccaccgccgccgcatccgccaccacccag
cccgccaccaccgagcccgccacccccgagcccgtcgccaccgtctccaccgccacccag
ccctccaccgccctcgccgtcgccgccctcgccgccgccgccggcccctccgcctccttc
accgccgccaccctcgccgccgccgccccatcccccgccgcccccaccgccgccaccgtc
gccgcagccactggctccgcctccaccaagccttttgcctttgacgactctgaatgcggc
aaactggccaagaggatcgatgacggcttcaaacagcaagccgcactgcttggtgcaaac
atccaggtgccattccgcctggaccactgcacgcccacctacctcaagctgatgggcacc
ttcggctcggcccgcgatggcgagatgctgcaggagtggctgaacgggccgctgggcatg
ctggactgggtgaagagcgtgacgggcgaatgccccgaccggctctccggctacgccgtc
cgcagtgcggtgcagccacccaacaacgacaccaacagctgccttgtgggcgacttcaag
ctggagtgcttctaccagccaccccccccccagccgccgctgccgccaccctcgccgccg
ccgccctgtgtggtctgcatcacaaccaccatccagccgccagtgtcggcgtcggcgtca
actgtgtatagcctcaccgatgcccagtgcttggacctgtcgtccaccatcattgacaac
atgcaaatgctggccttcgacaccggagcagtcattgtgacgccgtttgcccaggacgcc
tgctcactctcctataatgcgacgtctgtgccagccaagtatccgtttgcgcgcgtgtgc
ggtgctttcctttccgcagacgacggtgcattggtagcagaccccctaaaggagctgatg
aaggagtgggtggagtcgctcacgggtggcgctgcatgttcttctgcatctttgagtggc
cacctgattagcagtaagacgccgctctcgcccgcgcccttcgccttcacacctgcttct
tgcgccgacctcgcagccgtgattactgatgacgtctcacagcaagcggccgacatgggt
tcggtcatgctcgcgcccttcgcgctcactgagtgctccgacaactcgcttaggctgtgc
ggcaccttccagtccgcagctgacggcgccgcgctgggtccctggctggaggaccagtcc
cagttctggctggaagcgctgggcggcggcgactgttccgcagagctggccggctatagc
atggtcttcgaggccgtggcagggccgggcggtggaggcgtgtgcctgcaggtcaacgcg
ccgccgctgccacgcattccctgtgaggtgcttgtccacatcttgctacagcctcccgac
ggtctgccggcagtagcagaggccatcaccgacggcgtcggcagcgccaccagcactagc
cggcatcgggagcgactgctgctgcaacagctcacagtaaccgccacagcggctgatgct
tccgggagcgcggcgttctccttcgacgccgcctcttgcgctgcgctttccacccgaata
gccacgggcttcgcggtccaggcgccgctggttggctccgacatcaccgtgcccttcacc
cagttcgcctgcgcgccgcagcagctcgtcctgtacggctcctttgcaaccgcctacgac
ggctttttgttgtacgactggcttaacggcccagatggcatgcaggcctgggttcattcg
gtcacaggcggcgacgcctgctctcctgagctccagggctacctcatccgcagtgtggtc
acgggtcctagtggcgagctggcgcctagctgcatggcgggcggttttaagcagcagtgc
gagggcggaccggcgctgccgccgccgcccccgccgccgccctcccctccgcccccgctt
ctgccacccagcccatcgccaccctcaccgggcccgccgccgcggcaggccacgcctggc
ctacggcaaccaagcatgccgccgccgccgccaccctcgccgagcccgccgccgccgcca
ccttctaggcccgacctggttcagacgcacgaatgtgtggcgagcacaaacgacgtgccg
tacagtgtggggccgctgtacgtacggcagtccctggaccagttcggagctcctgcggtg
gccatgtgcacacgtgtgtcgggccggcaggcgtgccgccaggccgcgttctgctgcgac
atggactttgccaagatcgaggtgcccatcaaccccgcctgccgcaacgaactgcgccgc
atcgccgtcaaccgccgcctgaaggattggagctggggcagctaccccagcggcctgctc
actgtcaagttcgagagcctgatcacggacctgccggacggccccgacggcgcggagctg
tgttggctggtgcggcctggcggcgtgtgcgccgacccgtccgtgttctgcttgcagcgc
tcctgccaggtcaacatcttctccaccaacaacaagtgctgtccgagcgccttcatctcg
tag
DBGET
integrated database retrieval system