Camelina sativa (false flax): 104790493
Help
Entry
104790493 CDS
T05044
Name
(RefSeq) extensin-2 isoform X1
Organism
csat
Camelina sativa (false flax)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104790493
NCBI-ProteinID:
XP_010514556
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(5796327..5799998)
Genome browser
AA seq
985 aa
AA seq
DB search
MRSSSKMGPSAHLISALGVIIMATMVAAYEPYTYSSPPPPYSTPSPKVEYNSPPPPYVDY
KSPPPVYSSPPPSPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSS
PPPPYYSPSPKVDYKSSPPPYVYSSPPPPYYSPSPMVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP
MVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPP
YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY
YSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYDYSSPPPPYYSPAPKVDYK
SPPPPYDYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYDYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYDYSS
PPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYDYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP
KVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPP
YVYSSPPPQYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPY
YAPSPKVVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPAPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYK
SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKYPPPPYVYSSPPRPYYSPSPKVVYKSPPHPHVCVC
PPPPPCYSPSPKAIYKSPPPPYVYSSPPPPYHSPSPKVVYKSSPPPYVYSSPPPPYYSPS
PKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKVVYKSPPP
PYVYSSPPLPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPP
YYSPSPKVEYKSPPTPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDY
KSPPPPYVYSSPPPPSYSPSPKTEY
NT seq
2958 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagatcttcctctaagatggggccttctgcccatctcatttccgctctaggagttatc
atcatggcaacaatggttgctgcttatgagccatacacatacagttctccaccaccacca
tattctacaccatctccgaaggttgaatacaactctcccccaccaccatacgttgactat
aaatctccaccacctgtatacagttccccaccaccatcgccatattactctccatcccca
aaggttgagtacaagtctcctcctccaccatatgtctacagctctccaccaccaccatac
tactctccatcccctaaggtagactacaagtctcctccaccaccgtatgtttacagctcc
ccaccgccaccatactactctccatcccctaaggtagactacaagtcttctccaccaccg
tatgtttacagctccccaccaccaccatactactctccatcccccatggtagactacaag
tctcctcccccaccgtatgtttacagctccccaccaccaccatactactctccatccccc
atggtagactacaagtctcctcccccaccgtatgtttacagctccccaccaccaccatac
tactcaccgtctcctaaggtagactacaagtctcctcctccaccatatgtttacagctcc
ccaccaccaccatactactctccagcccctaaggttgactacaagtctcctcctccacca
tatgtctacagctccccaccaccaccctactactctccatctcctaaggttgactacaag
tctcctccaccaccatatgtgtacagttctccaccaccaccatactactctccatcccct
aaggttgactacaagtctcctcctccaccatatgtctacagctccccaccaccaccctac
tactctccatctcctaaggttgactacaagtctcctccaccaccatatgtgtacagttct
ccaccaccaccatactactcaccagcccctaaggttgactacaagtctcctcctccacca
tatgactacagctctccaccaccaccatactactctccagcccctaaggttgactacaag
tctcctcctccaccatatgactacagctctccaccaccaccatactactctccagcccct
aaggttgactacaagtctcctcctccaccatatgactacagctctccaccaccaccatac
tactctccagcccctaaggttgactacaagtctcctcctccaccatatgactacagctct
ccaccaccaccatactactctccagcccctaaggttgactacaagtctcctcctccacca
tatgactacagctctccaccaccaccatactactctccagcccctaaggttgactacaag
tctcctccaccaccatatgtttacagttccccaccaccaccatattactctccatcccct
aaggtagactacaagtctcctccaccaccatatgtctacagctctccaccaccaccatac
tactctccagcccctaaggttgactacaagtctcctcctccaccatatgtttacagttct
ccaccaccaccatactactctccatcccctaaggtagtctacaagtctcctccaccacca
tatgtttacagctccccacctccacaatactactctccatcccctaaggttgtatacaag
tctcctcctccaccatatgtctacagctctccaccaccaccatactactctccatcccct
aaggtagtctacaagtctcctccaccaccatatgtttacagttccccaccaccaccgtac
tacgctccatccccaaaggttgtatacaagtctccccctccaccatatgtctacaactct
ccaccaccaccatactactctcccgccccaaaggttgtatacaagtctcctcctcctccc
tacgtctacagttctcccccaccaccatactattctccatcccctaaggttgtatacaag
tctccacctccaccatatgtctacagctctccaccaccaccatactattctccatcccct
aaggtgcactacaagtatcctccaccaccgtatgtttacagctccccaccacgaccatac
tattctccatcccctaaggttgtatacaaatctccaccacatcctcatgtttgtgtgtgt
ccaccacctcctccatgttattctccatctccaaaggctatatacaagtctcctccaccc
ccatatgtttacagttctccaccaccaccataccactctccatcccctaaggttgtatac
aagtcttctcctccaccgtatgtctacagttctccaccaccaccatattattctccatcc
cccaaggtagtatacaagtctcctcctccaccatatgtttacagttctccaccaccacca
tactactctccatcccctaaggttgactacaagtctcctcctccaccatatgtttacagc
tctccaccaccaccatactactcaccagcccctaaggtagtctacaagtctcctccacca
ccatatgtttacagctccccaccactaccatactactctccatcccctaaggtagtatac
aagtctcctcctccaccatatgtctacagctctccaccaccaccatactactctccatcc
cctaaggtagtatacaagtctcctcctccaccatatgtctacagctctccaccaccacca
tactactctccatcccctaaggttgaatacaagtcccctcctaccccatatgtctacagt
tcaccaccaccaccatactactctccatcccctaaggtagactacaagtctcctcctccc
ccgtatgtctacagttctccaccaccaccatactactctccttcccctaaggtagactac
aagtctcctccaccaccatatgtttacagttccccacccccaccatcatactcaccttct
ccaaaaactgagtactaa
DBGET
integrated database retrieval system
