Cylindrospermum stagnale: Cylst_1906
Help
Entry
Cylst_1906 CDS
T02398
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family N-terminal domain protein
Organism
csg
Cylindrospermum stagnale
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPS
Glycos_transf_2
Big_1
Glyco_tranf_2_3
Glyco_tranf_2_2
Glyco_trans_2_3
Chlam_PMP
Glyco_tranf_2_4
DNA_III_psi
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ24155
UniProt:
K9WUV5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2230007..2235631)
Genome browser
AA seq
1874 aa
AA seq
DB search
MMPIISLVITVYNRELYLRAAIESILAQTRGDFELLIWDDGSTDSTPEIAREYEKRDRRV
RVVVAEHQGHGLALKAAIAQTTAPYIGWVDSDDLLAPTALAETAAVLDAQPEVGWVYTDY
LDIDEQDNILSYGYRCLVPYSREELLNRFMTFHFRLIRREVFDLVGGINESLKIAEDYDL
CLRLSEVAQVQHIFKPLYYYRTHPESISRQRQQEQIRQSHQIITKAQKRRKLWVSSVAAS
ILPLMLGFLPNFAQAQSITPANDGTGTVINTQGNNIDISGGSLSSDRTNLFHSFSQFGVD
ANQTANFLSQPSIQNILGRVIGGNASLINGLITVTGGNANLYLINPAGILFGANSSLNVP
ASFTATTANAIGFDNQQWFNAIGANNYSNLNGNPTEFAFTTSQPGNIFNAGNLGVGEGQN
LMLLGGTVINTGTVSAANGKITIMAVPGEKLVRLAPANSLLSLDLPIETKAQINPQPFSP
LSLPALLTGGNLNSATGVTVENGEIKLTSTNTPIPTDAGTTIISGQVSVANLSNSIADST
GQINILGDRVALLKANLNASGINGGTVLIGGDYQGQGTVPNASRTFVSSDSVINADGLKN
GNGGKVIVWADDTTRFFGTITAKGGNGGLVETSGKNSLDVTGAKVDASAINGQAGTWLLD
PTDINIIKGGSGTIQAGLFDPSNNSDIDPATIVSALDSGTNVTITTNGGTGGSGDITLTD
SINQTGGGNASLTLTARQFFLNPYGQINMTSTGDLTFNLNQVNPDLTNASTSSIQNAINA
IGSVAGNTTINLGAGTYTGDTILINKPLTLNGVGASNTKVDGENDHGVFNISDTGGIVTL
NDLAIINGKAVGSNGGGIVNSGVTLNINNVIFSSNSTTFDIESGGLGGAIYNSFGDVTVN
NSTFSSNSASSNGGAIYNQGGEGGTVTVNNSTFSGNSATNSGGGIYNSFGDVTVNNSTFG
GNSAAFGAGFYAYGGAVNVNSSTFSLNSASSNGGGIYRDIVGAKVTLKNTIAAGNTSPTS
PDIFGLLDAASSYNLIGDGTGVTGINNGVDGNQVGTAAVPIDPKLSVLGDYGGSTQTFAL
LPGSLAIDAGTPDRNITTDQRGISRPQGTTPDIGAFELVGYNLIPTAGSGQSTTVNNNFS
TDLQAQVTETGFNKPVSGITVNFNAPSSGATASFTGNTTLTTDSSGIVSIPVTANTVAGS
YSVSANSGSLTPANFSLTNNPDVAASIIATGGTPQTTVVNTAFANLLQATVKDQYGNLIS
NATVNFNAPSSGATANFTGNTTLTTDSSGIVSIPVTANTVAGSYSVSANSGSLTPANFSL
TNNPDVAASIIATGGTPQATVVNTAFANSLQATVKDQYGNLISNATVNFNAPSSGATANF
TGNTTLTTNSSGVVSIPVTANTVAGSYIVSANSGSLIPANFSLTNNNNLDNLPNPEQLAQ
LPNTQLPLVTLPIAADNAALGIEQKFTNQFQQYLGITAKTEMTTVSQASDILQKIENATG
VKPALIYINFVPETLAGSNDLSKNQPIPITSPSDRLELLVITAKGKPIRKVLKVTRSQIL
AVAQTFKNRVTDPVLRQDYKDSAKQLYEWLITPIETELQERKINNLAFLMDTGLRSLPIA
ALYDGKQYLVERYSVGLMPSLSLSDTNYVDIKKAEVLGMGASKFANQNPLPAVPIELKTI
TPRLWQGKSFLNEGFTLKNLQAQRQQTPFGIIHLATHGEFKPGAPSNSYIQLWDTQLRMD
RIRELGWNNPPVQLVVLSACRSALGDENAELGFAGFAIQSGAKSALASLWYVSDEGTLGL
MSEFYEQLKTAPIKAEALRQTQVAMLKGQVQLADGKLNTSRGDVTLPPVLKELGDKNLQH
PYFWSAFTLIGNPW
NT seq
5625 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgccaataatttcccttgtcatcacagtttataaccgagaactttatctccgtgca
gctattgaaagcattttagctcaaactaggggtgattttgaactactaatttgggatgat
ggctcaacagacagtaccccagaaattgcccgcgaatatgaaaagcgcgatcgccgtgtg
cgggttgtagtagcagaacatcaggggcatggattggcgttaaaagcggcaatagcccaa
actacagccccctatatcggttgggtagacagtgacgacttactcgcgccgacagcactg
gcagaaaccgcagcggttctagatgcacaaccagaagtgggttgggtttacaccgattat
ctagatatcgacgaacaggacaacatcctcagctatggctatcgttgtctcgtcccctac
agccgagaagaattgttaaacaggtttatgacatttcactttcgactgatccgtcgggaa
gtattcgacttggtgggggggattaatgagtcgctgaaaatagcagaagattatgacttg
tgtctgcgtctttcagaagttgcccaagtgcagcatatttttaagccgctttactactac
cgcacccatccagaaagcatatcccggcaacgacaacaagagcaaattagacaatcgcat
caaataattaccaaagcacaaaaacgccgcaagctttgggtaagttctgtagcagcaagt
attttacctttaatgctggggtttcttcccaatttcgctcaagcacaatcaattactcca
gctaacgatggtactggcacagttatcaatacacaaggtaacaacattgatattagtggc
ggtagtttgagtagcgatcgcactaacttatttcacagtttctcgcaatttggagttgat
gccaaccaaactgctaacttcctttctcagccatcgatacaaaacatcttagggcgtgtc
atcggtggcaacgcttccttaattaacggactaattacagtcacaggcggtaatgctaac
ttatatttaattaacccggcggggattctatttggggcgaattccagtttaaatgtgcca
gcatcttttacagctacaacagccaatgcaattgggtttgataaccagcaatggtttaat
gctattggcgctaataactacagcaatttaaatggcaatcccacggagtttgcgtttaca
actagccagccaggaaatatcttcaatgccggaaatctgggagtaggtgaggggcaaaac
ctgatgttactcggtgggacagtcataaatacggggacggtttcggctgccaacggtaag
atcacaatcatggcagtgccgggagaaaaactggttcggctagcaccagcaaatagttta
ttgagtttagatttaccgatagaaacgaaagcccaaattaacccacaaccattttcacca
ctctctctgcctgcattacttacaggtggtaatctcaacagtgccacaggggtaacagtt
gaaaatggcgagatcaagctgacaagtacaaatacaccaattcctactgatgctggtaca
accattattagtggtcaggtgtctgtcgccaatctcagtaatagtatcgctgacagcaca
ggtcaaattaatattttaggcgatcgcgttgccctcctcaaagctaacctcaacgcttct
ggtatcaacggcggtacagtcctgattgggggtgattatcaaggtcagggaacagtcccc
aatgccagccgtacctttgttagcagtgattctgtgatcaatgccgatgggttgaaaaat
ggtaacggtggcaaagtcattgtctgggcagatgataccacccgcttcttcggcacaatt
accgctaaaggtggtaacggtggcttagtggaaacctctgggaaaaattccctggatgtg
acgggtgctaaggtagatgccagtgccataaatggacaagcggggacttggttactcgac
ccgaccgatatcaatattattaagggtggtagtgggacgatacaagcaggactatttgac
ccatccaataatagcgatattgatccggcaaccattgtatctgccttggatagtggtacg
aatgtcaccatcacaacgaatggtgggacggggggtagtggtgatattaccctaacggat
tcgattaaccagacgggaggtgggaatgcttcgttgacgctgacagcacggcaatttttc
ttgaatccctatggtcaaatcaatatgactagtacgggtgacctgacatttaatctcaat
caggtcaatccagacttgactaatgcgtctaccagttcaattcagaatgcgattaatgca
attggctccgtagcaggaaataccacaattaacttgggtgcaggcacttacacaggcgac
actatattgattaataaacctctaaccttaaatggtgttggggcaagtaacaccaaggta
gatggtgaaaatgatcatggtgtgtttaatatttcggatacgggagggatagtaactctc
aatgatttggcgattattaatggcaaagccgttggcagtaatggtggtggcattgtcaac
tcaggggtgacgctgaatatcaataacgttatcttcagtagtaattcgacaaccttcgac
atagaaagtggtggtctcggtggcgctatctataactcatttggcgatgtgaccgtgaac
aatagtaccttcagtagcaattctgccagcagcaacggcggtgccatctataaccaaggt
ggcgagggaggtacagtgactgtgaacaatagtaccttcagtggtaattccgcaaccaat
agcggcggtggcatctacaactcatttggtgatgtgactgtgaataacagtaccttcggt
ggtaattccgcagcctttggtgctggtttttatgcttatggtggtgcagtcaatgtcaac
agcagcaccttcagcctgaattcagccagcagcaacggcggcggcatctacagggatata
gtaggtgcaaaggtgacactgaagaatactattgcggcaggcaatacaagtccaacgagt
cccgatatctttggcttgctggatgcagctagtagctataacctcatcggagatggcact
ggtgtcacaggcattaacaatggagtcgatggtaatcaggtaggtacggcggctgtgccg
attgatccaaaactctcagttctaggcgactacggcggatctacccaaacctttgccctg
ttaccaggtagtctagcaattgacgctggaacacctgatcgaaacattactacggatcaa
cgtggtatcagccgacctcaaggcacaacacctgatattggtgcgtttgagttggtgggt
tataatctcatacctactgctgggtcaggacaaagtaccactgttaacaataatttttcc
acagacttacaagcacaagtaacagaaaccggcttcaataaacctgtttctgggatcaca
gttaattttaatgccccaagtagtggtgcaactgccagcttcacgggaaatactaccctg
actaccgatagcagcggtattgtttctattcccgtgacggcgaatacagtggcaggtagt
tatagtgtcagtgcgaatagtggtagtctcaccccggctaacttcagtttgacgaataac
ccagatgttgcagccagtatcatcgctacaggcggaacaccgcaaactactgttgttaac
actgcttttgctaatttgctgcaagccaccgttaaagaccaatacggcaacttaatctcc
aatgccacagttaattttaatgccccaagtagtggtgcaactgccaacttcacgggaaat
actaccctgactaccgatagcagcggtattgtttctattcccgtgacggcgaatacagtg
gcaggtagttatagtgtcagtgcgaatagtggtagtctcaccccggctaacttcagtttg
acgaataacccagatgtggcagccagcatcatcgctacaggtggaacaccgcaagctact
gttgtcaacactgcttttgccaactcactgcaagcgacagttaaagaccaatacggcaac
ttaatctccaacgccacagttaattttaatgccccaagtagtggtgcaactgccaacttc
acgggaaatactaccctgacaaccaatagcagcggcgttgtttctattcccgtgacggcg
aatacagtggcaggtagttatattgtcagtgcgaatagtggtagtttaattcctgctaat
ttcagtttgaccaataataataatttagataatcttcctaatccagagcagttggcacaa
ttacccaatacgcaactaccactggttaccttacccattgcagccgacaatgcggcattg
ggaattgagcaaaagttcaccaaccagtttcagcaatatttaggtattactgccaaaact
gagatgacaactgtcagccaagccagtgatatcctgcaaaaaattgaaaatgcgactggc
gttaaacctgcactcatatatattaattttgtccctgaaacccttgcaggctctaatgat
ctgtcaaaaaatcaaccaatacccataacatcgccaagcgatcgcttggaactactggtt
attaccgccaaggggaagccaattcgcaaagtgctgaaggtgacgcgatcgcaaattctc
gcagttgcccaaaccttcaaaaaccgagtcacagatccggtattgcgtcaggactacaaa
gactcagctaaacagctgtatgagtggttaattacaccgatagaaactgaactgcaagag
cgaaaaattaacaatttagcatttctcatggatacgggattgcgatcgcttccgattgct
gccctttatgatgggaaacagtacctggtagaacgctacagcgtcggtttaatgcccagt
ctcagcctctccgatacaaactatgttgacattaaaaaagctgaggttctgggtatgggt
gcatctaaatttgccaaccaaaaccctttaccagccgtacctatagaattaaaaaccatt
actccccgactatggcagggtaaatcctttttaaacgaaggcttcaccctgaaaaatctc
caagcgcagcgtcagcaaacaccctttggcattattcacctagccacccacggcgaattt
aagcctggtgcgcctagtaactcctacattcagttgtgggatacgcaattgagaatggat
cgaatccgagaactgggctggaataacccccccgtgcagctagtggtgctgagtgcttgt
cgttccgccttgggggacgaaaacgcagagttgggctttgctggttttgccatccaatct
ggtgctaagtctgcactcgcaagtttatggtatgtgtcagatgaaggcactttaggattg
atgagtgaattctatgagcaattgaaaacagcccccatcaaagcggaagcactcaggcaa
acacaagtggcaatgctaaaagggcaagtgcaactggcggacggtaaactaaatacttct
cgtggcgatgtaactttgccaccggtactgaaggaactcggtgacaaaaacttgcaacat
ccctatttctggtctgcttttactctaattggcaacccgtggtag
DBGET
integrated database retrieval system
