Chryseobacterium shandongense: EG350_14945
Help
Entry
EG350_14945 CDS
T05920
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
Organism
csha
Chryseobacterium shandongense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
Por_Secre_tail
Ig_3
I-set
TcfC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZA58405
UniProt:
A0A3G6MXQ9
LinkDB
All DBs
Position
complement(3339683..3344662)
Genome browser
AA seq
1659 aa
AA seq
DB search
MKNFYSTIKTLAKTVVTTGALLLGYAQAQTTLSPGGIVFTSYDSTSTSVDVFSFVLLAPI
SSGTQISFTDRGYQGGSAWQPAGSTESAVTWTSGTALPAGTEVYISALSASVYNPSTSTS
TPNGTVALTDGTSSNGLVLSSVGDQIIAFQGGNGSVTGANVTCIAGINYFYTAGSTTAAW
NSDAVGSPNASLMPPGLTGGTNAFYTGPVSGVTVARSGKFNCTGVPTSTVANIRTAVMNN
ANWTLSTAAGSQYSGCTFLASNPVITANPANRTICAGGTTTFTVSASGATSYQWYQNSGS
GFIALTNTAPYSGVTTNTLTITGVTSAMNGYQYRAVASNGAGSATSTAASLTVASISTTG
SKTDISCNGGSNGVATVVPSGGVAPYTYSWAPAGGTAATATGLAAGTYTVTVTDNLGCQT
TRTFTINQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLA
AGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYT
FNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVACNGAS
NGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPASA
VSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIITDAN
GCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDR
TGLAAGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPSSAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGT
APYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVAC
NGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIVTDANGCTATVNATVTQ
PASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVII
TDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGIT
TEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTP
AGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVT
NVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVNA
TVTQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTY
TVIITDANGCTATVNATVTQPASAVSGTTVVTNVACNGASNGAINLTPAGGTAPYTFNWG
GGITTEDRTGLAAGTYTVIITDANGCTATVSRTVTQPTALAATTSQTNIACNGGSTGVAT
INVSGGTAPYTYSWSPSGGTAATATGLSAGTYTVTVTDANACTLTRTFTITQSAPVAAPT
GTSPQNFAPGSTLSALVVTGQNIKWYASSTDAQNHVNSLPLSTALVNNTTYYATQTVGSC
ESTASLAVLAINSTLGVADNTKTKSQLQIYPNPVRDILNFSGQEVVVKAVIIAADGRKVT
EKKLQSGERSIDVNSLPQGMYLIQVFTENGMQTFKFIKK
NT seq
4980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatttttattctacaatcaaaacgctggcgaaaacagtcgtcacgacgggcgcg
ttgttgctgggatatgcccaggcacagacgacgctctctccgggagggattgtatttacc
tcctatgattctacttctacctcggtagatgtattctcatttgtattgcttgctcctatt
tcaagtggcacgcaaataagctttaccgaccgtggctatcagggtggaagcgcatggcaa
ccggccggttctacggagtctgcagttacatggaccagtggcaccgcattgccggccggt
actgaagtgtacatttcagcattgtcggcttctgtttataacccttctaccagtacatcc
acgccaaacggtacagtagcgcttaccgacggaacatcctccaatggactggttttatca
tccgttggagatcagatcattgcattccagggaggaaacggaagtgttacaggtgctaat
gtaacctgcattgccgggatcaattatttttatacagcggggtctacaacagccgcatgg
aatagtgatgccgttggaagtcctaacgcgtcattaatgccaccgggacttacgggagga
actaatgcattttacacaggaccggtatctggtgttacagtcgccagatccggaaagttt
aactgtacaggagtaccaacctcaacagttgcgaatataaggacagcggttatgaacaat
gccaactggacacttagtactgctgcgggatcacagtattcaggatgtacatttctggcc
agcaaccctgtaattactgccaatccggcaaatagaactatatgcgcaggaggtactact
acctttacggttagtgcttcaggagctacttcgtaccaatggtaccagaattcgggtagt
ggatttattgccttaaccaatacagctccatactctggagttacaaccaatactttaact
atcacaggagttacttcagcaatgaatggttaccagtatcgtgctgtcgcaagtaacggt
gctggttctgccacttcaactgctgcttcactaacggttgctagtattagtacgaccgga
agcaagacggatatatcctgtaacggtggatctaacggtgtcgctacggtagtaccatca
ggtggtgttgcaccttatacttattcgtgggcacctgcaggaggaacagctgcaacagca
accggtctggctgccggaacctatacggtaacggtaaccgacaatttgggatgtcaaact
acccgaacatttactattaatcagcctgcaagtgcagtaagcggaacaacagtagtaacg
aatgtagcatgcaacggtgcttccaacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacg
gcaccttacacattcaactggggtggtggaatcacgacagaagacagaaccggtcttgct
gccggaacatacacggtaatcatcactgatgccaacggatgtactgcaaccgtgaatgca
actgtaacgcagcctgcaagtgcagtaagcggaacaacggtagtgacaaacgtagcatgt
aacggcgcttccaacggagcaatcaacttaactccagcaggaggaacggcaccttacaca
ttcaactggggtggtggaatcacgacagaagacagaacaggtcttgctgcaggaacatac
acggtaatcatcactgatgccaacggatgtactgcaaccgtgaatgcaactgtaacgcag
cctgcaagtgcagtaagcggaacaacagtagtgacaaacgtagcatgtaacggcgcttcc
aacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacggcaccttatacgttcaactggggt
ggtggaatcacaaccgaagacagaacaggtttagctgccggaacatacaccgtaatcatc
actgatgctaacggatgtaccgcaacagttaatgcaactgtaacacaacctgcaagtgca
gtaagcggaacaacggtagtaacaaatgtagcatgtaacggcgcttccaacggagcgatc
aacttaactccagcaggaggaacagcaccttacacgttcaactggggtggtggaatcacg
acagaagacagaacaggtcttgctgcaggaacatacacggtaatcatcactgatgccaac
ggatgtactgcaaccgtgaatgcaactgtaacgcagcctgcaagtgcagtaagcggaaca
acagtagtaacgaatgtagcatgtaacggcgcttccaacggagcgatcaacttaactcca
gcaggaggaacggcaccttatacattcaactggggtggcggaatcacaaccgaagacaga
acaggtttagctgccggaacatacaccgtaatcatcactgatgctaacggatgtaccgca
acagttaatgcaactgtaacgcagccttcaagtgcagtaagcggaacaacggtagtaaca
aacgtagcatgtaacggagcttctaacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacg
gcaccttacacgttcaactggggtggtggaatcacaaccgaagacagaacaggtttagct
gccggaacatacaccgtaatcatcactgatgctaatggttgtacagcaaccgttaacgca
acagtaacacaacctgcaagtgcagtaagcggaactacagtagtaacaaatgtagcatgt
aatggtgcttcgaatggagcaatcaacttgactccagcaggaggaacggcaccttacacg
ttcaactggggtggtggaatcacaaccgaagacagaacaggtttagctgccggaacatac
actgtaatcgtcactgatgctaatggttgtacagcaaccgttaacgcaacagtaacacaa
cctgcaagtgcagtaagcggaacaacagtagtaacaaatgtagcatgtaacggcgcttcc
aacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacggcaccttacactttcaactggggt
ggtggaatcacaaccgaagacagaacaggtttagctgccggaacatacactgtaatcatc
actgatgctaatggttgtacagcaaccgttaacgcaacagtaacacaacctgcaagtgca
gtaagcggaacaacagtagtaacaaatgtagcatgtaacggcgcttccaacggagcgatc
aacttaactccagcaggaggaacggcaccttacacgttcaactggggtggtggaatcaca
accgaagacagaacaggtttagctgccggaacatacactgtaatcatcactgatgctaat
ggttgtacagcaaccgttaacgcaacagtaacgcagcctgcaagtgcagtaagcggaact
acggtagtaacaaatgtagcatgtaacggcgcttccaacggagcgatcaacttaactcca
gcaggaggaacagcaccttacacgttcaactggggtggtggaatcacgacagaagacaga
acaggtcttgctgcaggaacatacacggtaatcatcactgatgccaacggatgtactgca
accgtgaatgcaactgtaacgcagcctgcaagtgcagtaagcggaacaacagtagtgaca
aacgtagcatgtaacggcgcttccaacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacg
gcaccttatacgttcaactggggtggtggaatcacaaccgaagacagaacaggtttagct
gccggaacatacaccgtaatcatcactgatgctaacggatgtaccgcaacagttaatgca
actgtaacacaacctgcaagtgcagtaagcggaacaacggtagtaacaaatgtagcatgt
aacggcgcttccaacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacagcaccttacacg
ttcaactggggtggtggaatcacgacagaagacagaacaggtcttgctgcaggaacatac
acggtaatcatcactgatgccaacggatgtactgcaaccgtgaatgcaactgtaacgcag
cctgcaagtgcagtaagcggaacaacagtagtaacgaatgtagcatgtaacggcgcttcc
aacggagcgatcaacttaactccagcaggaggaacggcaccttacacgttcaactggggt
ggtggaatcacaaccgaagacagaacaggtttagctgccggaacatacacggtaatcatt
actgatgctaacggatgtaccgcaacagtaagcagaacggtaacccagccaacggctcta
gctgcgactacttcccaaacgaatatcgcatgtaatggcggatcaacaggagtagcaaca
attaatgtttcaggaggaacagcaccatacacgtattcatggtctccatcaggaggaaca
gcagcaacagctaccggtttatctgcgggaacctatacagtgactgttactgatgctaat
gcatgtacattaaccagaacatttactattacgcagtctgctcctgtagctgctcctaca
ggaacttcacctcagaattttgctcctggaagtacattgagtgctttggtagtaactggt
cagaatatcaaatggtacgcatcatctacagatgcacagaaccatgtaaatagcttaccg
ttaagcacggctttggtaaacaataccacttactatgctacgcaaacagtaggatcttgt
gaatcaacggcttctttggcagtattggctatcaatagtacccttggtgttgctgataat
acaaaaacaaaatctcagcttcagatttatcctaatcctgtaagagatattttgaatttc
agtggacaggaagtagttgttaaagcggtaattattgctgctgacggaagaaaagtaact
gaaaagaaactgcagtcaggagaaagaagcattgatgttaattcgctgcctcaaggaatg
tatttgattcaggtctttacagaaaacggtatgcaaactttcaaatttattaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
