Cannabis sativa (hemp): 115705159
Help
Entry
115705159 CDS
T08987
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At3g14730 isoform X1
Organism
csav
Cannabis sativa (hemp)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
E_motif
PPR_3
PPR_long
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115705159
NCBI-ProteinID:
XP_030488266
LinkDB
All DBs
Position
X:17638310..17640567
Genome browser
AA seq
623 aa
AA seq
DB search
MKPLLLHHYSSSKLQHRYSVKDLRTCITLLQSCANERNLIKGKQVHSFMVTNGFLINSPP
SITSVINMYSKCQRMNEAVSVFNHPSDEDRNVFAFNAVIAGFIANERSKDGFEFYRRMRE
VGVVVPDKYTFPCVIKACFDSIEVRKIHGLLFKLGLDLDIFVGSALVNTYLKFGLMEYAQ
QVFVKMPEKDVVLWNAMVNGYAQIGCFDEALEMFRIMSREGFVVPSSYTVTGVLSIFAVT
GEIYNGRGVHGFVVKMGYDSGVTVLNALIDVYGKCKCNNDALNIFEMMNEKDIFSWNSII
SVLEQCGDHDGTIRLFDRMLRVGVLPDLVTITTVLPACSNLAALMHGREIHGYMIRKSLG
NNGDCQHKFIDDVLMNNALMDMYAKCGSMRIAHKVFDKMSSKDTASWNIMIMGYGMHGNG
NEALNMFARMCEANFKPDEVTLVGVLSACNHAGLLRQGRKFFSQMTTKYSVVPTIEHYTC
VIDMLGRAGKVKEAYELVLTMPIEANPVVWRALLAACRLHGDADLAKIAAERVIELEPGH
CGSYVLISNIYGVDGQYEEVSEVRETMRQQNVKKTPGCSWIELKEGVNTFVTGDRGHPDA
HLIYSELNSLTANLCDHGYVPHI
NT seq
1872 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacctcttcttcttcatcattattcaagttcgaagcttcagcatcgttactcagtg
aaagacctccggacatgtataaccttattacaatcttgtgcaaatgagagaaatctgatt
aaaggtaagcaagttcactcatttatggtcaccaatggcttccttattaactctcctcct
tcaattacaagtgttattaatatgtactcaaagtgtcaaagaatgaacgaagctgtttct
gtttttaatcatccgagtgatgaagatcgtaacgttttcgcattcaatgctgtgatagct
ggattcattgctaatgagagatccaaagatgggtttgagttttacagaagaatgcgtgaa
gtgggtgttgttgttcctgataagtatacttttccttgtgtaattaaagcttgttttgat
tccattgaggttaggaagattcatgggttgttgtttaaacttgggttggatttggatatc
tttgttggtagtgctttggttaatacttacttgaaatttgggttaatggagtatgcacaa
caagtgtttgtgaaaatgcctgagaaagatgttgtgttgtggaatgctatggttaatggg
tatgcacagattgggtgttttgatgaagctttggagatgtttaggattatgagtagagaa
ggttttgttgtgccaagtagttatacagttactggggtgttgtcgattttcgcagtgacg
ggagaaatctacaatggaagaggtgttcatggttttgtggtgaaaatggggtatgattct
ggtgttactgttttaaatgctttgattgatgtttatgggaaatgtaagtgtaataatgat
gctttgaatatttttgagatgatgaatgagaaggatattttctcatggaactcaattata
tctgttcttgaacaatgtggtgatcatgatggtacaattaggctttttgataggatgtta
agggttggagttttgcctgatttggttactataactacagttcttccggcttgttctaat
ctagctgcgttaatgcacggtagagagattcatggatacatgattcgtaaatcgttggga
aacaatggcgattgtcaacacaagtttatcgacgatgtgttgatgaacaatgctcttatg
gacatgtatgcgaaatgtgggagtatgagaattgctcataaggttttcgataagatgagt
agtaaagacacagcttcatggaatattatgataatgggatacggtatgcatggaaatggc
aatgaggcgctaaacatgtttgctcgaatgtgtgaggcgaatttcaagcctgatgaggtc
acactagttggtgtactatcagcttgcaatcatgctggtttgttaagacaagggcgcaag
tttttctcccaaatgacaacgaaatacagcgtggttccaaccatcgagcactatacttgt
gtgattgacatgctcggtagagctgggaaagttaaggaggcatatgaattggtactaaca
atgccaatcgaggccaaccctgtcgtgtggagagccttattggcagcatgtcggcttcat
ggtgatgcagaccttgccaagattgctgcagaacgagtaatcgagcttgaaccagggcat
tgtggtagttatgttctgatatccaatatttatggagtagatggtcaatatgaagaagta
tcagaagttagagaaacaatgagacaacaaaatgtgaagaaaacacctggttgtagttgg
attgagctcaaggaaggtgtaaatacttttgttactggtgataggggccatccagatgcc
catttgatttattctgaattgaattcattaactgctaacctttgtgatcatggatatgtg
ccccatatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
